#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 09, 2025; 20:12 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Herron M., Castoe T., & Parkinson C.L. 2003. Sciurid phylogeny and the paraphyly of Holarctic ground squirrels (Spermophilus). Molecular Phylogenetics and Evolution, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1078] BEGIN TAXA; TITLE TaxonLabelSet11329; DIMENSIONS NTAX=169; TAXLABELS Allactaga_elater Ammospermophilus_harrisii_AF157926 Ammospermophilus_harrisii_AHU46172 Ammospermophilus_interpres Ammospermophilus_leucurus Anomalurus_sp_ASP389526 Aplodontia_rufa Belomys_pearsonii Callosciurus_erythraeus_1 Callosciurus_erythraeus_2 Callosciurus_finlaysonii Callosciurus_nigrovittatus Callosciurus_prevostii_1 Callosciurus_prevostii_2 Castor_fiber Cavia_porcellus Cynomys_gunnisoni Cynomys_leucurus Cynomys_ludovicianus Cynomys_mexicanus Cynomys_parvidens Eliomys_quercinus Glaucomys_sabrinus_AF030390 Glaucomys_sabrinus_AF271668 Glaucomys_sabrinus_AF359211 Glaucomys_sabrinus_AF359221 Glaucomys_sabrinus_griseifrons Glaucomys_volans_AF157921 Glaucomys_volans_GVO389531 Glis_glis Graphiurus_murinus Hylopetes_phayrei Idiurus_macrotis Marmota_Marmota Marmota_baibacina_centralis Marmota_baibacina_kastchenkoi Marmota_bobak_bobak_AF143916 Marmota_bobak_bobak_AF143917 Marmota_broweri Marmota_caligata_caligata Marmota_camtschatica_camtschatica Marmota_camtschatica_doppelmayri Marmota_caudata_aurea Marmota_caudata_caudata Marmota_flaviventris_luteola Marmota_flaviventris_obscura Marmota_himalayana_robusta Marmota_marmota_marmota_AF143929 Marmota_marmota_marmota_AF143930 Marmota_menzbieri_zachidovi Marmota_monax_monax Marmota_monax_ochracea Marmota_olympus Marmota_sibirica_sibirica Marmota_vancouverensis Microsciurus_flaviventer Paraxerus_cepapi Pedetes_surdaster Petaurista_alborufus Petaurista_elegans Petaurista_leucogenys Petaurista_petaurista Petaurista_philippensis Petinomys_setosus Pteromys_momonga Pteromys_volans Sciurillus_pusillus Sciurus_aberti_barberi Sciurus_aberti_chuscensis Sciurus_aberti_kaibabensis Sciurus_aestuans Sciurus_carolinensis Sciurus_lis_AB030024 Sciurus_lis_AB043881 Sciurus_niger Sciurus_stramineus Sciurus_vulgaris_AB030028 Sciurus_vulgaris_gi8347068 Spermophilopsis_leptodactylus Spermophilus_adocetus Spermophilus_annulatus Spermophilus_armatus Spermophilus_atricapillus Spermophilus_beechyi Spermophilus_beldingi_creber Spermophilus_brunneus_brunneus Spermophilus_citellus Spermophilus_citellus_relictus Spermophilus_columbianus_columbianus Spermophilus_columbianus_ruficaudus Spermophilus_dauricus Spermophilus_elegans_elegans Spermophilus_erythrogenys_AF157855 Spermophilus_erythrogenys_AF157875 Spermophilus_franklinii_AF157893 Spermophilus_franklinii_AF157894 Spermophilus_fulvus Spermophilus_lateralis_trepidus_AF157887 Spermophilus_lateralis_trepidus_AF157950 Spermophilus_madrensis_AF157946 Spermophilus_madrensis_AF157947 Spermophilus_major_AF157903 Spermophilus_major_AF157905 Spermophilus_mexicanus_mexicanus Spermophilus_mexicanus_parvidens Spermophilus_mohavensis Spermophilus_musicus Spermophilus_pallidicauda Spermophilus_parryi Spermophilus_parryi_kenicotti Spermophilus_parryi_plesius Spermophilus_perotensis Spermophilus_pygmaeus_AF157907 Spermophilus_pygmaeus_AF157910 Spermophilus_relictus_AF157867 Spermophilus_relictus_AF157876 Spermophilus_richardsoni Spermophilus_saturatus Spermophilus_spilosoma_AF157846 Spermophilus_spilosoma_marginatus_AF157911 Spermophilus_suslicus_AF157895 Spermophilus_suslicus_AF157898 Spermophilus_tereticaudus Spermophilus_townsendi_idahoensis Spermophilus_townsendi_mollis Spermophilus_townsendi_townsendi Spermophilus_townsendi_vigilis Spermophilus_tridecemlineatus_arenicola Spermophilus_undulatus_AF157906 Spermophilus_undulatus_AF157912 Spermophilus_variegatus Spermophilus_variegatus_utah Spermophilus_washingtoni Spermophilus_xanthoprymnus Tamias_amoenus_AF147630 