#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 19, 2025; 5:29 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Katz L.A., Grant J.R., Parfrey L.W., Gant A., O'kelly C., Anderson O.R., Molestina R.E., & Nerad T. 2011. Subulatomonas tetraspora nov. gen. nov. sp. is a member of a previously unrecognized major clade of eukaryotes. Protist, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11336] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=89; TAXLABELS Acanthamoeba_castellanii Alexandrium_tamarense Allomyces_macrogynus Amastigomonas_bermudensis Amastigomonas_sp._ATCC_50062 Amoebidium_parasiticum Aplysia_californica Arabidopsis_thaliana Aureococcus_anophagefferens Bigelowiella_natans Blastocystis_hominis Branchiostoma_floridae Breviata_anathema Caenorhabditis_elegans Candida_albicans Capitella_capitata Capsaspora_owczarzaki Chlamydomonas_reinhardtii Chondrus_crispus Ciona_intestinalis Cryptosporidium_parvum Cyanophora_paradoxa Dictyostelium_discoideum Dimorpha_sp Diplonema_papillatum Drosophila_melanogaster Eimeria_tenella Emiliania_huxleyi Encephalitozoon_cuniculi Entamoeba_histolytica Entodinium_caudatum Euglena_gracilis Euglena_longa Gallus_gallus Giardia_lamblia Ginkgo_biloba Glaucocystis_nostochinearum Guillardia_theta Hartmannella_vermiformis Heteromita_globosa Homo_sapiens Isochrysis_galbana Jakoba_libera Karena_brevis Leishmania_major Malawimonas_jakobiformis Mesostigma_viride Mnemiopsis_leidyi Monosiga_brevicollis Naegleria_gruberi Nematostella_vectensis Nyctotherus_ovalis Oryza_sativa Oscarella_carmela Paramecium_caudatum Pavlova_lutheri Perkinsus_marinus Phaeodactylum_tricornutum Phanerochaete_chrysosporium Phreatamoeba_balamuthi Physarum_polycephalum Physcomitrella_patens Phytophthora_infestans Planomonas_micra Plasmodium_berghei Porphyra_yezoensis Prymnesium_parvum Reclinomonas_americana Reticulomyxa_filosa Saccharomyces_cerevisiae Sawyeria_marylandensis Schistosoma_mansoni Schizosaccharomyces_pombe Seculamonas_ecuadoriensis Sphaeroforma_arctica Spironucleus_vortens Spizellomyces_punctatus Strongylocentrotus_purpuratus Subulatomonas_tetraspora Tetrahymena_thermophila Thalassiosira_pseudonana Theileria_parva Toxoplasma_gondii Trichomonas_vaginalis Trimastix_pyriformis Trypanosoma_brucei Ustilago_maydis Volvox_carteri Welwitschia_mirabilis ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M8462] TITLE 10_16_Sub_90_DNA; LINK TAXA = Taxa; DIMENSIONS NCHAR=1205; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Acanthamoeba_castellanii 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Alexandrium_tamarense 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Allomyces_macrogynus 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Amastigomonas_bermudensis 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Amastigomonas_sp._ATCC_50062 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Amoebidium_parasiticum 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Aplysia_californica 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Arabidopsis_thaliana 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Aureococcus_anophagefferens 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------------------CCATGCATGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCAGATGGCTCATTAAATCAGAAATAATTTCTTTGAT--GATACCCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTG--GGAGGTATTTATTAG-CCATTTCTGCCCTATCAGCTATTGACGGTAGTGTAGTGGACTACCGTGGCCGTAACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCC-GACACGGGAGGTAGTGACAAGAAATATCGTGACTGTGC-----TCGAAATGAGTAC----TAAATGCCTT-GCGAG-ATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAATGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATATCTACTTTGAAGAAATTCGAGTGTTCAAAGCAGGCATGGAATAATTGATAGGGACAGTTGGGGGTGCTGCTATTCCGCGGCCAGAGGTGAAATTCTCAGATTCCCGGAAGAGCAACTTATGCGAAAGCATTCACCAAGGATGTCTTCTTTAATCAAGAACGAAAGTAGGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTCTACCATAAACTATGCCGACTAGATCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGACACCACCAGAAGTGGAACTTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTTCCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGATTGAAGATCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCG-CCTTAGAGGGACCGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGTGTTACACTGACGC-TTCATCAAGCCGTGTTAGGGATAGATTATTGTAATTATTAGTCTTGAACGAGGAATTTCTAGTAAACGCGAGTCATCAACTCGCATTGATTACGTCCCTGTCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTTTGTACTTCTTGGGAAGTGATACAAAC--------- Blastocystis_hominis 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Branchiostoma_floridae 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Breviata_anathema 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Caenorhabditis_elegans 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Capitella_capitata 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Capsaspora_owczarzaki 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Chlamydomonas_reinhardtii 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Chondrus_crispus 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Ciona_intestinalis 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Cryptosporidium_parvum 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Cyanophora_paradoxa 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Dictyostelium_discoideum 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Diplonema_papillatum 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Drosophila_melanogaster 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Eimeria_tenella 