#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 09, 2025; 13:39 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Zhang S., Soltis D., Li D., Yang Y., & Yi T. 2011. Multi-gene analysis provides a well-supported phylogeny of Rosales. Molecular Phylogenetics and Evolution, 60(1): 21-8. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11237] BEGIN TAXA; TITLE Untitled_Taxa_Block; DIMENSIONS NTAX=38; TAXLABELS Albizia Alnus Anisophyllea Barbeya Begonia Boehmeria Broussonetia Cannabis Ceanothus Celtis Coriaria Cucumis Cudrania Datisca Debregeasia Dirachma Dryas Elaeagnus Ficus Filipendula Gouania Hippophae Hovenia Juglans Morus Myrica Neillia Pilea Polygala Quercus Quillaja Rhamnus Sanguisorba Spiraea Stylobasium Trema Ulmus Zelkova ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M14654] TITLE Rosales_12_loci; LINK TAXA = Untitled_Taxa_Block; DIMENSIONS NCHAR=17706; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Anisophyllea 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Begonia 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Cannabis 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Filipendula 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Hippophae TGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGTAAGTATGAACTAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTGTTTGATGGTATCTGCTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCAACAAACCCCGAC-TTC-TGGAAGGGATGCATTTATTGGATAAAAGGTCGACGCGGGCTC-TGCCCGTT-GCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCACGGCCATTGAGCCGGCGACGCATCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACTATGGTGGTGACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCTCA-TAGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGACCTTGGGTTGAGTCGATCGGTCCGCCTC--TGGTGTGCACCGGTCGTCTCGTCCCTTCTACCGGCGATGCGCTCCTGGCCTTAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGTGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGGATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTGTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCGGCGGATGTTGCTTATAGGACTCCGCCGGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGATAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGCTATGCGGAGGAT-CCCTCCGTGGCCAGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCTTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGTATTCAACGAGTTTATAGCCTTGGCCGACAGGCCCGGGTAATC-TTTGAAATTTCATCGTGATGGGGATAGATCATTGCAATTATTGGTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGGTCCGGTGAAGTGTTCGGATCGCGGCGACGTGGGCGGTTCGCTGCCCGCGACGTCGCGAGAAGTCCACTGAACCTTATCATTTAGAGGATTCCCC-TAGTAACGGCGAGCGAACCGGGA--ACAGCCCAGGTTGAGAATCGAATG-CCT----TCGGTGTTCGAATTGTAGTCTGAAGAAGCGTCCTCAGCGACGGACCGGGCTCAAGTCCCCTGGAAGGGGGCGCCAGAGAGGGTGAGAGCCCCGTCGTGCCCGGACCCTGTCGCACCACGAGGCGCTGTCGGCGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCAAATCGGGCGGTAAATTCTGTCCAAGGCTAAATACGGGCGAGAGACCGATAGCAAACAAGTACCGCGAGGGAAAGATGAAAAGGACTTTGAAAAGAGAGTCAAAGAGTGCTTGAAATTGTCGGGAGGGAAGCGGATGGGGGCCGGCGATGCGCCTCGGTCGGATGTGGAACGGTGATG-AACCGGTCCGCCGATCGACTCGGGGCGTGGACCGATGCGGATTGTGACGGCGGCCCAAGCCTGAGTTGTTGATATGCTCGTGGAGATGTCGTCGTCACGATTGTGGTAGGCAGCACGCGCCAACTTGGCGTGCTTTG-GCAACTGCGTGCTCCAGGCATCGGCCTGTGGGCTCCCCATTCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTGACATGTGTGCGAGTCAACGGGCCAGTAAACCCGTAAGGCGTAAGGAAGCTGACTGACGGGATCCCTT-TGTGGGTTGCACCGCCGACCGACCTTGATC-TTTTGAGAAGGGTTCGAGTGAGAGCATGCCTGTCGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAGCGGGGCGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCCCGCAGCGATACTGACGTGCAAATCGTTCGTCTGACTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCGTCTAGTAGCTGGTTCCCTCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCTGGAGCTCGCAAATGAGTTCTATCGGGTAAAGCCAATGATTAGAGGCATCGGGGGCGCAACGCCCTCGACCTATTCTCAAACTTTAAATAGGTAGGACGGTGTGGCTGCTTTG-TTGAGCCACGCCACGGAATCGAGAGCTCCAAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGGAAGCCGGGTTACGGTGCCCAACTACGCGCTAACCTAGAACCCACAAAGGGTGTTGGTCGATTAAGACAGCAGGACGGTGGTCATGGAAGTCGAAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACCTGCCGAATCAACTAGCCCCGAAAATGGATGGCGCTTAAGCGCGTGACCTATACCCGGCCGTCGGGGCAAGTGCCAGGCCTCGATGAGTAGGAGGGCGTGGCGGTCGCTGCAAAACCTGGGGCGTGAGCCCGGGCGGAGCGGCCGTCAGTGCAGATCTTGGTGGTAGTAGCAAATATTCAAATGAGAACTTTGAAGGCCGAAGAGGGGAAAGGTTCCATGTGAACGGCACTTGCACATGGGTTAGTCGATCCTAAGAGACGGGGGAAGCCCGTCTGATAGCGCT-GTTAGCGCGAGCTTCGAAAGGGAATCGGGTTAAAATTCCTGAACCGGGATGTGGCGGTTGACGGCAACGTTAGGGAGTCCGGAGACGTCGGCGGGGGCCTCGGGAAGAGTTATCTTTTCTGTTTAACAGCCTGCCCACCCTGGAAACGGCTCAGCCGGAGGTAGGGTCCAGCGGCTGGAAGAGCACCGCACTTCGCGTGGTGTCCGGTGCGCCCCCGGCGGCCCTTGAAAATCCGGAGGACCGAGTGCCTCCCACGCCCGTTCGTACTCATAACCGCATCAGGTCTCCAAGGTGAACAGCCTCTGGTCGATGGAACAATGTAGGCAAGGGAAGTCGGCAAAATGGATCCGTAACCTCGGGAAAAGGATTGGCTCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCTGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTTCCGCGGCGAGAGCGGGTCGCTGCGTGCCGGCCGGGGGACGGATTGGGAACGGCCCCTTC--GGGGGCC-TTCCCCGGGCGTCGAACAGTCAACTCAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTTTAATTAAAACAAAGCATTGCGATGGTCCCTGCGGATGTTTACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCTGTCTACTATCCAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAGAATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTTGAGCTTGACTCTAGTCCGACTTTGTGAAATGACTTGAGAGGTGTAGTATAAGTGGGAGCTCC----GGCGAAAGTGAAATACCACTACTTTTAACGTTATTTTACTTATTCCGTGAATCGGAGGCGGGGCATTGCCCCTCTTTTTGGACCCAAGGCTTGCTTCG-GCGGGCCTATCCGGGCGGAAGACATTGTCAGGTGGGGAGTTTGGCTGGGGCGGCACATCTGTTAAAAGATAACGCAGGTGTCCTAAGATGAGCTCAACGAGAACAGAAATCTCGTGTGGAACAAAAGGGTAAAAGCTCGTTTGATTCTGATTTTCAGTACGAATACGAACCGTGAAAGCGTGGCCTATCGATCCTTTAGACCTTCGGAATTTGAAGCTAGAGGTGTCAGAAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATTGTGAAGCAGAATTCACCAAGTGTTGGATTGTTCACCCACCAATAGGGAACGTGAGCTGGGTTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGGCAGTGTCGCAATAGTAATTCAACCTAGTACGAGAGGAACCGTTGATTCGCACAATTGGTCATCGCGCTTGGTTGAAAAGCCAGTGGCGC-GAAGCTACCGTGCGCTGGATTATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAATCCGGGCTAGAAACGACGCGTGTGCTTGCCGCCCGTTTGCCGACCTGCAGTAGGGGCC--TCGG-CCCCCAAAGGCGCGTGTCGTTGGTGAAGCCCTCACGGCGGACTAGCTGTGAGGGCCGCCTTGAAGTGTAATTTCCATCGAGCGGCTGGTAGAATCCTTTGCAGACGA????CTCT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Stylobasium 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