#NEXUS [MacClade 4.05 registered to Susumu Takamatsu, Faculty of Bioresources, Mie University] BEGIN TAXA; DIMENSIONS NTAX=50; TAXLABELS Erysiphe_glycines_AB015927 Erysiphe_glycines_AB015934 Erysiphe_heraclei_AB000942 Erysiphe_betae_AF011290 Erysiphe_polygoni_AF011308 Erysiphe_polygoni_AF011307 Erysiphe_trifolii_AB015913 Erysiphe_friesii_AB000939 Erysiphe_lespedezae_AB015923 Erysiphe_baeumleri_AB015919 Erysiphe_diffusa_AB078800 Erysiphe_pisi_AF073348 Erysiphe_howeana_AF011301 Erysiphe_cruciferarum_AF031283 Erysiphe_convolvuli_AF154327 Erysiphe_liriodendri_AF011302 Erysiphe_quercicola_AB292691 Erysiphe_quercicola_AB292694 Erysiphe_abbreviata_AB271785 Erysiphe_castaneigena_AF298545 Erysiphe_alphitoides_AB237783 Erysiphe_pseudolonicerae_AB015915 Erysiphe_monascogera_AB331646 Erysiphe_hypophylla_AB292715 Erysiphe_epigena_AB292720 Erysiphe_hypogena_AB292724 Erysiphe_syringae_AB015920 Erysiphe_magnifica_AF011312 Erysiphe_paeoniae_AB257438 Erysiphe_blasti_AB015918 Erysiphe_aquilegiae_AB015929 Erysiphe_macleayae_AB016048 Erysiphe_weigelae_AB015932 Erysiphe_weigelae_AB015931 Erysiphe_huayinensis_AB015914 Erysiphe_viburni_ex_Viburnum_plicatum_MUMH786 Erysiphe_hedwigii_AF298539 Erysiphe_viburni_AF298541 Erysiphe_deutziae_DQ861918 Erysiphe_deutziae_DQ861917 Viburnum_plicatum_MUMH794 Erysiphe_pulchra_AB015924 Erysiphe_pulchra_AB000941 Erysiphe_helwingiae_AB015916 Erysiphe_vanbruntiana_AB015925 Erysiphe_miranda_MUMH2561 Erysiphe_staphyleae_AB015922 Erysiphe_pulchra__AB015935 Erysiphe_ligustri_AB015917 Erysiphe_juglandis_AB015928; END; BEGIN CHARACTERS; DIMENSIONS NCHAR=605; FORMAT DATATYPE=DNA MISSING=? GAP=- MATCHCHAR=. ;OPTIONS MSTAXA=UNCERTAIN ; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Erysiphe_glycines_AB015927 CAGAGCGTGAGGCTCAGT-CGCTGGCATCT-GCCACGTGCTGGGCCGACCCTCCCACCCGTGTCGATTTTATAGATTGTTGCTTTGGCGGGCCGGGAC-C-GTCCAC--GTCGT-TCACAGTG--ACGCGT---GCGAGCT-GCCC--ACCGGCT--TTGG-CTGGAGCGTGTCCGCCAAAGACCC-AACCCAAAACT-CTTATATTTGTCATG-GTAGTCT-AAG-TAAAAGTA----TATAATTGATAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTTAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATAA-CA-CCCCC-TCGAGCTACCGTTGT--GTGGCTGTGGTGTTGGGGCTCGCCGCGTCTCGCGGTGGCTCTTAAAGACAGTGGCGGTCCCGGCGTGGGCTCTACGCGTAGTAACTT-GATTCTCGCGACAGAGTGACGAC-GATGATCAGCCAAAAAACCCCCTTTTAA--CCAAGTCCGGTCATACGGATTTTACAGG [569] Erysiphe_glycines_AB015934 ..................-...-...G...-....T..............................-.....T.........................-.-......--....C-..G.....--...T..---....A..-....--.......--....-..........C.............-.T...C...---..C.....-...C.--.C.....-...-.G.T.T..----.........................................................................................................................................................................-..-.....-.........AA....--...........................C.......................................................CT..T.......................-..A............CC....AACC.TTAAT..........A.ATAC.GA........ [566] Erysiphe_heraclei_AB000942 .....T.C..........-..T-.......-..TG..C............................-...G..TC.....................CTG.C...GT.--.CT..-C.G.CTG.--..A..C---.TCG..C-....--.....T.--.C.A-........C.C.............-....A....A--..C..G..-...TGT-..C....-T..-CTTT.TA.---TG.A................................................................................................................................................G.....................-..-.....-..C....G.......--.......C..............T....AT--....C...C...............................................-.C...................C.T.G..GCTT....G..C.A.....A..G-----GGTC.A.TCA-C.T...--.C..... [561] Erysiphe_betae_AF011290 ---------.........-..T-...G...-..TG...............................-...G..TC.....................CTG.C...GT.--.CT..-C.G.CTG.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C.A-........C.C.............-....A....---..C..G..-...TGT-..C....-T..-CTTT.TA.A--TG.A......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G.......--.......C..............T....AA.-....C...C...............................................-.C...................C.T.G..GCTT....G..C.A.....A..G-----GGTC.A.TCA-C.T...--.C...T. [553] Erysiphe_polygoni_AF011308 .....T.C..........-..T-...G...-..TG...............................-...G..TC.....................CTA.C...GT.--.CT..-C.G...G.--..A..C---.TCG..C-....--.....T.--.C.A-........C.CG............-....A...----..C..G.A-...TGT-..C....-T..-CTTT.TA.---TG.A......................................................................................................................................................................-..-.....-..C............--.......C..............T....A.--....C...C......................A........................