#NEXUS

BEGIN TAXA;
	DIMENSIONS NTAX=122;
	TAXLABELS
		Danio_rerio Xenopus_tropicalis Gallus_gallus Taeniopygia_guttata Anolis_carolinensis Ornithorhynchus_anatinus Tachyglossus_aculeatus Didelphis_virginiana Monodelphis_domestica Caluromys_philander Glironia_venusta Dromiciops_gliroides Notoryctes_typhlops Caenolestes_fuliginosus Rhyncholestes_raphanurus Perameles_bougainville Macrotis_lagotis Echymipera_kalubu Acrobates_pygmaeus Cercartetus_nanus Macropus_sp. Petaurus_breviceps Trichosurus_vulpecula Phascolarctos_cinereus Aepyprymnus_rufescens Hypsiprymnodon_moschatus Pseudochirops_cupreus Tarsipes_rostratus Pseudantechinus_bilarni Myrmecobius_fasciatus Echinops_telfairi Amblysomus_hottentotus Chrysochloris_asiatica Elephantulus_rufescens Rhynchocyon_petersi Heterohyrax_brucei Procavia_capensis Dasypus_novemcinctus Choloepus_hoffmanni Bradypus_tridactylus Cyclopes_didactylus Tragulus_napu Prionodon_linsang Ailurus_fulgens Fossa_sp. Felis_sp. Suricata_suricatta Mephitis_mephitis Nandinia_binotata Procyon_lotor Genetta_genetta Manis_pentadactyla Manis_tricuspis Craseonycteris_thonglongyai Emballonuridae Furipterus_horrens Hipposideros_commersoni Megaderma_lyra Miniopterus_manavi Tadarida_brasiliensis Pteronotus_parnellii Mystacina_tuberculata Myzopoda_aurita Natalus_stramineus Noctilio_albiventris Nycteris_thebaica Artibeus_jamaicensis Nyctimene_albiventer Rhinolophus_creaghi Rhinopoma_hardwickii Thyroptera_tricolor Myotis_davidii Cynocephalus_volans Galeopterus_variegatus Oryctolagus_cuniculus Ochotona_princeps Erinaceus_amurensis Podogymnura_sp. Solenodon_sp. Sorex_araneus Talpa_altaica Ptilocercus_lowii Tupaia_chinensis Callithrix_jacchus Microcebus_murinus Daubentonia_madagascariensis Otolemur_garnettii Propithecus_coquereli Lemur_catta Nycticebus_coucang Tarsius_sp. Abrocoma_bennettii Agouti_sp. Anomalurus_beecrofti Aplodontia_rufa Heterocephalus_glaber Capromys_sp Myocastor_sp Cavia_porcellus Chinchilla_lanigera Cricetulus_griseus Ctenodactylus_gundi Ctenomys_boliviensis Dasyprocta_punctata Dinomys_branickii Jaculus_jaculus Hoplomys_sp. Erethizon_dorsatum Geomyidae Dipodomys_ordii Hystrix_brachyurus Mus_musculus Gliridae Octodontomys_gliroides Pedetes_capensis Petromus_typicus Sciuridae Thryonomys_swinderianus Laonastes_aenigmamus Spalax_sp. Petromyscus_sp. Calomyscidae 
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	Xenopus_tropicalis            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	Taeniopygia_guttata           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	Anolis_carolinensis           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	Manis_tricuspis               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	Tadarida_brasiliensis         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	Mystacina_tuberculata         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	Artibeus_jamaicensis          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	Rhinolophus_creaghi           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	Tupaia_chinensis              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	Daubentonia_madagascariensis  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	Geomyidae                     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	Mus_musculus                  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???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
