#NEXUS BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=45; TAXLABELS Sphenodon_punctatus Agama_agama Chamaleo_sp Enyalioides_laticeps Uromastyx_sp Oplurus_cyclurus Anolis_carolinensis Ophisaurus_apodus Anniella_pulchra Celestus_enneagrammus Elgaria_multicarinata Heloderma_horridum Heloderma_suspectum Shinisaurus_crocodilurus Xenosaurus_grandis Lanthanotus_borneensis Varanus_acanthurus Varanus_exanthematicus Varanus_salvator Anelytropsis_papillosus Dibamus_novaeguinae Eublepharis_macularius Strophurus_ciliaris Gekko_gecko Gonatodes_albogularis Delma_borea Lialis_burtonis Cordylus_mossambicus Acontias_sp Scincus_scincus Feylinia_polylepis Lepidophyma_flavimaculatum Pholidobolus_sp Lacerta_viridis Aspidoscelis_tigris Amphisbaena_fuliginosa Bipes_canaliculatus Rhineura_floridana Trogonophis_wiegmanni Anilius_scytale Liotyphlops_albirostris Leptotyphlops_sp Typhlops_jamaicensis Boa_constrictor Xenopeltis_unicolor ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE comb_red_mol; DIMENSIONS NCHAR=15794; FORMAT DATATYPE = 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Anolis_carolinensis 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Ophisaurus_apodus 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Anniella_pulchra 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Celestus_enneagrammus CAGTTGCATGAAAGCTGCCCCAATGAAAGAAGTTAGCCTCAGAGGACAA---GGCAGCTTGGCTTATCCCGGTCTCCGGACGCAGGGAAACCTGGAAAACCTC---GGTGGGCCCAATGAAGCCACAAGAGGATTGACATCTTTGGCAGACACCTTTGAACAGATCATAGAGGAGCTCCTGGACGAGCAGGAGGTCCTCCAGCCGAGCAAGGAAAACAAGGATGCGGACTTGTACTCGTCCCGGGTGATGCTCAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAGCCTCCACTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTATAAAAACTACTTGGATGCTGCGAACATGTCCATGAGGGTCCGGCGCCACTCTGACCCTGCTCGCCGTGGCGAGCTGAGTGTGTGTGACAGCACCAGCGAGTGGGTAACAGCGGCGGAGAAAAAGACCGCGGTGGACATGTCAGGGGCGACGGTGACCGTCCTGGAAAAAGTCCCCGTATCCAAAGGCCAACTGAAGCAATATTTTTATGAGACCAAATGCAACTCGAAGGGTTATACGAAAGAGGGCTGCCGGGGCATAGACAAGAGGTACTGGAACTCCCAGTGCCGAACTACCCAGTCTTACGTGAGAGCTCTCACCATGGATAATAAAAAGAGAGTTGGATGGCGCTTTATAAGAATAGACACTTCCTGTTTCTTAAGCTGGAGAGAGAGGCCTCCAAGGACCCTGTCACAAGACTCTTGGACACCCGCTTGGTGCATCATAATGCTAGCACATGGGAAACATTTGATGTAACGCCCGCTATCATGAGGTGGATTGCACATGGACAACCCAACCATGGTTTTGTAGTAGAAGTGGTACACTTGGAC---AGGGAGAGCAGTGTCTCCAAGAGACATGTCAGAATCAGCAGGTCATTGCATCAGGATGATGCCAGCTGGTCTCAGATCAGGCCGTTGCTAGTCACCTTTGGGCATGACGGAAAGGGACATCCTCTCCATAAGAGAGAGAAACGTCAGACGAAGCAGAAGCCACGCAAG------CGCCATAAATTCAATTGTAAAAGACACCCTTTATACGTGGACTTCAACGACGTGGGGTGGAATGACTGGATAGTGGCCCCGCCAGGTTACAGTGCCTTCTATTGCCACGGAGACTGCCCCTTTCCACTGGCAGATCACCTGAACTCCACAAACCATGCCATTGTTCAGACTCTGGTCAATTCCGTGAACTCCAAAATCCCCAAAGCTTGCTGCGTGCCGACAGAACTGAGTGCAATCTCCATGCTC??????????????????????????????????????????????GGGTAGTTCCAAAAAAGTTTTGGGAGATCTGAAATTCCTCGAGGGCTTGAAGATGTACGACAAAGATAATATCCCTCAAGCTGTAATGAAGAGAATTAGAGAGAAGTTTATCAACCATCCAGACTTCCAGCCAGCTGTCATTAAAAACGTGTCATCCGCCTGTGAAGGCTTATGCAAATGGGTGAGGGCCATGGAAGTCTATGACCGCGTTGCCAAGGTAGTTGCTCCGAAACGTGAACGACTCCGGGAGGCAGAAGGTTTGCTCGACATACAAATGCAGAAGCTCAATACGAAGCGTGCAGAACTCAAGAACGTAATGGACCGGCTCCAAGCTTTGAATGATGAGTTCGAAGATATGAATAACAGGAAGAAAGAGCTTGAGAACAATATTGACATCTGCTCTCAGAAGCTCATAAGGGCTGAAAAACTGATCAGTGGCTTGGGAGGAGAAAAGGAGAGGTGGACGGAAGCTGCTCGCTTGCTAGGAATCCGATACACAGACCTTACCGGAGATGTTTTGTTATCTTCAGGCACGGTAGCTTATCTGGGTGCCTTTACTGTTGATTACCGCCAGGAATGTCAGGAGAAATGGCTGACCCTGTGCAAGGAACAAAAGATCCCATGCTCGAATGATTTCAGCCTGAGTAACACTTTAGGGGATCCAGTCAAGATCCGCGCCTGGCAGATTGCAGGATTGCCAATTGATTCCTTTTCTATTGATATGAGCCTGTGCTCCAGAAAATTGACCTCGAAACGATGTCATACATCAAGACAATTAGTTTAAAGGATTACAATTGCGTTCCRAAGACTCTGGCTTACACCCACCTTGGAGGATATTACTTCCTGAGCTGCAAGCCTGACACTACTGGAGCTGTTCCACCACAGCTAATAGTGGACAGTGTTACCGACTCTATTATTGGATATAATGGTGATGTAACAGGAACTCCATATATCTCTCCAGATGGTCACTATCTAGTCAGCATTGATGATGTGAAAGGTCTCATGCGGGTCCAGACCATTACAGTTAGAGGAGAAATACAGGATGCCTTCGACATTCACACCAACTTGCACATATCTGATGTGGCTTTTCAAGCGTCGTTTACTGAGGCCCATCAATATAATGCCTTTGGTAGCTCTAGCACACAAACTGATGTCCTCTTTGTAGAATTGTCCTCTGGCAAAGTGAAAATGGTGAAGAGTCTTAAGGAACCTCTTAGGCCAGATGAATGGCCTTGGAACAATAAGAACCGGTTAATTGAGGGCAGTGGGCTCTTCGGTCAGTACTTGATGACACCTTCCAAGGAATCCTTGTTTATTCTAGATGGACGACTGAACAAGCTGAAT????????????????GGGAGACAAATTTTCCAGCCGCTGCATGCTCTCCGAACATCTGAAAAGTCCCTCCTACCAGGTTACCACCCATTTGAGTGGAACCCCGCCTTAAAAAATGTGTCCAGTAACACGGAGGTAGGCATTATCGATGGGCTCTCGGGGATACAACATTTGGCTGATGACTACCCAGTAGACACGATTGCGAAGAGATTTCGATATGATGCAGCTTTGGTTTCTGCTCTAATGGATATGGAAGAAGACATACTGGAGGGGCTGAAAACTCAGGACTTGGATGACTATTTGAAAGGACCCTTCACCGTGGTGATTAAAGAGTCTTGTGATGGAATGGGGGACGTTAGTGAAAAGCATGGCTGTGGCCCGGCTGTCCCCGAGAAAGCAGTTCGATTCTCTTTCACCCTCATGACCATCACTGTCGCTCATGACAACAGGAACACAAAGGTCTTTGAAGAAACCAAGCCCAACTCGGAGCTTTGCTGCAAACCTCTGTGCCTCATGTTGGCTGATGAATCGGACCATGAGACACTCACGGCTATCCTCAGTCCTCTCATAGCAGAAAGAGAGGCCATGAAGAGCAGCGTGTTGATCCTGGATATGGCTGGAATCCCCAGAATGTTCAAATTCATCTTTCGGGGGACTGGATACGATGAGAAGCTCGTCCGTGAAGTAGAGGGCCTGGAAGCTTCTGGCTCCACTTACATTTGTACCCTTTGTGATGCAACGCGCCCGGAAGCCTCTCAGAACTTGATCCTTCACTCCATCACGAGGAGTCATGCGGAAAACTTGGAACGGTATGAGGTGTGGAGATCCAACCCATACCATGAGACGGTTGATGAACTACGTGACCGAGTGAAGGGAGTTTCCGCCAAGCCCTTTATCGAGACGGTTCCGTCGATAGATGCACTGCACTGTGACATCGGCAACGCAGCCGAGTTTTACAAGATATTCCAGTTTGAGATTGGCGAAGTGTACAAAAACCCGAACGCGTCGAAAGAAGAGAGAAAGAGGTGGCAGTCAACTCTTGACAAACACCTCAGAAAGAAG???????????????????????????????ATCCAGTCTACAAACATGGATCAAGGGAGTTTACCAGAAGATTCAATAAATTCTCTGATTATCAAACTTATTCAAGCAGACATTTTGAAAAATAAAGACTCCAAACAGGTGATAGACATTAAGGGAAGTGTTCAAGACCCATTGGAGAAAGCAGATTCTGCTGAACCAAGCACAGATGGCAGCGAAAATGTGAAATTGGATTTCCCGCCGGTTATTTCAATGGATACAGAACTGTTGAGGCAACAGAGACGCTACAGCTCCCCCAGAGTCCTCTTCAGTGACAATGCCCCATTGGAACCCCCACCATTGTATCTTATGGAGGATTACATTGGTAGTTCTGTGGTGGTGAACCGAACGTCTCGGCGGAAGAGATTTGCTGAAAACAAGAGTCACCGTGGTGAGTATTCCGTGTGTGACAGCGAAAGCCGATGGGTCACAGACAAATCTTCAGCTGTTGACATTAGAGGACACCAAGTAACTGTGCTAGGTGAAATCAAAATGGGCCCTTCCAATGCCTTGGTATTTTATGCTTATTGGACACCATGCCCTAATGATGGGCCTTGCATTAACCCATGCGTCAATGACCACTGCGCAGAAAACATTACTCAGATTTATGACAGAATGAAT------GCCACTGAATTTGAGAAAATTCCTGAAGCTGGTCCCTGTTGGGTTCTATATTTAGATCCTGCCTTGTGTCTGATAATGGTTTGTATTCTGCTCTACACAACTTACCCTCTGCTTAAAGAATCCGCTCTTATCCTTTTGCAAACTGTTCCCAAACAAATTGACATTCGCTCTTTAAACGAGAAGCTCCGTAAACTGGAAGAAGTTGAAGCTGTCCACGAACTGCATGTTTGGCAGCTGGCAGGAAGCAGGATCATCGGCACAGCTCATATAAAATGTAAGGACCCAGAATCGTACATGAAAGTGGCCAAGGATATTAAAGAGATCTTTCACGATGAGGGGATACATGCAACAACCATTCAGCCTGAGTTCACAGTTAGGGGCTATGATGTAGGCTCTGATGAGGGTGTAAGCAAATGTGAACTTCCCTGCAGA?????????????????????GGCAACGTCCTCCGAGTTCTCATCTGGTTCATCAACATCCTCGCCATCCTGGGGAACCTTGTCGTTTTCGTCATTCTGGTCAGCAGCCAGTATAAGCTCACTGTCCCTCGCTTCCTAATGTGCAACCTCGCATTTGCAGACCTGTGCACGGGCATCTA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Elgaria_multicarinata 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Heloderma_horridum 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Heloderma_suspectum 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Shinisaurus_crocodilurus 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Xenosaurus_grandis 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Lanthanotus_borneensis 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Varanus_acanthurus 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Varanus_exanthematicus 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Varanus_salvator 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Anelytropsis_papillosus 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Dibamus_novaeguinae 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Eublepharis_macularius 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Strophurus_ciliaris 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Gekko_gecko 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Gonatodes_albogularis 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Delma_borea 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Lialis_burtonis 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Cordylus_mossambicus 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Scincus_scincus 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Feylinia_polylepis 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Lepidophyma_flavimaculatum 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Lacerta_viridis 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Aspidoscelis_tigris 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Amphisbaena_fuliginosa 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Bipes_canaliculatus 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Rhineura_floridana