NEXUS
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[Matrix accession#: M2412]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2412;
	DIMENSIONS  NTAX=15;
	TAXLABELS
		Mucor_hiemalis_f_luteus_AY243951	Umbelopsis_isabellina_YODK039	Umbelopsis_isabellina_YODK041	Umbelopsis_ramanniana_YODK170	Umbelopsis_ramanniana_YODK119	Umbelopsis_ramanniana_YODK106	Umbelopsis_ramanniana_YODK101	Umbelopsis_ramanniana_YODK036	Umbelopsis_ramanniana_YODK122	Umbelopsis_ramanniana_YODK120	Umbelopsis_ramanniana_YODK028	Umbelopsis_ramanniana_YODK130	Umbelopsis_ramanniana_YODK129	Umbelopsis_ramanniana_YODK126	Umbelopsis_ramanniana_YODK004
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2412;
	DIMENSIONS NCHAR=602;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		Mucor_hiemalis_f_luteus_AY243951       AAGGCTTGGCTTCCGGGTCACGCTCTTCTATAATTTACTGTGAACCTGTATTATTTTCTGGCGTTTGAGAAATGTCCTGCTGGCTATAAGGATAGGCCTGGTAGGAATGTTAATCGAGTCAGAGTCAGGCTTAGGCCTGGTATCCTATTATTATTTACCAAAAGAATTCAGTATTATAATTGTAACATAAGCGTAAAAAACTTA-TAAAAACAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGC-AAAGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCATA-TTCAGTGAATCATCGAGTCTTTGAACGC-ATCTTGCGCCTGATGGTATTCCATCAGGCACGCCTGTTTCAGTATCAAAAACACCCCACATTCCAAAC---CTTGCGT--TTGAA-A-TGGACTTGAGAAGTTCCACCTTGG-------TGGATTTCTTTAAATACATTAGGCCTGAACTTTGGTTTTTCTGCCTGA-ACATTTTTTTAATATAAAGGAATGCTCTAGTAAAAA----AGACTTTCTTGGG------------GGCCTCCCAAATAAATCATTCT------------------------TA
		Umbelopsis_isabellina_YODK039          CCAAAAGAT-AATC---TTTCA--TTCGAAAGA--TCTTT-CC--TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTAATTTTG-----GGACTTAAACATGATCCGCCTTACGGT--------GTATCGGTCCCAAAAACAATATATCATCCTT-ATTAAAAACTTACTGAAC----T-AAACAATT---GATTTAA------TAATCTGTTTAAAACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGTACGC-ACATTGCACTCCTTGGTATTCCGAGGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAGCACTCTCACACC-TAAC---CTTTGGGTTATGTT--GTGGAATTGGGATGCGCCGATTTTACACTAGTCGGCACCCCTAAAATGTAGCTCTTG-GCTGTTT-CCTACTACAGCAGT----TTGGCCTAATA-GTTTTGAC--TTTTGTC-AAATCTTTGGCTACATTTGCTTCTGGAA-ATCAGTCTTGATAATACAGAAAACT-------------------CATT-CA
		Umbelopsis_isabellina_YODK041          CCAAAAGAT-AATC---TTTCAA-CTCGAAAGA--TCTTTTCCT-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTAATTTTG-----GGACTTAAACATGGTAAGCCTTACGGT--------TTACCGGTCCCAAAAACAATATATCATCCTT-ATGAAAAACTTACTGAACA-ACT-AAACAATG---ATTTTAA------TAATCTGTTTAAAACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCCACATTGCACTCCTTGGTATTCCGAGGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAGCACTCTCACACC-TAAC---CTTTGGGTTATGTC--GTGGAATTGGGATGCGCCGATTTTT-ACTAGTCGGCACTCCNAAAATGTAGCTCTTG-GCTGTTT-CCTATTACAGCAGT----TTGGCCTAATA-GTTTTGAC--TTTTGTC-AAATCTTTGGCTACATTTGCTTCTGGAA-ATCAGTCTTGATAATACAGAAAACT-------------------CATTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK170          CTGAAGTG--AGTC----TTCATTCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTAATGTTG-----GGGATTAAACATGGTTGAGA--GAAAT-------CTTGGCCGTCCCCAACAAATTATCTTATCCTTTATTAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAAAA-TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAACATTTTTTTTGTTGTAATTAGTGGACTTGGGATGCGCTGGTGTCAAA----TCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGC-ATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATC-CTGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTTTTGAGGT------TGTACCTCCTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK119          CTGAAGTG--AGTC----TTCAATCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTAATGTTG-----GGGATTAAACATGGTTGAGA--GAAAT-------CTTGGCCGTCCCCAACAAATTATCTTATCCTTTATTAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAAAAATAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAACATTTTTTTTGTTGTAATTAGTGGACTTGGGATGCGCTGGTGTCAAA----TCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGC-ATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATC-CTGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTTTTGAGGT------TTTACCTCTTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK106          CTGAAGTG--AGTC----TTCAATCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTAATGTTG-----GGGATTAAACATGGTTGAGA--GAAAT-------CTTGGCCGTCCCCAACAAATTATCTTATCCTTTATTAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAAAA-TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAACATTTTTTTTGTTGTAATTAGTGGACTTGGGATGCGCTGGTGTCAAA----TCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGC-ATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATC-CTGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTTTTGAGGT------TTTACCTCTTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK101          CTGAAGTG--AGTC----TTCAATCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTAATGTTG-----GGGATTAAACATGGTTGAGA--GAAAT-------CTTGGCCGTCCCCAACAAATTATCTTATCCTTTATTAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAAAA-TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAACATTTTTTTTGTTGTAAT-AGTGGACTTGGGATGCGCTGGTGTCAAA----TCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGC-ATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATC-CTGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTTTTGAGGT-------TTACCTCTT-CA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK036          