-.C...................C.T.G..GCTT....G..C.A....AA..G-----GGTC.A.TCA-C.T...--.C..... [559] Erysiphe_polygoni_AF011307 .....T.C..........-..T-...G...-..TG...............................-...G..TC.....................CTA.C...GT.--.CT..-C.G...G.--..A..C---.TCG..C-....--.....T.--.C.A-........C.C.............-....A...----..C..G..-...TGT-..C....-T..-CTTT.TA.---TG.A......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G.......--.......C..............T....AA--....C...C......................A........................-.C.............A.....C.T.G..GCTT....G..C.A.....A..G-----GGTC.A.TCA-C.T...--.C..... [559] Erysiphe_trifolii_AB015913 .....T.C..........-...-...G..G-...G...............................-...G..TC.....................C.G.C...GT.--.CT..-..G..AG.--...T.C---.TCG..C-....--.....T.--.A.AA........C.C.............-....A...----..C..G..-..TTGT-..C....-C..-CTTT.T..---TG.A......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C...........A..T....AT--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C.....TC...T-----GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [559] Erysiphe_friesii_AB000939 .C...T.C..........-..T-...G...-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.C...GT.--.CT..-C.G..TG.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C.A-........C.C.............-....A....---..C..G..-..TTGT-..C....-T..-.TTG.TA.---TG.A......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G.......--.......C..............T....A.--....C...C.............C.................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C.A....C...T-----GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [559] Erysiphe_lespedezae_AB015923 .....T.C..........-..T-...G...-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.C.C.GT.--.CT..-C.G..CG.--.TAT.C---ATCG..C-....--.....T.--.C.A-........C.C.............-C.T.A...----..C.AG..-..TT.T-..C....-T..-C.TT.T..---TG.A......................................................................................................................................................................-..-.....C..C....G.......--.......C...........G..T....AT--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C.A...ACG..T-----GTCC.A.TCA-C.T..GA..C.T... [561] Erysiphe_baeumleri_AB015919 .....T.C..........-...-...G...-...G...............................-...G..TC.....................C.G.C...GT.--.CT..-..G..AG.--..CT.C---.TCG..C-....--.....TC--...AA........C.C.............-....A...----..C..G..-...TGT-..C....-C..-CTTT.T..---TG.A......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C...........A..T....AT--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C.....TAC..T-----GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [559] Erysiphe_diffusa_AB078800 .....T.C..........-..T-...G...-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.C.CTGTT--.CA..-C.G..TG.--..AT.C---.TCG..C-....C-C....TG--..CCA........C.C.............-....A...----..C..G..-..TTGT-A.C....-C..-CTTT.T..---TG.A......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..A....--.......C..............T....AT--....C...C..................T...A........................-.C.....................-.G..GCTT....G..C.A...TC...T-----GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [560] Erysiphe_pisi_AF073348 .....T.C..........-..T-.......-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.C.CTGT.--.CT..-C.G..TG.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.--..CAA........C.C.............-....A...----..C..G..-..TTGT-..C....-C..-CTTT.T..---TG.A......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C..............T....AA--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C.A...TCA.CT-----GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [559] Erysiphe_howeana_AF011301 -...-T.C..........-..T-.......-...G...............................-...G..TC.....................CTG.C.CTGT.--.CT..-C.G..TG.--..AT.C---.TTG..C-....--.....T.--..CAA........C.C.............-....A...----..C..G..-..TTGT-..C....-C..-CTTT.T..---TG.A......................................................................................................................................................................-..-.....C..C....G..T....--.......C..............T....AT--....C...C........T......................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C.A-..TCA..T-----GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [557] Erysiphe_cruciferarum_AF031283 .....T.C..........-..T-...G...-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.C...GT.--.CT.C-C.G..TG.G-..AT.C---.TCG..C-....--.....T.TCAC.A-.......AG...............-....A....---..C..G..-...TGT-..C....-C..-CTTT.T..---TG.A..............................................................................G.......................