#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 19, 2025; 0:34 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Xu S., Yang Y., Zhou X., Xu J., Zhou K., & Yang G. 2013. Adaptive evolution of the osmoregulation-related genes in cetaceans during secondary aquatic adaptation. BMC Evolutionary Biology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14426] BEGIN TAXA; TITLE AQP3; DIMENSIONS NTAX=29; TAXLABELS Balaenoptera_acutorostrata Bos_taurus Callithrix_jacchus Canis_familiaris Cavia_porcellus Dasypus_novemcinctus Dipodomys_ordii Equus_caballus Erinaceus_europaeus Gorilla_gorilla Kogia_simus Lipotes_vexillifer Macaca_mulatta Mesoplodon_densirostris Microcebus_murinus Monodelphis_domestica Mus_musculus Myotis_lucifugus Neophocaena_phocaenoides Ornithorhynchus_anatinus Oryctolagus_cuniculus Pan_troglodytes Procavia_capensis Pteropus_vampyrus Rattus_norvegicus Sousa_chinensis Sus_scrofa Tupaia_belangeri Tursiops_truncatus ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M18376] TITLE AQP3.nexus; LINK TAXA = AQP3; DIMENSIONS NCHAR=768; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Balaenoptera_acutorostrata 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ATGTTCGGCTGTGGCTCCGTCGCCCAGGTCGTGCTCAGCCGGGGCACCCACGGAGGTTTCCTCACCATCAACCTGGCCTTTGGCTTTGCAGTCACCCTGGGCATCCTGGTCGCTGGCCAGGTCTCTGGGGCCCACCTGAACCCTGCCGTGACCTTTGCCATGTGCTTCCTGGCACGTGAGCCCTGGATCAAGCTGCCCATCTACACCTTGGCACAGACGCTCGGAGCCTTCTTGGGTGCTGGGATCGTTTTCGGGCTATATTATGATGCAATCTTGAGCTTTGCCAACAATGAGTTTATAGTCTCGGGCCCCAATGGCACAGCAGGCATCTTTGCCACCTACCCCTCTGGACACCTGGACATGGTCAATGGCTTCTTCGACCAGTTCATAGGCACAGCTTCCCTCATCGTGTGCGTGTTGGCCATTGTGGACCCTTACAACAACCCTGTCCCCCGCGGCCTGGAGGCCTTCACCGTGGGCCTGGTGGTCCTGGTCATTGGCACCTCTATGGGCTTCAACTCTGGCTACGCTGTCAACCCTGCCCGGGATTTCGGCCCCCGTCTTTTCACTGCCATCGCGGGCTGGGGCTCTGAGGTCTTCACGACTGGCCGGCACTGGTGGTGGGTGCCCATCGTCTCTCCCCTGCTGGGCTCCATTGCGGGCGTCTTCGTGTACCAGCTCATGATCGGCTGCCACCTGGAGCAGCCTCCTCCCTCCACCGAGTCGGAGAACGTGAAGCTGGCCCACGTGAAGCACAAGGAGCAGATC Pan_troglodytes ATGTTTGGCTGTGGCTCCGTGGCCCAGGTTGTGCTCAGCCGGGGCACCCACGGTGGTTTCCTCACCATCAACCTGGCCTTTGGCTTTGCTGTCACTCTGGGCATCCTCATCGCTGGCCAGGTCTCTGGGGCCCACCTGAACCCTGCCGTGACCTTTGCCATGTGCTTCCTGGCTCGTGAGCCCTGGATCAAGCTGCCCATCTACACCCTGGCACAGACGCTGGGAGCCTTCTTGGGTGCTGGAATAGTTTTTGGGCTGTATTATGATGCAATCTGGCACTTTGGCGACAACCAGCTTTATGTTTCGGGCCCCAATGGCACAGCCGGCATCTTTGCTACCTACCCCTCTGGACACTTGGATATGATCAATGGCTTCTTTGACCAGTTCATAGGCACAGCCTCCCTTATCGTGTGTGTGCTGGCCATTGTTGACCCCTACAACAACCCCGTCCCCCGAGGCCTGGAGGCCTTCACCGTGGGCCTGGTGGTCCTGGTCATTGGCACCTCCATGGGCTTCAACTCCGGCTATGCCGTCAACCCTGCCCGGGACTTTGGCCCCCGCCTTTTTACAGCCCTTGCGGGCTGGGGCTCTGCAGTCTTCACGACCGGCCAGCATTGGTGGTGGGTGCCCATCGTGTCCCCACTCCTGGGCTCCATTGCGGGTGTCTTCGTGTACCAGCTGATGATCGGCTGCCACCTGGAGCAGCCCCCACCCTCCAACGAGGAAGAGAATGTGAAGCTGGCCCATGTGAAGCACAAGGAGCAGATC