Tamias_amoenus_AF147632 Tamias_bulleri Tamias_canipes Tamias_cinericollis_AF147636 Tamias_cinericollis_AF147638 Tamias_dorsalis_AF147639 Tamias_dorsalis_AF147641 Tamias_durangae Tamias_merriami Tamias_minimus_AF147645 Tamias_minimus_AF147650 Tamias_obscurus Tamias_ochrogenys Tamias_palmeri Tamias_panamintinus Tamias_quadrimaculatus Tamias_quadrivittatus_AF147658 Tamias_quadrivittatus_AF147660 Tamias_ruficaudus Tamias_rufus_AF147662 Tamias_rufus_AF147663 Tamias_senex Tamias_sibiricus Tamias_siskiyou Tamias_sonomae Tamias_striatus Tamias_townsendii_AF147674 Tamias_townsendii_AF147676 Tamias_umbrinus Tamiasciurus_douglasii Tamiasciurus_hudsonicus Tamiasciurus_mearnsi Xerus_inauris Xerus_rutilus ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M139] TITLE cytochrome_b; LINK TAXA = TaxonLabelSet11329; DIMENSIONS NCHAR=1140; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= :; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Allactaga_elater ATGACCAACATACGAAAAACTCATCCTTTAATAAAAATCATTAACGAGTCTTTCATTGACCTTCCTACCCCATCTAACATCTCTGCATGATGGAACTTCGGCTCTCTTTTAGGATTATGCCTTGTAATTCAGATTCTCACAGGACTTTTCCTAGCCATACATTACACCTCCGACACCACAACAGCCTTCTCATCAGTCACCCATATCTGCCGAGACGTAAACTACGGATGATTAATCCGATACATACATGCTAACGGAGCTTCAATATTCTTCATCTGCCTCTTCCTCCACGTAGGACGAGGCCTGTACTATGGGTCATACACTTTCATTGAAACCTGAAACATTGGAGTACTATTATTATTCACTGTAATAGCAACAGCCTTTATAGGCTACGTCTTACCATGAGGACAAATATCCTTCTGAGGAGCCACAGTAATTACAAACCTCCTATCCGCTATCCCCTATATCGGCACAACCCTGGTAGAATGGACTTGAGGCGGCTTCTCAGTAGACAAAGCCACCCTGACTCGATTCTTCGCCTTTCACTTTATCCTTCCATTCATCGTAGCAGCCCTAGCTGTAGTACATCTTCTATTCCTCCACGAAACAGGATCCAACAACCCTATCGGACTAAACTCAGACGTGGACAAAATTCCATTCCATCCGTACTACACAATCAAAGATGCCCTGGGATTCCTTCTCCTAATCCTAGTTCTCCTTATACTAGTACTATTCTCCCCAGACCTCCTAGGAGACCCCGACAACTACACACCAGCTAACCCACTCAACACTCCACCCCATATCAAGCCTGAATGATACTTCCTATTTGCCTACGCCATCTTACGATCAATTCCAAATAAACTAGGAGGAGTAATTGCTCTAGTCCTATCAATCCTGATCCTAGCCCTCGTCCCATTCCTACATAATTCTAAACAACGAAGCATAATCTTCCGACCAATTAGCCAATGCCTGTACTGACTACTCGTAGCTGACCTGCTTACCCTAACTTGAATCGGAGGACAACCAGTGGAGCACCCTTTCATTATCATCGGACAAATCGCATCTATCCTATACTTCTCCATCATCCTCATCCTCATACCCCTAGCTAGCATACTAGAAAACAAGATATTAAAATGAAGA Ammospermophilus_harrisii_AF157926 ATGACAAACATCCGCAAAACCCACCCTCTAATTAAAATTGTTAACCACTCCTTTATTGACCTACCTACACCTTCTAATATCTCTGCATGATGAAACTTCGGATCTCTCCTAGGCCTCTGCCTAGCTATTCAAATCCTTACAGGATTATTCCTAGCAATACATTATACATCAGATACCATAACAGCTTTTTCATCTGTTACCCATATTTGTCGAGATGTAAATTACGGTTGACTAATCCGCTATATACACGCCAACGGTGCATCAATATTCTTCATCTGCCTCTTCCTTCATGTAGGCCGAGGACTATACTATGGATCCTACACTTACTTTGAAACATGAAACATTGGAGTTATTCTCCTATTCGCAGTGATAGCTACAGCATTCATAGGCTACGTTCTCCCATGAGGCCAAATATCATTTTGAGGAGCAACCGTAATTACTAACCTTTTATCTGCCATTCCTTACATTGGCACAACTTTAGTAGAATGAATTTGAGGAGGCTTTTCAGTTGACAAAGCTACTCTAACACGATTTTTCGCATTCCACTTCATCCTCCCATTTATTATCGCAGCCTTAGTTATAGTTCATCTTCTCTTCCTTCACGAAACAGGATCAAACAACCCTTCAGGCCTAATCTCTGACTCAGACAAAATTCCCTTTCACCCATACTTTACTATCAAAGACATCCTTGGAGTCCTCCTCCTTATCCTAGCCCTAATGATCCTTGTCCTATTTTCACCAGACCTCTTGGGAGACCCTGACAATTATACACCTGCCAATCCTCTTAATACTCCTCCCCACATTAAACCAGAATGATATTTCCTATTCGCTTATGCTATCCTCCGATCTATTCCCAACAAATTAGGAGGTGTATTAGCCCTAGTTTTCTCCATCCTAATCCTTATACTATTTCCATTACTTCACATGTCCAAACAACGTAGTATAATTTTCCGACCACTAAGCCAATGCATGTTTTGAATTCTTGTCGCAGATTTATTTACACTGACTTGAATTGGAGGACAACCTGTTGAATACCCCTTTATTATTATTGGCCAACTAGCATCAGTCTTATACTTTAGCATTATTCTTCTAATCATACCCGCCACCAGCCTAATTGAAAACAAACTTCTAAAATGAAGA Ammospermophilus_harrisii_AHU46172 ATGACAAACATCCGCAAAACCCATCCTCTAATTAAAATCGTCAACCACTCCTTTATTGATCTACCTGCACCTTCTAATATCTCTGCATGATGAAACTTTGGATCTCTACTAGGCCTCTGCCTAGCTATCCAAATCCTCACAGGATTATTTCTAGCAATACATTATACATCAGATACCATAACAGCCTTCTCATCAGTTACCCATATCTGCCGAGATGTAAATTACGGCTGACTTATCCGCTATATACATGCCAACGGTGCATCAATGTTCTTCATCTGCCTCTTCCTTCATGTAGGCCGAGGATTATACTATGGCTCCTACACTTACTTTGAAACATGAAACATTGGAGTTGTTCTCCTATTCGCAGTAATAGCCACAGCATTCATAGGCTATGTCCTCCCATGAGGTCAAATATCATTTTGAGGAGCAACCGTAATTACTAACCTTTTATCTGCCATTCCTTACATTGGCACAACCTTAGTAGAATGAATTTGAGGAGGCTTTTCAGTTGACAAAGCCACTCTAACC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Ammospermophilus_interpres