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C..............T....AT--....C...C......A........................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C.A....C....-----GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [562] Erysiphe_convolvuli_AF154327 .....T.C.......C..-..T-......A-..TG...A...............................G..TC..............A......C.GTT...GT.--.CT.C-C.G..TG.--G.AT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C.A-..........C.............-....A...----..C..G..-..TTGT-..C....-C..-CTTT.T..---TG.A......................................................................................................................................................................-..A.....-..C....G.......--.......C..C...........T....CT--....C...C...............................................-.C.....................-.GC.GCTT....G..C.A..T.....G-----GTTC.A.TCA-C.T...--.C.T... [560] Erysiphe_liriodendri_AF011302 .....T.C..........-..T-.......-..TG...............................-.G.G..TC.....................C.G.C...GC.--.CT.CTC.G..AG.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.-T.C..-..........C.............C..T.A...----..C..G..-..TT.T-..C....-C..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................................................................................-..-.....C..C.......T....--.......C..C...........T....AT--....C...C...............................................-.C.....................-.GC.GCTT....G..C.A..GAAC..T-----GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [562] Erysiphe_quercicola_AB292691 ..................-..T-.......-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.-...GT.--.CT.CCC.G..AG.--..AA.C---.TCG..C-....--.....T.--.C..-........C.C.............-C.T.A...----..C..G..-..TTAT-..C....-T..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C..T....T....--.......C..............T..T.AT--A...C...C...............................................-.C.....................-.GC.GCTT....G..C-AA...AC..------GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [556] Erysiphe_quercicola_AB292694 ..................-..T-.......-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.-...GT.--.CT.CCC.G..AG.--..AA.C---.TCG..C-....--.....T.--.C..-........C.C.............-C.T.A...----..C..G..-..TTAT-..C....-T..-CTTT.T..---t.GA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C..T....T....--.......C..............T..T.AT--A...C...C...............................................-.C.....................-.GC.GCTT....G..C-AA...AC..------GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [556] Erysiphe_abbreviata_AB271785 .....T.C..........-..T-.......-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.-...GCT--.CT..-G.G..AG.--..AT.C---.GTG..C-....--.....T.--.C..-........C.C.............-....A...----..C..G..-A.TT.TT..C....-T..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T.G..--..C....C..............T....AT--....C.T.C...............................................-.C.....................-.G..GCTT....G..G-AA...ACG.T-----GTTC.A.TCA-C.T...A-.C.A... [558] Erysiphe_castaneigena_AF298545 .....T.C..........-..T-...G...-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.CA..GT.--.CT.C-C.G..AG.--..CA.C---.TCG..C-....--.....TC--.C..-........C.C.............-....A...----..C..G..-..TT.T-..C....-C..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C..............T....AT--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT....G...GAA...AC..------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [557] Erysiphe_alphitoides_AB237783 .....T............-..T-.......-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.-...GT.--.CT.CTC.G..AG.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C..-........C.C.............-....A...----..C..G..-..TT.T-..C....-T..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C..............T....AT--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C-AA...AC..------GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [556] Erysiphe_pseudolonicerae_AB015915 .....T............-..T-.......-..TG...............................-...G..TCA....................C.G.C...GT.--.CT.CTC.G..AG.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C..-........C.C.............-....A...----..C..G..-..TT.T-..C....-T..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C..............T....AT--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C-AA...AC..------GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [557] Erysiphe_monascogera_AB331646 .....t............-..t-.......-...g...............................-...g..tc.....................c.g.-...gt.--.ct.ctc.g..ag.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C..