;
END;

BEGIN SETS;
	CHARSET TTN   =   1 -  4437;
	CHARSET CNR1   =   4438 -  5442;
	CHARSET BCHE   =   5443 -  6438;
	CHARSET EDG1   =   6439 -  7398;
	CHARSET RAG1   =   7399 -  9198;
	CHARSET RAG2   =   9199 -  9645;
	CHARSET ATP7   =   9646 -  10332;
	CHARSET TYR1   =   10333 -  10761;
	CHARSET ADORA3   =   10762 -  11094;
	CHARSET BDNF   =   11095 -  11655;
	CHARSET ADRB2   =   11656 -  12459;
	CHARSET PNOC   =   12460 -  12780;
	CHARSET A2AB   =   12781 -  13629;
	CHARSET BRCA1   =   13630 -  16722;
	CHARSET BRCA2   =   16723 -  21768;
	CHARSET DMP1   =   21769 -  23130;
	CHARSET GHR   =   23131 -  24078;
	CHARSET VWF   =   24079 -  25251;
	CHARSET ENAM   =   25252 -  29151;
	CHARSET APOB   =   29152 -  31776;
	CHARSET IRBP   =   31777 -  33030;
	CHARSET APP   =   33031 -  33727;
	CHARSET BMI1   =   33728 -  34064;
	CHARSET CREM   =   34065 -  34506;
	CHARSET FBN1   =   34507 -  35252;
	CHARSET PLCB4   =   35253 -  35603;
END;

BEGIN TREES;
	Title atol122;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
[0] 		1 Danio_rerio,
[1] 		2 Xenopus_tropicalis,
[2] 		3 Gallus_gallus,
[3] 		4 Taeniopygia_guttata,
[4] 		5 Anolis_carolinensis,
[5] 		6 Ornithorhynchus_anatinus,
[6] 		7 Tachyglossus_aculeatus,
[7] 		8 Didelphis_virginiana,
[8] 		9 Monodelphis_domestica,
[9] 		10 Caluromys_philander,
[10] 		11 Glironia_venusta,
[11] 		12 Dromiciops_gliroides,
[12] 		13 Notoryctes_typhlops,
[13] 		14 Caenolestes_fuliginosus,
[14] 		15 Rhyncholestes_raphanurus,
[15] 		16 Perameles_bougainville,
[16] 		17 Macrotis_lagotis,
[17] 		18 Echymipera_kalubu,
[18] 		19 Acrobates_pygmaeus,
[19] 		20 Cercartetus_nanus,
[20] 		21 Macropus_sp.,
[21] 		22 Petaurus_breviceps,
[22] 		23 Trichosurus_vulpecula,
[23] 		24 Phascolarctos_cinereus,
[24] 		25 Aepyprymnus_rufescens,
[25] 		26 Hypsiprymnodon_moschatus,
[26] 		27 Pseudochirops_cupreus,
[27] 		28 Tarsipes_rostratus,
[28] 		29 Pseudantechinus_bilarni,
[29] 		30 Myrmecobius_fasciatus,
[30] 		31 Echinops_telfairi,
[31] 		32 Amblysomus_hottentotus,
[32] 		33 Chrysochloris_asiatica,
[33] 		34 Elephantulus_rufescens,
[34] 		35 Rhynchocyon_petersi,
[35] 		36 Heterohyrax_brucei,
[36] 		37 Procavia_capensis,
[37] 		38 Dasypus_novemcinctus,
[38] 		39 Choloepus_hoffmanni,
[39] 		40 Bradypus_tridactylus,
[40] 		41 Cyclopes_didactylus,
[41] 		42 Tragulus_napu,
[42] 		43 Prionodon_linsang,
[43] 		44 Ailurus_fulgens,
[44] 		45 Fossa_sp.,
[45] 		46 Felis_sp.,
[46] 		47 Suricata_suricatta,
[47] 		48 Mephitis_mephitis,
[48] 		49 Nandinia_binotata,
[49] 		50 Procyon_lotor,
[50] 		51 Genetta_genetta,
[51] 		52 Manis_pentadactyla,
[52] 		53 Manis_tricuspis,