Procavia_capensis ATGTTTGGCTGTGGTTCTGTGGCCCAGGTGGTGCTCAGCCGGGGCACCCACGGAGGCTTCCTCACCATCAACCTGGCTTTCGGTTTTGCTGTCACTCTGGGCATCCTCATTGCTGGCCAAGTTTCTGGGGCCCATCTGAACCCTGCTGTGACCTTTGCCATGTGCTTTCTGGCACGTGAACCCTGGATCAAGCTGCCCATCTACACCCTGGCTCAGACGCTGGGAGCCTTCCTGGGTGCTGGGATCATTTTTGGACTATATTATGATGCAATCTGGGCCTTTGCCAACAATCAGCTTGTAGTCTCGGGCCCCAACGGCACAGCTGGCATCTTTGCCACCTACCCCTCTGGACACTTGGACATGGTCAATGGATTCTTTGACCAGTTCATCGGCACGGCCTCCCTCATTGTGTGTGTGCTGGCCATTGTTGACCCAAACAACAACCCTGTCCCCCGTGGCCTGGAGGCCTTCACCGTGGGCCTGGTAGTCCTGGTCATCGGCACCTCCATGGGCTTCAACTCTGGCTATGCTGTCAACCCTGCCCGTGACTTCGGCCCCCGCCTTTTCACCGCCATCGCTGGTTGGGGCTCTGAGGTCTTCACGACTGGCAAGCACTGGTGGTGGGTGCCCATTGTCTCACCACTCCTGGGCTCCATCGCTGGTGTCTTCGTGTACCAGCTCATGATCGGCTGCCACTTGGAGCAGCCCCCGCCTTCTACTGAGCAGGAGAATGTGAAGCTGGCCCACCTGAAGCACAAGGAGCAGATC Pteropus_vampyrus ATGTTTGGCTGTGGCTCAGTGGCCCAGGTCGTGCTCAGCCGGGGCACCCATGGTGGTTTCCTTACCATTAACCTGGCCTTTGGCTTTGCTGTCACCCTGGGCATCCTCATTGCTGGCCAGGTCTCCGGGGCTCACCTGAACCCTGCTGTGACCTTTGCCATGTGCTTCCTGGCACGTGAGCCATGGATCAAGCTGCCCATCTACACTTTGGCCCAGACGCTGGGAGCCTTCCTGGGCGCTGGGATCGTTTTCGGGCTGTATTATGATGCAATCTTG---TTCGCCAACAACGAGTTTGTAGTCTCGGGTCCCAATGGCACAGCTGGCATCTTTGCCACCTATCCCTCTGGACACTTGGACATGGTCAATGGCTTCTTCGACCAGTTCATCGGCACGGCTTCTCTCATTGTGTGTGTGCTGGCCATTGTGGACCCCTACAACAACCCTGTCCCCCGAGGCCTGGAGGCCTTCACCGTGGGCCTGGTGGTCTTGGTCATTGGCACTTCCATGGGCTTCAACTCCGGCTATGCCGTCAACCCTGCCCGAGACTTCGGCCCCCGTCTCTTCACCGCCATCGCAGGCTGGGGCTCTGAAGTCTTCACGACGGGCCGCCACTGGTGGTGGGTGCCCATCATCTCCCCACTCCTGGGCTCCATCGCGGGAGTCTTTGTGTACCAGATCATGATCGGCTGCCACTTGGAGCAGCCTCCACCCTCCACTGAGCAAGAGAATGTGAAGCTGGCTCACGTGAAGCACAAGGAGCAAGTC Rattus_norvegicus ATGTTCGGCTGTGGTTCCGTGGCTCAAGTGGTGCTCAGCCGAGGGACCCATGGTGGCTTCCTCACCATCAACTTGGCTTTTGGCTTCGCTGTCACCCTTGCCATCTTGGTGGCTGGCCAAGTGTCTGGAGCCCACTTGAACCCTGCTGTGACCTTTGCAATGTGCTTCCTGGCACGAGAGCCCTGGATCAAGCTGCCCATCTACACACTGGCACAGACCCTCGGGGCCTTCTTGGGTGCTGGGATTGTTTTTGGGCTCTACTATGATGCAATCTGGGCCTTTGCTGGCAATGAGCTTGTTGTCTCCGGCCCCAATGGCACAGCTGGTATCTTTGCCACCTATCCCTCTGGACACTTGGATATGGTCAATGGCTTCTTTGATCAGTTCATAGGCACAGCAGCCCTTATTGTGTGTGTGCTGGCCATTGTTGACCCTTATAACAACCCTGTGCCCCGGGGCCTGGAGGCCTTCACTGTGGGCCTTGTGGTCCTGGTCATTGGGACCTCCATGGGCTTCAATTCTGGCTATGCCGTCAACCCAGCTCGTGACTTTGGACCTCGCCTTTTCACTGCCCTGGCTGGCTGGGGTTCAGAAGTCTTTACGACTGGCCAGAACTGGTGGTGGGTACCCATCGTCTCTCCACTCCTGGGTTCCATTGGTGGTGTCTTCGTGTACCAGCTCATGATTGGCTGCCACCTGGAGCAGCCCCTGCCTTCCACTGAGGCAGAGAATGTGAAGCTGGCCCACATGAAGCACAAGGAGCAGATC