#NEXUS [MacClade 4.08 registered to etter, UMass] BEGIN TAXA; DIMENSIONS NTAX=49; TAXLABELS L3 L1 L2 L4 L5 L6 L7 L8 L9 L10 L11 L12 L13 L14 L15 L16 L17 L18 L19 L20 L21 L22 L23 L24 L25 L26 L27 L28 L29 L30 L31 L32 L33 L34 L35 L36 L37 L38 L39 L40 L41 L42 L43 L44 L45 L47 L48 L49 L50; END; BEGIN CHARACTERS; DIMENSIONS NCHAR=150; FORMAT DATATYPE=DNA MISSING=? GAP=- ; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150] [ . . . . . . . . . . . . . . .] L3 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L1 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L2 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L4 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAATTTAGAAT [144] L5 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATATATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L6 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L7 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-GGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L8 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AGATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATTTAGTTAATTTTGAATTTAGAAT [144] L9 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAATTTAGAAT [144] L10 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L11 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTAAATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L12 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAGAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L13 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L14 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAATTTAGAAT [143] L15 TTTAATT-ATTATA-TATAAAAGTGAAA-TA-TA-CAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L16 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTAATAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [145] L17 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGACCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L18 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAGA-TA-CA-AGATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L19 TTTAATT-ATTATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L20 TTTAATT-ACCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L21 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTGTGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L22 TTTAATT-ACCATA-TATAAAAATGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAATTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L23 TTTAATT-ATCACA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L24 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTGA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L25 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATATAATCATTCA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L26 TTTAATT-ATCGTA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L27 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGAAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L28 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AGATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L29 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L30 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGTAA-TA-CA-AGATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L31 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATCTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L32 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTCAATTTTGAACTTAGAAT [144] L33 TTTAATT-ATCATAATATAAAAGTGAAA-TA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L34 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATCAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTACGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L35 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCGTTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L36 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L37 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATCAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTAGGATCCAAATT-AGTTGATTTTGAACTTAGAAT [143] L38 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAAATTTGAACTTAGAAT [143] L39 TTTAATT-ATTATA-TATAAAAGTGAAAATA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L40 TTTAATT-ATTATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L41 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-TA-AAATATAATTTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L42 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAACT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [143] L43 TTTAATTTATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L44 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TACGA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L45 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATACTACAAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTCAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAATTTAGAAT [146] L47 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAG [144] L48 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGACGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAACTTAGAAT [144] L49 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAA-TA-CA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGGGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAATAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAGCTTAGAAT [143] L50 TTTAATT-ATCATA-TATAAAAGTGAAAATA-TA-AAATATAAATTAATTTTAGTTGGAGCAACTGGGAGGGATAAAAATCTTTTATTAAATCATTTA-TAGTAATATTTATATTTATGATCCAAATT-AGTTAATTTTGAATTTAGAAT [144] ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions = N: 1-150; CODESET * UNTITLED = Universal: all ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE=unord PolyTcount=MINSTEPS ; END; BEGIN TREES; TRANSLATE 1 L3, 2 L1, 3 L2, 4 L4, 5 L5, 6 L6, 7 L7, 8 L8, 9 L9, 10 L10, 11 L11, 12 L12, 13 L13, 14 L14, 15 L15, 16 L16, 17 L17, 18 L18, 19 L19, 20 L20, 21 L21, 22 L22, 23 L23, 24 L24, 25 L25, 26 L26, 27 L27, 28 L28, 29 L29, 30 L30, 31 L31, 32 L32, 33 L33, 34 L34, 35 L35, 36 L36, 37 L37, 38 L38, 39 L39, 40 L40, 41 L41, 42 L42, 43 L43, 44 L44, 45 L45, 46 L47, 47 L48, 48 L49, 49 L50 ; TREE * UNTITLED = [&R] (28,(30,(2,((34,37),((7,10),(((8,14),9),((((((12,((21,(20,22)),16)),(31,((4,(15,19)),((((((33,36),3),(24,(25,17))),(23,35)),11),((26,(29,(32,1))),5))))),(6,(39,18))),27),13),38))))))); END; BEGIN MacClade; Version 4.0 87; LastModified -919190301; FileSettings editor '0' '0' '1' '1'; Singles 010; Editor 00011001111111100100010010 '1' '12' Geneva '9' '180' '1' all; EditorPosition '47' '16' '931' '1655'; TreeWindowPosition '46' '6' '755' '1230'; ListWindow Characters closed Geneva '9' '50' '10' '273' '399' 000; ListWindow Taxa closed Geneva '9' '50' '10' '177' '490' 100000000; ListWindow Trees closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490' ; ListWindow TypeSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490' ; ListWindow WtSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490' ; ListWindow ExSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490' ; ListWindow CharSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490' ; ListWindow TaxSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490' ; ListWindow CharPartitions closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490' ; ListWindow CharPartNames closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490' ; ListWindow WtSets closed Geneva '9' '50' '10' '276' '490' ; ChartWindowPosition '52' '30' '518' '740'; StateNamesSymbols closed Geneva '9' '10' '50' '30' '148' '220'; WindowOrder ; OtherSymbols &/ 00 ?-; Correlation '0' '0' '1000' '0' '0' 10011010; Salmo 00000001; EditorFile '2'; ExportHTML _ MOSS '100' 110000; PrettyPrint 10; EditorToolsPosition '485' '165' '115' '165'; TreeToolsPosition '439' '5' '126' '138'; TreeWindowProgram 10; TreeWindow 0000; Continuous '0' '3' 1; Calculations 0000001; SummaryMode '0' '0' 0; Charts Geneva '9' (normal) 0010; NexusOptions '0' '0' '50' 001011011; TipLabel '1'; TreeFont Geneva '9' (normal); TreeShape 1.0 1.0 0100; TraceLabels 0101; ChartColors '0' '0' '65535' '9' '0' 1; ChartBiggestSpot 1; ChartPercent 10; ChartBarWidth '10' 1; ChartVerticalAxis 10101; ChartMinMax '0'; TraceAllChangesDisplay '1' 1; BarsOnBranchesDisplay '0' '0' '60000' '10000' '10000' '10000' '10000' '60000' '65000' '65000' '65000' '6' '1' 0000101; ContinuousBranchLabels 0; AllStatesBranchLabels 1; IndexNotation '2' 1; PrintTree 10.00 '2' '2' '2' '2' '2' '2' '2' '2' '2' '2' '2' Geneva '9' (normal) Geneva '10' (normal) Geneva '9' (normal) Geneva '9' (normal) Geneva '9' (bold ) Geneva '9' (normal) Geneva '9' (normal) '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '0' '1' '1' '1' '1' '147' '0' '-39' '4' '-40' '0' '1' '2' '1' '8' '0' '0' '0' '2' 1000111000000000000100000111000; MatchChar 00 .; EntryInterpretation 01; ColorOptions 00; TreeTools '0' '5' '4' '0' '10' '4' '0' 00100111111101110; EditorTools '1' '0' '0' '1000' '0' '0' '6' '3' '0' 100010101110001; PairAlign '2' '2' '3' '2' '1' '1' '2' '1' '3' 1010; BothTools '1'; END;