CAGTTGCATGAAAGCTGCACCAATGAAAGAAGTTAGCATCAGAGGACCA---GGCAGCTTGGCTTATCCCAGTCTTCGGACACAGGGAAATCTGGAGAACCTC---GGTGGCCCCAATGATGCCTCAAGAGGATTGACATCTTTGGCAGACACTTTTGAACATGTCATAGAGGAGCTCCTGGATGAGCAGCATGTCATCCAGCCCAGCAAGGAAAATAAGGATGCAGACTTGTACTCATCTCGGGTAATGTTAAGCAGTCAAGTGCCTTTGGAGCCACCACTGCTCTTTCTGCTTGAGGAGTATAAAAACTACTTGGATGCTGCAAACATGTCAATGAGGGTCCGACGTCACTCTGATCCTGCACGCCGCGGGGAGCTGAGTGTGTGTGACAGTACTAGCGAGTGGGTGACAGCAGCTGAGAAAAAGACTGCGGTGGACATGTCAGGGGCAACGGTTACAGTCCTGGAAAAAGTTCCGGTACCCAAAGGCCAACTGAAGCAATATTTTTATGAGACCAAATGCAACTCAAAGGGTTATACGAAAGAGGGCTGCAGGGGCATAGACAAGAGGTACTGGAATTCCCAGTGCCGAACTACCCAGTCGTACGTGCGAGCTCTCACTATGGATAACAAAAAGAGAGTTGGATGGCGGTTTATAAGAATAGACACTTCCTGTTTGTACAGCCAGAACAAGAGGCTTCCACGGACCCCATCACAAGACTCTTGGACACCCGCTTGGTGCATCACAATGCCAGCAAGTGGGAGACCTTTGACGTAACACCAGCTATAATGCAGTGGATTGCACACGGACAACCCAATCACGGTTTTGTGGTGGAAGTGGTTCACTTGGAC---AATGAGAGCAGTGTCTCCAAGAGACACGTCAGGATCAGCAGGTCTTTGCATCAAGACGATRCCAGCTGGTCTCGGATCAGGCCATTACTAGTCACCTTTGGGCATGACGGAAAGGGACACCCTCTGCATAAGAGGGAGAAACGTCAGGCAAAACACAAACAACGCAAA------CGC---AAATCCAATTGCAAAAGGCACSATTTATATGTGGACTTCAACGATGTCGGGTGGAATGACTGGATAGTGGCTCCACCGGGTTACAGTGCCTTCTACTGCCATGGAGACTGCCCGTTTCCCTTGGCAGATCACCTGAACTCCACCAACCATGCCATTGTTCAGACTCTTGTCAATTCAGTGAATTCCAAAATCCCCAAAGCTTGCTGCGTGCCGACARAACTGAKTCCTATCTTCATGCTC??????????????????????????????????????????????GGGTAGTTCCAAAAAGGTTCTAGGAGATCTGAAATTCCTTGAGGGCTTAAAGACTTACGATAAAGATAATATTCCTCCAGCTGTAATGAAGAGAATCAGAGAGAAGTTTATCAACCATCCAGACTTCCAGCCGGCTGTCATTAAAAATGTGTCTTCAGCCTGTGAAGGCTTATGCAAATGGGTGAGGGCCATGGAGGTGTACGATCGCGTCGCAAAGGTGGTTGCACCCAAACGTGAACGACTCAGGGAGGCTGAAGGTTTGCTCGACATTCAAATGCAGAAGCTCAATACAAAGCGGGCAGAACTTAAGAACGTGATGGACCGCCTCCAAGATTTGAATGATGAGTTTGAAGAGATGAATAACCGGAAGAAAGAACTCGAGACCAATATAAATATATGTTCCCAGAAGCTGATTCGGGCTGAAAAGCTGATCAGTGGCTTGGGAGGAGAGAAGGAGAGATGGACAGAGGCAGCGCGTTTGCTTGGAATCCGCTACACTGATCTTACCGGGGATGTCTTGCTGTCTTCAGGTACAGTGGCTTATCTGGGAGCCTTTACCGTCGATTACCGTACTGAATGTCAGAAGAAATGGCTGGTCTTGTGCAAAGAAGAGAAGGTCCCA?GCTC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGAGCCTGTGCTTCAGAAAATTGATCTTGAAACTATGTCATACATCAAGACAATTAGTTTAAAGGATTACAATTGTGTTCCAAAGTCTCTGGCTTACACACATCTTGGAGGATATTACTTTATAAACTGTAAGCCTGACACTACAGGAGCTGTTCCACCGCAGCTAATAGTGGACAGTGTTACAGACTCCATTATGGGATATAATGGTGATGTAACAGGAACTCCATATATCTCTCCAGATGGTCACTACCTAGTCAGCATTGATGATATGAAAGGTCTCATGAGGGTCCAGACCATTACAGTTAGAGGAGAAATACAGGATGCCTTCGACATCCACACCAACTTGCACATATCTGATGTGGCTTTTCAAGCATCATTTACTGAAGCCCATCAATATAATGTCTTTGGTAGCTCTAGCACACAAACTGATGTGCTCTTTGTAGAATTGTCTTCTGGCAAGGTGAAGATGGTGAAGAGTCTTAAGGAACCTCTTAAGCCAGATGAATGGCCTTGGAACAGTAAGAATCGGTTAATTGAGGGCAGTGGGCTTTTTGGCCAGTACCTGATGACACCTTCCAAGGAATCCTTGTTTATTCTAGATGGACGGCTGAACAAGCTGAATTGTAAAAGCGATAACAGGAAGACAGATTTTTCAGCCATTGCATGCTCTCCGAACAGCTGAAAAATCCCTCCTCCCAGGTTACCATCCATTTGAGTGGAAACCACCCTTGAAAAATGTGTCCAGTAACACAGAAGTAGGCATTATAGATGGGCTCTCAGGCATACAGCAGTCGGTTGATGACTACCCGGTAGACACAATTGCGAAAAGATTTCGATATGATGCAGCTTTGGTTTCTGCCCTAATGGATATGGAAGAAGACATCCTTGAAGGGCTGAAAACTCAAAACTTGGATGACTATTTGAAAGGCCCTTTCACAGTGGTGCTTAAAGAGTCCTGCGATGGAATGGGAGATGTCAGTGAAAAGCATGGCTGTGGCCCACCTGTCCCTGAGAAAGCTGTTCGATTCTCTTTCACACTCATGAGCATCACTGTAGCTCATGACAATGGAAGTGCAAAGATTTTTGAAGAAAATAAGCCCAATTCAGAGTTGTGTTGCAAACCTTTGTGCCTTATGTTGGCTGATGAGTCAGACCATGAAACACTCACAGCCATTCTGAGCCCTCTTGTGGCAGAAAGAGAAGCCATGAAAAACAGTGTATTGATACTTGATATGGGTGGGATCCCCAGAATGTTCAAATTTGTCTTTCGGGGCACTGGATATGATGAAAAGCTTGTCCGTGAAGTAGAGGGCCTTGAAGCCTCAGGCTCCACTTACATCTGCACACTTTGTGATGCAACTCGCCTGGAAGCCTCTGAGAACTTGATCCTCCACTCCATAACAAGGAATCATGCTGAAAACCTAGAGCGCTATGAGGTGTGGAGGTCGAACCCCTATCATGAGACTGTTGATGAGCTACGTGACAGAGTGAAGGGTGTATCTGCCAAGCCTTTTATTGAGACTGTTCCTTCAATAGATGCATTGCACTGTGACATTGGCAATGCAGCTGAGTTTTACAAGATATTCCAGTTTGAGATTGGTGAAGTATACAAAAATTCTGATGTATCCAAAGAAGAGAGAAAGAGATGGCAATCAACTCTTGATAAACACATTAGAAAGAAGATGAACTTAAAGCCTATGACAAGGATGAACGATCCAGTCTACCAATATGGATCAAGGGAGCTTAACAGAAGATTCAATAAGTTCTCTCATTATGAAACTTATTCAAGCAGACATCTTAAAAAACAAGATATCCAAACAAATGACAGATATTAAGGATAGTGTTCAAGACACAATTAAGAACATGGAGACTGCTGAGCCTGATATGGATGACAATGAAAGTGTGAAATTGGATTTCCAGCCAGTTATCACAATGGATACAGAACTACTAAAACAACAGAAACGCTACATCTCTCCCAGGGTCCTCTTGAGTGACAATACCCCATTGGAGCCCCCACCTTTGTATCTAATGGAGGATTACATTGGCAGTTCTGTGATGGCGAATCAAACTTCTCGGCGGAAGAGGTTTGCTGAAAACAAGAGTCACCGTGGAGAGTATTCAGTGTGTGACAGTGAAAGCCGATGGGTCACAGACAAATCTTCAGCTGTTGACATTAGGGGCCACCAGGTAGCTGTGCTGGGAGAAATCAAAATGGGACCTTCCAATGCTTTAGTATTTTACTCTTATTGGAGTCCATGCCCTAAGGATGGGCCTTGTATTAACCCATGTATCAATGACCATTGTGCAGAAAACATTACTCTGATTTTTGGCAGAATGAAT------GCAACTGAATTAGAAAAAATTCCTGTAGCTGGTCCCTGCTGGGTTCTATATTTAGATCCTGCGTTGTGTCTGATAATGGTTTGCATTCTGCTCTATACAACTTACCCACTGCTTAAAGAATCTGCTCTCATCCTTTTACAAACTGTTCCCAAACAAATTGATATTCGTTCTTTAAACGAGAAACTCCGCAAACTGGAAGACGTTGAAGCTGTCCATGAATTGCATGTCTGGCAGTTGGCAGGAAGCAGGATAATTGGCACTGCTCATATAAAATGTAAGGACCCAGAATCATACATGAAAGTGGCAAAGGATATTAAAGAGATCTTTCATGATGAAGGAATACATGCAACAACTATACAGCCTGAATTTACTATTGTGGGGTCT------------GATGGGGCTGTAAGCAAATGTGAACTTCCCTGCAGA??????????????????????????????????????????ATCTGGTTCATCAACATCCTGGCAATCATGGGTAACCTTGTCGTCTTCATCATCTTAGTCAGCAGTCAATATAAGCTCACGGTCCCTCGATTCCTAATGTGCAATCTTGCATTTGCAGACCTGTGCACTGGCATCTA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Trogonophis_wiegmanni 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Anilius_scytale 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Liotyphlops_albirostris 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Typhlops_jamaicensis 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Boa_constrictor 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Strophurus_ciliaris 100-00-000(0 1)102000000013010000001000000003-00002----00110210011??1100010001-0311(0 1)00?-?11-100??-1?-0110000?(0 1)01100011100211000100?00011001220100?00001000100011?031100000000--00001010022320-0000011010?000010-11110110000000000000000010(1 2)0-1001-1101010000000100001011110101(1 2)0100?0100200-1001101000311?00?1-1(0 1)0000-0-----010?101000100?????0000(1 2)100000000000???????????????? Gekko_gecko 101000-0001100000000003001100000000000103-00002----001102100110-1100010000-03210101-011-10001-1--011000111011000001002110001000000110010200000110010001000010031100001000--1--1--1002232120010010010-000010-01110000000000000000000010100-001-??01010000000100001?11111?001010000100000-1000100000?11?00?1-100001000-000010?1010001?3??????00?1100000???0?0???????????????? Gonatodes_albogularis 