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Emiliania_huxleyi 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Entamoeba_histolytica 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Giardia_lamblia 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Homo_sapiens 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Isochrysis_galbana 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Jakoba_libera 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Karena_brevis 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Leishmania_major 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Malawimonas_jakobiformis 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Mesostigma_viride CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAAGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATCGGATACCCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGAGGGATGTATTTATTAGACCATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGATACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATATCGGGCGATAATTGGAATGAGTACAATCTAAACCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATGGAATAACTAATAGGGACAGTTGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTGGGGGATCGAAGACGATTAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTTAGAGGGACTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCATCCAACGAGTCGTGATGGGGATAGACTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Mnemiopsis_leidyi CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTCTATTTGATTGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGAGGGATGTATTTATTAGACCATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTGACAACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCCGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGATTCGGGAGGTAGTGACAATAAATAACGTTGCA-GGCTGCAGTCGGAATGAGTACAATATAACACCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTACTTT{AG}AAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATGGAATAATTAATAGGGACAGTTGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGAGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTTCCAACCATAAACGATGCCGTCTGCTTCGGCACGCTATGAGAAATCAAAGACTTCGGGTTCCGGGGGGAGTATGTTCGCAAGAATGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAACCTGCGGTTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCAGGTCCAGACATAGGAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCACACGCGCGTTACACTGATGAAGCCAGCGAGTCGTGCTGGGGATAGACCATTGCAATTATTGGTCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAGCACGAGTCATCAACTCGTGCTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTT Monosiga_brevicollis CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACGGTGAAACTGCGAAAGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATTGGATACCCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGAGGGTTGTATTTATTAGACCATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTACAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGGGCCTGAGAAATGGCCACCACTTCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACAGAGCTGTAATTGGAATGAGAACAATGTAAATACCTTATCGAGTACCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTCGGACTTCTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATGGAATAATTAATAGGGATAGTTGGGGGCATTAGTATTTAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACTAACATCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGATTGGCACCTTATGGGAAACCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGGAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTTTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACTGAGGCAACAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACGGAGTCAACGAGTCGTGCTGGGGATAGATCTTTGCAATTATCGATCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGTGATTCATCAGATCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTT Naegleria_gruberi CTTGTCTCAAAGCCTAAGCCATGCAAATGTAAGATCA-------AGTCTGTGGAAGGCTCATTATAACAGTTATACTCCTAGCCACAGGATACCACCGTTAACTGCAGCGATA-TACTTG---------------------TTTCTTACCTATCAGCT--CGTTGTTTGTTTAAAGGACAAACCAGGCTTTGACGGGT-ACGGGGAATCAGTGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATCGCTACCACATCTAAGGACGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCTCAATAGAGGAGGTAGTGACAAGCTATAGTGACTCCACACGACGATTTCCATGATTTGGGTGTAGATAACCCTTAGAGTAGCCATTGGAGGAAAAGTCTGGTGCCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAGAGCGTATATTAATACTGCTGTAGTTAAAACGCCCGTAGTATACCTAACACTGTAAATAAATCGTTGTGCTTAAAGCGGGCATGGGACTGCTAATGGAGCCAGGTGAGGCCCCGGGTACCATGAGGCTAGAGGTGAAATTCTGAGACCCTCATGTGACCAACTAAGGCGAAAGCTGTCGGCCACCACAAGCTCGTCTATCAGGGACAAAAGTTGGGGGATCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCCCAACTATAAACGATACCAACCGACTCAGAACTCAA-GGGAAACCA-AGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATAGTCGCAAGACCGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGAGTGGAGTCTGCGGCTTAATTCGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCAGGACACAAGTTTGATTGACAGGTTAAAGCCCTTTCTTGATTGTGTGGTGGGTAGTGCATGGCCGTTTCCAGTTCGTGGAGTGATCTGTCTTGTTAATTCAGATAACGAACGAGACCTAAGCCTTAAAGGGACTTAGGCCATAACAGGTCTGTGATGCTCTTAGATGTCCTGGGCTGCACGCGTACTACAATAACGGTACCAGCGAGCTATGACAGGGATCGAGGATTGGAAC--ATCCTCGTGAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGTGGTTCATCATACCACATTGATTACGTCCCTGCCTTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATGTCTTCGTCTGTAGGAAGGAAAAGTCGTAACAAGGTC Nematostella_vectensis