CTGAAGTG--AGTC----TTCAATCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTAATGTTG-----GGGATTAAACATGGTTGAGA--GAAAT-------CTTGGCCGTCCCCAACAAATTATCTTATCCTTTATTAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAAAA-TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAACATTTTTTTTGTTGTAATTAGTGGACTTGGGATGCGCTGGTGTCAAA----TCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGC-ATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATC-CTGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTTTTGAGGT------TTTACCTCTTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK122          CTGAAGTG--AGTC----TTCA-TCATTTGAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTATT-GTAATGTTG-----GGGATTAAACATGGTTGA-------TTTAT----TTCGGCCGTCCCCAACAATTTATCTTATCCTTTATTAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAAA--TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCCCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAAC---TTTTTTGTTGTAAG-AGTGGACTTGGAATGCGCTGGTGTCA-A----TCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGC-ATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATC-CTGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTTT-GAGGTTAAC--G---CTTCTTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK120          CTGAAGTG--AGTC----TTCA-TCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTAATGTTG-----GGGATTAAACATGGTTGAAT-----TTT------TTTAGCCGTCCCCAACAATTTATCTTATCCTTTATAAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAA---TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAAC---TTTTTTGTTGTAAG-AGTGGACTTGGAATGCGCTGGTGTCA-A----TCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGC-ATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATC-CTGGCTTTTTTTGCTTAGTATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTTT-GAGGTTAAC--G---CCTCTTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK028          CTGAAGTG--AGTC----TTCAATCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTAATGTTA-----GGGATTAAACATGGTTGGAAAA---TTTTT----TTCAGCCGTCCCTAACAATTTATCTTATCCTTTATAAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAA---TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTACACC---TTTTTTGTTGTAAG-AGTGGACTTGGAATGCGCTGGTGTCA-A----TCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGC-ATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATC-CTGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTT--GAGGTTGAC--G---CCTCTTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK130          CTGAAGTG--AGTC----TTCA-TCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTTATGTTG-----GGGATTAAACATGGTTGGAA-----TTTAT----TTCAGCCGTCTCCAACAATT-ATCTCATCCTTTATTAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAA---TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAAC---TTTATTGTTGTAAT-AGTGGACTTGGAATGCGCTGGTGTCA-A----TCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGTAATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATCACTGGCTTTTTTTACTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTT--GAGGT-GACTTGTTCTCCTCTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK129          CTGAAGTG--AGTC----TTCA-TCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTTATGTTG-----GGGATTAAACATGGTTGGAA-----TTTAT----TTCAGCCGTCCCCAACAATT-ATCTCATCCTTTATTAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAA---TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAAC---TTTATTGTTGTAAT-AGTGGACTTGGGATGCGCTGGTGTCA-A----TCAGCCCTCCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGTAATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATCACTGGCTTTTTTTACTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTT--GAGGT-GACTTGT-CTCCTCTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK126          CTGAAGTG--AGTC----TTCA-TCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTTATGTTG-----GGGATTAAACATGGTTGAAA-----TTTAT----TTCAGCCGTCTCCAACAATT-ATCTCATCCTTTATTAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAA---TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAAC---TTTATTGTTGTAAT-AGTGGACTTGGGATGCGCTGGTGTCA-A----TCAGCCCTCCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGTAATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATCACTGGCTTTTTTTACTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTT--GAGGT-GACTTGT-CTCCTCTTCA
		Umbelopsis_ramanniana_YODK004          CTGAAGTG--AGTC----TTCA-TCATT-GAAGCTTCTT-CCCA-TTGTGCTGGCTTTGACCGTAT--GTTATGTTG-----GGGATTAAACATGGTT----A-GAATTTAT----TTTAGCCGTCCCCAACAATT-ATCTCATCCTTTATTAAA-TTGAACTGAACTCATT-TTGAGATT---ACATAAAAAA---TAATCT-TTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGC-GAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGC-ACATTGCACTCTATGGTATTCCGTAGAGTATGCCTGTTTCAGTATCATGAACACCTCACTACTATAAC---TTTATTGTTGTAAT-AGTGGACTTGGAATGCGCTGGTGTCA-A----TCAGCCCTTCTAAAATGGAGTTCTTGCACTGTTGATTTGTTTTAACAGCGATGTTGGCCTAATAAGTTTCGGCAGTAATGTTGAAATC-CTGGCTTTTTTTGCTTAGAATCTGACAGTCTTGATA-TACAGAATTTT--GAGGT-GACTTGT-CTCCTCTTCA
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 602 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;