#NEXUS BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=143; TAXLABELS Allorgella_semperiana Anoplolejeunea_conferta_I Anoplolejeunea_conferta_II Archilejeunea_fuscescens Bromeliophila_natans Capillolejeunea_mascarena Ceratolejeunea_belangeriana Ceratolejeunea_cornuta Ceratolejeunea_cubensis Ceratolejeunea_fallax Ceratolejeunea_filaria Ceratolejeunea_globulifera Ceratolejeunea_grandiloba Ceratolejeunea_guianensis Ceratolejeunea_laetefusca Ceratolejeunea_minuta Ceratolejeunea_spinistipula_I Ceratolejeunea_spinistipula_II Cheilolejeunea_clypeata Cheilolejeunea_discoidea Cheilolejeunea_filiformis Cheilolejeunea_holostipa Cheilolejeunea_lineata Cheilolejeunea_rigidula Cololejeunea_calcarea Cololejeunea_cardiocarpa Cololejeunea_inflectens Colura_calyptrifolia Colura_irrorata Cumulolejeunea_ocellata Cyclolejeunea_chitonia Cyclolejeunea_convexistipa Cyclolejeunea_luteola Diplasiolejeunea_cavifolia Diplasiolejeunea_pauckertii Diplasiolejeunea_pellucida Drepanolejeunea_angustifolia Drepanolejeunea_anoplantha Drepanolejeunea_biocellata Drepanolejeunea_blumei Drepanolejeunea_brunnea_I Drepanolejeunea_brunnea_II Drepanolejeunea_commutata Drepanolejeunea_cutervoensis Drepanolejeunea_elegans Drepanolejeunea_erecta Drepanolejeunea_fissicornua Drepanolejeunea_granatensis Drepanolejeunea_hamatifolia Drepanolejeunea_inchoata Drepanolejeunea_intermedia Drepanolejeunea_levicornua Drepanolejeunea_lyrata Drepanolejeunea_madagascariensis Drepanolejeunea_polyrhiza Drepanolejeunea_sp Drepanolejeunea_spicata Drepanolejeunea_spinosocornuta Drepanolejeunea_tenera Drepanolejeunea_thwaitesiana Drepanolejeunea_trematodes Drepanolejeunea_yunnanensis Echinolejeunea_papillata Gaolejeunea_gaoi_I Gaolejeunea_gaoi_II Haplolejeunea_sticta Haplolejeunea_umbrosa Harpalejeunea_grandis Harpalejeunea_grandistipula Harpalejeunea_marginalis Harpalejeunea_molleri Kymatolejeunea_bartlettii_I Kymatolejeunea_bartlettii_ii Leiolejeunea_grandiflora_I Leiolejeunea_grandiflora_II Lejeunea_capensis Lejeunea_cavifolia Lejeunea_cerina Lejeunea_exilis Lejeunea_flava Lejeunea_laetevirens Lejeunea_mimula Lejeunea_paucidentata Lejeunea_thallophora Lejeunea_trinitensis Lepidolejeunea_bidentula_I Lepidolejeunea_bidentula_II Lepidolejeunea_borneensis__II Lepidolejeunea_borneensis_I Lepidolejeunea_borneensis_III Lepidolejeunea_cordifissa Lepidolejeunea_cuspidata Lepidolejeunea_delessertii Lepidolejeunea_eluta Lepidolejeunea_grandiocellata Lepidolejeunea_integristipula Lepidolejeunea_involuta Lepidolejeunea_novae_caledonia Lepidolejeunea_sullivantii Leptolejeunea_convexistipa Leptolejeunea_vitrea Lopholejeunea_eulopha Luteolejeunea_herzogii Macrocolura_sagittistipula Metalejeunea_crassitexta Metalejeunea_cucullata Microlejeunea_africana Microlejeunea_capillaris Microlejeunea_squarrosa Microlejeunea_ulicina Myriocoleopsis_gymnocolea Neurolejeunea_breutel Otigoniolejeunea_portoricensis Otolejeunea_moniliata_I Otolejeunea_moniliata_II Pictolejeunea_picta Prionolejeunea_denticulata Prionolejeunea_limpida Ptychanthus_striatus Pycnolejeunea_contigua Pycnolejeunea_densistipula Pycnolejeunea_macroloba Rectolejeunea_flagelliformis Rectolejeunea_versifolia_I Rectolejeunea_versifolia_II Rectolejeunea_versifolia_II.2 Reinerantha_foliicola Siphonolejeunea_elegantissima Soella_obtusifolia_I Soella_obtusifolia_II Soella_obtusifolia_III Thiersianthus_silamensis