Sousa_chinensis CTGTTTGGCTGTGGCTCTGTGGCCCAGGTCGTGCTCAGCCGGGGCACCCACGGTGGTTTCCTCACCATCAACCTGGCCTTTGGCTTCGCCGTCACCCTAGGCATCCTTATCGCTGGCCAGGTCTCTGGGGCCCACATGAACCCTGCCGTGACCTTTGCTATGTGCTTGCTGGCGCGTGAGCCCTGGATCAAGCTGCCCATCTACGCCATGGCTCAGACTCTGGGAGCCTTCCTGGGTGCCGGGATCGTTTTTGGGCTGTATTATGATGCAATCTGGGGCTTCGCCAACAACGAGCTTATAGTTTCGGGCCCCAATGGCACAGCCGGCATCTTTGCCACCTACCCCTCTGGACATTTGGACATGGTCAATGGCTTCTTCGACCAGTTAATTGGCACAGCCTCCCTCATCGTGTGTGTGCTGGCCATTGTGGACCCCTACAATAACCCTGTCCCGCCTGGCCTGGAGGCCTTCACTGTGGGCCTGGTGGTCCTGGTCATCGGCACGTCCATGGGCTTCAACTCTGGCTACGCCGTCAACCCCGCCCGGGACTTCGGCCCTCGCCTTTTCACAGCCATTGCCGGCTGGGGCCCGGAAGTCTTCACGACCGGCCGCCACTGGTGGTGGGTGCCCATCATCTCCCCACTCCTGGGTTCCATCACGGGTGTCCTCGTGTATCAGCTCATGATCGGCTGGCACCTGGAACCACCTCCACCCTCCACCGATGAGGAGAATGTGAAGCTGTCCCACGTGAAGCACAAGGGGCAGATG Sus_scrofa ATGTTTGGCTGTGGCTCCGTGGCACAGGTCGTGCTCAGCCGGGGCACTCATGGTGGTTTCCTCACCATCAACCTGGCCTTTGGCTTCGCTGTCACCCTGGGTATCCTTGTTGCCGGCCAGGTCTCTGGGGCCCACCTGAACCCTGCTGTGACCTTCGCTATGTGCTTCCTGGCCCGTGAACCCTGGATCAAGCTGCCCGTCTATACCCTGGCTCAGACTCTGGGAGCCTTCCTGGGTGCTGGGATCATTTTTGGGCTGTATTATGATGCAATCTGGGCCTTCGCCAACAACCAGCTTATAGTCTCAGGCCCCAATGGCACAGCTGGCATCTTTGCCACCTACCCCTCTGGACACTTGGACATGGTCAATGGCTTCTTCGACCAGTTCATCGGCACAGCCTCCCTCATCGTGTGCGTGCTGGCCATTGTGGACCCCAACAACAACCCCGTGCCCCGTGGCCTGGAGGCCTTCACTGTGGGCCTGGTGGTCCTGGTCATTGGCACCTCCATGGGCTTCAACTCTGGCTATGCCGTCAACCCTGCCCGGGACTTCGGCCCTCGCCTCTTCACTGCCATTGCTGGCTGGGGCTCAGAAGTCTTCACGACCGGCCGCCACTGGTGGTGGGTGCCCATTGTCTCTCCGCTCCTGGGTTCCATCGCCGGTGTCTTCGTGTACCAGCTCATGATCGGCTGCCACCTGGAGCCACCGCCACCCTCCACTGACGAGGAGAATGTGAAGCTGTCCCAAGTAAAGCACAAGGAG------ Tupaia_belangeri 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CTGTTTGGCTGTGGCTCTGTGGCCCAGGTCGTGCTCAGCCGGGGCACCCACGGTGGTTTCCTCACCATCAACCTGGCCTTTGGCTTCGCCGTCACCCTAGGCATCCTTATCGCTGGCCAGGTCTCTGGGGCCCACATGAACCCTGCCGTGACCTTTGCTATGTGCTTGCTGGCGCGTGAGCCCTGGATCAAGCTGCCCATCTACGCCATGGCTCAGACTCTGGGAGCCTTCCTGGGTGCCGGGATCGTTTTTGGGCTGTATTATGATGCAATCTGGGGCTTCGCCAACAACGAGCTTATAGTTTCGGGCCCCAATGGCACAGCCGGCATCTTTGCCACCTACCCCTCTGGACATTTGGACATGGTCAATGGCTTCTTCGACCAGTTAATTGGCACAGCCTCCCTCATCGTGTGTGTGCTGGCCATTGTGGACCCCTACAATAACCCTGTCCCGCCTGGCCTGGAGGCCTTCACTGTGGGCCTGGTGGTCCTGGTCATCGGCACGTCCATGGGCTTCAACTCTGGCTACGCCGTCAACCCCGCCCGGGACTTCGGCCCTCGCCTTTTCACAGCCATTGCCGGCTGGGGCCCGGAAGTCTTCACGACCGGCCACCACTGGTGGTGGGTGCCCATCATCTCCCCACTCCTGGGTTCCATCGTGGGTGTCCTCGTGTATCAGCTCATGATCGGCTGGCACCTGGAACCACCTCCACCCTCCACCGATGAGGAGAATGTGAAGCTGTCCCACGTGAAGCACAAGGGGCAGATG ; END;