101000-0001102000000003011000000000000103-00002----001102100110-1110010010-03210100-011-10001-1--011000111011000001002110001000000110012100000110010000000110031000000000--0311-010122320-0010011010-000010-01110000000000000000000010100-001-120?010000000100001001111?001010010?00000-1000200000311?00?1-1?0000-0---00010?1???0???1??????00?0???????????????????????????? Delma_borea 100000-0001102000000113010-00000100010-03-001--------1100100110-1110000000-13?010001011-00001-1--011000110011000101002110001010000110010200000110010-2-0001??031?10000000--0011--10120020-00100110100000010-1101010000000000000000???????????????????????????????????????????????????????????????????0???2-110100-0-----010?10??1???0?????????????????????????????????????? Lialis_burtonis 001000-00011010000001130(0 1)0-00000100000003-00002------1100100110-1100010-00-03?010001011-10001-1--011000010011011111002110001000000110010200000210010000000110031100000000--030??010122020-0010011010-000000-11010100000000000000000??12001021-??00010010000100101010100-0031--0-0-4--------1--1001--1100?2-110100-0-----010?10?000000??????-00210001000000?0???1??????????? Cordylus_mossambicus 10000001111100000000013001000001000000?0(1 2)00000000(0 1)0(0 1)01(0 1)021000-0-(0 1)100(0 1)1001(0 2)-2(0 3)?110?010100100010021001(0 1)0001001110011100(1 2)110000000000000000200000100(0 1)10000000000011200000000010(0 1)1010000(0 1)23(0 1)0-00000100100100000-10(0 1)111(0 2)0000000(0 1)0000000?00120011(0 2)1-??0(0 1)01010000(1 2)00000?00(0 1)110000(0 1)0000001000000000020(0 1)000(0 2)101000201(0 1)0101111000(0 1)000010(1 2)000200?????00(0 1)000000100001?0???00??????????? 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Scincus_scincus 1000000101(0 1)10(0 2)0000000130010000(0 1)10000(0 1)01020000000(0 1)(0 1)00(0 1)1102100100-1100110-12-20(0 1)1000210100100020(0 1)010011000110111001(1 2)10021110(0 1)000000000000020000010011000(0 1)00001001120000100(0 1)0100001-10112010-00000000000100000-1011110000000000100000?1012001021-11001101000000000010011100011010010000200-100(0 1)201000(0 2)10000?20110101111000000001020002?0??????00?????????????01-100010(0 1)1(0 1)00(0 1)(0 1)0 Feylinia_polylepis 1010000000110000000100(1 3)0000100121000(0 1)01020001--------1000100100-1100010-10-220101021010110001-1--001100011011101121-12111000010000000000200000210-10000000010011200001000011--??-10122?10-021-000010?100000-1011110000000000100000??012001021-??00?1010000?????000010---2-31--0-0----------??-?--1--0000?2011110111?0000000?1020002?0?????????????????????0001110101111-00- Lepidophyma_flavimaculatum 100000-000110000000000200110000000000000200000101000010010000-0-1110110002-23111??210101000?210-0001000011011000101002100013-10000010000100000210-100000000?0011200001000--00100-10122110-0011011010?10001100000000400000000000000000120010?1-0100110?0000?00?00?00111000?10000???0000000000201000010100020101000-0--00-0101102000200??????????01??21?????????????????????? 