-....G...C.C.............-....A...----..C..G..-..TT.T-..C....-C..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................R.......R.......................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C..............T....AT--....C...C...............................................-.C.....................-.GC.GCTT....g..c-aa...ac..------gctc.a.tca-c.t...--.c..... [556] Erysiphe_hypophylla_AB292715 ..................-..T-.......-...G...............................-...G..TC.....................C.G.-...GT.--.CT.CTC.G..AG.--.TAT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C..-........C.C.............-....A...----..C..G..-..TT.T-..C....-C..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C..............T....AT--....C...C...............................................-.T.....................-.G..GCTT....G..T.AA...AC..------GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [557] Erysiphe_epigena_AB292720 .....T.......A....-..T-.......-..TG...A...........................-...G..TC.....................C.G.-...GT.--.CT.C-C.G..AG.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C..-........C.C.............-....A...----..C..G..-..TT.T-..C....-C..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C..............T.....T--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C-AA...AC..------GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [555] Erysiphe_hypogena_AB292724 .....T.......C....-..T-.......-..TG...............................-...G..TC.....................C.G.-...GT.--.CT.C-C.G..AG.--..AT.C---.TCG..C-....--.......--.C..-........C.C.............-....A...----..C..G..-A.TT.T-..C....-C..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G.......--.......C...........C..T.....T--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT....G..C-AA...AC..------GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [555] Erysiphe_syringae_AB015920 .....T.C..........-..T-A......-..TG...........A...................-...G..TC.....................C.G.C...GT.--.CT.C-C....CG.--..AA.C---.TCG..C-....--.....T.--.C.A-........C...............-....A...----..C..G..-T.TT.TC..C....-C..-CTTT.T..---T.GA................................................................................................................................................G.....................-..-.....-..C....G..T....--.......C..............T....AT--....C...C...............................................-.C............G........-.GC.GCTT....G..C.A...AC...------GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [558] Erysiphe_magnifica_AF011312 ------------------------C.G...-..TG...............................-...G..TC.C...................C.G.C...GT.--.CT.C-C.G..AG.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C..-.....A..C..............T-....A...----..C..G..-..TT.T-..C....-C..-CTTT.T..---T.GA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C..............T....AT--....C...C....................T..........................-.C.....................-AGC.GCTT....G..C.AT.TAC...------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [535] Erysiphe_paeoniae_AB257438 ............TC....-..T-...G...-...G...............................-.A.G..TC.....................CTGT-...GT.--.CT.C-C.G..AG.--..AT.C---.TCGT.C-....--.....T.--.C..-........C..............T-..T.A...----..C..G..-...TAT-.......-C..-CTTT.T..----.TA......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--....T..C...........A..T...AGT--....C..........A.T..........T...........................-.C.....................-.G..GCTT.......CCT.TAT..--------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [553] Erysiphe_blasti_AB015918 ..................-..T-...G...-..T................................-...G..TC.....................TTA.-..GG..--.CT.C-C.GT.AG.--.TAT.C---.TCG...-....--.....T.--.C..-........C...............-..T.A....---..C..G..-...T.T-.C.....-C..-CTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--.......C...........A..T....CA--....C...C....................T..........................-.C............G........-AG..GC.T.......CC..GTT.---------GTTC.A.TCA-..T...--.C..... [553] Erysiphe_aquilegiae_AB015929 ..................-..T-...G..A-..TG...............................-...C..TC.....................CTA.-...GT.--.CT.C-C.GT.CG.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C.A-........C..............T-....A...----..C..G..-...T.T-..C....-C..-CTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--....T..C...........C..T.....T--....CA.......................T..........................-.C.....................-AG..GCTT.......GC..GTT.---------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [552] Erysiphe_macleayae_AB016048 ..................