Thysananthus_spathulistipus Vitalianthus_aphanellus_I Vitalianthus_aphanellus_II Vitalianthus_bischlerianus Vitalianthus_guangxianus_I Vitalianthus_guangxiensis_II Vitalianthus_lamyii Xylolejeunea_crenata Xylolejeunea_grolleana Yanoella_truncatilobula_I Yanoella_truncatilobula_II ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE 'Lejeuneaceae rbcL trnL-trnF and nrITS'; DIMENSIONS NCHAR=2081; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Allorgella_semperiana 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Ceratolejeunea_spinistipula_II 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Cheilolejeunea_filiformis 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Cololejeunea_cardiocarpa 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Cololejeunea_inflectens 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Colura_calyptrifolia 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Colura_irrorata 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Cumulolejeunea_ocellata 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Diplasiolejeunea_pauckertii 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Diplasiolejeunea_pellucida 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Drepanolejeunea_angustifolia 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Drepanolejeunea_anoplantha 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Drepanolejeunea_commutata 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Drepanolejeunea_cutervoensis 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Drepanolejeunea_erecta 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Drepanolejeunea_fissicornua 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Drepanolejeunea_levicornua 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Drepanolejeunea_lyrata 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Drepanolejeunea_polyrhiza 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Drepanolejeunea_spicata 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Drepanolejeunea_trematodes 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Drepanolejeunea_yunnanensis 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Echinolejeunea_papillata 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Gaolejeunea_gaoi_I GGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGAACACACGATCTCGGAAAAACTTTGCGAACGATATCCCGAGGGATCGTGTCCGGAGGCACGGTCGTCGGTGCCGGAGCAGGATTCATGTGCCTTGTCGTG-TCCCGCGTGGCGGGGCTCGTGGTTCTTTTACCGTCGGATGACACGCGTGGCTCCGGGGAGCGCATCCCCTCCACCCGGTGCCCCATTTTAACCCGACCAAACGACCGAAATGACTCTCAGCAACGGATATCTTGGCTCTTGCAACGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACCTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGCGAATCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCTCGTCCGAGGGCATGCCTGCCTGAGCGTCCGCTCCGACCCACCCACGTGCGCGTGGAATTGGTCGCCCGGGAACTCGCGGTTGGCTGAAAAATGGGAGCCGTCCGTCCGCTGGGGGAAGGGTGCGTCGCGAGAAGGTGGGACGTTGGTAAAAAGTGCCGTTCCCCGCGGAGTTTGACGGATGTTCGGACCTCAGATCAGGCAAGACCACCgagccttagtaga----------gaaatctattaagtgactgttttcatattcagggaaacctaaggtttgaaatgt---acggtaatcctgagccaaattttagttatgagataggtgcagagactcgaaggaaactatcctaacgaaatttctcta--tttttt------------gaatattg----------------gtaatac--aaaa-tatat-----ttaaaataataaaaaaatct--------------ggat-actaa-------------tatg-aata--ttagtttttagataa-cttcta-atag---acgaggataaagatagagt---ccttttt-taca----atctatataattttttattttta--tagat-aattgtaaaaagaaaatccgttggc-tttaatagaccttgagggttcaagtccct-ctacccccat-cat------tggctggc-aaaatttt----gttccaattttagaaattcaaattgccgggatagctcagtcggtagagcaggggactgaaaa?