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Clitocybe_subditopoda_EU852807 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AAATCTGGTGGTC-CTTGTGGCCGTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCGTTATCCGCGCCGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAACGGAGCGTCATAGAGGGTGA-GAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCGGGGCTT-TGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCCGGGGATCAACCTTGC-TCTTTTGCTTGGCG-TACTTTCCGGTCGA-CGGGTCAGCATCAATTTTGACCGGTGGATAAAGGTCAGGGGAATGTGGCATCTTCGGATGTGTTATAGCCCTTGGTCGCATGCATCGATTGGGATTGAGGAACTCAG-CACGCCGCAAGGCCGGGT-TTTT--AACCACGT-ACGTGCTTAGGATGCTGGCATAATGGCTTTAATCGAC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATATAGGGCTCTTTCGGGTCTTATAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACTTCAGACCTGGTCGGGCGGTCCGCTTAACGGCGTGTACTGTCTGACTGGGCCTTACCTCTTGGTGAGCCGGCGTGCCCTTTATTGGTGTGCGTCGGGGAACCAGGACTTTTACCTTGAGAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTATGCCCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGAGTCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTTGGGGGCATTGGTATTGAGTCGCTAGAGGTGAAATTCTTGGATTGACTCAAGACCGACTATTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAGGTTAGGGGATCGAAAACGATCAGATACCGTTGTAGTCTTAACAGTAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGACCTCAAATATGATGTATCGCTCGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGTGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGA Clitocybe_pruinosa_KJ681062_KJ681062_KJ681084_KJ681 AAATCTGGTAGCC--TCTAGGTTATCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCGTTGTCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAATGGAGCATCATAGAGGGTGA-GAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCAGGGCTT-TGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGTTCTGGGATCAGCCTTGC-TATCTTGCTTGGTT-TACTCCCTGGGCAA-TGGGTCAGCATCAATTTTGACTGGTGGACAAAGGCCAGGGGAATGTGGCATCTTCGGATGTGTTAAAGCCCTTGGTTGCATACATTGGTTGGGATTGAGGAACTCAG-CACGCCGAAAGGCCGGGTTTATTTAAACCACGTT-CGTGCTTAGGATGCTGGCATAATGGCTTTAATCGAC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGTGTGTGGATGGGTGTTCATCGTGACCCTGCCAACTTGGTGAAAACTATTAAGAAGTTGCGGCGGAAGGATGATATCAGTCCCGAGGTGTCTGTTGTTCGGGATATCCGCGAGAAGGAACTACGGTTGTACACAGATGCTGGTCGTGTTTGTCGACCTCTTTTCATCGTTGAAAATCAACAATTGGCACTTCAGAAAAAACACATCAAATGGCTTAACAATGGTTATAATGATGAGGGTGAGGAGTACAAATGGGAGCAGCTCATTAAAGGTGGTATTATTGAGCTATTGGATGCAGAGGAGGAAGAAACTGTCATGATTTCGATGACCCCAGAAGATCTGGAGAATTCTCGATTACATCAGAGCGGTGTCGATCCTCACGCTAACGATACAGACTTCGATCCAGCGGCAAGGCTCAAAGCAGGCATTAATTCGCATACTTGGACACATTGCGAAATCCATCCAAGCATGATTTTAGGTA???????????????????????????????????????????????????ATTGTGCCATCCTCATCATTGCTGGTGGTACTGGTGAATTCGAAGCTGGCATCTCCAAGGATGGCCAGACTCGCGAGCACGCTTTGCTTGCTTTCACCCTCGGTGTCAGACAGCTTATTGTTGCTGTTAACAAAATGGACACCACTAAAGTAAGCTTCCATTCTTTGTATGGTCTTGAA------------TCTTGTCCAATAGTTATTGTAGTGGAGCGAGGACCGATTCAACGAAATCGTGAAGGAGACCTCAAATTTCATCAAAAAGGTCGGCTATAACCCCAAGGCAGTTGCTTTCGTTCCCATTTCTGGