NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:13:26]
[Matrix accession#: M2778]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2778;
	DIMENSIONS  NTAX=10;
	TAXLABELS
		Dubautia_sp_Asap3A_haplotype8	Dubautia_sp_Asap3A_haplotype6	Dubautia_sp_Asap3A_haplotype7	Dubautia_sp_Asap3A_haplotype3	Dubautia_sp_Asap3A_haplotype2	Dubautia_sp_Asap3A_haplotype1	Dubautia_sp_Asap3A_haplotype4	Dubautia_sp_Asap3A_haplotype5	Dubautia_laxa_subsp._hirsuta_Asap3A	Argyroxiphium_sandwicense_subsp._macrocephalum_Asap3A
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2778;
	DIMENSIONS NCHAR=1022;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		Dubautia_sp_Asap3A_haplotype8                               TACAAACAGGCAGGTGACATACTCAAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTACGTACATATCTTGTATCTATAATCTATATCTCGATCGATCGATCTTCTACACCTTCTGCTTGCTTGCTTTCAAGAAACAACTAACTCAACATCATCTCTGAAAATAATATCGAATTTTGTCAATTTGATTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTCTGGACCTCCCACTATGAGGTCATCTCTCTCCTCTACCACTTCATATTCTATCCTCATACCATCTTGATCATCATGACTCGACTGCTTGACTTTTTAAACTTTGAATGTGTCAATGTTTGACCAAGTTAAACTTTTTAGAAGGCCAGTCGTCCCTCTTTATTCATATATGACCTTCTGACTTTTTT-CAAGTTTAAAAAGTTAGACGGTCATACAATATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGCTCAACTTATAAT-GACCATAGTGGTGCTGTGAGATTAGAAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGTTTATCATAAAAAATTAGTTTCAAGGATGTTACCAATAATATTTCAAAAACTCGAAAATCGCCTAAAATTGCGAGGTTTCACATCTTCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTTGTATTTTAAGAAAAGAATTGCTGTTGTGTCGAGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGAGAGCAACAATAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGATTCTAATACAATAAAGATTGAAATTTTGTTGTAGGTTCAATAAATTAATTGGTTAACTCTTAAGATTTAACTGATAAACTTGAATGGGTTTGCAGGCAAC
		Dubautia_sp_Asap3A_haplotype6                               TACAAACAGGCAGGTGACATACTCAAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTACGTACATATCTTGTATCTATAATCTATATCTCGATCGATCGATCTTCTACACCTTCTGCTTGCTTGCTTTCAAGAAACAACTAACTCAACATCATCTCTGAAAATAATATCGAATTTTGTCAATTTGATTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTCTGGACCTCCCACTATGAGGTCATCTCTCTCCTCTACCACTTCATATTCTATCCTCATACCATCTTGATCATCACGACTCGACTGCTTGACTTTTTAAACTTTGAATGTGTCAATGTTTGACCAAGTTAAACTTTTTAGAAGGCCAGTCGTCCCTCTTTATTCATATATGACCTTCTGACTTTTTT-CAAGTTTAAAAAGTTAGACGGTCATACAATATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGCTCAACTTATAATTGACCATAGTGGTGCTGTGAGATTAGGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGTTTATCATAAAAAATTAGTTTCAAGGATGTTACCAATAATATTTCAAGAACTCGAAAATCGCCTAAAATTGCGAGGTTTCACATCCTCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTTGTATTTTAAGAAAAGAATTGCTGTTGTGTCGAGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGAGAGCAACAATAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGATTCTAATACAATAAAGATTGAAATTTTGTTGTAGGTTCAATAAATTAATTGGTTAACTCTTAAGATTTAACTGATAAACTTGAATGGGTTTGCAGGCAAC
