#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on July 09, 2025; 16:24 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Bellot S., & Renner S.S. 2014. Exploring New Dating Approaches for Parasites: The Worldwide Apodanthaceae (Cucurbitales) as an Example. Molecular Phylogenetics and Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S15658] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=28; TAXLABELS Alnus_sinuata Anisophyllea_fallax Apodanthes_caseariae_Panama_Galdames_7260 Apodanthes_tribracteata_Bolivia_Smith_14057 Betula_pendula Clusia_rosea Coccinia_adoensis Corynocarpus_laevigatus Cucumis_sativus Cucurbita_pepo Datisca_glomerata Fagus_grandifolia Juglans_mandshurica Nothofagus_antarctica Pilostyles_aethiopica_Zimbabwe_Bellot_29 Pilostyles_berteroi_Chile_Heibl_05017 Pilostyles_calliandrae_Brazil_Heringer_5768 Pilostyles_coccoidea_Australia_Thiele_3495 Pilostyles_collina_Australia_Thiele_4501 Pilostyles_goyazensis_Brazil_Irwin_14880 Pilostyles_hamiltonii_Australia_Dixon_1039 Pilostyles_haussknechtii_Iran_Chehregani_17834 Pilostyles_ingae_Brazil_Glaziou_22029 Pilostyles_mexicana_Mexico_Breedlove_27233 Pilostyles_mortoni_Mexico_Wynd_256 Pilostyles_thurberi_Mexico_Johnston_11286 Pilostyles_ulei_Bolivia_Nee_48695 Pilostyles_ulei_Brazil_Ceccantini_3593 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Apodanthes_tribracteata_Bolivia_Smith_14057 AAGCCAT-GCATGTGCA-GTATGAACGATTTCGGACGGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGT-TATCGTTTGTTTGATGGTACAAGCTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCG-AACGGCCCCGACC-CT-CGGAAGGGGCGCATTTATTAGATAAAAGGCCGACGCGGGCCCT-----GCCCGTTGCTCTGGTGAATCATGATAACTAGGCGGATCGCACGGCCACCGCGCCGGCGACGCATCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATATGGGCCTACCATGGTGGCGACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAA{CT}GGCTACCACATCCAAGGAAGG{CT}AGCA-GGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAACTATCAATATCGGGCTC--T-CGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCTCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTTGGGGTTGGCCTGTCGGTCCG???-?--??GGCGAGCAC-CGGCCGT-CCCTCCCCATCTGTCGGCGATGCGGCCCG-GCCTTGATTGGTCGGGCCGCTCCTCCGGCGCGGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCGCGG-GCTCTGCATACATTAGCATGGGATAACGACGAAGGATTTCGGTCCTATCGTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGACTAACAGGGACGGTCGGGGGCATCCGTATTCCGCAGTCAGAGG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Betula_pendula ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCT-----GCCCGTTGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCACGGCCATCGTGCCGGCGACGCATCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACTATGGTGGTGACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCA-GGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCTC-TTTAGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTTGGGTTGGGCAGATCGGTCCGCC--C--CTGGTGTGCAC-CGGTCCG-CTCGTCCCTTCTACCGGCGATACGCTCCTGGTCTTAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGTGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCAAGCCTAC-GCTCTGGATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGGTCCTATTGTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGAACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCGGCGGATGTTGCTTTCAGGACTCCGCCGGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGTTAACTAGCTATGCGGAGGA--TCCCCTCCGCGGCCAGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGCTTAGGCCACGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGTATTCAACGAGTTTATAGCCTTGGCCGACAGGCCCGGGTAATCTTTGAAATTTCATCGTGATGGGGATAGATCATTGCAATTGTTGGTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGGTCCGGTGAAGTGTTCG?????????????????????????????????????????????????????????????????? Clusia_rosea ???CCAT-GCATGTGTAAGTATGAACTAATTCAGACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGT-TATAGTTTGTTTGATGGTATCTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCA-ACAAACCCCGACT-TC-AGGAAGGGGCGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTCT-----GCTCGTTGTTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCACGGCCATTGTGCCGGCGACGCATCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTGACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCA-GGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCTC-TC-TGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGACCTTGGGACGAGATGATCGGTCCGCC--TC-ACGGTGTGCAC-CTGTCAT-GTCGTCCCTTCTACCGGCGATGCGCTCCTGGCCTTAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGTGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCATGCCTAC-GCTCTGGATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGATCCTATTCTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCGGCGGATGTTACTTTTAGGACTCCGCCGGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTATGCGGAGGT---ATCCTCTGCGGCCAGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCTTCCAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGTATTCAACGAGTCTATAGCCTTGGCCGACAGGCCCGGGTAATCTTTGAAATTTCATCGTGATGGGGATAGATCATTGCAATTATTGATCTTCAACGAGGAATTCCTTGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGGTCCGGTGAAGTGTTCGGATCGCGGCGAC---GTGGGCGGTTCGCTGCCGGCGACGTCGCGAGAAGTCCACTGAACCTTATCA Coccinia_adoensis 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Cucumis_sativus 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Cucurbita_pepo 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Datisca_glomerata 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Fagus_grandifolia 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Juglans_mandshurica 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Nothofagus_antarctica ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AC-TGTAAGGGATGCATTTATTAGATAAAAGGTCGACGCGGGCTTT-----GCCCGTTGCTCTGATGATTCATGATAACTCGACGGATCGCACGGCCATCGTGCCGGCGACGCATCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACTATGGTGGTGACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCA-GGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCTC-AT-TGAGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCA-GCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGACCTTGGGTTGGGCAGGTCGGTCCGCC--C--CTGGTGTGCAC-CGGCCCG-CTCGTCCCTTCTACCGGCGATGCGCTCCTGGCCTTAATTGGCCGGGTCGTGCCTCCGGTGCTGTTACTTTGAAGAAATTAGAGTGCTCAAAGCAAGCCTAC-GCTCTGGATACATTAGCATGGGATAACATCATAGGATTTCGGTCCTATTCTGTTGGCCTTCGGGATCGGAGTAATGATTAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACCAGGGATCGGCGGATGTTACTTTTAGGACTCCGCCGGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGCTATGCGGAGGA--GACCCTCCGTGGCCAGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCTTTTAGGCCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGTATTCAACGAGTTTATAGCCTTGGCCGACAGGCCCGGGTAATCTTTGAAATTTCATCGTGATGGGGATAGATCATTGCAATTGTTGGTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGGTCCGGTGAAGTGTTCG?????????????????????????????????????????????????????????????????? Pilostyles_aethiopica_Zimbabwe_Bellot_29 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