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGAGTCCCCCAAGTACGTAG----TCCTTCATTTCCACCATGAATCTTTTATTCAATAATCCA--TTCATAGCATGCCATGGTTCAAGGGCTGGACCAAGGAGAATAAATCTGGTGCTGTCAAAGGCAAGACCCTCCTTGATGCCATCGATGCCATCGAGCCCCCGGTCCGTCCGTCCGAGAAACCCCTTCGTCTTCCTCTCCA?GATGTCTAC?????????????CGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATATAGGGCTCTTTCGGGTCTTATAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATMTTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACTTCAGACCTGGTTGGGCGGTCCGCTTAACGGCGAGTACTGTCTGACTGGGCCTTACCTCTTGGTGAGCCGGCGTGCCCTTTATTGGCGTGCGTCGGGGAACCAGGACTTTTACCTTGAGAAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGGCCTATGCCCGAATACATTAGCATGGAATAATAAAATAGGACGTGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGAGTCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTTGGGGGCATTGGTATTGAGTCGCTAGAGGTGAAATTCTTGGATTGACTCAAGACCAACTATTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAGGTTAGGGGATCGAAAACGATCAGATACCGTTGTAGTCTTAACAGTAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGACCTCAAATTTAATGTGTCGCTCGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGA?????????????????????????????????????? Tricholoma_myomyces_U76459_DQ367436_DQ367429 AAATCTGAGGGTC-TTTATGGCCTTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGCTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAACGGAGCGTCATAGAGGGTGA-GAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCAGGGCTTATGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCATTGGCCAGGGATCAACCTTGC---TTTTCCTTGGTG-TATTTTCTGGTTAA-TGGGTCAGCATCAATTTTGATCGGTGGAAAAAGATCAAGGGAATGTGGCATCTTCGGATGTGTTATAGCCTTTGGTTGTATACATCGGTTGGGATTGAGGAACTCAG-CACGCCGCAAGGCCGGGT-TTTT--AACCACGT-ACGTGCTTAGGATGCTGGCATAATGGCTTTAATCGACTTGGCGCTCATGGCCTGTATATCTGTCGGTTCTTACTCTGCACCCGTTATCGAGTTCCTGGAAGAGTGGGGACTCGAATCTCTTGAAGAGAACGCGCATTCTTCCACACCTTGCACCAAGGTGTTTGTTAATGGTGTGTGGATGGGCGTCCATCGCGATCCAGCGAATCTCGTGAAGACCATTAAAAAGCTACGACGGAAGGATGACATCAGCCCTGAAGTCTCGGTTGTCCGGGATATCCGGGAGAAGGAATTGCGATTGTACACCGATGCAGGACGCGTTTGTCGACCGCTGTTCATCGTCGAAAATCAACAACTTGCGCTACAAAAGAAGCACATCAGATGGCTTAATAGTGGGTTTAATGATGAGGGAGAGGAATTCAAGTGGGAGCAGCTTGTAAAGGGTGGTATAATTGAGTTATTGGACGCAGAGGAGGAAGAGACCGTCATGATATCGATGACACCTGAGGATTTAGAGAACTCCAGATTGCATCAAAGCGGCGTCGATCCTCACGCCAACGACGGAGAGTTCGACCCAGCAGCAAGACTGAAAGCAGGGATTAACTCACACACTTGGACACATTGTGAAATTCATCCTAGCATGATTCTCGGTATCTGTGCAAGTATCATCCCTTTCCCTGATCACAATCAGGTATGATTTCATCATTGTGCCATTCTCATTATCGCTGGTGGCACAGGTGAGTTTGAGGCCGGTATCTCCAAGGACGGTCAAACTCGAGAGCACGCCCTCCTTGCATTCACGCTTGGTGTGCGGCAGCTCATTGTTGCTGTGGACAAGATGGACACCACCAAAGTAGGAATCTTTCAATGTCG-ATATCCGAGCTTATGATAATCATACC--------AATCTGCAGTGGAGTGAAGACCGATTCAACGAAATCGTGAAGGAAACGTCCAACTTCATCAAGAAGGTCGGTTACAACCCGAAGACTGTTGCCTTTGTGCCTATATCTGGCTGGCATGGCGACAACATGTTGGAGGAGTCTCCAAAGTATGGGA-ACCACG-TGATTTGTCTTCACAGCCT-CCCTGATGACTA----TTACACAGCATGCCATGGTACAAGGGTTGGACAAAAGAGACCAAGGCTGGCGTTGTCAAGGGCAAGACTCTCCTTGATGCTATCGATGCTATCGAACCTCCGGTTCGACCTTCCGACAAGCCCCTTCGTCTTCCTCTTCAGGACGTCTACAAAATCGGTGGTA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Tricholoma_subaureum_U76466_EF421015_EF421085 