ATGACAAACATCCGCAAAACCCACCCTCTAATTAAAATCGTCAACCACTCCTTTATTGACCTACCTGCACCTTCTAACATTTCTGCATGATGAAACTTCGGATCTCTTCTAGGCCTCTGCCTAGCTATTCAAATCCTTACAGGACTATTCCTAGCAATACATTACACATCAGATACCATAACAGCTTTTTCATCTGTTACCCACATTTGCCGAGATGTAAATTACGGCTGATTAATCCGCTATATACACGCCAACGGTGCATCAATATTCTTCATCTGCCTCTTCCTTCATGTAGGCCGAGGACTATATTATGGGTCCTACACTTACTTTGAAACATGAAACATTGGAGTCATTCTCCTATTCGCAGTAATAGCCACAGCATTTATAGGCTACGTCCTTCCATGAGGCCAAATATCATTTTGAGGAGCAACCGTAATCACTAACCTTTTATCTGCCATTCCTTACATTGGCACAACTTTAGTAGAGTGAATTTGAGGAGGCTTTTCAGTTGACAAAGCTACTTTAACC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Ammospermophilus_leucurus ATGACAAACATCCGCAAAACCCACCCTCTAATTAAAATCGTCAACCACTCCTTTATTGACCTACCTGCACCTTCTAATATTTCTGCATGATGAAACTTCGGATCTCTTCTAGGCCTCTGCCTAGCTATTCAAATCCTTACAGGATTATTCCTAGCAATACATTATACATCAGATACCATAACAGCCTTTTCATCTGTTACCCATATTTGCCGAGATGTAAATTACGGCTGATTAATCCGCTATATACACGCCAACGGTGCATCAATATTCTTCATCTGCCTCTTCCTTCATGTAGGCCGAGGATTATACTATGGGTCCTACACTTACTTTGAAACATGAAACATTGGAGTTATTCTCCTATTTGCAGTAATAGCCACAGCATTCATAGGTTATGTCCTCCCATGAGGCCAAATATCATTTTGAGGAGCAACCGTAATTACTAACCTTTTATCTGCCATTCCTTACATTGGTACAGCTTTAGTAGAATGAATTTGAGGAGGCTTTTCAGTTGACAAAGCTACTCTAACA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Anomalurus_sp_ASP389526 ATGACCAATACACGAAAAACACACCCCCTAACAAAAATTATTAACAACTCATTCATTGACCTACCAACACCCTCCAATATTTCATCATGATGAAATTTCGGATCACTACTAGGCCTATGCTTAATTACACAGATTATCACAGGACTATTTCTATCAATACACTACACCCCCGACACATCAACAGCATTTTCATCCGTAGCCCACATTTGCCGAGACGTAAACTACGGCTGATTAATCCGGTATCTACACGCAAACGGAGCCTCAATATTTTTCATCTGCCTGTTCGTCCACGCAGGACGAGGCTTATACTACGGCTCCTACATACTAAAAGAAACATGAAACATTGGAGTAATTCTCCTACTAATTACAATAGCTACCGCCTTTATAGGATACGTATTACCCTGAGGACAAATATCCTTTTGAGGTGCAACAGTAATCACAAACCTTCTATCAGCTATCCCTTATATCGGCACAAACATCGTAGAATGAATTTGAGGCGGATTTTCAGTTGATAAAGCCACATTAAACCGATTCTTCGCCTTTCACTTTATCCTCCCTTTTATCATCGCAGCCCTAGCCATAATTCACTTGTTATTCCTACACGAAACAGGCTCCAACAACCCATCAGGATTATCATCAGACTCAGACAAAATCCCTTTCCACCCTTACTTCACAATCAAAGACATCCTGGGAGTTATCGTACTAGCAACCATCCTTATACTCCTGGTTTTATTTTCCCCAGATATCTTAGGAGACCCCGACAACTATATCCCAGCAAACCCTCTAGTTACCCCTCCACATATCAAACCAGAATGATACTTTTTATTTGCCTACGCTATCCTACGATCTATCCCAAATAAACTAGGAGGAGTAATCGCCCTAGCCGCATCAATCCTTATCCTTATAACTATACCCATTATCCACAACTCAAAACAACGAAGCCTTATATTCCGACCTTTCAGCCAATTCACATTCTGAATTTTAGTCGCAGACCTACTAACATTAACATGAATTGGAGGTCAACCAATCGAATACCCCTTTATAACAATTGGACAACTAGCATCAACCCTTTACTTCTCCTCCATCTTAATCCTCATACCAACAACAAGTATATTAGAAAATAAACTACTTAAATGAAGA Aplodontia_rufa ATGACCAACATCCGCAAAACCCATCCACTAATAAAAATTATTAATCACTCATTTATTGATCTACCAACCCCATCAAATATCTCAGCATGATGAAACTTTGGATCCCTACTTGGTTTCTGCCTAATTGTCCAAATCATAACAGGCCTATTCTTAGCTATACACTACACATCTGACACTACAACAGCATTCTCCTCCGTTGCCCATATCTGCCGAGACGTAAATTACGGATGACTTATTCGCTATATGCATGCCAACGGGGCCTCATTATTCTTCATCTGCTTATATCTTCATGTAGGCCGAGGTATGTACTATGGCTCCTACCTATCCTACGAAACATGAAACATTGGCATTCTACTCTTACTCGCTGTTATAGCCACAGCATTTATGGGCTATGTACTCCCTTGAGGACAAATATCATTCTGAGGGGCTACTGTGATTACCAACCTTCTATCCGCAATTCCCTATATCGGGGCTAGCCTAGTGGAGTGAATTTGAGGAGGATTTTCCGTAGATAAAGCCACCCTTACCCGATTTTTTGCATTCCATTTCGTACTTCCATTTATTATTATAGCCCTAGCAATAATTCACCTTTTATTTCTTCATGAATCAGGGTCTAACAACCCCTCCGGCTTGATATCAGACTCAGACAAGGTCCCATTCCATCCTTATTATACAATTAAAGATATTTTGGGTCTTATCCTCCTAACTTTATTTTTCATGATTCTCGTTTTATTCTCCCCTGACATTCTAGGTGACCCAGACAATTACACTCCTGCTAACCCCCTAATTACTCCGCCCCATATCAAACCAGAATGATATTTTCTATTCGCCTATGCTATCTTACGATCAATCCCAAACAAACTGGGAGGTGTCCTGGCTCTAGTATTTTCTATCCTTATTCTAGTTCTACTCCCCCTTCTACATATATCAAAACAACGAAGCATAGCCTTTCGTCCTCTCACCCAATGCCTATTCTGGATTCTTGCAGCTGACCTTCTCACTCTCACATGAATTGGAGGGCAGCCAGTTGAATACCCATTTATTGCTATTGGTCAACTGGCCTCTATCTTATATTTCCTCTTGATCCTTTTTATAATACCACTTACTAGTCTAATAGAAGATAAACTCCTAAAATGATAG Belomys_pearsonii ???????????????????????????CTACGCAAATACGTAAACCAATCTTTTATTGATCTCCCCACTCCCTCTAACATCTCAGCATGATGGTATTTCGGCTCCCTCCTAGGATTTTGCCTAATTATCCAAATCCTAACCGGACTCTTTCTGGCTATACATTACACATCAGATACAATAACCGCCTTTTCATCCGTAACCCATATCTGCCGAGACGTAAACTACGGCTGACTTATCCGATATATGCACGCAAACGGCGCCTCAATATTCTTCATCTGCCTTTTCTTACATGTAGGCCGAGGACTCTACTATGGATCCTATACTTACTTTGAAACCTGAAATATTGGAATTATTCTTTTATTTACAGTTATAGCCACAGCATTTATAGGCTATGTTCTACCATGAGGACAAATATCTTTCTGAGGAGCCACTGTCATCACAAACCTCCTTTCAGCTATCCCTTATATTGGAACTGATCTAGTAGAGTGAATCTGAGGGGGGTTTTCAGTTGACAAGGCAACCCTAACACGATTCTTCGCATTCCACTTTATCTTACCATTTATCGTAGCAGCCCTTGCAATAGTCCACCTTCTTTTCCTCCACGAAATTGGGTCAAATAATCCCCCCGGATTAATTTCTGAATCTGATAAAGTACCATTCCACCCATACTTCACAATCAAAGATATTCTTGGCGCCCTAATCTTCGGCCTTATATTTACAACCCTTATTCTATTCGCCCCTGATCTCCTAGGAGACCCTGACAACTATACTCCGGCCAATCCACTTAACACCCCTCCCCACATTAAACCAGAATGATACTTTCTAATTTATTACGCAATCCTTCGATCCATCCCCAACAAACTAGGAGGAGTCTTAGCATTAGTATTCTCCATCCTAATCCTTGTTCTATTCCCAATCCTCCACCTATCCAAACAACGCAGTATAATATTCCGTCCACTAAGCCAATGCGTTTTCTGAATTCTTGTAGCCGACCTCCTAACGTTAACATGAATTGGTGGCCAACCAGTTGAACACCCATTCATCACTATCGGTCAATTGGCCTCAATCATCTACTTTACAATTATCCTTATTATT????????????????????????????????????????????? Callosciurus_erythraeus_1 ???????????????????????????CTAATCAAAATTATTAATCACTCGTTTATTGACCTTCCCACCCCCTCCAACATCTCAGCATGATGAAACTTCGGCTCTCTCCTGGGCATCTGCCTAATTATTCAAATCTTAACTGGACTTTTCCTGGCCATACACTACACATCAGACACCCTTACCGCTTTCTCCTCCGTCACTCATATCTGCCGAGACGTCAACTATGGCTGACTTATCCGCTATATACATGCCAACGGTGCCTCCATATTCTTCATTTGCCTGTTCCTGCATGTAGGCCGCGGGTTATACTACGGTTCCTACCTCTATTTTGAAACATGAAACATCGGAGTTGTCCTCCTGCTCACAGTTATAGCCACAGCATTCATAGGCTACGTCCTTCCCTGAGGACAAATATCTTTCTGAGGTGCCACCGTCATTACCAACCTCCTATCCGCCATCCCGTATATGGGAACAAGTCTAGTAGAATGAATTTGAGGGGGCTTCTCAGTCGACAAAGCTACCCTCACCCGATTCTTTGCATTCCACTTCGTTCTACCCTTTATTATCGCAGCCCTAGCTATAGTCCACCTGCTATTCCTTCACGAAACAGGGTCAAACAACCCAGCAGGCCTAATCTCTGACTCTGACAAAATCCCTTTCCACCCTTACTATACAATCAAAGATATCCTGGGCCTATTGCCCCTTTTAATAATCTTTATAATACTAATCCTATTTTCCCCCGACCTCCTAGGAGATCCTGACAATTATACCCCCGCCAATCCCCTAAACACACCCCCTCACATTAAACCTGAATGGTATTTTCTTTTCGCCTACGCTATCCTTCGTTCTATCCCAAATAAACTAGGAGGCGGCCTTGCATTAGTATTCTCCATCCTAATTCTCGTACTTCTACCTATCCTCCACACATCAAAGCAACGAAGCATAATATTCCGACCCCTAAGCCAGTGTCTCTTTTGAATCCTAGTGGCTGATCTCTTCACCCTAACCTGAATCGGAGGCCAGCCTGTAGAACATCCCTTCATTACAATCGGCCAGCTAGCCTCCATCCTCTATTTTTCCCTCATCCTCCTAATAATACCTATCGCC????????????????????????????????? Callosciurus_erythraeus_2 ???????????????????????????CTAATCAAAATTATTAATCACTCGTTTATTGACCTTCCCACCCCCTCCAACATCTCAGCATGATGAAACTTCGGCTCTCTCCTGGGCATCTGCCTAATTATTCAAATCTTAACTGGACTTTTCCTGGCCATACACTACACATCAGACACCCTTACCGCTTTCTCCTCCGTCACTCATATCTGCCGAGACGTCAACTATGGCTGACTTATCCGCTATATACATGCCAACGGTGCCTCCATATTCTTCATTTGCCTGTTCCTGCATGTAGGCCGCGGGTTATACTACGGTTCCTACCTCTATTTTGAAACATGAAACATCGGAGTTGTCCTCCTGCTCACAGTTATAGCCACAGCATTCATAGGCTACGTCCTTCCCTGAGGACAAATATCTTTCTGAGGTGCCACCGTCATTAACAACCTCCTATCCGGCATCCCGTATATGGGAACAAGTCTAGTAGAATGGATTTGAGGGGGCTTCTCAGTCGACAAAGCTACCCTCAACCGATTCTTTGCATTCCACTTCGTTCTACCCTTTATTATCGCAGCCCTAGCTATAGTCCACCTGCTATTCCTTCACGAAACAGGGTCAAACAACCCAGCAGGCTTAATCTTGGACTTTGACAAAATCCCTTTCCACCCTTACTATACAATCAAAGATATCCTGGGACTATTAGCCCTTTTAATAATCTTTATAATACTAATCCTTTTTTCCCCCGACCTCCTAGGAGATCCTGACAATTATACCCCCGCCAATCCCCTAAACACACCCCCTCACATTAAACCTGAATGGTATTTTCTTTTCGCCTACGCTATCCTTCGTTCTATCCCAAATAAACTAGGAGGCGGCCTTGCATTAGTATTCTCCATCCTAATTCTCGTACTTCTACCTATCCTCCACACATCAAAGCAACGAAGCATAATATTCCGACCCCTAAGCCAGTGTCTCTTTTGAATCCTAGTGGCTGATCTCTTCACCCTAACCTGAATCGGAGGCCAGCCTGTAGAACATCCCTTCATTACAATCGGCCAGCTAGCCTCCATCCTCTATTTTTCCCTCATCCTCCTAATAATACCTATCGCC????????????????????????????????? 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Cynomys_parvidens 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Marmota_caudata_aurea 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Marmota_flaviventris_luteola 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Marmota_flaviventris_obscura 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Marmota_himalayana_robusta 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Marmota_marmota_marmota_AF143929 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Marmota_marmota_marmota_AF143930 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Marmota_menzbieri_zachidovi 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Marmota_monax_monax 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Marmota_monax_ochracea 