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Typhlops_jamaicensis 001010-000110201-000001000-3--0--000---03---1--------10001003-0-01100100100-3-11-00-101---1---1--1--001010011-21101-021000010-00-012211----11000?112-2-01010?031120001100-10-11---0001320-20-1-10100-0000-0-000100000200-000?0201011012211221-020?210?110002-2110002----2--1--2------------22-1-2---?000?2-110100-0----0111?????1???0?????????????????????????????????????? Boa_constrictor 10(0 1)011-0001(1 2)02?1-0000(0 1)30000(0 2)100100000--03-001--------10?00003-1101-00(1 3)0-11(0 1)-3-(0 1)2-?0-1001000??-1?(0 1)1--001010121(0 1)(0 1)0102-0(1 2)1100000010-002211-(0 1)--11110101202-010001021120001110-100000-00001(1 3)21(0 1)20(0 1)1200100?--0000-00010-0003(0 1)0000(0 1)10(0 1)000110120(0 1)1221-??0?210111(0 1)0?2-201?002----2--1--2------------2??1-01--0000?(1 2)(0 1)1?0100-0-----0110411?1?0?0??????--?0000?00???1-2(0 1)??01??????????? Xenopeltis_unicolor 101011-0001202?1-00001300002100100000--03-001--------10?00003-1101-0030-110-3-02-?0-1001-01---1-11--001010111100102-011100000000-002211-0--11110101202-01000?021121001110-101100-0000132002011200100?-00000-00010-100300000010000011012000221-??0?21011100?2-201?002----2--1--2--------?---2?-1--1--0000?2-1?0100-0-----0110411?1?0?0??????--??0?0??????1-20??01??????????? ; END; BEGIN TREES; Title com_red_MB; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Sphenodon_punctatus, 2 Agama_agama, 3 Chamaleo_sp, 4 Enyalioides_laticeps, 5 Uromastyx_sp, 6 Oplurus_cyclurus, 7 Anolis_carolinensis, 8 Ophisaurus_apodus, 9 Anniella_pulchra, 10 Celestus_enneagrammus, 11 Elgaria_multicarinata, 12 Heloderma_horridum, 13 Heloderma_suspectum, 14 Shinisaurus_crocodilurus, 15 Xenosaurus_grandis, 16 Lanthanotus_borneensis, 17 Varanus_acanthurus, 18 Varanus_exanthematicus, 19 Varanus_salvator, 20 Anelytropsis_papillosus, 21 Dibamus_novaeguinae, 22 Eublepharis_macularius, 23 Strophurus_ciliaris, 24 Gekko_gecko, 25 Gonatodes_albogularis, 26 Delma_borea, 27 Lialis_burtonis, 28 Cordylus_mossambicus, 29 Acontias_sp, 30 Scincus_scincus, 31 Feylinia_polylepis, 32 Lepidophyma_flavimaculatum, 33 Pholidobolus_sp, 34 Lacerta_viridis, 35 Aspidoscelis_tigris, 36 Amphisbaena_fuliginosa, 37 Bipes_canaliculatus, 38 Rhineura_floridana, 39 Trogonophis_wiegmanni, 40 Anilius_scytale, 41 Liotyphlops_albirostris, 42 Leptotyphlops_sp, 43 Typhlops_jamaicensis, 44 Boa_constrictor, 45 Xenopeltis_unicolor; TREE PAUP_1 = (1:0.35209,(((((((2:0.143976,5:0.082026):0.007807,3:0.137649):0.077814,(4:0.047489,(6:0.077864,7:0.128805):0.007481):0.063253):0.026158,((((((8:0.036564,11:0.028145):0.014253,10:0.088547):0.004212,9:0.041844):0.024915,15:0.050732):0.005401,(12:0.004454,13:0.004234):0.053837):0.007289,(14:0.045276,(16:0.026504,((17:0.018412,19:0.010813):0.007396,18:0.020926):0.051517):0.053161):0.008715):0.045965):0.002124,(((40:0.048856,(44:0.047057,45:0.041117):0.006851):0.054707,41:0.111517):0.006761,(42:0.10348,43:0.112314):0.007506):0.128357):0.010521,((33:0.110148,35:0.091288):0.132976,(34:0.16317,(((36:0.063225,39:0.029956):0.016829,37:0.047529):0.082675,38:0.078895):0.008409):0.025507):0.015278):0.03036,((28:0.110766,32:0.111356):0.013362,(29:0.066865,(30:0.052327,31:0.095954):0.014271):0.056733):0.014747):0.009906,((20:0.052452,21:0.083704):0.122822,((22:0.081448,(23:0.064725,(26:0.027312,27:0.041695):0.039456):0.058857):0.005166,(24:0.062727,25:0.105086):0.014433):0.089797):0.007552):0.0; 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END; BEGIN TREES; Title com_red_MP; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Sphenodon_punctatus, 2 Agama_agama, 3 Chamaleo_sp, 4 Enyalioides_laticeps, 5 Uromastyx_sp, 6 Oplurus_cyclurus, 7 Anolis_carolinensis, 8 Ophisaurus_apodus, 9 Anniella_pulchra, 10 Celestus_enneagrammus, 11 Elgaria_multicarinata, 12 Heloderma_horridum, 13 Heloderma_suspectum, 14 Shinisaurus_crocodilurus, 15 Xenosaurus_grandis, 16 Lanthanotus_borneensis, 17 Varanus_acanthurus, 18 Varanus_exanthematicus, 19 Varanus_salvator, 20 Anelytropsis_papillosus, 21 Dibamus_novaeguinae, 22 Eublepharis_macularius, 23 Strophurus_ciliaris, 24 Gekko_gecko, 25 Gonatodes_albogularis, 26 Delma_borea, 27 Lialis_burtonis, 28 Cordylus_mossambicus, 29 Acontias_sp, 30 Scincus_scincus, 31 Feylinia_polylepis, 32 Lepidophyma_flavimaculatum, 33 Pholidobolus_sp, 34 Lacerta_viridis, 35 Aspidoscelis_tigris, 36 Amphisbaena_fuliginosa, 37 Bipes_canaliculatus, 38 Rhineura_floridana, 39 Trogonophis_wiegmanni, 40 Anilius_scytale, 41 Liotyphlops_albirostris, 42 Leptotyphlops_sp, 43 Typhlops_jamaicensis, 44 Boa_constrictor, 45 Xenopeltis_unicolor; TREE PAUP_1 = (1,((((((((2,3),5),((4,7),6)),(((((((8,11),10),9),15),(12,13)),(14,(16,((17,19),18)))),(((40,(44,45)),41),(42,43)))),((33,35),(34,(((36,39),37),38)))),((28,32),(29,(30,31)))),((22,(24,25)),(23,(26,27)))),(20,21))); TREE PAUP_2 = (1,((((((((2,3),5),(4,(6,7))),(((((((8,11),10),9),15),(12,13)),(14,(16,((17,19),18)))),(((40,(44,45)),41),(42,43)))),((33,35),(34,(((36,39),37),38)))),((28,32),(29,(30,31)))),((22,(24,25)),(23,(26,27)))),(20,21))); END; BEGIN MRBAYES; charset BDNF_3rdpos = 1 -676 \ 3; charset BDNF_1stpos = 2 -676 \ 3; charset BDNF_2ndpos = 3 -676 \ 3; charset BMP2_2ndpos = 677 -1321 \ 3; charset BMP2_3rdpos = 678 -1321 \ 3; charset BMP2_1stpos = 679 -1321 \ 3; charset DNAH3_3rdpos = 1322 -2043 \ 3; charset DNAH3_1stpos = 1323 -2043 \ 3; charset DNAH3_2ndpos = 1324 -2043 \ 3; charset FSTL5_3rdpos = 2044 -2665 \ 3; charset FSTL5_1stpos = 2045 -2665 \ 3; charset FSTL5_2ndpos = 2046 -2665 \ 3; charset RAG1_3rdpos = 2666 -3756 \ 3; charset RAG1_1stpos = 2667 -3756 \ 3; 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