-..T-...G..A-..TG...............................-...C..TC.....................CTA.-...GT.--.CT.C-C.GT.CG.--..AT.C---.TCG..C-....--.....T.--.C.A-........C..............T-....A...----.GC..G..-...T.T-..C....-C..-CTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--....T..C...........C..T.....T--....CA.......................T..........................-.C.....................-AG..GCTT.......GC..GTT.---------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [552] Erysiphe_weigelae_AB015932 .................GG..T-A......-..TG...........A.T.................-...G..TC.....................TTA.-.C.GT.--.CT.G-C.G..AG.--..AT.CGTA.GCT..C-....--..T....--.C..-........C.C............T-....A...----..C..G..-...T.T-.......-C..-.T.T.T..----.TG......................................................................................................................................................................-..-.....-..C......-T...A--.......C...........A..T....GT--....C......A...................................C........-.C.....................-.G..GCTT........-G..TA...-------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [556] Erysiphe_weigelae_AB015931 .....T...........GG..T-A......-..TG...........A.T.................-...G..TC.....................TTA.-.C.GT.--.CT.G-C.G..AG.--..AT.C---.TAG...GC.G.CC..T....--.C..-........C.C............T-....A...----..C..G..-...T.T-.......-C..-.T.T.T..----.TG................................................................................................................................................G.....................-..-.....-..C.......T...A--.......C...........A..T....GT--....C......A...................................C........-.C.....................-.G..GCTT.........G..TA...-------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [558] Erysiphe_huayinensis_AB015914 .......C..........-..T-A....G.-..TG..C............................-...G..TC...............A.....CTG.-...G..--CCT.C-C.GT.CG.--..AA.C---.TCG..CC....--..T.T..AT.C..-........C..T............-....AC...---..C..G..-...T.TT..C....-...-GT.T.TATCTAA.TG......C............................................................................................................................................................G..A..-.....C..........T....TG...................A..T....GA--....C...C...................T...........................-.C...................CT-.G..GCTT.....C..TAA...GC.C------GTTC.A.TCA-C.T..GA-.C..... [569] Erysiphe_viburni_ex_Viburnum_plicatum_MUMH786 -------------------------------------------------------------.....-...G..TC...............A.....CTGT-...G..--.CT.C-C.G..AG.--..AT.C---.ACG..C-....--.......--.C..-........C...............-....A...----..C..G..-...T.T-.C.....T...-CTTT.T..----.TG......C...............................................................................................................................................................-..-....A-..C....G..T...C--.......C...........A..T....GT--....C...C...............................................-.C.....................G.TC.GC.T....G...G.T.AT..--------GTTC.A.TCA-C.T...--CC.T... [497] Erysiphe_hedwigii_AF298539 ..................-..t-.......-...g..c............................-...g..tc...............a.....ctgt-...g..--.ct.c-c.g..ag.--..at.c---.acg..c-....--.......--.c..-........c...............-....a...----..c..g..-...t.t-.c.....t...-cttt.t..----.tg......................................................................................................................................................................-..-....a-..c.......t...c--.......c...........a..t....gt--....c...c...............................................-.c.....................g.tc.gc.t....g...g.t.at..--------gttc.a.tca-c.t...--.c.t... [555] Erysiphe_viburni_AF298541 ..................-T.T-.......-...G..C............................-...G..TC...............A.....CTGT-...G..--.CT.C-C.G..AG.--..AT.C---.ACG..C-....--.......--.C..-........C...............-....A...----..C..G..-...T.T-.C.....T...-CTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................-..-....A-..C.......T...C--.......C...?.......A..T....GT--....C...C...............................................-.C.....................G.TC.GC.T....G...G.T.AT..--------GTTC.A.TCA-C.T...--.C.T... [555] Erysiphe_deutziae_DQ861918 .......C.....C..CA-..T-.....G.-..TG.....G.........................-...G.CTC..................A..CTG.-...GT.--.CT.C-C.GT.CG.--..A..C---.TCG..C-...T--G.....C--CA..-........C...............A.........---..C..G..-.....TT.C.....-...-CTTT.T..---T.GA.T.GATA.............................................................................................................................................................C.