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Marmota_olympus 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Sciurus_aberti_barberi 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Sciurus_aberti_chuscensis 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Sciurus_carolinensis 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Spermophilopsis_leptodactylus 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Spermophilus_adocetus 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Spermophilus_annulatus 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Spermophilus_armatus 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Spermophilus_atricapillus 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Spermophilus_beechyi 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Spermophilus_beldingi_creber 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Spermophilus_brunneus_brunneus 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Spermophilus_citellus 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Spermophilus_citellus_relictus 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Spermophilus_columbianus_columbianus 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Spermophilus_columbianus_ruficaudus 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Spermophilus_dauricus 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Spermophilus_elegans_elegans 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Spermophilus_erythrogenys_AF157855 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Spermophilus_erythrogenys_AF157875 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Spermophilus_franklinii_AF157893 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Spermophilus_franklinii_AF157894 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Spermophilus_fulvus ATGACAAACACTCGTAAAACCCACCCTTTAATCAAGATCATTAATCACTCTTTCATTGATCTACCAGCACCTTCCAATATCTCTGCATGATGAAACTTTGGATCCCTACTAGGCCTATGCCTGATCATTCAAATCCTTACCGGACTATTTCTAGCAATACACTATACATCTGATACAATAACAGCATTTTCATCAGTTACCCATATTTGCCGAGACGTAAATTATGGTTGACTTATTCGCTATATACATGCTAACGGTGCATCTATATTCTTCATCTGCCTCTTCCTTCATGTAGGCCGAGGAATATATTATGGTTCATATACTTACTTTGAAACATGGAATATTGGAGTTATCCTCCTATTTGCAGTAATAGCCACAGCTTTCATAGGCTATGTTCTTCCCTGAGGCCAAATATCATTCTGAGGGGCAACTGTAATTACCAATCTCTTATCTGCCATCCCTTACATTGGTACAACTTTAGTTGAATGAATCTGAGGTGGCTTCTCAGTAGATAAAGCTACCCTAACACGATTTTTCGCATTCCACTTTATTCTTCCATTTATTATTGCAGCCTTAGTCATAGTCCATCTTCTTTTTCTCCATGAAACCGGATCAAATAACCCTTCAGGTCTTATTTCTGACTCAGATAAAATCCCCTTTCACCCATATTATACAATTAAAGACATTCTTGGAGTTCTTCTTCTTGTCCTAACCCTTATAGCACTAGTTCTTTTCTCACCTGACCTTCTTGGAGACCCCGACAACTACACACCCGCAAACCCCTTAAGCACTCCACCCCATATTAAACCAGAATGATACTTCTTATTTGCCTACGCTATTCTCCGATCTATTCCCAATAAACTAGGAGGCGTCTTAGCCCTAGTCTTCTCAATTCTTATCTTAATACTCTTTCCATTACTTCATTTATCCAAACAACGTAGCATAATATTTCGACCACTAAGTCAGTGTGTATTCTGAATTCTAGTAGCAGATCTATTTACATTAACCTGAATCGGAGGCCAACCTGTTGAACATCCATTTATCATTATTGGCCAACTAGCATCTATCCTATATTTTGCTATTATCCTTTTAATCTTACCAACTGTTAGCATAATCGAAAACAAACTTCTTAAATGAAGA Spermophilus_lateralis_trepidus_AF157887 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Spermophilus_lateralis_trepidus_AF157950 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Spermophilus_madrensis_AF157946 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Spermophilus_major_AF157903 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Spermophilus_major_AF157905 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Spermophilus_mexicanus_mexicanus 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Spermophilus_mexicanus_parvidens 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Spermophilus_mohavensis 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Spermophilus_musicus