[53] 		54 Craseonycteris_thonglongyai,
[54] 		55 Emballonuridae,
[55] 		56 Furipterus_horrens,
[56] 		57 Hipposideros_commersoni,
[57] 		58 Megaderma_lyra,
[58] 		59 Miniopterus_manavi,
[59] 		60 Tadarida_brasiliensis,
[60] 		61 Pteronotus_parnellii,
[61] 		62 Mystacina_tuberculata,
[62] 		63 Myzopoda_aurita,
[63] 		64 Natalus_stramineus,
[64] 		65 Noctilio_albiventris,
[65] 		66 Nycteris_thebaica,
[66] 		67 Artibeus_jamaicensis,
[67] 		68 Nyctimene_albiventer,
[68] 		69 Rhinolophus_creaghi,
[69] 		70 Rhinopoma_hardwickii,
[70] 		71 Thyroptera_tricolor,
[71] 		72 Myotis_davidii,
[72] 		73 Cynocephalus_volans,
[73] 		74 Galeopterus_variegatus,
[74] 		75 Oryctolagus_cuniculus,
[75] 		76 Ochotona_princeps,
[76] 		77 Erinaceus_amurensis,
[77] 		78 Podogymnura_sp.,
[78] 		79 Solenodon_sp.,
[79] 		80 Sorex_araneus,
[80] 		81 Talpa_altaica,
[81] 		82 Ptilocercus_lowii,
[82] 		83 Tupaia_chinensis,
[83] 		84 Callithrix_jacchus,
[84] 		85 Microcebus_murinus,
[85] 		86 Daubentonia_madagascariensis,
[86] 		87 Otolemur_garnettii,
[87] 		88 Propithecus_coquereli,
[88] 		89 Lemur_catta,
[89] 		90 Nycticebus_coucang,
[90] 		91 Tarsius_sp.,
[91] 		92 Abrocoma_bennettii,
[92] 		93 Agouti_sp.,
[93] 		94 Anomalurus_beecrofti,
[94] 		95 Aplodontia_rufa,
[95] 		96 Heterocephalus_glaber,
[96] 		97 Capromys_sp,
[97] 		98 Myocastor_sp,
[98] 		99 Cavia_porcellus,
[99] 		100 Chinchilla_lanigera,
[100] 		101 Cricetulus_griseus,
[101] 		102 Ctenodactylus_gundi,
[102] 		103 Ctenomys_boliviensis,
[103] 		104 Dasyprocta_punctata,
[104] 		105 Dinomys_branickii,
[105] 		106 Jaculus_jaculus,
[106] 		107 Hoplomys_sp.,
[107] 		108 Erethizon_dorsatum,
[108] 		109 Geomyidae,
[109] 		110 Dipodomys_ordii,
[110] 		111 Hystrix_brachyurus,
[111] 		112 Mus_musculus,
[112] 		113 Gliridae,
[113] 		114 Octodontomys_gliroides,
[114] 		115 Pedetes_capensis,
[115] 		116 Petromus_typicus,
[116] 		117 Sciuridae,
[117] 		118 Thryonomys_swinderianus,
[118] 		119 Laonastes_aenigmamus,
[119] 		120 Spalax_sp.,
[120] 		121 Petromyscus_sp.,
[121] 		122 Calomyscidae;
	TREE MajRule = (1:4.3481447499999994,(2:3.503823,((5:2.72723425,(3:0.790256,4:0.790256):0.96848925[%consensusFrequency = 1 ]):0.228665[%consensusFrequency = 1 ],((6:0.31823674999999996,7:0.31823674999999996):0.925179[%consensusFrequency = 1 ],(((14:0.11444425,15:0.11444425):0.6309224999999999[%consensusFrequency = 1 ],((10:0.28374,(11:0.253072,(8:0.19506199999999999,9:0.19506199999999999):0.029005125000000003[%consensusFrequency = 1 ]):0.015334[%consensusFrequency = 1 ]):0.20003525[%consensusFrequency = 1 ],(12:0.5749534999999999,((13:0.5361305,((29:0.2449865,30:0.2449865):0.267892[%consensusFrequency = 1 ],(17:0.23288000000000003,(16:0.1080815,18:0.1080815):0.062398875000000006[%consensusFrequency = 1 ]):0.1399995[%consensusFrequency = 1 ]):0.02325125[%consensusFrequency = 1 ]):0.005772875000000001[%consensusFrequency = 1 ],(24:0.47093575,((20:0.39145625,23:0.39145625):0.03657775[%consensusFrequency = 1 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