		Dubautia_sp_Asap3A_haplotype7                               TACAAACAGGCAGGTGACATACTCAAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTACGTACATATCTTGTATCTATAATCTATATCTCGATCGATCGATCTTCTACACCTTCTGCTTGCTTGCTTTCAAGAAACAACTAACTCAACATCATCTCTGAAAATAATATCGAATTTTGTCAATTTGATTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTCTGGACCTCCCACTATGAGGTCATCTCTCTCCTCTACCACTTCATATTCTATCCTCATACCATCTTGATCATCACGACTCGACTGCTTGACTTTTTAAACTTTGAATGTGTCAATGTTTGACCAAGTTAAACTTTTTAGAAGGCCAGTCGTCCCTCTTTATTCATATATGACCTTCTGACTTTTTT-CAAGTTTAAAAAGTTAGACGGTCATACAATATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGCTCAACTTATAAT-GACCATAGTGGTGCTGTGAGATTAGAAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGTTTATCATAAAAAATTAGTTTCAAGGATGTTACCAATAATATTTCAAAAACTCGAAAATCGCCTAAAATTGCGAGGTTTCACATCTTCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTTGTATTTTAAGAAAAGAATTGCTGTTGTGTCGAGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGAGAGCAACAATAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGATTCTAATACAATAAAGATTGAAATTTTGTTGTAGGTTCAATAAATTAATTGGTTAACTCTTAAGATTTAACTGATAAACTTGAATGGGTTTGCAGGCAAC
		Dubautia_sp_Asap3A_haplotype3                               TACAAACAGGCAGGTGACATACTCAAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTACGTACATATCTTGTATCTATAATCTATATCTCGATCGATCGATCTTCTACACCTTCTGCTTGCTTGCTTTCAAGAAACAACTAACTCAACATCATCTCTGAAAATAATATCGAATTTTGTCAATTTGATTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTCTGGACCTCCCACTATGAGGTCATCTCTCTCCTCTACCACTTCATATTCTATCCTCATACCATCTTGATCATCACGACTCGACTACTTGACTTTTTAAACCTTGAATGTGTCAATGTTTGACCAAGTTAAACTTTTTAGAAGGCCAGTCGTCCCTCTTTATTCATATATGACCTTCTCACTTTTTTTCAAGTTTAAAAAGTTAGACGGTCATACAATATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTCAACTTATAATTGACCATAGTGGTGCTGTGAGATTAGTAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGTTTATCATAAAAAATTAGTTTCAAGGATGTTACCAATAATATTTCAAGAACTCGAAAATCGCCTAAAATTGCGAGGTTTCACATCCTCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTTGTATTTTAAGAAAAGAATTGCTGTTGTGTCGAGTGATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGAGAGCAACAATAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGATTCTAATACAATAAAGATTGAAATTTTGTTGTAGGTTCAATAAATTAATTGGTTAACTCTTAAGATTTAACTGATAAACTTGAATGGGTTTGCAGGCAAT
		Dubautia_sp_Asap3A_haplotype2                               TACAAACAGGCAGGTGACATACTCAAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTACGTACATATCTTGTATCTATAATCTATATCTCGATCGATCGATCTTCTACACCTTCTGCTTGCTTGCTTTCAAGAAACAACTAACTCAACATCATCTCTGAAAATAATATCGAATTTTGTCAATTTGATTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTCTGGACCTCCCACTATGAGGTCATCTCTCTCCTCTACCACTTCATATTCTATCCTCATACCATCTTGATCATCACGACTCGACTACTTGACTTTTTAAACCTTGAATGTGTCAATGTTTGACCAAGTTAAACTTTTTAGAAGGCCAGTCGTCCCTCTTTATTCATATATGACCTTCTCACTTTTTTTCAAGTTTAAAAAGTTAGACGGTCATACAATATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTCAACTTATAATTGACCATAGTGGTGCTGTGAGATTAGGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGTTTATCATAAAAAATTAGTTTCAAGGATGTTACCAATAATATTTCAAGAACTCGAAAATCGCCTAAAATTGCGAGGTTTCACATCCTCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTTGTATTTTAAGAAAAGAATTGCTGTTGTGTCGAGTGATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGAGAGCAACAATAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGATTCTAATACAATAAAGATTGAAATTTTGTTGTAGGTTCAATAAATTAATTGGTTAACTCTTAAGATTTAACTGATAAACTTGAATGGGTTTGCAGGCAAT
