#NEXUS
[written Mon May 27 18:29:18 EDT 2013 by Mesquite  version 2.75 (build 566) at Simba.local/10.0.0.10]

BEGIN TAXA;
	TITLE Taxa;
	DIMENSIONS NTAX=9;
	TAXLABELS
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	;

END;


BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  'atp6 epi E-INS-i';
	DIMENSIONS  NCHAR=660;
	FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?;
	MATRIX
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;



END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
	TYPESET * UNTITLED   =  unord:  1 -  660;

END;

BEGIN CODONS;
	CODESET * UNTITLED   =  universal:  1 -  660;


END;

BEGIN MESQUITECHARMODELS;
	ProbModelSet * UNTITLED   =  'Jukes-Cantor':  1 -  660;
END;

BEGIN TREES;
	Title 'atp6 epi E-INS-i';
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Sebacina_epigaea_JQ665660,
		2 Sebacina_epigaea_JQ665661,
		3 Sebacina_epigaea_JQ665662,
		4 Sebacina_epigaea_JQ665663,
		5 Sebacina_epigaea_JQ665664,
		6 Sebacina_epigaea_JQ665665,
		7 Sebacina_epigaea_JQ665666,
		8 Sebacina_epigaea_JQ665667,
		9 Sebacina_epigaea_JQ665668;
	TREE PAUP_1 = (9:0.13958473,((7:1.0E-8,8:1.0E-8):0.02552348,((5:1.0E-8,6:1.0E-8):0.02587076,(4:1.0E-8,(3:1.0E-8,(1:1.0E-8,2:1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):0.01062986):2.77E-6):0.13958473)[% ] [% ] [%  setBetweenBits = selected ];

END;


Begin MESQUITE;
		MESQUITESCRIPTVERSION 2;
		TITLE AUTO;
		tell ProjectCoordinator;
		timeSaved 1369693758430;
		getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa;
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			setID 0 3523956876167210885;
		endTell;
		getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters;
		tell It;
			setID 0 6823930264468884300;
			mqVersion 275;
			checksumv 0 3 546512163 null  getNumChars 660 numChars 660 getNumTaxa 9 numTaxa 9   short true   bits 15   states 15   sumSquaresStatesOnly 195087.0 sumSquares 195087.0 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true   NumFiles 1 NumMatrices 1;
			mqVersion;
		endTell;
		getWindow;
		tell It;
			suppress;
			setResourcesState true false 190;
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			desuppress;
		endTell;
		endTell;
end;