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Lejeunea_capensis 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Lejeunea_cavifolia ??????????????????????????????AACCTGCGGAAGGATCATTGAACACACGATCTCGGACAAACTTTGCGAACCGTACCCGGAGGGATCGTGTCCGGAGACGCGATTGTCGATGGCGGAGTCGGATTCATGTGCTCCGCCGTGTCCCCGCGCGGCGGGATTAGTGACTCTGTCATCGTCGGACTGCACGCACGCTTCCGGGGGGCGCGTCCCCTCCTCCGGGGGCCCTTTTTTACCCTGATGAAACAACCGAAATGACTCTCAGCAACGGATATCTTGGCTCTTGCAACGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACCTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGCGAATCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCTCGTCTGAGGGCATGCCTGCCTGAGCGTCCGCTCCGACCCACCCACGTGCGAGTGGAACTGGTCGTCCGGGGACCTGCGGTTGGCTGAAAAATGGGAGCCGTCCGTCCGCCGGGGGATCGGTGCGTTGCGAGAAGGTGGAACGTTGGTAAAAAGCTTCGCTCCCCGCGGAGTTTGACGGATGCTCGGACCTCAGATCAGGCAAGACCACCgagccttagtaga----------gaaatctactaagtgactgttttcacattcagggaaacctaaggtttgagatat---gaggtaatcctgagccaaatttcaattatgaaataggtgcagagactcaaaggaaactatcctaacgaaatttctcta--ttttttatta-------tgagtagta-------gttaagtgcataatac--aaaa-tatat-----tcgaaataataaaaacatct--------------gaac-actaa-----------aatatt-cata--ttagtttttaaatga-ctttta-ctag---acgaggataaagatagagt---ccttttt-taca----atctatataa-tttttc--ttta--tagat-aattgtaaaaagaaaatccgctggc-tttaatagaccttgagggttcaagtccct-ctacccccat--------------------------------ttttatttttagaaatcaaaattgccgggatagctcagttggtagagcaggggactgaaaaAAGGTCGATGCTATGATATTGAACCTGTTCGTGGAGAAGAAAATCAATACATTGCTTATGTTGCATATCCATTAGATTTATTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACCTTTTTACTTCTATTGTAGGTAACGTATTTGGATTTAAAGCTTTACGAGCTTTACGTCTTGAAGATTTGCGAATTCCTCCAGCTTATGTCAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAATAAGTATGGTCGTCCTTTATTAGGATGTACTATCAAACCAAAATTAGGTTTATCAGCAAAAAATTACGGTAGAGCTGTATATGAATGTCTTCGTGGTGGACTTGATTTCACAAAAGATGATGAAAATGTAAATTCTCAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGCTTCTTATTTGTAGCTGAAGCTCTTTTCAAATCTCAAGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGACACTATTTAAACGCTACAGCAGGTACATGCGAAGAAATGTTAAAACGAGCGCAATGTGCTAGAGAGTTAGGTGCACCGATTATTATGCATGATTATCTTACCGGTGGTTTTACTGCAAATACTACTTTAGCTCATTATGCTCGAGATAATGGTTTACTTCTTCATATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAAAAAAATCATGGTATGCATTTTCGTGTATTAGCTAAAGCACTACGTTTATCTGGAGGTGATCATATTCATGCCGGTACCGTTGTAGGTAAACTGGAAGGAGAACGTGGAGTAACTTTAGGCTTTGTAGACTTATTACGTGATGATTATGTAGAAAAAGATAGACCTCGCGGTATTTATTTTACCCAAGATTGGGTATCTTTGCCAGGTGTTCTTCCTGTGGCATCTGGAGGTATTCATGTTTGGCATATGCCAGCTTTAACTGA Lejeunea_cerina GGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGAACACACGATCTCGGATAAACTTTGCGAACCGTACCCGGAGGGATCGTGTCCGGAGACACGATTGTCGATGGCGGAGTCGGATTCATGTGCTCCGCCGTGTCCCCGCGCGGCGGGATTAGTGAATCTGCTATCGTCGGATTGCACGCACGCTTCCG?????????????????????GGGGCCCTTTTTTACCCTGGTGAAACGACCAAAATGACTCTCAGCAACGGATATCTTGGCTCTTGCAACGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACCTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGCGAATCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCTCGTCTGAGGGCATGCCTGCCTGAGCGTCCGCTCCGACCCACCCACGTGCGAGTGGAACTGGTCGTCCGGGGACCCGCGGTTGGCTGAAAAATGGGAGCCGTCCGTCCGCCGGGGGATGGGTGCGTTGCGAGAAGGTGGAACGTTGATAAAAAGCTTCGCTCCCCGCGGAGTTTGACGGATGCTCGGACCTCAGATCAGGCAAGACCACCgagccttagtaga----------gaaatctactaagtgactgttttcacattcagggaaacctaaggtttgagatat---gaggtaatcctgagccaaatttcaattatgaaataggtgcagagactcaaaggaaactatcctaacgaaatttctcta--ttttttatta-------tgagtagta-------gttaagtgcataatac--aaaa-tatat-----tcgaaataataaaaacatct--------------gaac-actca-----------aatatt-cata--ttaatttttaaatga-ctttta-atag---acgaggataaagatagagt---ccttttt-taca----atctatataa-tttttc--ttta--tagat-aattgtaaaaagaaaatccgctggc-tttaatagaccttgagggttcaaatccct-ctacccccat--------------------------------ttttagttttataaatcaaaattgccgggatagctcagttggtagagcaggggactgaaaa????TCGATGCTATGATATTGAACCTGTTCGTGGAGAAGAAAATCAATACATTGCTTATGTTGCATATCCATTAGATTTATTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACCTTTTTACTTCTATTGTAGGTAACGTATTTGGATTTAAAGCTTTACGAGCTTTACGTCTTGAAGATTTGCGAATTCCTCCAGCTTATATCAAAACTTTCCAAGGCCCACCTCATGGTATTCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAATAAGTATGGTCGTCCTTTATTAGGATGTACTATCAAACCAAAATTAGGTTTATCAGCAAAAAATTATGGTAGAGCTGTATATGAATGTCTTCGTGGTGGACTTGATTTTACAAAAGATGATGAAAATGTAAATTCTCAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGCTTCTTATTTGTAGCTGAAGCTCTTTTCAAATCTCAAGCTGAAACAGGTGAAATCAAAGGACACTATTTAAATGCTACAGCAGGTACATGCGAAGAAATGTTAAAACGAGCACAATGTGCTAGAGAGTTAGGTGTACCGATTATTATGCATGATTATCTTACCGGTGGTTTTACTGCAAATACTACTTTAGCTCATTATTCTCGAGATAATGGTTTACTTCTTCATATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAAAAAAATCACGGTATGCATTTTCGTGTGTTAGCTAAAGCACTACGTTTGTCTGGAGGTGATCATATTCATGCCGGTACCGTTGTAGGTAAACTGGAAGGAGAACGTGGAGTAACTTTAGGCTTTGTAGACTTATTACGTGATGATTATGTAGAAAAAGATAGACCTCGCGGTATTTATTTTACCCAAGATTGGGTATCTTTGCCAGGTGTTCTTCCTGTGGCATCTGGAGGTATTCATGTTTGGCATATGCCAGCTTTAACTG? 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Lejeunea_trinitensis 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Lepidolejeunea_eluta 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Lepidolejeunea_grandiocellata 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Lepidolejeunea_integristipula 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Lepidolejeunea_involuta 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Lepidolejeunea_novae_caledonia GGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTACACACGATCTTGGAAAAACCCAGAGAACCGTACCACGAGGGATCGTGCCCGGAGGCACGATTGTCGGTGCGGGAGTTGGATCGAAGTGCTTTGCCGTGGCCCCGCGCGGCGGGGTCAGCAACTCGTCCACTGACGGAACACACGCATGGCTCCGGGGATGGCGTCCCCTCCTCCGGGGGCCCTTTTTTAAACCGGTGAAACGACTGAAATGACTCTCAGCAACGGATATCTTGGCTCTTGCAACGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACCTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCTCGTCCGAGGGCATGCCTGCCTGAGCGTCCGCTCCTTACCACCCATGTGCGAGTGGAACTGGTCGTCCGAGAACCTGCGGTTGGCTGAAAAGCACGAGCCATCCGTCCGTTGGGGGAGCGGTGCGTCGCGGCAAGGTGGGACGTTTGTAATGGGCGACGCTCCTCGCGAAGTCTGACGGATGCTTGGACCTCAGATCAGACAAGACCACCGAGCCTTAATAGA----------GAAATCTACTAAGTGACTGTTTTCACATTCAGGGAAACCTAAGGTTTGAGATAT---GAGGTARTCCTGAGCCAAATTTTAKTTATGAAATAGGTGCAGAGACTCGAAGGAAACTATCCTAACGAAATTTCTCTA--TTTTTTATTA-------TGAGTATTG-------GTTAAGTGCATAACAT--AAAA-TATAT-----TCAAAATAATAAAAAAATTT--------------GAAT-ACTGA------------ATATG-AATA--TTAGTTTTTAAATAA-CTTTTA-ATAG---ACGAGGATAAAGATAGAGT---CCTTTTT-TATA----ATCTATATCA-TTTTTT--GTTA--TAGAT-AATTGTAAAAAGAAAATCCGTTGGC-TTTAATAGACCTTGAGGGTTCAAGTCCCT-CTACCCCCAT-TAT----------TGGC-AAAATTTT----GTTCCAATTTTATAAATTCAAATTGCCGGGATAGCTCAGTTGGTAGAGCAGGGGACTGAAAAAAGGTCGATGCTATGATATTGAACCTGTTCGTGGAGAAGAGAATCAATTTATTGCTTATGTTGCTTATCCATTAGATTTATTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACCTTTTYACTTCTATTGTAGGTAACGTATTTGGATTTAAAGCTTTACGAGCTTTACGCCTTGAAGATTTGCGAATTCCTCCAGCTTATATCAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAATAARTAYGGTCGTCCTTTGTTAGGATGTACTATCAAACCAAAATTAGGTTTATCAGCAAAAAATTATGGTAGAGCTGTATATGAATGTCTTCGTGGTGGACTTGATTTCACAAAAGATGATGAAAATGTAAATTCTCAACCGTTTATGCGTTGGAGAGATCGCTTYTTATTTGTAGCTGAAGCTCTTTTTAAATCTCAA-CTGAAACAGGTGAAATTAAAGGACATTATTTAAATGCTACAGCAGGTACRTGTGAAGAAATGTTAAAACGAGCACAATGTGCTAGAGAATTAGGTGTACCAATTATTATGCATGATTACCTTACAGGTGGTTTTACTGCAAATACTASTTTAGCTCATTATTCCCGAGATAATGGTTTACTTCTTCATATTCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAAAAAAATCACGGYATGCATTTYCGTGTATTAGCTAAAGCACTACGTTTATCTGGAGGTGATCATATTCATGCCGGTACTGTTGTAGGTAAACTAGAAGGAGAACGTGAAGTCACTTTAGGGTTTGT?GACTTATTACGTGATGATTAYATAGAAAAAGATAGACCTCGTGGTATTTATTTCACCCAAGATTGGGTATCTTTGCCAGGTGTTTTGCCTGTTGCATCTGGAGGTATTCATGTTTGGCATATGCCRGCTTTAACTGA Lepidolejeunea_sullivantii 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Leptolejeunea_convexistipa 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Leptolejeunea_vitrea 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Lopholejeunea_eulopha 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Luteolejeunea_herzogii 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Macrocolura_sagittistipula 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Metalejeunea_crassitexta 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Microlejeunea_africana 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Pictolejeunea_picta 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Prionolejeunea_denticulata 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Prionolejeunea_limpida 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Ptychanthus_striatus 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Pycnolejeunea_contigua 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Pycnolejeunea_densistipula 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Pycnolejeunea_macroloba 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Rectolejeunea_flagelliformis 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Rectolejeunea_versifolia_I 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Rectolejeunea_versifolia_II 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Rectolejeunea_versifolia_II.2 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Reinerantha_foliicola 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Siphonolejeunea_elegantissima 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Soella_obtusifolia_I 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Soella_obtusifolia_II 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Vitalianthus_bischlerianus 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Vitalianthus_guangxianus_I 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Vitalianthus_guangxiensis_II 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Yanoella_truncatilobula_I GGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGAACACACGATCTCGGAAAAACCTTGCGAACATTATCCAGAGGGATCGTGCCCGGAGGCACGATCGTCGGTGCCGGAGCAGGATTCATGTGCTTCGCCGTG-TCCCGCGTGGCGGGAATCGTGGCTCGTTCACCGTCGGACGACACGCGCGGTTCCGGGGAGCGAATCCCCTCCACCTGGTGCCCCATTTTAACCCGGTGAAACGACTGAAATGACTCTCAGCAACGGATATCTTGGCTCTTGCAAC???????????????????TGCGATACCTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGCGAATCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCTCGTCCAAGGGCATGCCTGCCTGAGCGTCCGCTCCGGCCCACCCACGTGCGCGTGGAATTGGCCGTCCGGGAAATCGCGGTTGGCTGAAAAATGGGAGCCGTCCGCCCGTTGGGGGAAGGGCGCGTCGCGAGAAGGTGGGACGCTGGTAAAAAGCGACGTTCCTCTCGGAGTCCGACGGAT?????????????????????????????gagccttagtaga----------gaaatctattaagtgactgttttcatattcagggaaacctaaggtttgagatgt---aaggtaatcctgagccaaattttagttatgaaataggtgcagagactcgaaggaaactatcctaacgaaatttctcta--ttttcta-ta-------cRagtattg-------gttaaatgcacaatac--aaaa-tatat-----ttgaaataataaaa-------------------------actaa-------------tatg-aata--ttagtttttaaataa-cttcta-ataR---acgaggataaagatagagt---ccttttt-taca----atctatataatttttta--ttta--tagat-aattgtaaaaagaaaatccgttggc-tttaatagaccttgagggttcaagtccct-ctacccccMtatat----------tggc-aaaatttt----gttccaattttagaaattcaaattgccgggatagctcagtcggtagagcaggggattgaaaaAAGGGCGATGCTATGATATTGAACCTGTTCGTGGAGAAGAAAATCAATATATCGCTTATGTTGCTTATCCATTAGATTTATTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACCTTTTCACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGATTTAAAGCTTTACGAGCTTTGCGTCTTGAAGATTTGCGAATTCCTCCAGCTTATACCAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAATAAGTACGGTCGTCCTTTATTAGGATGTACAATCAAACCAAAATTAGGTTTATCAGCAAAAAATTATGGTAGAGCTGTCTATGAATGTCTTCGTGGTGGACTTGATTTCACAAAAGATGACGAAAATGTAAACTCTCAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGCTTTTTGTTTGTAGCTGAAGCTCTTTTTAAATCTCAATCTGAAACAGGTGAAATTAAAGGACATTATTTAAATGCTACAGCAGGTACATCTGAAGAAATGTTAAAAAGAGCATACTGTGCTAGAGAATTAGGTGTACCAATTGTTATGCATGATTATCTTACAGGTGGTTTTACTGCAAATACTAGTTTAGCTCATTATTGCCGAGATAATGGTTTACTTCTTCATATTCACCGAGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCACGGCATGCATTTTCGTGTATTAGCTAAAGCACTACGTTTATCTGGAGGTGATCATATTCATGCTGGTACTGTCGTAGGTAAGCTAGAARGAGAACGTGAAGTAACTTTAGGCTTTGTAGACTTATTACGTGATGATTATATAGAAAAAGATAGACCTCGTGGTATTTATTTTACTCAAGATTGGGTATCTTTACCAGGTGTTCTGCCTGTTGCATCTGGAGGTATTCATGTTTGGCATATGCCAGCTTTAACCGA Yanoella_truncatilobula_II GGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGAACACACGATCTCGGAAAAACCTTGCGAACATTATCCAGAGGGATCGTGCCCGGAGGCACGATCGTCGGTGCCGGAGCAGGATTCATGTGCTTCGCCGTG-TCCCGCGTGGCGGGAATCGTGGCTCGTTCACCGTCGGACGACACGCGCGGTTCCGGGGAGCGAATCCCCTCCACCTGGTGCCCCATTTTAACCCGGTGAAACGACTGAAATGACTCTCAGCAACGGATATCTTGGCTCTTGCAACGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACCTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGCGAATCATCGAGTTTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAGGCTCGTCCAAGGGCATGCCTGCCTGAGCGTCCGCTCCGGCCCACCCACGTGCGCGTGGAATTGGCCGTCCGGGAAATCGCGGTTGGCTGAAAAATGGGAGCCGTCCGCCCGTTGGGGGAAGGGCGCGTCGCGAGAAGGTGGGACGCTGGTAAAAAGCGACGTTCCTCTCGGAGTCCGACGGATGTTCGGACCTCAGATCAGGCAAGACCACCGAGCCTTAGTAGA----------GAAATCTATTAAGTGACTGTTTTCATATTCAGGGAAACCTAAGGTTTGAGATGT---AAGGTAATCCTGAGCCAAATTTTAGTTATGAAATAGGTGCAGAGACTCGAAGGAAACTATCCTAACGAAATTTCTCTA--TTTTCTA-TA-------CGAGTATTG-------GTTAAATGCACAATAC--AAAA-TATAT-----TTGAAATAATAAAA-------------------------ACTAA-------------TATG-AATA--TTAGTTTTTAAATAA-CTTCTA-ATAG---ACGAGGATAAAGATAGAGT---CCTTTTT-TACA----ATCTATATAATTTTTTA--TTTA--TAGAT-AATTGTAAAAAGAAAATCCGTTGGC-TTTAATAGACCTTGAGGGTTCAAGTCCCT-CTACCCCCATATAT----------TGGC-AAAATTTT----GTTCCAATTTTAGAAATTCAAATTGCCGGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAAAAGGGCGATGCTATGATATTGAACCTGTTCGTGGAGAAGAAAATCAATATATCGCTTATGTTGCTTATCCATTAGATTTATTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACCTTTTCACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGATTTAAAGCTTTACGAGCTTTGCGTCTTGAAGATTTGCGAATTCCTCCAGCTTATACCAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCATGGTATCCAAGTTGAAAGAGATAAATTGAATAAGTACGGTCGTCCTTTATTAGGATGTACAATCAAACCAAAATTAGGTTTATCAGCAAAAAATTATGGTAGAGCTGTCTATGAATGTCTTCGTGGTGGACTTGATTTCACAAAAGATGACGAAAATGTAAACTCTCAACCATTTATGCGTTGGAGAGATCGCTTTTTGTTTGTAGCTGAAGCTCTTTTTAAATCTCAATCTGAAACAGGTGAAATTAAAGGACATTATTTAAATGCTACAGCAGGTACATCTGAAGAAATGTTAAAAAGAGCATACTGTGCTAGAGAATTAGGTGTACCAATTGTTATGCATGATTATCTTACAGGTGGTTTTACTGCAAATACTAGTTTAGCTCATTATTGCCGAGATAATGGTTTACTTCTTCATATTCACCGAGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAAAATCACGGCATGCATTTTCGTGTATTAGCTAAAGCACTACGTTTATCTGGAGGTGATCATATTCATGCTGGTACTGTCGTAGGTAAGCTAGAAGGAGAACGTGAAGTAACTTTAGGCTTTGTAGACTTATTACGTGATGATTATATAGAAAAAGATAGACCTCGTGGTATTTATTTTACTCAAGATTGGGTATCTTTACCAGGTGTTCTGCCTGTTGCATCTGGAGGTATTCATGTTTGGCATATGCCAGCTTTAACCGA ; END; BEGIN TREES; Title 'Lejeuneaceae rbcL, trnL-trnF and nrITS NJ'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE [0] 1 Allorgella_semperiana, [1] 2 Anoplolejeunea_conferta_I, [2] 3 Anoplolejeunea_conferta_II, [3] 4 Archilejeunea_fuscescens, [4] 5 Bromeliophila_natans, [5] 6 Capillolejeunea_mascarena, [6] 7 Ceratolejeunea_belangeriana, [7] 8 Ceratolejeunea_cornuta, [8] 9 Ceratolejeunea_cubensis, [9] 10 Ceratolejeunea_fallax, [10] 11 Ceratolejeunea_filaria, [11] 12 Ceratolejeunea_globulifera, [12] 13 Ceratolejeunea_grandiloba, [13] 14 Ceratolejeunea_guianensis, [14] 15 Ceratolejeunea_laetefusca, [15] 16 Ceratolejeunea_minuta, [16] 17 Ceratolejeunea_spinistipula_I, [17] 18 Ceratolejeunea_spinistipula_II, [18] 19 Cheilolejeunea_clypeata, [19] 20 Cheilolejeunea_discoidea, [20] 21 Cheilolejeunea_filiformis, [21] 22 Cheilolejeunea_holostipa, [22] 23 Cheilolejeunea_lineata, [23] 24 Cheilolejeunea_rigidula, [24] 25 Cololejeunea_calcarea, [25] 26 Cololejeunea_cardiocarpa, [26] 27 Cololejeunea_inflectens, [27] 28 Colura_calyptrifolia, [28] 29 Colura_irrorata, [29] 30 Cumulolejeunea_ocellata, [30] 31 Cyclolejeunea_chitonia, [31] 32 Cyclolejeunea_convexistipa, [32] 33 Cyclolejeunea_luteola, [33] 34 Diplasiolejeunea_cavifolia, [34] 35 Diplasiolejeunea_pauckertii, [35] 36 Diplasiolejeunea_pellucida, [36] 37 Drepanolejeunea_angustifolia, [37] 38 Drepanolejeunea_anoplantha, [38] 39 Drepanolejeunea_biocellata, [39] 40 Drepanolejeunea_blumei, [40] 41 Drepanolejeunea_brunnea_I, [41] 42 Drepanolejeunea_brunnea_II, [42] 43 Drepanolejeunea_commutata, [43] 44 Drepanolejeunea_cutervoensis, [44] 45 Drepanolejeunea_elegans, [45] 46 Drepanolejeunea_erecta, [46] 47 Drepanolejeunea_fissicornua, [47] 48 Drepanolejeunea_granatensis, [48] 49 Drepanolejeunea_hamatifolia, [49] 50 Drepanolejeunea_inchoata, [50] 51 Drepanolejeunea_intermedia, [51] 52 Drepanolejeunea_levicornua, [52] 53 Drepanolejeunea_lyrata, [53] 54 Drepanolejeunea_madagascariensis, [54] 55 Drepanolejeunea_polyrhiza, [55] 56 Drepanolejeunea_sp, [56] 57 Drepanolejeunea_spicata, [57] 58 Drepanolejeunea_spinosocornuta, [58] 59 Drepanolejeunea_tenera, [59] 60 Drepanolejeunea_thwaitesiana, [60] 61 Drepanolejeunea_trematodes, [61] 62 Drepanolejeunea_yunnanensis, [62] 63 Echinolejeunea_papillata, [63] 64 Gaolejeunea_gaoi_I, [64] 65 Gaolejeunea_gaoi_II, [65] 66 Haplolejeunea_sticta, [66] 67 Haplolejeunea_umbrosa, [67] 68 Harpalejeunea_grandis, [68] 69 Harpalejeunea_grandistipula, [69] 70 Harpalejeunea_marginalis, [70] 71 Harpalejeunea_molleri, [71] 72 Kymatolejeunea_bartlettii_I, [72] 73 Kymatolejeunea_bartlettii_ii, [73] 74 