#NEXUS [written Wed Jul 11 15:50:54 CAT 2012 by Mesquite version 2.75 (build 564) at RakSwam/10.0.0.100] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=38; TAXLABELS Phytophthora_asparagi_VHS17644_HQ012844 Phytophthora_humicola_WPC_P6702 Phytophthora_inundata_VHS16836 Phytophthora_amnicola_CBS13152_JQ029948 Phytophthora_amnicola_VHS19503_JQ029946 Phytophthora_hybrid_CMW37727 Phytophthora_hybrid_CMW37728 Phytophthora_hybrid_CMW37729 Phytophthora_hybrid_CMW37730 Phytophthora_hybrid_MUCC774 Phytophthora_fluvialis_CBS129424_JF701441 Phytophthora_fluvialis_VHS17350_JF701440 Phytophthora_gonapodyides_MUCC761_HQ012850 Phytophthora_gonapodyides_MUCC776_JN547642 Phytophthora_litoralis_CBS127953_HQ012866 Phytophthora_litoralis_VHS17085_HQ012864 Phytophthora_megasperma_DDS3432_HQ012867 Phytophthora_megasperma_VHS17183_HQ012868 Phytophthora_hybrid_MUCC777 Phytophthora_hybrid_MUCC778 Phytophthora_hybrid_MUCC779 Phytophthora_pgchlamydo_IMI389731_JF935968 Phytophthora_pgchlamydo_SLPA121_JN547652 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Phytophthora_hybrid_MUCC783 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Phytophthora_pgchlamydo_VHS3753_HQ012878, 25 Phytophthora_pgchlamydo_VHS6595_HQ012879, 26 Phytophthora_thermophila_CBS127954_HQ012872, 27 Phytophthora_thermophila_VHS16164_HQ012875, 28 Phytophthora_hybrid_MUCC780, 29 Phytophthora_hybrid_MUCC781, 30 Phytophthora_hybrid_MUCC782, 31 Phytophthora_hybrid_MUCC783, 32 Phytophthora_hybrid_MUCC784, 33 Phytophthora_hybrid_CMW37731, 34 Phytophthora_hybrid_CMW37732, 35 Phytophthora_hybrid_CMW37733, 36 Phytophthora_hybrid_CMW37734, 37 Phytophthora_hybrid_VHS5185, 38 Phytophthora_hybrid_VHS22715; TREE coxI_MP_bootstrap_consensus = (1:0.0,((2:100.0,3:100.0)100:100.0,((4:100.0,5:100.0,6:100.0,7:100.0,8:100.0,9:100.0,10:100.0)100:100.0,(((11:100.0,12:100.0)100:100.0,(15:100.0,16:100.0)100:100.0)99:99.0,(26:100.0,27:100.0,28:100.0,29:100.0,30:100.0,31:100.0,32:100.0,33:100.0,(34:100.0,35:100.0)65:65.0,36:100.0,37:100.0,38:100.0)100:100.0)75:75.0,((13:100.0,14:100.0)100:100.0,(17:100.0,18:100.0)100:100.0)78:78.0,((19:100.0,20:100.0,21:100.0)86:86.0,22:100.0,23:100.0)100:100.0,(24:100.0,25:100.0)100:100.0)51:51.0)100:100.0)0; END; BEGIN TREES; Title coxI_MP_; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Phytophthora_asparagi_VHS17644_HQ012844, 2 Phytophthora_humicola_WPC_P6702, 3 Phytophthora_inundata_VHS16836, 4 Phytophthora_amnicola_CBS13152_JQ029948, 5 Phytophthora_amnicola_VHS19503_JQ029946, 6 Phytophthora_hybrid_CMW37727, 7 Phytophthora_hybrid_CMW37728, 8 Phytophthora_hybrid_CMW37729, 9 Phytophthora_hybrid_CMW37730, 10 Phytophthora_hybrid_MUCC774, 11 Phytophthora_fluvialis_CBS129424_JF701441, 12 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