#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 09, 2025; 18:15 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Dole S.A., Jordal B.H., & Cognato A. 2010. Polyphyly of Xylosandrus Reitter inferred from nuclear and mitochondrial genes (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 54: 773-782. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11978] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=47; TAXLABELS Amasa_bicostatus Amasa_resectus Amasa_schlichi Amasa_sp._301 Amasa_sp._349 'Amasa sp. n. 1 SAD-2010' Amasa_striatotruncatus Amasa_versicolor Anisandrus_dispar Anisandrus_hirtus Anisandrus_obesus Anisandrus_sayi Cnestus_bimaculatus Cnestus_pseudosuturalis Coccotrypes_dactyliperda Coccotrypes_longior Euwallacea_russulus Xyleborus_affinis Xyleborus_californicus Xyleborus_impexus Xyleborus_pelliculosus Xyleborus_rotundicollis Xylosandrus_ater Xylosandrus_cf._zimmermanni Xylosandrus_compactus_02 Xylosandrus_compactus_04 Xylosandrus_crassiusculus_01 Xylosandrus_crassiusculus_02 Xylosandrus_crassiusculus_07 Xylosandrus_crassiusculus_08 Xylosandrus_discolor_02 Xylosandrus_germanus_01 Xylosandrus_germanus_02 Xylosandrus_improcerus Xylosandrus_mancus_02 Xylosandrus_monteithi_A17 Xylosandrus_morigerus Xylosandrus_morigerus_01 Xylosandrus_morigerus_02 Xylosandrus_morigerus_03 Xylosandrus_mutilatus Xylosandrus_queenslandi Xylosandrus_sp._2 Xylosandrus_sp._Borneo_466 'Xylosandrus sp. n. 342 SAD-2010' Xylosandrus_ursa Xylosandrus_ursinus ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Cnestus_pseudosuturalis 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Coccotrypes_dactyliperda 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'Xylosandrus sp. n. 342 SAD-2010' TGAAGGCTGAACGTGAACGTGGTATCACCATTGATATTGCCTTATGGAAATTCGAAACTGCAAAGTACTATGTAACCATCATTGATGCTCCTGGACACAGAGATTTCATCAAGAACATGATCACTGGAACATCTCAAGCTGATTGTGCTGTGCTAATTGTAGCTGCTGGTACTGGAGAATTTGAAGCTGGTATCTCGAAAAATGGACAAACCAGAGAACATGCTCTTCTCGCTTTTACCCTTGGAGTAAGGCAACTCATTGTCGGTGTCAACAAAATGGATTCCACCGAACCGCCCTACAGCGAGCCTCGTTTTGAGGAAATTAAGAAGGAAGTCTCTTCATATATCAAGAAAATTGGTTACAACCCAGCTGCAGTCGTTTTTGTGCCTATTTCTGGTTGGCATGGAGACAATATGTTGGAGCCATCTAACAAGATGCCATGGTTCAAAGGATGGTCCATTGAACGTAAAGAAGGAAAGGCTGAAGGCAAAACTCTCATTGATGCTTTGGATGCCATCCTCCCACCTAGTCGCCCAACTGACAAACCCTTCGTC?CATAGTAGGAACATCCCTAAGAGTCTTAATTCGTACAGAATTAGGAACCCCAGGAAGATTAATTATAGATGATCAAATTTTTAATACTATTGTAACAGCCCATGCATTCGTAATAATTTTCTTTATAGTTATACCTATTCTTATTGGAGGTTTTGGCAATTGACTAGTCCCTTTAATATTAGGGGCCCCAGATATAGCTTTTCCACGACTTAATAATATAAGATTTTGACTACTTCCACCAAGATTAACCCTTCTATTAATAAGAAGAATTATTGATAAAGGAGCTGGAACAGGATGAACAGTTTACCCACCACTAGCAGCAAATATTGCCCATGAAGGAGCATCCGTTGACCTAGCAATTTTTAGCTTGCATATATCAGGAGTATCTTCAATTCTTGGAGCAATCAATTTTATTTCAACAATCATTAATATACATCCAACAGGAATAAAACCTGAACAACTTTCATTATTTACATGAGCTGTAAAAATTACAGCTATCCTTCTATTACTTTCTCTACCAGTTTTGGCAGGAGGAATTACTATACTTCTTACAGATCGAAATATTAATACATCTTTTTTTGATCCAGGTTTTGCCAATACAAACGAAGAGCTGACTGTGTTAGCCACTCAAGCCTTAGCGCATTCCAGCCAACTTGTCATCGACAAATCTTTAAAAGGTTGGAAGGAAGTTGAGTACGAAGTGGTCCGTGATGCATATGATAACTGCATAACCGTGTGTAACATGGAAAACGTAGACCCCTTGGGCATTCATACTGGAGAATCAATCGTAGTCGCCCCCAGCCAGACTTTATCCAATCGAGAATACAACATGTTACGGACCACCGCCATAAAAGTTATAAGACACTTTGGAGTTGTGGGTGAATGCAACATCCAGTACGCTTTGAGCCCTTTTTCCGAAGAGTACTACATCATTGAAGTTAATGCCCGACTGTCCAGGAGTTCTGCCCTTGCAAGCAAGGCCACAGGGTATCCGCTGGCATATGTGGCTGCAAAACTGTCCTTAGGAATACCTTTGCCAGAAATTAAAAACTCCGTTACAGGAGACACCACTGCTTGCTTCGAGCCCAGTTTGGATTA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TATGCTCCAGATGCTGAAGCCTATACAGTATTCGCTGATCTCTTCGATCCCATCATCGAAGACTACCACAAAGGGTTCAGCAAGGGCGATAAGCACCCCCCCAAGAACTGGGGTGATGTCAGCGTATTCGGCAACCTCGATCCTAACAACGAATTCGTGGTTTCTACCCGCGTGAGGTGCGGTAGGTCTCTGGAAGGATACCCTTTCAACCCCTGCTTAACCGAGGAGCAGTACAAGGAAATGGAACAGAAAGTTTCCAGTACCTTATCCGGACTTGAGGCCGAGTTGAAAGGAACTTTCTACCCATTGACTGGAATGAGCAAAGACGTTCAGCAGAAACTGATCGATGATCACTTCTTGTTCAAGGAAGGGGACAGATTCTTGCAGGCTGCCAACGCCTGCCGTTTCTGGCCCTCTGGACGTGGTATTTTCCACAACGAAAACAAAACATTCTTGGTCTGGTGTAACGAGGAAGACCATCTTCGTATCATTTCTATGCAAATGGGTGGTGACTTGGGACAAGTCTACCGTCGTCTGGTCACAGCTGTTAATGATATCGAGAAGAGAATCCCCTTCTCTCACAACGACAGGCTTGGATTCCTTACTTTTTGCCCTACTAACTTAGGTACTACTGTTCGTGCTTCAGTACACATCAAGGTACCCAAGCTGGCCGCCAATAAGGCCAAACTTGAAGAAGTGGCTGGCAAGTACAAC????????????????????????????????????????AAACCCGAAAGGTCGAAGGGAGAAA-TTCATTCGCG--TTT-CGA--CGT-AGGCGTT-GGAC---GGGGTCG---AGAGAGAGAG---CGAGATAAC-GATGGAA---CGCGTTCTTCGGAACGAG----TTTCGCGTTT------CTC----------ACCCCC-T---------ACTCGTTCT--T-CGAACCGGCGACGAACGCGT-GCACT-TTTCTCCTGGTAGGACGTCGCGATCCGTCGGGTGTCGGTCT-ACGACT-------TGC-GGTGGAGCCCGTCCGT--------CGTCCTAA---CGT-GACGGTACGGATGGACCCGCA-ACGCTC-------TGGCCGACTCGCTCGACGGTAT-AC---TAAACGGTCGGAGGCCGCTCG-------TTACAGG-------AGCGTTCGACTCGTCGCAAGCGCGCCACGTGCGTCGGCACGCGGACCTAGTGCCGCGTCCGACCTCTGGTGACTGTTGGCGACGAAGTTCTCGAACAGACCTT-------------------------------------------------------CTTTTTTTTTG---------------------GAAACAAAAAAA-----------------------ATGACC-GATCGGCGACGCTATAGCTTTGGGTACTTTC-AGGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAGCATGTACGC-GAGTCATTGGGAA--T-CACTAAACCTAA-AGGCGTAATGAAAGTGAAGGTCTTCCTC--GCGA-A-GACCGAGGGAAGACGGACGGTTAA--------TTTTTATAAACCACCCTCAAAAA-----GTGGGACCGTCCTGCATTCCCGGGGCGTCTCGTTCACAT---TGCGTGAAGAGGCGCACCAAGAGCGTACACGCTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGGTCAGGACGAAGTCAGGGGAAACCCTGATGGAGGTCCGTA???????? Xylosandrus_ursa ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????AACCCCCATTGATGCT?CCGGACACAGAGATTTCATCAAGAACATGATCACTGGAACGTCCCAGGCTGATTGTGCTGTGCTAATCGTAGCTGCTGGTACTGGTGAATTTGAAGCCGGTATCTCGAAAAATGGACAGACCAGAGAACATGCTCTTCTTGCCTTCACCCTTGGAGTGCGACAACTTATTGTCGGTGTCAACAAAATGGATTCTACAGAACCCCCTTACAGCGAGTCTCGATTTGAAGAAATTAAGAAGGAAGTCTCTTCTTACATCAAGAAAATTGGTTACAATCCAGCTGCTGTCGTTTTCGTGCCTATTTCTGGTTGGCACGGGGACAACATGTTGGAACCCTCCACCAAGATGCCATGGTTCAAAGGATGGTCCATTGAACGC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CATAGTAGGGACCTCCCTGAGAATACTAATTCGTACAGAACTAGGAACCCCAGGAAGGCTAATCAGAGATGATCAAATCTTCAATACTATTGTAACCGCTCATGCCTTCATTATAATTTTCTTTATAGTAATGCCAATCCTAATTGGTGGATTTGGAAACTGGTTAGTACCATTAATGCTTGGAGCCCCCGATATAGCCTTCCCACGACTTAACAATATAAGATTCTGACTTCTCCCTCCCAGACTATCTCTCCTTCTTATAAGAAGAATTATTGACAAAGGAGCAGGAACAGGATGAACAGTATACCCCCCGCTAGCCTCCAACATTGCCCATGAAGGGGCATCTGTTGACCTAGCAATCTTCAGCCTTCACATGTCAGGGGTATCCTCAATCCTAGGAGCAATTAATTTCATCTCCACAATTATTAATATACACCCTGCAGGGATAAAGCCAGAACAGCTATCCTTATTCACCTGAGCAGTAAAAATTACTGCTATCCTATTATTATTGTCCCTTCCTGTGCTAGCAGGAGGTATCACAATACTCCTTACAGACCGTAATATCAATACATCTTTTTTTGACCC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGTGATGCGTATGATAACTGCATAACCGTCTGCAATATGGAGAACGTGGACCCCTTAGGCATTCATACTGGAGAATCAATCGTAGTCGCCCCCAGCCAGACTTTATCCAATCGCGAGTACAACATGTTGCGAACCACCGCCATAAAAGTTATAAGACACTTCGGAGTTGTCGGTGAATGCAACATCCAGTATGCTTTGAGTCCCTTTTCCGAGGAGTACTACATCATTGAGGTGAATGCTCGACTGTCGAGGAGTTCTGCCCTTGCAAGCAAGGCCACAGGGTATCCGTTGGCATATGTGGCTGCAAAACTTTCTTTGGGAATATCTTTGCCAGAAATTAAAAATTCCGTTACTGGAAACACCACCGCCTGTTTCGAGCCCAGTTTAGATTACTGCGTAGTGAAAATTCCACGCTGGGATCTCCACAAATTTTCCAGAGTGAGCACCAAGATTGGTAGTTCAATGAAAAGCGTTATGCTCCTGATGCTGAAGCCTACACAGTATTCGCCGATCTCTTCGATCCCATTATCGAAGACTATCACAAAGGGTTCACCAAGGGCGACAAGCATCCCCCCAAGAACTGGGGTGATGTCAGCGTGTTCGGCAACCTCGACCCCAACAACGAATTCGTGGTTTCCACCCGTGTGAGGTGCGGCAGGTCGCTGGAAGGATATCCTTTCAACCCCTGCTTAACCGAAGAGCAGTATAAGGAAATGGAACAGAAAGTCTCCAGTACTTTATCCGGCCTTGAGAGCGAGTTGAAGGGAACTTTCTACCCTTTAACTGGCATGAGCAAAGACGTTCAGCAGAAATTGATCGACGATCATTTCTTGTTCAAGGAGGGTGACAGGTTCTTGCAGGCTGCCAACGCCTGTCGTTTCTGGCCGTCTGGACGTGGCATTTTCCACAACGAAAACAAAACATTCTTGGTCTGGTGTAATGAGGAAGATCATCTTCGTATCATTTCCATGCAAATGGGTGGTGACTTGGGGCAAGTCTACCGCCGTCTGGTCACAGCTGTCAATGATATCGAGAAGCGTATTCCCTTCTCTCACAACGACAGGCTTGGATTCCTCACTTTCTGCCCAACCAACTTAGGTACCACTGTCCGTGCTTCAGTACACATCAAGGTACCCAAGCTGGCCGCTAACAAGGCCAAACTTGAAGAAGTTGCTGCCAAGTACAAC??????????????????????????????????????????????????????????????????????TTCGCG--TTT-CGA--CGC-AGGCGTG-GGAC---GGAG-TT---TGTGC--------GACGGAACT-CGCGCGC---CGCGCGTTCTTC-GGAAC----CGCGAGCGTG------TC------CGTAGTTTTGCGC---------CCTTCGTTC--TTCGAACCGGCGACGAACGCGT-GCACT-TTTCTTCTGGTAGGACGTCGCGATCCGTCGGGCGTCGGTCT-ACGACT-------TGC-GG?GGAGCCCGTCCGT--------CGTCGTCTT-TCGT--ACGATGCGGACGGACCCGTT-CGTTTT------CCGACCGACTCGCTCGACGGTAT-GCT--TATAAGGTCGGAGGCCGCTCGATATTTTTTCAAGG-------AGCGTTCGACTCGTCGCAAGCGCGCCACGTGCGTCGGCACGCGGACCCAGTGCCGCGTCCGACCTCTGGTGACTGTTGGCGACGATGTTCTCGGACAGACCTCTTCACATCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTTCCTCTCTTCTCATTTTAACC-----GGTGGGAGGAGGGTGTGCGGCGAGGGGATTGTGGGGGGAGTCGGTGAGAG--GAGACC-GATCGGCGACGCTATAGCTTTGGGTACTTTC-AGGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAGCATGTACGC-GAGTCATTGGGAAT---TACTAAACCTAA-AGGCGTAATGAAAGTGAAGGTCTTCCT--CGCGA-A-GACCGAGGGAAGACGGACGGTCTGC-----------------GCCCTCAAAAGTG-----TTGGGACCGTCCTGCATTCCCGGGGCGTCTCGTTCACAT---TGCGTGAAGAGGCGCACCAAGAGCGTACACGCTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGGTCAGGA-???????????????????????????????????????? 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