AAATCTGAGGGCTCTTCGTGGCCTTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGCTATCCGCGCTGGGCCGTGTACAAGTCTCCTGGAACGGAGCGTCATAGAGGGTGA-GAATCCCGTCTTTGACACGGACTGCCAGGGCCTATGTGATGTGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGTGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGTGTTGACCAGGAATCAACCTTGC---TCTTGCTTGGTG-TACTTTCTGGTTAA-TGGGTCAGCATCAATTTTGACCGGTGGATAAAGGTCAGGGGAATGTGGCATCTTTGGATGTGTTATAGTCCTTGGTCGCATACATCGGTTGGGATTGAGGAACTCAG-CATGCCGCAAGGCCGGGC-TTAAA-AACCACGT-ACATGCTTAGGATGCTGGCATAATGGCTTTAATCGACTTGGCTCTCATGGCTTGTATATCTGTCGGTTCTTATTCTGCGCCCGTCATCGAGTTCTTGGAAGAGTGGGGGCTGGAATCTCTTGAGGAGAACGCACATTCGTCTACTCCTTGCACCAAGGTGTTTGTTAATGGTGTGTGGATGGGCGTTCACCGTGACCCCGCGAATCTAGTGAAGACCATCAAAAAGTTGCGACGGAAGGATGATATCAGCCCTGAGGTCTCGGTTGTTCGGGATATTCGGGAGAAGGAATTGCGATTATATACCGATGCTGGACGCGTTTGTCGACCATTATTCATCGTCGAGAATCAGCAACTAGCTTTACAAAAGAAGCACATCAGATGGCTTAACAGTGGTTCTAACGAGGACGGAGAAGAATACAAGTGGGAGCAACTGGTCAAGGGCGGTATCATTGAGCTGTTGGACGCAGAGGAGGAGGAGACTGTTATGATATCGATGACACCCGAAGATTTGGAGAACTCAAGGTTGCACCAAAGCGGTATCGATCCTCATGCCAACGACGGAGATTTCGATCCAGCAGCAAGGTTGAAAGCTGGAATCAACTCACACACTTGGACGCATTGTGAGATTCACCCTAGCATGATTCTTGGTATCTGTGCAAGTATCATCCCCTTCCCCGATCACAACCAGGTATGATTTCAAAACTGCGCCATCCTCATCATTGCTGGTGGCACGGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAAACACGAGAGCATGCCCTCCTTGCATTTACCCTTGGCGTGCGGCAGCTCATCGTTGCCGTGAATAAGATGGACACCACCAAAGTATGCATCTCTCGACGTCCTAGCAGTGAATGTAAAATAATTATGCCTTTACGCCGATTCGTAGTGGAGTGAGGACCGATTCAACGAAATCGTGAAGGAAACGTCCAACTTCATCAAGAAGGTCGGGTACAACCCAAAGACTGTTGCCTTCGTGCCCATATCTGGTTGGCATGGTGACAACATGTTGGAGGAGTCTGCAAAGTAGGGGG-ATTACG-TGATATTTTTTCACAACT---CCTAATGACCA----TTACGTAGCATGCCATGGTACAAGGGCTGGACGAAGGAGACCAAGGGTGGTGTCGTCAAGGGCAAGACACTCCTTGATGCTATCGATGCTATCGAACCCCCGGTTCGACCTTCTGAGAAGCCTCTCCGACTCCCTCTTCAGGATGTTTACAAAATTGGCGGTA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN TREES; Title 'Clitocybe 28S nLSU-rpb2-tef1-18S nSSU'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Lactobacillus_reuteri_AF042581_EF421906_EF421068, 2 Lyophyllum_connatum_AF042590_EF420995_EF421061, 3 Clitopilus_fallax_AF223166_EF421018_EF421089, 4 Clitocybe_dealbata_AF223175_DQ825407_EF421080_DQ825, 5 Tricholomella_constricta_AF223188_DQ825412_EF421079, 6 Asterophora_parasitica_AF223191_EF420988_EF421054_AJ496, 7 Tephrocybe_gibberosa_AF223198_EF421005_EF421073, 8 Lyophyllum_sykosporum_AF223208_EF421003_EF421069, 9 Lyophyllum_caerulescens_AF223209_EF421000_EF421066, 10 Clitocybe_nebularis_AF223217_EF421011_EF421081, 11 Callistosporium_luteoolivaceum_AF261405_DQ825406, 12 Clitocybe_phyllophila_AY207157, 13 Collybia_tuberosa_AY639884_AY787219_AY881025_NG013, 14 Clitocybe_candicans_AY645055_DQ385881_DQ408149, 15 Clitocybe_subditopoda_AY691889_AY780942_DQ408150_AY771, 16 Entoloma_sinuatum_AY691891_GQ289264_X_AY657007, 17 