#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 12, 2025; 14:58 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Petersen G., Seberg O., & Salomon B. 2011. The origin of the H, St, W, and Y genomes in allotetraploid species of Elymus L. and Stenostachys Turcz. (Poaceae: Triticeae). Plant Systematics and Evolution, 291: 197-210. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10712] BEGIN TAXA; TITLE Untitled_Taxa_Block; DIMENSIONS NTAX=44; TAXLABELS Aegilops_comosa Aegilops_speltoides Aegilops_tauschii Agropyron_cristatum Amblyopyrum_muticum Australopyrum_pectinatum Australopyrum_retrofractum Australopyrum_velutinum Bromus_arvensis Bromus_sterilis Crithopsis_delileana Dasypyrum_villosum Elymus_canadensis Elymus_canadensis_H Elymus_caucasicus Elymus_caucasicus_Y Elymus_semicostatus Elymus_semicostatus_Y Elymus_sibiricus Elymus_sibiricus_H Eremopyrum_distans Eremopyrum_triticeum Festucopsis_serpentini Henrardia_persica Heteranthelium_piliferum Hordeum_brachyantherum Hordeum_erectifolium Hordeum_marinum Hordeum_murinum Hordeum_vulgare Lophopyrum_elongatum Peridictyon_sanctum Psathyrostachys_fragilis Psathyrostachys_stoloniformis Psathyrostachys_villosus Pseudoroegneria_spicata Secale_strictum Stenostachys_enysii Stenostachys_enysii_H Stenostachys_gracilis Stenostachys_gracilis_W 'Taeniatherum caput-medusae' Thinopyrum_bessarabicum Triticum_monococcum ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Aegilops_speltoides GACAATGCATGGCTCCTTT-ACATCTCTCTT--AACCCATTTAAGGAAGAATAGATAAAGATCTTTGTTTAATTTGTGATCTTTCTGTTTT-AGATCATATACGCTCGTGCATACACCTATGAGCACCAGTACAACTTACTCCTGGGCCTTGCTGCCAAGATGGCTGAAGAGCCTTTCAGGCTTCTGGTACGCATGACTTT-GCTGACATGTACTATTA---TTACAAGTTGATAGATCTCAACTGTGCTCATGTGATCT-TTGTTTGGCTTGGAAATGATAGATCGTGGATTCTGTGATTGCGCTATTCCGTGTTGATTTCAGTGGTAGGGGTGAACTTGCAGAGCGTCAGGTATTCTACTGTAACTAGCTAACTATGTG-------AAAAAATCAAGCAACTCATGATGTAGTCGAATGC---TT-GCGTTTTATACACTTGCTCT-AAGTGATGTGCTCTGGAACTGCAGCAAAAACTGGCACAAATGCTGTCCCGCCTTAC????????CTGAGGAGTTCAATGTTGCAGTGTACATCACCAACCAAGGTGTGCTTTTCCAATCT--A------TCC--------------------------------------------TGTCTGTTCCAAGAAAGAGCTCCTTATA-TTCGTGGATCTCAAATCATACAAATTCTTT----CCTTGTTCCAGTGATTGCGGACCCAGGTGGTGGTATGTTCATCACTGACCCCAAAAAGCCGGCGGGAGGCCACGTGCTGGCGCATGCAGCCACCATCCGGTTGATGCTGAGGAAAGGCAAAGGCGAGCAGCGTGTCTGCAAGATCTTTGACGCCCCTAACCTTCCCGAGGGAGAAGCTATATCCTTTT-GCTCTATA-CTA------------------------------------------------------------------------GGAGTACTTGTTTACTGCTT-GT--GCTATTCATTCCATTAATTTGTTT-GGTTGCT--GAACTCTTGATAGGATT-------------------------------GTTTTGCTCAGACTTGCGCAGCAAAGTTT-------ATGATTTAGTTC-TA----GTTGTT-------------------------------------------------------GAGAAATTGTTTCCCTTGACCACCA-CACGGGGGGCCTTCCGTGAAGGATTGAGGAAAGCTGGCCCACGACTCCTGGAACCTATAATGAAGGTTGAAGTGATTACTCCTGAGGAGCATTTGGGTGATGTTATTGGTGACTTGAACTCTAGAAGAGGACAAGTTAACAGCTTCGGAGATAAGCCAGGTGGACTTAAGGTATT---AAGCAGTAC------TCC-TTTATGACCTTCTATTACTACTAATACTA---------CCTTGACTAACACTATAA-CAACATGAGTAAAATTGA-------ACAAATTGCAGTATGATTA-------TGCATTTAT----ATTTGACCTATCTGATGTACTAATTTT-GAGTCTAGT-GCACCAAATCTTCCTGCTGCACTT---AACATCCATTGTCAGCT-----ATAGCC-------GAGCATCTA-CATTCCATAACCCTTTTATTCTTTTTCTTTTTTG------GTCGAGAGATAGCCATTTTATTCTCGG-AGTTATTTC-TCCAATTAGACTTGTAGTTTGCCAGGATCTGCTGTCTGAAATATTTCTCGAGAATTG-AACTT-GCTTTGCTGTT-GACTGCAGGTGGTTGATGCTTTCGTGCCGCTGGCCGAGATGTTCCAGTATGTCAGCACTCTGAGGGGAATGTCCAAGGGGCGCGCGTCGTACACGATGCAGCTTGCCAAGTTCGACGTTGTCCCACAGCATATCCAGAACCAGCTATCTGCGGCAAAA---GAGGAAGCTGCTGCTTAAATCTTCAGTATC-CGTAGATAATATATAT--GAGGACGGCAGAGCAGGTGAGTATAGG---ACATCAA-GGTGTATGTAGCTTTGTAGTGTCGAGCCCAGTGGGTGATATTATTTGCCATTGTTTTT-???????????????????????????????????????????????????????CCCTGTTATTGTGAGAATTCTTAATTCAAGAGTTATAGGGAGGGACTTATGTCACCACAAACAGAAACTAAAGCAGGTGTTGGATTTAAAGCTGGTGTTAAAGATTATAAATTGACTTACTACACCCCAGAGTATGAAACTAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAAGTCCTCAGCCTGGGGTTCCGCCCGAAGAAGCAGGGGCTGCAGTAGCTGCCGAATCTTCTACTGGTACATGGACAACTGTTTGGACTGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTATCACATCGAGCCTGTTGCTGGGGAAGACAGCCAATGGATCTGTTATGTAGCTTATCCATTAGACCTATTTGAAGAGGGTTCCGTTACTAACATGTTTACTTCCATTGTAGGTAACGTATTTGGTTTCAAAGCCCTACGTGCTCTACGTTTGGAGGATCTACGAATTCCCCCTACTTATTCAAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAGTTGAACAAGTATGGTCGTCCTTTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGC?AAAAATTATGGTAGAGCGTGTTATGAGTGTCTACGTGGTGGACTTGATTTTACCAAAGATGATGAAAAC{CG}TAAACTCACAACCATTTAT{CG}CGCTGGAGAGACCGTTTTGTCTTTTGTGCCGAAGCTATTTATAAATCACAGGCCGAAACCGGTGAAATCAAGGGGCATTACTTGAATGCGACTGCGGGTACATGTGAAGAAATGATTAAGAGAGCTGTATTTGCAAGAGAATTAGGGGTTCCTATTGTAATGCATGACTACTTAACTGGGGGATTCACCGCAAATACTACTTTGGCTCATTATTGCCGCGACAATGGCCTACTTCTTCACATTCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCATGGTATGCATTTCCGTGTATTAGCTAAAGCATTGCGTATGTCTGGGGGAGATCATATCCACTCCGGTACAGTAGTAGGTAAGTTAGAAGGGGAACGCGAAATGACTTTAGGTTTTGTTGATTTATTACGCGATGATTTTATTGAAAAAGATCGTGCTCGCGGTATCTTTTTCACTCAGGACTGGGTATCCATGCCAGGTGTTATACCGGTAGCTTCAGGTGGTATTCATGTTTGGCATATGCCAGCTCTGACCGAAATCTTTGGGGACGATTCTGTATTACAATTTGGTGGAGGAACTTTAGGACATCCTTGGGGAAATGCACCTGGTGCAGCAGCTAATCGAGTGGCTTTAGAAGCCTGTGTACAAGCTCGTAACGAAGGGCGCGATCTTGCTCGCGAAGGTAATGAAATTATCCGAGCAGCTTGCAAATGGAGTCCTGAACTAGCCGCAGCTTGTGAAGTATGGAAGGCGATCAAATTCGAGTTCGAGCCGGTAGATACTATTGATATATATTTACTTACATTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGTAGCACTAAAGAGAGTTCCTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGGATACCCAAAGGAGTGAATAGGGATTTCGTTTTATCAACAACGAAGAGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCAAAAATTCAAGGTAATACAAGAAATAGGATAGGATCCTTTACTACGTCTTTTGGGGCTAAAAACACTTTTGCCTATCCGCATGAAACGGGAAATACTATGTTATTTCCTCTTCTTATATTACTACTTTTCACTTTGTTCATTGGATTCATAGGAATCTCTTTTGATAATGGAGGAATTGGTAATGGAATAGCAGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGTTAACTCCCTCAATAAACTTTACTCAGGAAAGTTCTAATTCTTTTGTAAATTCATATGAATTTATTACTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTCTAGCTATCTTTGGTTTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCCGCTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGGATTTAATAAACTCTTTTTACAAAGGAAATCCTAAAAAAGAATTTTTAGATCAAGTAAAAAAAAATATATACAGTTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATATTTTCTATACTAGGGTCTTTACCCTCGGTATAAGAGGGTTAACCGAACTAACGGAGTTTTTTGATAAGGGTGTTATTGATGGAATTACCAATGGAGTGGGTCTTGCTAGTTTTTGTATACCGCCTAAAAAAAGACGTCTGTAAAAGAATTAACCCGCTTTCAACTTTCATTTCAAGAGAAATAAACGATTCAATGATAAAATAATAATACTAGTCTATTATGGTTCGAGAGGAGGTAGCAGGATCCACTCAAACACTACAGTGGAAGTGTGTTGAATCAAGAGTAGATAGTAAGCGCCTTTATTATGGTCGTTTCATTCTGTCCCCGCTTAGAAAAGGTCAAGCGGACACCGTCGGTATTGCCTTGCGAAGAGCTTTACTTGGAGAAATAGAAGGAACATGTATCACACGTGCAAAATTTGGGAGCGTGCCGCACGAATATTCTACAATAGCAGGTATTGAAGAATCCGTACAAGAAATTTTACTAAATTTGAAAGAAATTGTATTGAGAAGTAATCTCTATGGAGTTAGAGACGCATCCATTTGCGTCAAAGGTCCTAGATACATAACTGCTCAAGATATCATCTTACCGCCTTCCGTAGAAATCGTTGATACGGCACAACCTATAGCTAACTTGACAGAGCCCATTGATTTCTGTATTGATTTACAGATCAAGAGAGATCGTGGATATCAGACAGAACTCAGAA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Amblyopyrum_muticum 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Australopyrum_pectinatum 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Australopyrum_retrofractum 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Crithopsis_delileana 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Dasypyrum_villosum 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Elymus_canadensis 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Elymus_semicostatus_Y 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Eremopyrum_distans 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Hordeum_murinum 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Peridictyon_sanctum 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'Taeniatherum caput-medusae' 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Triticum_monococcum 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