ATGACAAACACTCGTAAAACTCACCCTTTAATTAAAATTATTAACCACTCATTTATCGATTTACCAGCACCATCCAATATTTCTGCATGATGAAACTTTGGATCTTTGCTTGGCCTATGCCTAATTATTCAAATCCTTACTGGGTTATTTCTAGCAATACACTATACATCCGACACCATAACAGCCTTTTCATCAGTTACTCACATTTGCCGAGACGTAAATTACGGCTGACTTATCCGTTATATTCATGCTAACGGTGCATCCATATTCTTTATCTGCCTCTTTCTTCACGTAGGCCGAGGATTATACTATGGTTCATACACTTACTTTGAAACATGAAATATTGGAGTTATCCTTCTATTTGCAGTTATAGCCACAGCTTTCATGGGCTATGTTCTTCCCTGAGGCCAAATATCATTCTGAGGAGCAACCGTAATTACTAACCTTCTATCTGCCATCCCATATATCGGCACAACTTTAGTAGAATGAATCTGAGGTGGCTTTTCAGTAGATAAAGCCACTCTAACACGATTTTTCGCATTCCACTTTATCCTTCCATTTATTATCGCAGCCTTAGTCATAATTCATCTTCTCTTCCTCCACGAAACCGGATCAAACAATCCTTCAGGCTTAATTTCTGATTCAGATAAAATCCCTTTTCATCCATACTACACCATTAAAGACGTCCTCGGAGTCCTTCTCCTCGTACTAACCCTGATAATTCTAGTCCTATTCTCACCTGATCTTTTAGGAGACCCCGACAATTACACACCTGCAAACCCTTTAAGCACCCCACCCCATATTAAGCCAGAATGATATTTCTTATTCGCCTACGCTATTCTCCGATCTATCCCCAACAAATTAGGAGGTGTTTTAGCCCTAATCTTCTCAATTCTTATTTTAATACTCTTCCCACTACTTCACCTATCTAAACAACGTAGCATGATATTTCGACCATTAAGTCAGTGTGTATTCTGAGTCCTAGTAGCAGATCTATTTACATTAACCTGAATCGGAGGACAACCCGTCGAACATCCATTTATTATCATTGGCCAACTAGCATCAGTCCTGTACTTTACTATTATTCTTCTAATTTTACCAACTGTCAGCATAATCGAAAACAAACTTCTTAAATGAAGA Spermophilus_pallidicauda 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Spermophilus_parryi ATGACAAACATCCGCAAAACTCACCCTTTAATTAAAATCGTCAACCACTCCTTTATCGACTTACCTGCACCTTCCAACATTTCTGCATGATGAAACTTTGGGTCTCTTCTAGGCCTCTGCCTAGCAATCCAAATCCTCACTGGATTATTTCTAGCAATACATTATACATCTGATACTATAACAGCCTTTTCATCAGTTACTCACATTTGCCGAGATGTAAATTATGGCTGACTAATCCGCTATATACATGCTAACGGCGCATCTATGTTTTTTATCTGCCTCTTTCTTCATGTAGGCCGAGGATTATACTACGGCTCATATATTTACTTTGAAACATGAAACATTGGAGTCATCCTCCTGTTCGTAGTAATAGCCACAGCTTTCATGGGCTATGTTCTTCCCTGAGGTCAAATGTCATTCTGAGGAGCAACTGTAATTACTAACCTTTTATCCGCTATTCCGTACATTGGAGC??CC?TAGTAGAATGAATTTGAGGTGGCTTCTCAGTAGATAAAGCTACTCTAACACGATTTTTCGCATTCCACTTTATTCTTCCATTTATTATCGCAGCTCTAACTATAGTTCACCTTCTTTTCCTTCACGAAACCGGATCAAACAACCCCTTAGGCCTTGTTTCTGATTCAGATAAAGTCCCCTTTCACCCATACTACACCATCAAAGATATCCTTGGAGTCCTTCTTCTTATTTTAGCCCTAATAACTCTAATCCTATTTTCACCTGATCTTCTAGGAGACCCTGATAATTATACACCCGCAAACCCCCTAAGCACTCCACCTCACATCAAACCAGAATGATATTTCCTATTTGCCTACGCTATCCTCCGATCTATCCCCAACAAACTAGGGGGTGTATTAGCCTTAGCGTTCTCAATTCTCATTCTAATACTTTTCCCACTACTTCATCTATCTAAACAACGAAGCATAATATTTCGACCACTAAGTCAATGCGTATTTTGAATTCTAGTAGCAGACCTATTTACATTAACCTGAATTGGAGGACAACCCGTTGAATACCCATTTATTGTTATTGGCCAACTAGCATCAATCCTATACTTCACCATTATCCTCCTAATCTTACCAACCGCCAGCCTAATCGAAAATAAACTTCTTAAATGAAGA Spermophilus_parryi_kenicotti ATGACAAACATCCGCAAAACTCACCCTTTAATTAAAATCGTCAACCACTCCTTTATCGACTTACCTGCACCCTCCAACATCTCTGCATGATGAAATTTTGGGTCTCTTCTAGGCCTCTGCCTAGCAATCCAAATTCTCACTGGATTATTTCTAGCAATACATTATACATCTGATACTATAACAGCCTTTTCATCAGTTACTCACATTTGCCGAGATGTAAATTATGGTTGACTAATCCGCTATATACATGCTAACGGCGCATCTATATTTTTTATCTGCCTCTTTCTTCATGTAGGCCGAGGACTGTACTATGGCTCATACACTTACTTTGAAACATGAAACATTGGAGTCATTCTCCTGTTCGTAGTAATAGCCACAGCTTTCATGGGCTATGTTCTTCCCTGAGGTCAAATGTCATTCTGAGGAGCAACTGTAATTACTAACCTTTTATCCGCTATTCCATACATTGGAACAACCCTAGTAGAATGAATTTGAGGCGGCTTCTCAGTAGATAAAGCTACTCTAATACGATTTTTCGCATTCCACTT?????TTCCATTTATTATCGCAGCTCTAGTCATAGTTCACCTTCTTTTCCTTCACGAAACTGGATCAAACAACCCTTCAGGCCTTATTTCTGATTCAGATAAAATCCCCTTTCACCCGTACTACACCATCAAAGATATCCTTGGAGTCCTTCTTCTTATTTTAGCCCTAATAACTCTAGTCCTGTTTTCACCTGATCTTCTAGGAGACCCTGATAATTATACACCCGCAAACCCCCTAAGCACCCCACCTCACATCAAACCAGAATGATATTTCCTATTTGCCTACGCTATCCTCCGATCTATCCCCAACAAACTAGGAGGTGTATTAGCCTTAGTACTCTCAATTCTCATCCTAATACTTTTCCCACTACTCCATTTATCTAAACAACGAGGCATAATATTTCGACCACTAAGTCAATGCATATTCTGAATTCTAGTAGCAGACCTATTTACATTAACCTGAATTGGAGGACAACCCGTTGAATACCCATTTATCATTATTGGCCAACTAGCATCAATCCTATATTTCACCATTATTCTCCTAATCTTACCAACCGTCAGCCTAATTGAAAATAAACTTCTTAAATGAAGA Spermophilus_parryi_plesius 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Spermophilus_perotensis