CTTGTCTCAAAGATTAAGCC-TGCATGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGAGGGATG-ATTTATTAGACCATTTCTGCCCTATCAACTGTCGATGGTAAGGT{AG}TTGGCTTACCATGGTTACAACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACTCGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAATACAGGGCTGTAATTGGAATGAGTACAACTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATAT-------------------------GT?GTTGGATTTCTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATGGAATAATTAAGAGGGACAGTTGGGGGCATTCGTATTTCGTTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTACGAAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGAGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTTCTAACCATAAACGATGCCGACTAGTTTGGCACCTTATGGGAAACCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGGAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACGAAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACGGTGTCAACGAGTCGTGCTGGGGATAGATCATTGCAATTATTGATCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-- Nyctotherus_ovalis CTTGTCTCAAAGATTAACCCATGCATGTGTAAGTATATACAGCGAAACTGCGAATGGCTCCTTAAAACAGTTATAATTTATTTGATTGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGAGGGCTGCATTTACTAGGCCATATCTGACCTATCAGCTTT-GATGGTAGTGTATTGGACTACCATGGCATTAACAGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAAAGAGCCTGAGAAACGGCTATTACATCTACGGACGGCAGCAGGGGCGTAAATTACCCAATCTTGACTTAGGAGGTAGTGACAAGAAATACCGAACTAGTG-TAGGATTGAAATGGACCAAATTTAATACCCTTGGCGAGTAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATATCTACCTTGAGAAAACTAGAGTGTTTCAGGCAGGCATGGAATAATTAATAGGAACAGTTGGGGGCATTAGTATTTAATTGTCAGAGGTGGAATTCTCGGATTTGTTAAAGACTAACTAAAGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCAAAGACGATCAGATACCGTTGTAGTCTTAACCATAAACGATGCCGACTAGTTCAGCATCTAAGGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTGAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATCTGACTCAACACGGAGAAATTTACCAGGTCCAGACATTAGAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTTATTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACTAAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTC?TGGGCTGCACGCGTGCTACACTGATGCATACAATAAGTCGTGATTGGGATAGATCTTTGTAATTATGGATCTTTAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGTAAGTCATCAGCTTACGCTGATTAAGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTAAATCACTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGCT Oryza_sativa CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGCAAGTATGAACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTGTTTGATCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGAGGGGCGCATTTATTAGGCTGTTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGGGGCCTACCATGGTGGTGACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGACCTTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCAAGCATGGGATAACTAATAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGCCGGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGGGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGCAAGGATTGACAGACTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTTAGAGGGACTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGG-CGCACGCGCGCTACACTGATGTATCCAACGAGTCGTGATGGGGATAGATCATTGCAATTGTTGGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTA-------- Oscarella_carmela 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Paramecium_caudatum 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Pavlova_lutheri 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Perkinsus_marinus 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Phaeodactylum_tricornutum 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Phanerochaete_chrysosporium C?TGTCTCAAAGA?TAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCGAATGG?TCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGAGGGGTGTATTTATTAGACCATATCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATAAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCA?GGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATATAGGGCTATAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCTCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACTTCTACCTTGAGAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATGGAATAATTAATAGGGATAGTTGGGGGCATTAGTATTCCGTTGCTAGAGGTGAAATTCTTGGATTTACGGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAGGTTAGGGGATCGAAAACGATCAGATACCGTTGTAGTCTTAACAGTAAACTATGCCGACTAGCTCGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGTGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATGACTAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCATGATTTTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACAGAGCCAGCGAGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATACCTAGTAAGCGTGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTT Phreatamoeba_balamuthi 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Physarum_polycephalum 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Physcomitrella_patens 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Phytophthora_infestans 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Planomonas_micra 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Plasmodium_berghei 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Porphyra_yezoensis 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Prymnesium_parvum 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Reclinomonas_americana 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Reticulomyxa_filosa 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Saccharomyces_cerevisiae -----------------GCCATGCATGTCTAAGTATATACAGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGAGAGATGTATTTATTAGATCATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTTTCAACGGGTAACGGGGAATAAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTAATTCGGGAGGTAGTGACAATAAATAACGATACAGGGCTGTAATTGGAATGAGTACAATGTAAATACCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATGGAATAATTAATAGGGACGGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGACGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGATGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGCTCGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACACAATAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTTTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGACGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACGGAGCCAGCGAGTCGTGCTGGGGATAGAGCATTGTAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTAGTACCGATTTGGTCATTTAGAGGAA-------------------- Sawyeria_marylandensis 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Schistosoma_mansoni 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Schizosaccharomyces_pombe 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Seculamonas_ecuadoriensis 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Sphaeroforma_arctica -----------GATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATATTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATTGGATAACCGGGGTAATTCTAGAGCTAATACATGAGGGCTGTATTTATTAGACCATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAAGGTATTGGCTTACCATGGTTACAACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACTTCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAAAAAATAACAATACAGGACTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTTTACTGTGAGAAAATTAGAGTGTTTAAAGCAGGCATGGAATAATTAATAGGGATAGTTGGGGACATTAATATTTAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGATTAACTTCTGCGAAAGCATTTGTCAAGGATGTTTTCGTTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGATCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCAGGTCCGGACATAGTGAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGAAGTCAACGAGTCGTGCTGGGGATAGATGATTGCAATTATTCATCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCATGTCATCAGCATGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTT Spironucleus_vortens 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Spizellomyces_punctatus 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Strongylocentrotus_purpuratus 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Subulatomonas_tetraspora 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Tetrahymena_thermophila 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Thalassiosira_pseudonana 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Theileria_parva 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Toxoplasma_gondii 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Trichomonas_vaginalis 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Trimastix_pyriformis 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Trypanosoma_brucei CTTGTTTCAAGGACTTAGCCATGCATGCCTCAGAATC------GAATCTGCGCATGGCTCATTACATCAGACGTAATCTGCCGCCATGGATAACTTGGCGAAACGCCAAGCTAATACATG---------------------CAACTGCCCTATCAGCCAGTGATGGCCGTGTAGTGGACTGCCATGGCGTTGACGGG-AGCGGGGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATAGCTACCACTTCTACGGAGGGCAGCAGGCGCGCAAATTGCCCAATGTCGAAAAATGAGGCAGCGAAAAGAAATAGAGCCGACG--TGGTTGTTTCAATGGG-GATACTCAACCATCAAATCGAGTAACAATTGGAGGACAAGTCTGGTGCCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAAAGCGTATATTAATGCTGTTGCTGTTAAAGGGTTCGTAGTTGAACTGTTACTGTGACCAAAAAAGTGCGACCAAAGCAGGCATGGGATAACGAAGGAGGGTAGTCGGGGGAGAACGTACTGGTGCGTCAGAGGTGAAATTCTTAGACCGCACCAAGACGAACTACAGCGAAGGCATTCTTCAAGGATACCTTCCTCAATCAAGAACCAAAGTGTGGGGATCAAAGATGATTAGAGACCATTGTAGTCCACACTGCAAACCATGACACCCATCCCAGCACTTTCTGCGAAGCTG-AGGTTACAGTCTCAGGGGGGAGTACGTTCGCAAGAGTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAATGGCACCACAAGACGTGGAGCGTGCGGTTTAATTTGACTCAACACGGGGAACTTTACCAGATCCGGACAGGGTGAGGATTGACAGATGGATGTTCTTTCTCGATCCCCTGAATGGTGGTGCATGGCCGCTTTTGGTCGGTGGAGTGATTTGTTTGGTTGATTCCGTCAACGGACGAGATCCAAGCTTCTGCGGGATTTGGGCAACAGCAGGTCTGTGATGCTCCTCAATGTTCTGGGCGACACGCGCACTACAATGTCAGTGAGAACAAGACCCACTTGGGACCGAGTATTGCAATTATTGGTCGCGAACGAGGAATGTCTCGTAGGCGCAGCTCATCAAACTGTGCCGATTACGTCCCTGCCATTTGTACACACCGCCCGTCGTTGTTTCCGATGTGCTTCAATAGAGGAAGCAAAAGTC----------- Ustilago_maydis CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGAGGGGTGTATTTATTAGCCA-TATCTGCCCTATCAACTGTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTTGCAACGGGTAACGGGGAATAAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATGCAGGGCTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACGATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAGTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATGGAATAACTAAAAGGGACAGCCGGGGGCATTAGTATTTGCACGCTAGAGGTGAAATTCTTGGATTGTGCAAAGACTTCCTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAGGTTAGGGTATCGAAAACGATTAGATACCGTTGTAGTCTTAACAGTAAACTATGCCGACTCCATCGGCGCGGTACGAGAAATCAAAGTTTTT-GGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCGGGTCCGGACATAGTAAGGATTGACAGATTGAGGCGCTTTCATGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACCTTGACCTTAGAGGGACAAAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCCGGGCTGCACGCGCGCTACACTGACAGAGACAACGAGTCGTGCTGGGGATGGAGCTTTGTAATTTTTGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTA Volvox_carteri CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGAGGGTCGTATTTATTAGGCCATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAGATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCATGGAATAACTAAGAGGGGTAGTCGGGGGCATTCGTATTCCGTTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTACGGAAGACGAACATCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATACTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTTAGAGGGACTGAGGCGATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACGCGACCAACGAGCCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTCTCCCACCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT 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