NEXUS
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[Matrix accession#: M3919]

BEGIN TAXA;
	TITLE M3919;
	DIMENSIONS  NTAX=25;
	TAXLABELS
		Shiraia_bambusicola_NBRC_30147	Shiraia_bambusicola_NBRC_30312	Shiraia_bambusicola_NBRC_30737	Shiraia_bambusicola_NBRC_30738	Shiraia_bambusicola_NBRC_30752	Shiraia_bambusicola_NBRC_30753	Shiraia_bambusicola_NBRC_30754	Shiraia_bambusicola_NBRC_30755	Shiraia_bambusicola_NBRC_30771	Shiraia_bambusicola_NBRC_30772	Shiraia_bambusicola_NBRC_100220	Shiraia_bambusicola_NBRC_30739	'Shiraia-like fungus JP7'	'Shiraia-like fungus JP93'	'Shiraia-like fungus JP232'	Cordyceps_bassiana_DQ784577	Phoma_nigrificans_AY749030	Paecilomyces_viridis_AY624236	Phaeosphaeria_nodorum_AY786332	'Shiraia-like fungus JP256'	'Shiraia-like fungus JP185'	'Shiraia-like fungus JP119'	Nomuraea_rileyi_AY624250	Ophiostoma_dentifundum_AY495446	Aspergillus_ibericus_AM419748
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BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M3919;
	DIMENSIONS NCHAR=257;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
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		Shiraia_bambusicola_NBRC_30753        GGTCTCGAGGTCTACAATGGCACCTCGCCTTCAGCTCGAGCGCATGAATGTCTACTTCAACGAGGTAGTTTTTTCACGCACGATCTTGGGGCATCAGGCAACAAGTTTGTGCCCCGCGCTGTTCTTGTTGATCTTGAGCCCGGCACCATGGACGCTGTCCGCGCTGGGCCTTTTGGACAGCTTTTCCGTCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCTGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGT
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		Shiraia_bambusicola_NBRC_30772        GGTCTCGAGGTCTACAATGGCACCTCGCCTTCAGCTCGAGCGCATGAATGTCTACTTCAACGAGGTAGTTTTTTCACGCACGATCTTGGGGCATCAGGCAACAAGTTTGTGCCCCGCGCTGTTCTTGTTGATCTTGAGCCCGGCACCATGGACGCTGTCCGCGCTGGGCCTTTTGGACAGCTTTTCCGTCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCTGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGT
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		'Shiraia-like fungus JP93'            GGTCTCGAGGTCTACAATGGCACCTCGCCTCCAGCTCGAGCGCATGAATGTCTACTTCAACGAGGTAGTTTTTGCACGCACAACCTTGGGGCATCTGGCAACAAATTTGTGCCCCGCGCTGTTCTCGTCGATCTCGAGCCCGGCACAATGGACGCTGTCCGCGCTGGACCTTTCGGACAGCTGTTCCGTCCGACAACTTCGTTTTTGGCCAGTCTGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGT
		'Shiraia-like fungus JP232'           GGTCTCGAGGTCTACAATGGCACCTCGCCTCCAGCTCGAGCGCATGAATGTCTACTTCAACGAGGTAGTTTTTGCACGCACAACCTTGGGGCATCTGGCAACAAGTTTGTGCCCCGCGCTGTTCTCGTCGATCTCGAGCCCGGCACAATGGACGCTGTCCGCGCTGGACCTTTCGGACAGCTGTTCCGTCCGACAACTTCGTTTTTGGCCAGTCTGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGT
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		Phaeosphaeria_nodorum_AY786332        GGCCTCGAGGTCTACAATGGCACTTCGTCTCCAGCTCGAGCGCATGAACGTCTACTTCAACGAGGTGGTACAATCGCATACGACACAGAGGCTTCCGGCAACAAGTTCGTGCCCCGTGCTGTCCTCGTCGATCTCGAGCCCGGTACGATGGACGCCGTCCGCGCTGGCCCCTTCGGACAGCTCTTCCGTCCGACAACTTTGTCTTCGGCCAGTCTGGTGCTGGTAACAACTGGGCAAAGGGTCATTACACCGAGGGT
		'Shiraia-like fungus JP256'           GGTCTCGAGGTCTACAATGGCACCTCGCCTCCAGCTCGAGCGCATGAATGTCTACTTCAACGAGGTAGTTTTTGCACGCACAACCTTGGGGCATCTGGCAACAAATTTGTGCCCCGCGCTGTTCTCGTCGATCTCGAGCCCGGCACAATGGACGCTGTCCGCGCTGGACCTTTCGGACAGCTGTTCCGTCCGACAACTTCGTTTTTGGCCAGTCTGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGT
		'Shiraia-like fungus JP185'           GGTCTCGAGGTCTACAATGGCACCTCGTCTCCAGCTCGAGCGTATGAACGTCTACTTCAACGAGGTAGATTCAGCTCGCGCGACCCGAAGGCGTCAGGCAACAAGTTCGTCCCCCGCGCCGTCCTCGTCGATCTCGAGCCCGGTACGATGGATGCCGTCCGCGCTGGACCTTTCGGACAGCTTTTCCGCCCGACAACTTCGTCTTTGGCCAGTCTGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGT
		'Shiraia-like fungus JP119'           GGCCTCGAGGTCTACAATGGCACTTCGTCTCCAGCTCGAGCGTATGAACGTCTACTTCAACGAGGTAGATTTTGCTCGCACGACCCTGGGGCTTCCGGCAACAAGTTCGTGCCCCGCGCTGTCCTCGTCGATCTCGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCCGCGCTGGACCTTTCGGCCAGCTTTTCCGCCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCTGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGT
		Nomuraea_rileyi_AY624250              GGCCTGGAAGTCTACAATGGTACTTCGGCTCCAGCTCGAGCGTATGAGCGTCTACTTCAACGAGGTATTCGTAACCTGGATGACGCCAAGGCATCCGGTAACAAGTATGTCCCTCGCGCTGTTCTCGTCGATCTCGAGCCCGGTACCATGGATGCAGTCCGTGCCGGTCCTTTTGGCCAGCTTTTCCGTCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGT
		Ophiostoma_dentifundum_AY495446       GGCCTCGAAATCTACAACGGCACCTCGCCTCCAGCTGGAGCGTCTGAGCGTCTACTTCAACGAGGTTCCCTTTGCATGGGCAACTTCGAGGCCTCTGGCAACAAGTACGTCCCCCGTGCTGTGCTCGTCGATCTCGAGCCCGGCACCATGGACGCTGTCCGCGCTGGTCCTTTCGGCCAGCTGTTCCGCCCGACAACTTCGTCTTCGGTCAGTCTGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGT
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END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 257 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
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BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
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