#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 18, 2025; 21:25 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Struck T.H., Paul C., Hill N., Hartmann S., Hösel C., Kube M., Lieb B., Meyer A., Tiedemann R., Purschke G., & Bleidorn C. 2011. Phylogenomic analyses unravel annelid evolution. Nature, 471: 95-98. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10986] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=39; TAXLABELS Alvinella_pompejana Arenicola_marina Bugula_neritina Capitella_teleta Cerebratulus_lacteus Chaetopterus_variegatus Cirratulus Crassostrea_gigas Eisenia_andrei Eisenia_fetida Eulalia_clavigera Eurythoe_complanata Flabelligera_affinis Glycera_tridactyla Haementeria_depressa Helobdella_robusta Hirudo_medicinalis Lanice_conchilega Lottia_gigantea Lumbricus_rubellus Lumbrineris_zonata Malacoceros_fuliginosus Myzostoma_cirriferum Myzostoma_seymourcollegiorum Onuphis_iridescens Ophelia_limacina Pectinaria_koreni Perionyx_excavatus Platynereis_dumerilii Pomatoceros_lamarckii Ridgeia_piscesae Scoloplos_armiger Sipunculus_nudus Sthenelais_boa Terebratalia_transversa Themiste_lageniformes Tubifex_tubifex Typosyllis Urechis_caupo ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M7031] TITLE Dataset_33; LINK TAXA = Taxa; DIMENSIONS NCHAR=47953; FORMAT DATATYPE=Protein SYMBOLS= "A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y" MISSING=? 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Hirudo_medicinalis 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Pectinaria_koreni 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