ATGACAAACACTCGCAAAACTCACCCCCTAATCAAAATCATCAATCATTCTTTTATCGATTTACCCGCACCTTCCAACATTTCCGCATGGTGAAACTTCGGATCCCTATTAGGTCTCTGCCTGGCTATTCAAATCCTCACGGGATTATTTCTAGCAATACATTACACATCTGACACCATAACAGCCTTTTCATCAGTCACACATATTTGTCGAGATGTTAATTACGGTTGACTCATCCGCTATATACATGCTAATGGTGCATCCATATTTTTTATTTGCCTCTTCCTTCATGTAGGCCGAGGATTATATTACGGCTCATATACTTACTTTGAAACATGAAACATCGGAGTTATTCTTCTAT?CGCAGTCATAGCCACAGCTTTCATAGGCTACGTCCTCCCCTGAGGCCAAATATCATTCTGAGGGGCTACCGTAATTACTAATCTTTTATCTGCCATCCCATACATCGGTACAACCTTAGTAGAATGAATTTGAGGCGGATTCTCAGTAGACAAAGCCACCCTAACACGATTCTTCGCATTCCACTTTATTCTCCCATTTATTATTACAGCCCTAGTCATAGTCCACCTCCTTTTCCTCCATGAAACTGGATCAAACAACCCTTCAGGCCTCGTTTCTGACTCAGATAAAATTCCCTTTCACCCATACTACACTATCAAAGATATTCTCGGAATCCTCCTCCTCATTATAGCCCTAATGACTCTAATCCTATTTTCACCTGACCTTCTAGGGGACCCTGACAACTATACACCCGCAAACCCCCTAAGCACTCCGCCTCATATTAAACCAGAATGATACTTCCTATTTGCCTATGCCATCCTACGATCTATTCCCAACAAACTGGGAGGAGTCCTAGCTCTAGTATTTTCAATCCTTATTTTAATACTCTTTCCACTACTTCATCTATCCAAACAACGTAGCATGATATTCCGACCATTAAGCCAATGCATATTCTGAATTCTAGTAGCAGACCTATTTACATTAACTTGAATCGGAGGACAACCTGTTGAATATCCATTTATTGTTATCGGCCAATTAGCATCAATTCTTTATTTCACCATTATCCTTTTAATCTTACCAACCGTTAGCCTAATTGAAAACAAGCTTCTTAAATGAAGA Spermophilus_pygmaeus_AF157907 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Spermophilus_pygmaeus_AF157910 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Spermophilus_relictus_AF157867 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Spermophilus_relictus_AF157876 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Spermophilus_richardsoni 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Spermophilus_saturatus 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Spermophilus_spilosoma_marginatus_AF157911 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Spermophilus_suslicus_AF157895 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Spermophilus_townsendi_idahoensis 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Spermophilus_townsendi_mollis 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Spermophilus_townsendi_townsendi 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Spermophilus_townsendi_vigilis 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Spermophilus_undulatus_AF157906 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Spermophilus_variegatus 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Spermophilus_washingtoni 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Spermophilus_xanthoprymnus 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Tamias_bulleri 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Tamias_siskiyou ATGACAAACATCCGCAAAACCCATCCTCTAATTAAAATTATCAACCACTCATTCATTGACTTACCTGCACCATCCAACATCTCTGCATGATGAAATTTTGGATCCCTATTAGGCATTTGCCTAATTATTCAAATTCTTACTGGATTATTCCTAGCAATACACTACACATCTGACACAATAACAGCCTTCTCATCTGTTACCCATATCTGCCGAGATGTAAATTACGGTTGACTTATCCGATACATACACGCCAACGGAGCCTCCATATTCTTTATTTGCCTATTCCTTCATGTAGGCCGAGGACTTTACTATGGATCATACACTTACTTCGAAACATGAAACATTGGAGTAATTCTTTTATTCGCCGTTATAGCTACCGCATTCATAGGTTACGTTCTCCCATGAGGACAAATATCCTTTTGAGGTGCCACCGTCATCACAAACCTTCTATCAGCTATTCCTTATATCGGAACAACACTAGTAGAATGAATCTGAGGAGGCTTTTCAGTAGACAAAGCTACCCTAACACGATTCTTCGCATTTCACTTTATCCTTCCATTTATTATTACAGCATTAGTCATAGTCCACCTACTTTTTCTTCATGAAACCGGATCTAACAATCCCTCAGGACTAATCTCTGATTCTGATAAAATCCCATTCCATCCATATTACACTATTAAAGATATCCTAGGTGTCCTACTTCTAATCTTAATCCTAATAATCCTAGTCCTATTCTCCCCAGATCTCCTTGGAGACCCAGATAATTATACCCCTGCCAATCCACTAAATACTCCACCACATATTAAGCCAGAATGATACTTCCTATTTGCCTACGCCATCCTACGATCTATTCCTAATAAACTAGGAGGAGTATTAGCCCTAGTCCTCTCTATCCTTATCCTAATACTTTTTCCCATCCTCCATATATCTAAACAACGTAGCATAATATTCCGTCCACTCAGCCAATGCATATTCTGAATCTTAGTAGCTGATTTATTTACACTTACTTGAATTGGAGGTCAACCAGTCGAATACCCATTCATTATTATTGGCCAATTAGCATCAATCCTTTACTTTATAATCATCCTTCTCATTTTACCAACCATCAGCCTATTTGAAAATAAACTCCTTAAATGATAA Tamias_sonomae ??????????????????????ACCCCCTCATTAAAATTATTAACCACTCATTCATTGACCTACCTGCACCATCCAACATCTCTGCATGATGAAATTTCGGATCCCTATTAGGTATTTGCCTAATCATTCAAATTCTTACTGGATTATTCCTAGCAATACACTACACATCTGACACAATAACAGCCTTCTCATCTGTCACTCATATCTGCCGAGATGTAAACTATGGTTGACTTATCCGTTACATACACGCTAACGGAGCTTCCATATTCTTTATTTGCCTATTCCTTCATGTAGGCCGAGGACTTTATTATGGGTCATACACCTACTTCGAAACATGAAACATTGGAGTAATTCTTTTATTCGCCGTTATAGCTACCGCATTCATAGGTTACGTTCTACCATGAGGACAAATATCCTTTTGAGGTGCTACTGTCATTACAAACCTCCTATCAGCTATTCCATACATCGGAACAACACTAGTAGAATGAATCTGAGGAGGCTTCTCAGTAGACAAAGCCACTTTAACACGATTCTTTGCATTTCACTTCATTCTTCCATTTATTATCACAGCATTAGTTATAGTTCACCTACTTTTCCTCCATGAAACCGGATCTAATAATCCTTCCGGACTAATCTCTGATTCCGACAAAATTCCATTCCACCCATATTACACTATTAAAGACATCCTAGGTGTCCTCCTCTTAATCCTAATCCTAATAATATTAGTCCTATTCTCCCCTGATCTCCTTGGAGACCCAGACAATTACACCCCTGCCAATCCACTTAATACTCCACCACACATTAAGCCAGAATGATACTTTCTATTTGCCTACGCCATTCTACGATCCATTCCCAACAAACTAGGAGGAGTACTAGCCCTAGTCCTCTCTATCCTCATTCTAATATTATTCCCCATCCTACACGTATCTAAACAACGTAGCATAATATTCCGCCCACTTAGCCAATGCGTATTCTGAATCTTAGTAGCTGATCTATTTACACTTACCTGAATCGGAGGACAACCAGTCGAATACCCATTCATTATTATCGGCCAATTAGCATCCATCCTCTATTTTATAATTATTCTCCTCATTTTACCAGCCATCAGCCTATTCGAAAACAAACTCCTTAAATGATAA