#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 09, 2025; 18:12 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Scheel B.M., & Hausdorf B. 2014. Dynamic evolution of mitochondrial ribosomal proteins in Holozoa. Molecular Phylogenetics and Evolution, 76: 67-74. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14909] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=25; TAXLABELS Acropora_digitifera Acyrthosiphon_pisum Amphimedon_queenslandica Anopheles_gambiae Caenorhabditis_elegans Capitella_teleta Capsaspora_owczarzaki Daphnia_pulex Drosophila_melanogaster Helobdella_robusta Homo_sapiens Hydra_magnipapillata Lottia_gigantea Mnemiopsis_leidyi Monosiga_brevicollis Mus_musculus Nematostella_vectensis Neurospora_crassa Saccharomyces_cerevisiae Salpingoeca_rosetta Schistosoma_mansoni Sphaeroforma_arctica Strongylocentrotus_purpuratus Tetraodon_nigroviridis Trichoplax_adhaerens ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M21614] TITLE MRPs_Gblocks_concatenated; LINK TAXA = Taxa; DIMENSIONS NCHAR=8456; FORMAT DATATYPE=Protein SYMBOLS= "A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y" MISSING=? 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Acyrthosiphon_pisum 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Drosophila_melanogaster 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Mus_musculus 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