#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on September 19, 2025; 0:34 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Viana M.C., Menezes A., Moreira M.A., Pissinatti A., & Seuanez H.N. 2015. MECP2, a gene associated with Rett syndrome in humans, shows conserved coding regions, independent Alu insertions, and a novel transcript across primate evolution. BMC Genetics, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S17761] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=44; TAXLABELS Alouatta_belzebul_3 Alouatta_caraya_4 Alouatta_guariba_clamitans_5 Alouatta_seniculus_6 Aotus_lemurinus_17 Aotus_nigriceps_19 Aotus_trivirgatus_18 Ateles_paniscus_7 Brachyteles_arachnoides_8 Brachyteles_arachnoides_9 Cacajao_melanocephalus_13 Cacajao_melanocephalus_14 Callicebus_lugens_10 Callicebus_moloch_donacophilus_11 Callicebus_personatus_12 Callithrix_aurita_23 Callithrix_jacchus_24 Cebus_kaapori_31 Cebus_libidinosus_32 Cebus_olivaceus_29 Cebus_olivaceus_30 Cebus_robustus_33 Cebus_robustus_35 Cebus_xanthosternos_34 Cebus_xanthosternos_36 Cebus_xanthosternos_37 Chiropotes_israelita_15 Gorilla_gorilla_gorilla_39 Homo_sapiens_1 Leontopithecus_rosalia_22 Macaca_fascicularis_44 Macaca_mulatta_43 Nomascus_leucogenys_38 Pan_troglodytes_2 Pan_troglodytes_25 Papio_anubis_41 Pithecia_monachus_16 Pongo_abelli_42 Saguinus_bicolor_26 Saguinus_midas_27 Saguinus_mystax_28 Saimiri_boliviensis_21 Saimiri_sciureus_20 pan_paniscus_40 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M31811] TITLE Primate_MECP2_intron_3; LINK TAXA = Taxa; DIMENSIONS NCHAR=1119; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Cebus_libidinosus_32 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Cebus_olivaceus_30 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Cebus_robustus_33 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Cebus_robustus_35 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Cebus_xanthosternos_36 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Chiropotes_israelita_15 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