Entoloma_prunuloides_AY700180_DQ385883_DQ457633_NG013, 18 Rhodocybe_mundula_AY700182_DQ474128_X_DQ089017, 19 Tricholoma_palustre_AY700197_DQ484055_X_AY757267, 20 Callistosporium_graminicolor_AY745702_X_GU187761_AY752974, 21 Catathelasma_ventricosum_DQ089012_DQ470830_X_DQ435811, 22 Lepista_irina_DQ234538_DQ385885_DQ028591_AY059, 23 Clitocybe_nebularis_DQ457658_DQ470833_X_DQ437681, 24 Infundibulicybe_gibba_DQ457682_DQ472727_GU187759_DQ115, 25 'Clitopilus sp. VHAs07/02 EF421092 DQ825408 EF421086', 26 Pseudoclitocybe_cyathiformis_EF551313_GU187815_GU187742_GU187, 27 Clitocybe_subditopoda_EU852807, 28 Clitopilus_prunulus_GU384615_GU384650_X_AY771607, 29 Clitopilus_cystidiatus_HM623133_GQ289220, 30 Clitocybe_adirondackensis_HQ728530_HQ728532_X_HQ728531, 31 Tricholoma_viridiolivaceum_JF706317_JF706319, 32 Musumecia_bettlachensis_JF926521_KJ681060_KJ681082_KJ681, 33 Entoloma_abortivum_JQ320117_GU384642, 34 Musumecia_sp._KJ681037_KJ681061_KJ681083_KJ681, 35 Clitocybe_vermicularis_KJ681039_KJ681063_KJ681085_KJ681, 36 Clitocybe_vermicularis_KJ681040_X_KJ681086_KJ681073, 37 Singerocybe_hydrogramma_KJ681041_KJ681064_KJ681087_KJ681, 38 Singerocybe_hydrogramma_KJ681042_KJ681065_KJ681088, 39 Clitocybe_inornata_KJ681045_KJ681066_KJ681089, 40 Clitocybe_inornata_KJ681046_KJ681067_KJ681090_KJ681, 41 Clitocybe_inornata_KJ681047_X_KJ681091_KJ681076, 42 Clitocybe_inornata_KJ681048_X_KJ681092_KJ681077, 43 Clitocybe_connata_KJ681049_KJ681079, 44 Clitocybe_connata_KJ681050_X_X_KJ681078_, 45 Clitocybe_candicans_KJ681051_KJ681068_X_KJ681080, 46 Clitocybe_candicans_KJ681052_X_X_KJ681081_, 47 Clitocybe_pruinosa_KJ681062_KJ681062_KJ681084_KJ681, 48 Tricholoma_myomyces_U76459_DQ367436_DQ367429, 49 Tricholoma_subaureum_U76466_EF421015_EF421085; TREE con_50_majrule = (24:0.037782,((26:0.034769,(32:0.018314,34:0.002368)1.00:0.035921)1.00:0.0276,((((((((47:0.009625,35:0.01603)1.00:0.014852,(36:0.003349,21:0.001689,20:0.002104)1.00:0.025802)1.00:0.02853,(11:0.027087,(30:0.010204,37:0.006127)1.00:0.016023)1.00:0.010908)0.98:0.007832,(38:0.020555,(3:8.78E-4,18:9.21E-4)1.00:0.01934)1.00:0.020042)0.93:0.006064,((25:0.011984,28:0.022368)1.00:0.007481,29:0.020316,((33:0.015837,17:0.002757)0.99:0.006313,16:0.017605)1.00:0.015366)1.00:0.009657)0.91:0.00451,(5:8.79E-4,6:6.8E-4,7:9.01E-4,8:9.23E-4)1.00:0.010781,((9:0.001902,1:0.001673)1.00:0.010504,((39:0.001125,40:0.00111,41:0.002201)1.00:0.01842,((42:6.91E-4,15:7.54E-4)0.51:0.001461,27:0.001063)0.87:0.00315)1.00:0.008267)1.00:0.00782)1.00:0.01071,((44:8.14E-4,43:0.002238)1.00:0.013918,((2:0.010911,14:0.024983)0.97:0.007366,45:0.00724)0.91:0.005323,(46:0.015796,((19:8.63E-4,31:0.001529)1.00:0.006119,48:0.002905)1.00:0.035072)0.52:0.004239)0.99:0.005304)0.92:0.004751,((49:0.019405,23:0.009231)0.55:0.005552,10:0.014761,13:0.02884)1.00:0.016375)0.75:0.005927)1.00:0.012762,(4:0.007737,(22:0.011437,12:0.010776)1.00:0.026218)1.00:0.011758); END;