#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 18, 2025; 21:23 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Nesnidal M., Helmkampf M., Bruchhaus I., Ebersberger I., & Hausdorf B. 2013. "Lophophorata monophyletic – after all." In: Bartholomaeus T., & Wägele J.W., eds. Deep Metazoan Phylogeny: Backbone of the Tree of Life. pp. . Berlin, Walter de Gruyter. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14244] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=58; TAXLABELS Acropora_millepora Alcyonidium_diaphanum Apis_mellifera Aplysia_californica Asterina_pectinifera Biomphalaria_glabrata Brachionus_plicatilis Brugia_malayi Bugula_neritina Caenorhabditis Capitella_teleta Carinoma_mutabilis Cerebratulus_lacteus Chaetoderma_nitidulum Chaetopterus Crassostrea_gigas Cristatella_mucedo Daphnia Dreissena_rostriformis_bugensis Echinococcus_granulosus Echinoderes_horni Euperipatoides_kanangrensis Euprymna_scolopes Flustra_foliacea Helobdella Homo_sapiens Hydra_magnipapillata Hypsibius_dujardini Hyriopsis_cumingii Ixodes_scapularis Lepidochitona_cinerea Lottia_gigantea Lumbricus_rubellus Macrostomum_lignano Mytilus_galloprovincialis Nematostella_vectensis Nemertoderma_westbladi Novocrania_anomala Opisthorchis_viverrini Paraplanocera Pedicellina Pedicellina_cernua Petromyzon_marinus Philodina_roseola Phoronis_muelleri Ptychodera_flava Saccoglossus_kowalevskii Schistosoma_mansoni Schmidtea_mediterranea Symbion_pandora Taenia_solium Terebratalia_transversa Themiste_lageniformis Tubifex_tubifex Tubulipora Urechis_caupo Venerupis_decussatus Xiphinema_index ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M18859] TITLE 'Lophophorata, 58 Taxa 155 Proteins'; LINK TAXA = Taxa; DIMENSIONS NCHAR=29896; FORMAT DATATYPE=Protein SYMBOLS= "A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y" MISSING=? 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Apis_mellifera 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Daphnia 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Nematostella_vectensis 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Petromyzon_marinus 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Tubulipora 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