-..-.....C..C.......T....GT.......C...........C..T....GT--....C...C..G....CT..................................CT..-.C.................T.T.-.G..GCTT.......GC..GAT.---------G.TC.A...AGC..T.GG.CCT.... [562] Erysiphe_deutziae_DQ861917 .......C.....C..CA-..T-.....G.-..TG.....G.........................-...G.CTC..................A..CTG.-...GT.--.CT.C-C.GT.CG.--..A..C---.TCG..C-...T--G.....C--CA..-........C...............A.........---..C..G..-.....TT.C.....-...-CTTT.T..----.TG....................................................................................................................................................................C.-..-.....C..C.......T....GT.......C...........C..T....GT--....C...C..G....CT..................................CT..-.C.................T.T.-.G..GCTT.......GC..GAT.---------G.TC.A...AGC..T.GG.CCT.... [561] Viburnum_plicatum_MUMH794 ..................-..G-....C..-...G..C............................-...G..TC.....................TTGT-...GT.--.CT..-C.G.CAG.--.GTA.C---.TCG..C-....--G......--.C..-........C...............-....A....A--..C..G..-.....T-.C.....-...-CTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G.......--.......C...........A..T....GT--....C...C...............................................-.C....................AG.T-.GC.T....G..GC..AT.G---------GGTC.A.TCA-C.T...--.C..... [554] Erysiphe_pulchra_AB015924 ..................-..T-.....T.-...G...............................-......TC.....................CTG.-.C.G..--.CT..-C.G..AG.AA.GAT.C---.TCG.TC-....CCG......--.C..-........C...............-....A....AAA..C..G..-A....T-.C.....-...TCTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................A..-.....-..C....G..T...C--.......C...........A..T....GT--...AC...C..G............................................-.C.....................G.T..GCTT.......GC..GTT.---------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [563] Erysiphe_pulchra_AB000941 ..................-..T-.....T.-...G...............................-......TC.....................CTG.-.C.G..--.CT..-C.G..AG.AA.GAT.C---.TCG.TC-....CCG......--.C..-........C...............-....A....AAA..C..G..-A....T-.C.....-...TCTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................A..-.....-..C....G..T...C--.......C...........A..T....GT--...AC...C..G............................................-.C.....................G.T..GCTT.......GC..GTT.---------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [563] Erysiphe_helwingiae_AB015916 ..................-...-.......-...G...............................-...G..TC.....................CTGT-...G.TGT.CT.G-C.G.GAG.--..AT.C---ATCG..C-....--......C--.C..-........C.C......G...T.T-....A...----..C..G..-...T.TT.C.....-...-CTT..T.T---A.TG......................................................................................................................................................................-..A.....G..C....G..T....--.......C..............T....AT--....C...C......A........................................-.C.....................-.G..GCTT.......GC..GTT.---------GTTC.A.TCA-C.T...A-.C..... [559] Erysiphe_vanbruntiana_AB015925 .................C-.A.-.A.....-...G...............................-...G..TC.....................TTG.-...G.T--.CT.G-C.G..AG.--..AT.C---.TCG..C-....--.......--.C..-........C........G.....G-....A...----..C..G..-A..T..-.C.....-...-CTTT.T.T---A.TG......................................................................................................................................................................-..C.....C..C.......T....--.......C..............T....GT--....C...C...............................................-.C............G........-.GC.GCTT.......GC..ATT.---------GTTC.A.TCA-..T....-CC..... [556] Erysiphe_miranda_MUMH2561 ..................-..T-....A..-...G...............................-...G..TC.....................TTG.-...GT.--.CT..-..G..AG.--...GTGC--ATCG..C-A...--.......--.C..-.......................T-....A....---..C..G..-...T.T-.C.....-...-CTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................-..-.....C..C....G..T....--....T..C...........A..T....GT--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT.......GC...AT.---------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [555] Erysiphe_staphyleae_AB015922 ..................-..T-.......-.T.G...............................-...G..TC.....................CTG.-...GT.--.CGA.-C.G..AG.--..TG.C---.TCG..C-....--.......--.C..-........C..............T-....A...----..C..G..-...TAT-.C.....-...-CTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................-..-.....-..C.......T....--....T..C...........A..T....GT--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT.......GC..TAT.