NEXUS
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[Matrix accession#: M3458]

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		Chirita_heterotricha            AGACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAATAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTTGTTTTCTCAAAACAAGGGTTCAGAGAGCGAAAAA-----GAGG--ATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGC-TGTTCTAACAAATGGAGTTGACCGCGTTGGTAGAAGAATTGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATT-------------------------GAATACTATTGATGATTAATA------ATGGCCCGAATCTGTATCTGGG--TTTTTTGTATATGAAA----AATAGAAGAATTGGTGTGAATTGATTTCACATTGATAAAAGAATCGAAGATTTATTAATCAAATCATTCACTCCACAGTCCGATAAAT-TCTTAAAGAACTTATTATTCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAACTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTGAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAAATCCTATAATTGACTCCCAAAATATTTATCCTATCCGCTTTGTTCGTTAACGGTTCAAAATTCCTTTATATTTCTAATTCTTTTAAAAATGTCTTTGGTCGTAAATGACTTTCTCTTCTCACATGTGAGAATCACATGTGATATAGAATATACATTCAAA---------GAATCCTTATTAGAATAATTCACAATCAATAGCATTACGCATACTGATACTTACAAAGTCGTCTTTTTAAAGATCCAAGAGATTAGAG-ACTTGGAGAAAACTTTGTAATTTTCCCTTGTCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTCC-CATAATAAAATGAGGATGGGATGCTACATTGGGAAT
		Chirita_hamosa                  AGACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAATAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCT-GTTTTCTCAAAACAAGAGTTCAGAGAGTGAAAAA-----GAGG--ATAGGTGCAGAGACTCTACGGAAGC-TGTTCTAACAAATGGAGTTGACTGCGTTGGTAGAAGAATTGAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATT-------------------------GAATACTATTGATGATTAATA------ATGGCCCGAATCTGTATCTGAG---TTTTTGTATATGAAA----AATGGAAGAATTGGTGTGAATTGATTTCACATTAATAAACGAATTGAATATTCATTGATCAAATCATTCACTCCATAGTCCGATAGATCTCTTAAAGAACTTATTATTCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAACTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAAATCCTATAATTGACTCCCAAAATATTTATCCTATCCGCTTTGTTCATTAACGGTTCAAAATCTCTTTATCTTTCTAATTCTTTTAGAAATGTCTTTGGGCGTAAATGACTTTCTCTTCTCACATGTAA-------------TATAGAATACACATTCAAA---------GAATCCCTATTGGAATAATTCACAATCAATAGCATTACGCATACTGACACTTACAAAGTCGTCTTTTTAAAGATCCAAGAGATTAGAGGACTTGTAGAAAACTTTGTAATTTTCCCTTGTCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTCC-TCTAATAAAATTAGGGTGCGATGCTACATTGGGAAT
		Chirita_dielsii                 AGACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAATAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCT-GTTTTCTCAAAACAAGGGTTCAGAGAGCGAAAAAAAAAAGAGG--ATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGC-TGTTCTAACAAATGGAGTTGACCGCGTTGGTAGAAGAATTCAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATT-------------------------GAATACTATTGATGATTAATA------ATGGCCCGAATCTGTATCTGGG---TTTTTGTATATGAAA----AATAGAAGAATTGGTGTGAATTGATTTCACATTGATAAAAGAATCGAATATTCATTAATCAAATCATTCACTCCACAGTCCGATAGATCTCTTAAAGAACTTATTATTCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAACTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTCAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAA-TCCGATAATTGACTCCCAAAATATTTATCCTATCCGCTTTGTTTGTTAACGGTTCAAAATTCCTTTATCTTTCTACTTCTTTTACAAATGTCTTTGGGCGTACATTATTTTCTCTTCTCACATGTGA-------------TATAGAATATACATTCAAA---------GAATCCCTATTGGAATAATTCACAATCAATAGCATTACGCATACTGACACTTACAAAGTCGTCTTTTTAAAGATCCAAGAGATTAGAGGACTTGGAGAAAACTTTGTAATTTTCCCTTGTACCTTTAATTGACATAGACCCCAGTCC-TCTAATAAAATGAGGATGGGATGCTACATTGGGAAT
		Chirita_anachoreta              AGACTTTCAAATTCAGAGAAACC-TGGAATTAATAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCC-GTTTTCTCAAAACAAGGGTTCAGAGAGCGAAAAA-----GAGG--ATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGC-TGTTCTAACAAATGGAGTTGACCGCGTTGGTAGAAGAATTCAAACTTCAGAAAGGATGAAGGATAAACGTATCTATT-------------------------GAATACTATTGATGAATAATA------ATGGCCCGAATCTGCATCTGGG---TTTTTGTATATGAAA----AATAGAAGAATTGGTGTGAATTGATTTCACATTGATAAAAGAATCGAATATTCATTAATCAAATCATTCACTCCACAGTCCGATAGATCTCTTAAAGAACTTATTATTCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAACTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAGTCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAA-TCCTATAATTGACTCCCAAAATATTTATCCTATCCGCTTTGTTCATTAACGGTTCAAAATTCCTTTATCTTTCTAATTCTTTTACAAATGTCTTTGGGCGTAAATGATTTTCTCTTCTCACATGTGA-------------TATAGAATATACATTCAAA---------GAATCCCTATTGGAATAATTCACAATCAATAGCATTACGCATACTGACACTTACAAAGTCGTCTTTTTAAAGATCCAAGAAATTAGAGGACTTGGAGAAAACTTTGTAATTTTCCCTTGTCCCTTTAATTGACATAGACCCCAGTCC-TCTAATAAAATGAGGATGGGATGCTACATTGGGAAT
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END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 893 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
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