		Dubautia_sp_Asap3A_haplotype1                               TACAAACAGGCAGGTGACATACTCAAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTACGTACATATCTTGTATCTATAATCTATATCTCGATCGATCGATCTTCTACACCTTCTGCTTGCTTGCTTTCAAGAAACAACTAACTCAACATCATCTCTGAAAATAATATCGAATTTTGTCAATTTGATTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTCTGGACCTCCCACTATGAGGTCATCTCTCTCCTCTACCACTTCATATTCTATCCTCATACCATCTTGATCATCACGACTCGACTACTTGACTTTTTAAACCTTGAATGTGTCAATGTTTGACCAAGTTAAACTTTTTAGAAGGCCAGTCGTCCCTCTTTATTCATATATGACCTTCTCACTTTTTTTCAAGTTTAAAAAGTTAGACGGTCATACAATATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTCAACTTATAATTGACCATAGTGGTGCTGTGAGATTAGGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGTTTATCATAAAAAATTAGTTTCAAGGATGTTACCAATAATATTTCAAGAACTCGAAAATCGCCTAAAATTGCGAGGTTTCACATCCTCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTTGTATTTTAAGAAAAGAATTGCTGTTGTGTCGAGTGATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGAGAGCAACAATAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGATTCTAATACAATAAAGATTGAAATTTTGTTGTAGGTTCAATAAATTAATTGGTTAACTCTTAAGATTTAACTGATAAACTTGAATGGGTTTGCAGGCAAT
		Dubautia_sp_Asap3A_haplotype4                               TACAAACAGGCAGGTGACATACTCAAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTACGTACATATCTTGTATCTATAATCTATGTCTCGATCGATCGATCTTCTACACCTTCTGCTTGCTTGCTTTCAAGAAACAACTAACTCAACATCATCTCTGAAAATAATATCGAATTTTGTCAATTTGATTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTCTGGACCTCCCACTATGAGGTCATCTCTCTCCTCTACCACTTCATATTCTATCCTCATACCATCTTGATCATCACGACTCGACTACTTGACTTTTTAAACCTTGAATGTGTCAATGTTTGACCAAGTTAAACTTTTTAGAAGGCCAGTCGTCCCTCTTTATTCATATATGACCTTCTCACTTTTTTTCAAGTTTAAAAAGTTAGACGGTCATACAATATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTCAACTTATAATTGACCATAGTGGTGCTGTGAGATTAGGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGTTTATCATAAAAAATTAGTTTCAAGGATGTTACCAATAATATTTCAAGAACTCGAAAATCGCCTAAAATTGCGAGGTTTCACATCCTCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTTGTATTTTAAGAAAAGAATTGCTGTTGTGTCGAGTGATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGAGAGCAACAATAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGATTCTAATACAATAAAGATTGAAATTTTGTTGTAGGTTCAATAAATTAATTGGTTAACTCTTAAGATTTAACTGATAAACTTGAATGGGTTTGCAGGCAAT
		Dubautia_sp_Asap3A_haplotype5                               TACAAACAGGCAGGTGACATACTCAAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTACGTACATATCTTGTATCTATAATCTATGTCTCGATCGATCGATCTTCTACACCTTCTGCTTGCTTGCTTTCAAGAAACAACTAACTCAACATCATCTCTGAAAATAATATCGAATTTTGTCAATTTGATTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTCTGGACCTCCCACTATGAGGTCATCTCTCTCCTCTACCACTTCATATTCTATCCTCATACCATCTTGATCATCACGACTCGACTACTTCACTTTTTAAACCTTGAATGTGTCAATGTTTGACCAAGTTAAACTTTTTAGAAGGCCAGTCGTCCCTCTTTATTCATATATGACCTTCTCACTTTTTTTCAAGTTTAAAAAGTTAGACGGTCATACAATATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTCAACTTATAATTGACCATAGTGGTGCTGTGAGATTAGGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGTTTATCATAAAAAATTAGTTTCAAGGATGTTACCAATAATATTTCAAGAACTCGAAAATCGCCTAAAATTGCGAGGTTTCACATCCTCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTTGTATTTTAAGAAAAGAATTGCTGTTGTGTCGAGTGATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGAGAGCAACAATAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGATTCTAATACAATAAAGATTGAAATTTTGTTGTAGGTTCAATAAATTAATTGGTTAACTCTTAAGATTTAACTGATAAACTTGAATGGGTTTGCAGGCAAT
		Dubautia_laxa_subsp._hirsuta_Asap3A                         TACAAACAGGCAGGTGACATACTCAAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACAATGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTACGTACATATCTTGTATCTATAATCTATATCTCGATCGATCGATCTTCTACACCTTCTGCTTGCTTGCTTTCAAGAAACAACTAACTCAAGATCATCTCTGAAAATAATATCGAATTTTGTCAATTTGATTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTCTGGA----------------------TCTCCTCTACCACTTCATATTCTATCCTCATACCATCTTGATCATCACGACTCGACTGCTTGACTTTTTAAACTTTGAATGTGTCAATGTTTAACCAAGTTAAACTTTTTAGAAGGCCAGTCGTCCCTCTTTATTCATATATGACCTTCTGACTTTTTT-CAAGTTTAAAAAGTTAGACGGTCATACAATATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTCAACTTATAATTGACCATAGTGGTGCTGTGAGATTAGAAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGTT-ATCATAAAAAATTAGTTTCAAGGATGTTACCAATAATATTTCAAGAACTCGAAAATCGCCTAAAATTGCGAGGTTTCACATCCTCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTTGTATTTTAAGAAAAGAATTGCTATTGTGTCGAGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGAGAGCAACAATAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGATTCTAATACAATAAAGATTGAAATTTTGTTGTAGGTTCAATAAATTAATTGGTTAACTCTTAAGATTTAACTGATAAACTTGAATGGGTTTGCAGGCAAC
		Argyroxiphium_sandwicense_subsp._macrocephalum_Asap3A       TACAAACAGGCAGGTGACATACTCAAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTACGTACATATCTTGTATCTATAATCTATATCTCGATCGATCGATCTTCTACACCTTCTGCTTGCTTGCTTTCAAGAAACAACTAACTCAACATCATCTCTGAAAATAATATCGAATTTTGTCAATTTGATTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTCTGGACCTCCCACTATGAGGTCATCTCTCTCCTCTACCACTTCATATTCTATCCTCATACCATCTTGATCATCACGACTCGACTGCTTGACTTTTTAAACTTTGAATGTGTCAATGTTTGACCAAGTTAAACTTTTTAGAAGGCCAGTCGTCTCTCTTTATTCATATATGACCTTTTGACTTTTTT-CAAGTTTAAAAAGTTAGACGGTCATACAATATACAATGGTGTTGGCGGGTGGTTGTTCAACTTATAATTGACCATAGTGGTGCTGTGAGATTAGAAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGTTTATCATAAAAAATTAGTTTCAAGGATGTTACCAATAATATTTCAAGAACTCGAAAATCGCCTAAAATTGCGAGGTTTCACATCCTCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTTGTATTTTAAGAAAAGAATTGCTGTTGTGTCGAGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGAATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGAGAGCAACAATAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGATTCTAATACAATAAAGATTGAAATTTTGTTGTAGGTTCAATAAATTAATTGGTTAACTCTTAAGATTTAACTG--AAACTTGAATGGGTTTGTAGGCAAC
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 1022 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;