#NEXUS [written Mon Mar 23 15:25:09 JST 2015 by Mesquite version 2.75 (build 566) at KAGEYAMA-SHARE/127.0.0.1] BEGIN TAXA; TITLE clade2.Taxa; DIMENSIONS NTAX=17; TAXLABELS 'Phytophthora glovera S_2' Phytophthora_acerina Phytophthora_bisheria Phytophthora_botryosa Phytophthora_cactorum Phytophthora_capsici Phytophthora_citricola Phytophthora_citrophthora Phytophthora_colocasiae Phytophthora_glovera Phytophthora_himalsilva Phytophthora_inflata Phytophthora_meadii Phytophthora_multivora Phytophthora_pachypleura Phytophthora_plurivora Phytophthora_tropicalis ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE clade2.Character_Matrix; DIMENSIONS NCHAR=2905; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX 'Phytophthora glovera S_2' 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Phytophthora_citricola 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Phytophthora_colocasiae 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Phytophthora_himalsilva 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Phytophthora_inflata 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Phytophthora_meadii 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Phytophthora_multivora GAGCTTATCGACTCGGTGCTTGATGTCGTCCGCAAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGTTTCCAGATCACTCACTCGCTTGGTGGCGGTACCGGTTCCGGTATGGGTACGCTTCTTATCTCGAAGATTCGTGAGGAGTACCCCGACCGTATCATGTGCACGTACTCGGTCTGCCCGTCGCCTAAGGTGTCGGACACCGTCGTGGAGCCCTACAACGCCACGTTGTCGGTGCACCAGCTGGTCGAGAACGCCGATGAGGTCATGTGCCTGGATAACGAAGCCCTGTACGATATTTGCTTCCGTACGCTGAAGCTCACCACGCCCACCTACGGTGACCTAAACCATCTGGTGTGCGCCGCCATGTCTGGCCACGTGCCTGCGTTTCCCCGGTCAGCTGAACTCGGACCTGCGTAAGCTGGCCGTGAACCTGATCCCGTTCCCGCGTCTCCACTTCTTTATGATTGGTTTCGCTCCGCTGACCTCGCGTGGATCTCAGCAGTACCGTGCCCTCACGGTGCCTGAGCTGACCCAGCAGCAGTTCGATGCCAAGAACATGATGTGCGCCGCTGACCCTCGCCACGGCCGCTATTTAACTGCCGCGTGTATGTTCCGCGGACGTATGAGTACGAAGGAGGTTGACGAGCAGATGCTGAACGTGCAGAACAAGAACTCATCGTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCAAGGCTAGCGTGTGTGATATTCCTCCCAAGGGTCTGAAGATGAGCACTACGTTCATCGGTAACTCGACTGCCATCCAGGAGATGTTCAAGCGTGTGTCTGAACAGTTTACGGCTATGTTCCGTCGTAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGATGAGCCCTATCATGGCGAATGTTTGGATTCGGTCTGGGCTAGTAGCTTGTTTTAAACCATTCTACAATACTGATTATACTGTGGGGACGAAAGTCTCTGCTTTTAACTAGATAGCAACTTTCAGCAGTGGATGTCTAGGCTCGCACATCGATGAAGAACGCTGCGAACTGCGATACGTAATGCGAATTGCAGGATTCAGTGAGTCATCGAAATTTTGAACGCATATTGCACTTCCGGGTTAGTCCTGGGAGTATGCCTGTATCAGTGTCCGTACATCAAACTTGGCTTTCTTCCTTCCGTGTAGTCGGTGGAGGATGTGCCAGATGTGAAGTGTCTTGCAGGTGTCCTTCGGGTCGTCTGCGAGTCCTTTGAAATGTACTGAACTGTACTTCTCTTTGCTCGAAAAGCGTGGCGTTGCTGGTTGTGGAGGCTGCCTGCGTGGCCAGTCGGCGACCGGTTTGTCTGCTGCGGCGTTAATGGAGGAGTGTTCGATTCGCGGTATGGTTGGCTTCGGCTGAACAGGCGCTTATTGTATGCTTTTCCTGCTGTGGCGTGATGGACTGGTGAACCGTAGCTGTGTGGCTTGGCTTTTGAATCGGCTTTGCTGTTGCGAAGTAGAGTGGCGGCTCCGGCTGTCGAGGGTCGATCCATTTGGGAACTTTGCCCCTGGCCACCGTGACTTCATCAAGAACATGATTACGGGCACGTCGCAGGCCGATTGCGCCATTCTGGTGGTTGCTTCGGGTGTGGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGAGGGCCAGACCCGCGAGCACGCTCTGCTTGCCTTCACCCTGGGTGTGAAGCAGATGATCGTTGCCATCAACAAGATGGACGACTCGTCTGTCATGTACGGCCAGGCCCGTTACGAGGAGATCAAGTCGGAGGTGACGACCTACCTGAAGAAGGTGGGCTACAAGCCGGCCAAGATCCCGTTCGTGCCCATTTCCGGCTGGGAGGGAGACAACATGATCGACCGCTCCACCAACATGCCGTGGTACAAGGGACCTTTCCTCCTTGAGGCTCTTGACAACCTGAACGCCCCCAAGCGCCCGAGCGACAAGCCCCTGCGTCTGCCCCTTCAGGATGTGTACAAGATCGGCGGTATCGGCACGGTACCGGTCGGCCGTGTGGAGACTGGTGTCATCAAGCCTGGCATGGTCGCCACTTTCGGCCCCGTTGGTCTGTCAACTGAAGTCAAGTCCGTGGAGATGCACCACGAGTCCCTGCCGGAGGCTGTCCCTGGTGACAACGTCGGCTTCAACGTCAAGAACGTGTCGGTCAAGGAGCTGCGTCGTGGTTTCGTCGCTTCGGACTCCAAGAACGACCCCGCCAAGGGCACCCAGGACTTCACCGCCCAGGTGATTGTGCTGAACCACCCCGGCCAGATCGGAAACGGCTACTCGCCGGTGCTTGACTGCCACACGGCCCACGTTGCCTGCAAGTTCAAAGAGATCACGGAGAAGATGTATATAATGTTGTTGTAACTGCACATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATAGGTGCACCTGATATGGCTTTCCCACGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTAGAATCTGGTGCTGGTACAGGTTGGACCGTTTACCCCCCATTATCTAGTGTACAAGCACATTCTGGACCATCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCTTCATTATTAGGTGCAATTAATTTTATTTCTACTATTTATAATATGCGAGCTCCAGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTTTTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCGGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCTGGAGGAGGTGATCCTGTATTATATCAA Phytophthora_pachypleura GAGCTTATCGACTCGGTGCTTGATGTCGTCCGCAAGGAGGCTGAGAGCTGTGACTGCCTGCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCGCTTGGTGGCGGTACCGGTTCCGGTATGGGTACGCTTCTTATCTCGAAGATTCGTGAGGAGTACCCAGACCGTATCATGTGCACGTACTCGGTCTGCCCGTCGCCCAAGGTGTCGGACACCGTCGTGGAGCCCTACAACGCCACGTTGTCGGTGCATCAGCTGGTCGAGAACGCCGATGAGGTCATGTGCCTGGATAACGAGGCCCTGTACGATATTTGCTTCCGTACGCTGAAGCTCACCACGCCCACCTACGGTGACCTGAACCACCTGGTGTGCGCCGCCATGTCCGGCCACGTGCCTGCGTTTCCCCGGTCAGTTGAACTCGGATCTGCGTAAGCTGGCCGTGAACCTGATCCCGTTCCCGCGTCTCCACTTCTTTATGATTGGTTTCGCTCCGCTGACCTCGCGTGGGTCTCAGCAGTACCGTGCTCTTACGGTGCCGGAGCTGACCCAGCAGCAGTTCGATGCCAAGAACATGATGTGCGCCGCTGACCCTCGCCACGGCCGCTATTTAACTGCCGCGTGTATGTTCCGTGGACGTATGAGCACGAAGGAGGTTGACGAGCAGATGCTGAACGTGCAGAACAAGAACTCATCGTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCAAGGCTAGCGTGTGTGATATTCCTCCCAAGGGTCTGAAGATGAGCACTACGTTCATCGGTAACTCGACTGCCATCCAGGAGATGTTCAAGCGTGTGTCTGAACAGTTTACGGCTATGTTCCGTCGTAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGATGAGCCCTATCATGGCGAATGTTTGGATTCGGTCTGGGCTAGTAGCTTGTTTTAAACCATTCTACAATACTGATTATACTGTGGGGACGAAAGTCTCTGCTTTTAACTAGATAGCAACTTTCAGCAGTGGATGTCTAGGCTCGCACATCGATGAAGAACGCTGCGAACTGCGATACGTAATGCGAATTGCAGGATTCAGTGAGTCATCGAAATTTTGAACGCATATTGCACTTCCGGGTTAGTCCTGGGAGTATGCCTGTATCAGTGTCCGTACATCAAACTTGGCTTTCTTCCTTCCGTGTAGTCGGTGGAGGATGTGCCAGATGTGAAGTGTCTTGCGGGTGTCCTTCGGGTCGTCTGCGAGTCCTTTGAAATGTACTGAACTGTACTTCTCTTTGCTCGAAAAGCGTGGTGTTGCTGGTTGTGGAGGCTGCCTGTGTGGCCAGTCGGTGACCGGTTTGTCTGCTGCGGCGTTAATGGAGGAGTGTTCGATTCGCGGTATGGTTGGCTTCGGCTGAACAGGCGCTTATTGTATGCTTTTCCTGCTGTGGCGTGATGGGCTGGTGAACCGTAGCTGTGTGGCTTGGCTTTTGAATCGGCTTTGCTGTTGCGAAGTAGAGTGGCGGCTTCGGCTGTCGAGGGTCGATCCATTTGGGAACTTTGCCCCTGGCCACCGTGACTTCATCAAGAACATGATTACGGGCACCTCGCAAGCTGACTGCGCCATTCTGGTGGTTGCTTCGGGTGTGGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGAGGGCCAGACTCGTGAGCACGCTCTGCTTGCCTTCACCCTGGGTGTGAAGCAGATGATCGTCGCCATCAACAAGATGGACGACTCGTCTGTCATGTACGGCCAGGCCCGTTACGAGGAGATCAAGTCGGAGGTGACGACCTACCTGAAGAAGGTGGGCTACAAGCCGGCCAAGATCCCGTTCGTGCCCATCTCCGGCTGGGAGGGTGACAACATGATYGACCGCTCCACSAACATGCCGTGGTACAAGGGACCCTTCCTYCTTGAGGCTCTTGACAACCTGAACGCCCCCAAGCGCCCGAGCGACAAGCCCCTGCGTCTGCCCCTTCAGGATGTGTACAAGATCGGCGGTATCGGCACGGTACCGGTCGGCCGTGTGGAGACTGGTGTCATCAAGCCTGGCATGGTCGCCACTTTCGGCCCTGTTGGTCTGTCGACTGAAGTCAAGTCTGTGGAAATGCACCACGAGTCTCTGCCGGAGGCTGTCCCTGGTGACAACGTCGGCTTCAAYGTCAAGAACGTGTCGGTCAAGGAGCTGCGTCGTGGTTTCGTCGCTTCGGACTCCAAGAACGATCCCGCCAAGGCCACCCAGGACTTCACCGCCCAGGTGATTGTGCTGAACCACCCYGGCCAGATCGGCAACGGCTACTCGCCGGTGCTTGACTGCCACACGGCCCACGTTGCCTGCAAGTTCAAAGAGATCACGGAGAAGATGTATATAATGTTGTTGTTACCGCACACGCTTTTATAATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATAGGTGCACCTGATATGGCTTTTCCACGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTAGAATCTGGTGCGGGTACTGGTTGGACTGTTTATCCACCATTATCTAGTGTGCAAGCACACTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCTTCATTATTAGGTGCAATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCACAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCAGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAA Phytophthora_plurivora 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Phytophthora_tropicalis 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