---------GTTC.A.TCA-C.T...--.C..... [552] Erysiphe_pulchra__AB015935 ............T.....-..T-.......T...G...............................-...G..TC.....................CTG.-TC.AT.--.CT.C-C.G..AG.--..AT.C---.KTGAGC-....--.......--.C..-........C........G......-....A...----..C..G..-...T.T-.C.....-...-CTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................-..-...T.-..C....G..T....--.......C...........A..T....GT--....C...C...............................................-.C.....................-.G..GCTT.......GC..TTT..--------GTTC.A.TCA-C.T...--.C.T... [554] Erysiphe_ligustri_AB015917 .....T............-..T-.......-...G...............................-...G..TC...............A.....TTG.-...GT.--.CT.C-C.G..AG.--..AT.C---.TCGC.C-....--.......--.C..-........C...............-....A....---..C..G..-...T.T-.C.....-...-CTTT.T..----.TG......................................................................................................................................................................-..-.....-..C....G..T....--....T..C...........A..T....GT--....C...C..............T.......A.....A..................-.C.....................-.G..GCTT.......GC..TTT.---------GCTC.A.TCA-C.T...--.C..... [553] Erysiphe_juglandis_AB015928 ............T.....-..T-.......-...GT..C...A.......................C......TCA....................TTAT-.....G--....C-C.GT.AG.--GT....---AT.G..A-....--.......--.C..-.................G.....T-.T..A..-----..C..G..-...T.T-.C.....-...-GTTT.T..----.G.......................................................................................................................................................................A..-.....-......C.T.-.A..--....T.AC..............T..G..T.-C...C...C....................T.A...............C........-.C.....................-.G..GCTT.....G..G..TTT..--------G-TC.A.TCT-.CT...--.C.T... [553] ; END; BEGIN TREES; [! >Data file = ITS.nex >Heuristic search settings: > Optimality criterion = parsimony > Character-status summary: > Of 605 total characters: > All characters are of type 'unord' > All characters have equal weight > 365 characters are constant > 73 variable characters are parsimony-uninformative > Number of parsimony-informative characters = 167 > Gaps are treated as "missing" > Multistate taxa interpreted as uncertainty > Starting tree(s) obtained via stepwise addition > Addition sequence: random > Number of replicates = 100 > Starting seed = 1884929217 > Saving optimal trees from each replicate, even if they are not optimal > overall > Number of trees held at each step during stepwise addition = 1 > Branch-swapping algorithm: tree-bisection-reconnection (TBR) > Steepest descent option not in effect > Initial 'MaxTrees' setting = 100 (will be auto-increased by 100) > Branches collapsed (creating polytomies) if maximum branch length is zero > 'MulTrees' option in effect > Topological constraints not enforced > Trees are unrooted > >Heuristic search completed > Total number of rearrangements tried = 613813838 > Score of best tree(s) found = 649 > Number of trees retained = 2680 > Time used = 00:05:09.7 ] TREE PAUP_181 = [&R] (Erysiphe_glycines_AB015927,Erysiphe_glycines_AB015934,((((((((((((((((((((Erysiphe_heraclei_AB000942,Erysiphe_betae_AF011290),(Erysiphe_polygoni_AF011308,Erysiphe_polygoni_AF011307)),Erysiphe_friesii_AB000939),Erysiphe_lespedezae_AB015923),((Erysiphe_trifolii_AB015913,Erysiphe_baeumleri_AB015919),(Erysiphe_diffusa_AB078800,(Erysiphe_pisi_AF073348,Erysiphe_howeana_AF011301)))),Erysiphe_cruciferarum_AF031283),Erysiphe_convolvuli_AF154327),Erysiphe_syringae_AB015920),(Erysiphe_liriodendri_AF011302,(((((Erysiphe_quercicola_AB292691,Erysiphe_quercicola_AB292694),Erysiphe_alphitoides_AB237783,Erysiphe_pseudolonicerae_AB015915),(Erysiphe_monascogera_AB331646,Erysiphe_hypophylla_AB292715),(Erysiphe_epigena_AB292720,Erysiphe_hypogena_AB292724)),Erysiphe_castaneigena_AF298545),Erysiphe_abbreviata_AB271785))),Erysiphe_magnifica_AF011312),(Erysiphe_blasti_AB015918,(Erysiphe_aquilegiae_AB015929,Erysiphe_macleayae_AB016048))),Erysiphe_paeoniae_AB257438),(Erysiphe_miranda_MUMH2561,Erysiphe_staphyleae_AB015922)),Erysiphe_ligustri_AB015917),Erysiphe_pulchra__AB015935),((Erysiphe_deutziae_DQ861918,Erysiphe_deutziae_DQ861917),(Viburnum_plicatum_MUMH794,(Erysiphe_pulchra_AB015924,Erysiphe_pulchra_AB000941)))),(Erysiphe_helwingiae_AB015916,Erysiphe_vanbruntiana_AB015925)),(Erysiphe_viburni_ex_Viburnum_plicatum_MUMH786,Erysiphe_hedwigii_AF298539,Erysiphe_viburni_AF298541)),((Erysiphe_weigelae_AB015932,Erysiphe_weigelae_AB015931),Erysiphe_huayinensis_AB015914)),Erysiphe_juglandis_AB015928)); 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