Tamias_striatus ATGACAAACATCCGCAAAACCCACCCTCTTATTAAAATTATTAACCACTCATTTATTGACTTACCTACACCATCCAATATTTCTGCATGATGAAACTTCGGATCACTCTTAGGCTTATGTCTAATCATTCAAATTATTACTGGGCTATTCCTAGCAATACACTATACATCAGATACCGCAACAGCCTTTTCATCCGTCACTCATATCTGCCGAGACGTAAATTACGGCTGACTAATCCGCTATATACATGCTAATGGAGCCTCAATATTCTTCATCTGCCTATTCCTTCACGTAGGGCGAGGACTTTATTATGGATCTTATACTTATTTCGAAACCTGAAACATTGGTGTTATTCTCCTATTTGCTGTCATAGCAACCGCATTTATAGGCTACGTTCTTCCCTGAGGACAAATATCCTTCTGAGGAGCAACCGTAATTACTAACCTCCTATCTGCAATTCCATATATTGGAACAACACTAGTCGAATGAATCTGAGGAGGATTCTCAGTAGATAAAGCTACCCTCACACGGTTCTTCGCATTTCACTTTATTCTCCCATTTATCATTACAGCACTAGTAGCAGTCCACCTACTTTTTCTCCACGAAACTGGATCTAACAACCCCTCAGGACTAATTTCCGACTCCGATAAAATTCCTTTCCATCCATATTATACCATTAAAGATGTCTTAGGAGTATTATTACTACTATTGCTCCTAATAATTCTAGTCCTATTCTCCCCAGACCTATTAGGAGACCCAGATAATTATACTCCCGCTAACCCCCTTAATACCCCACCACACATTAAGCCAGAATGATATTTCCTATTCGCTTACGCTATTCTACGATCAATCCCCAATAAACTAGGAGGAGTCCTTGCGCTAGTTCTTTCAATCCTAATCCTTACACTTTTTCCCATTCTTCATATATCCAAACAACGTAGCATAATATTCCGCCCACTAAGCCAATGCATTTTCTGAATTTTAGTAGCTGATTTATTCACTTTAACCTGAATTGGAGGTCAGCCAGTTGAATACCCATTCATTGCTATTGGTCAACTAGCATCCATTCTATACTTTTCAATTATCCTTCTAATTCTACCAGCTATTAGCCTATTTGAAAACAAACTCCTAAAATGATA? 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Tamiasciurus_douglasii ATGACAAACATCCGCAAAACCCACCCTCTAATCAAAATTGTTAACCACTCTTTTATTGACCTCCCTGCTCCCTCTAACATCTCAGCATGATGGAACTTTGGTTCTCTTCTCGGACTCTGTCTCGCCATTCAAATCTTGACAGGCCTATTCCTAGCTATACACTACACCTCTGACACAATAACAGCATTCTCCTCAGTCACCCATATTTGCCGAGACGTAAACTATGGTTGACTAATTCGCTACATACATGCTAATGGAGCATCTATATTTTTTATCTGCCTATTCCTCCACGTAGGTCGAGGCCTTTACTACGGCTCCTACACCTACTTCGAAACCTGGAACATTGGTGTCATCCTTCTATTTGCTGTAATAGCTACCGCATTTATAGGATATGTCCTCCCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Tamiasciurus_hudsonicus ???????????????????????????????????????????????????????TTGACCTCCCCGCTCCCTCTAACATCTCAGCATGATGAAACTTTGGTTCGCTTCTCGGACTCTGTCTCGCTATTCAAATCTTGACAGGCCTATTCCTAGCTATACACTACACCTCTGACACAATAACAGCATTCTCCTCAGTCACCCATATTTGCCGAGACGTAAACTATGGTTGACTAATTCGCTACATACATGCTAATGGAGCATCTATATTTTTTATTTGCCTATTCCTCCACGTGGGACGAGGCCTTTACTACGGCTCCTACACCTACTTCGAAACCTGAAACATTGGTGTCATCCTTCTATTTGCTGTAATAGCTACTGCATTTATAGGATATGTTCTCCCTTGAGGTCAAATATCCTTCTGAGGGGCCACAGTCATCACAAACCTCCTCTCAGCTATCCCATATATCGGCACCAGCCTAGTAGAATGAATTTGAGGGGGATTCTCAGTTGACAAAGCCACCCTAACTGGATTCTTCGCATTCCATTTTATCTTACCTTTTATCGTTGCAGCCCTAGTCATAGTACACTTACTATTCCTGCACGAAACAGGATCAAACAATCCCTCTGGACTAATTTCCGACTCAGATAAAATCCCCTTCCACCCCTACTACACAATTAAGGACATCTTAGGAGTCCTACTCCTTATTCTTCTATTTATAATTCTAGTCTTATTCTCTCCAGACCTCCTAGGCGACCCAGATAACTACACGCCCGCTAATCCCCTTAACACCCCTCCACACATCAAGCCAGAATGATATTTCCTCTTTGCCTATGCCATCTTACGATCCATTCCTAATAAACTAGGCGGAGTCCTGGCCCTAGTATTTTCTATTCTTATCCTCATCCTATTTCCCATTCTCCATGTATCAAAACAACGCAGCATAATGTTCCGTCCCCTCAGTCAGTGCTTATTCTGAATCTTAGTAGCAGATCTCTTTACCCTAACCTGAATCGGAGGACAGCCAGTAGAATACCCATTCATTACCATTGGCCAACTAGCATCCATCCTATACTTTGCCATCATTCTTTTAGCC????????????????????????????????????????????? Tamiasciurus_mearnsi ATGACAAACATCCGCAAAACCCACCCTCTAATCAAAATTGTTAACCACTCTTTTATTGACCTCCCTGCTCCCTCTAACATCTCAGCATGATGGAACTTTGGTTCTCTTCTCGGACTCTGTCTCGCCATTCAAATCTTGACAGGCCTATTCCTAGCTATACACTACACCTCTGACACAATAACAGCATTCTCCTCAGTCACCCATATTTGCCGAGACGTAAACTATGGTTGACTAATTCGCTACACACATGCTAATGGAGCATCTATATTTTTTATTTGCCTATTCCTCCACGTAGGTCGAGGCCTTTACTACGGCTCCTACACCTACTTCGAAACTTGGAACATTGGTGTCATCCTTCTATTTGCTGTAATAGCTACCGCATTTATAGGATATGTTCTCCCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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