Leiolejeunea_grandiflora_I, [74] 75 Leiolejeunea_grandiflora_II, [75] 76 Lejeunea_capensis, [76] 77 Lejeunea_cavifolia, [77] 78 Lejeunea_cerina, [78] 79 Lejeunea_exilis, [79] 80 Lejeunea_flava, [80] 81 Lejeunea_laetevirens, [81] 82 Lejeunea_mimula, [82] 83 Lejeunea_paucidentata, [83] 84 Lejeunea_thallophora, [84] 85 Lejeunea_trinitensis, [85] 86 Lepidolejeunea_bidentula_I, [86] 87 Lepidolejeunea_bidentula_II, [87] 88 Lepidolejeunea_borneensis__II, [88] 89 Lepidolejeunea_borneensis_I, [89] 90 Lepidolejeunea_borneensis_III, [90] 91 Lepidolejeunea_cordifissa, [91] 92 Lepidolejeunea_cuspidata, [92] 93 Lepidolejeunea_delessertii, [93] 94 Lepidolejeunea_eluta, [94] 95 Lepidolejeunea_grandiocellata, [95] 96 Lepidolejeunea_integristipula, [96] 97 Lepidolejeunea_involuta, [97] 98 Lepidolejeunea_novae_caledonia, [98] 99 Lepidolejeunea_sullivantii, [99] 100 Leptolejeunea_convexistipa, [100] 101 Leptolejeunea_vitrea, [101] 102 Lopholejeunea_eulopha, [102] 103 Luteolejeunea_herzogii, [103] 104 Macrocolura_sagittistipula, [104] 105 Metalejeunea_crassitexta, [105] 106 Metalejeunea_cucullata, [106] 107 Microlejeunea_africana, [107] 108 Microlejeunea_capillaris, [108] 109 Microlejeunea_squarrosa, [109] 110 Microlejeunea_ulicina, [110] 111 Myriocoleopsis_gymnocolea, [111] 112 Neurolejeunea_breutel, [112] 113 Otigoniolejeunea_portoricensis, [113] 114 Otolejeunea_moniliata_I, [114] 115 Otolejeunea_moniliata_II, [115] 116 Pictolejeunea_picta, [116] 117 Prionolejeunea_denticulata, [117] 118 Prionolejeunea_limpida, [118] 119 Ptychanthus_striatus, [119] 120 Pycnolejeunea_contigua, [120] 121 Pycnolejeunea_densistipula, [121] 122 Pycnolejeunea_macroloba, [122] 123 Rectolejeunea_flagelliformis, [123] 124 Rectolejeunea_versifolia_I, [124] 125 Rectolejeunea_versifolia_II, [125] 126 Rectolejeunea_versifolia_II.2, [126] 127 Reinerantha_foliicola, [127] 128 Siphonolejeunea_elegantissima, [128] 129 Soella_obtusifolia_I, [129] 130 Soella_obtusifolia_II, [130] 131 Soella_obtusifolia_III, [131] 132 Thiersianthus_silamensis, [132] 133 Thysananthus_spathulistipus, [133] 134 Vitalianthus_aphanellus_I, [134] 135 Vitalianthus_aphanellus_II, [135] 136 Vitalianthus_bischlerianus, [136] 137 Vitalianthus_guangxianus_I, [137] 138 Vitalianthus_guangxiensis_II, [138] 139 Vitalianthus_lamyii, [139] 140 Xylolejeunea_crenata, [140] 141 Xylolejeunea_grolleana, [141] 142 Yanoella_truncatilobula_I, [142] 143 Yanoella_truncatilobula_II; TREE PAUP_1 = (((17:0.0,18:0.000631):0.038165,((8:0.016629,((10:0.0,14:0.015384):0.003077,(16:0.0,41:0.04966):0.045012):0.0):0.000664,(9:0.042129,((7:0.010798,11:0.007801):0.012619,(15:0.014394,(12:0.015497,13:0.018249):0.01013):0.002871):0.002019):0.0):0.012367):0.011737,(103:0.034999,((113:0.055618,((5:0.037394,(117:0.009159,118:0.005069):0.019417):0.009745,(33:0.03091,(31:0.015055,32:0.018298):0.016122):0.008141):0.035993):0.001632,(((((40:0.005584,76:0.0):0.050077,(136:0.00753,(120:0.0,134:0.00185):0.012871):0.02515):0.002346,(((68:0.00626,69:0.008456):0.006412,(70:0.005119,71:0.010041):0.004818):0.025038,((107:0.030461,(108:0.013643,(109:0.007904,110:0.008088):0.006079):0.012627):0.01153,(85:0.035165,(((79:0.020859,84:0.022827):0.00759,(80:0.016394,82:0.022479):0.000636):0.00529,((30:0.017406,81:0.01418):0.000982,(83:0.035698,(77:0.009508,78:0.011615):0.011092):0.010792):0.000861):0.003197):0.00276):0.003031):0.02719):0.001498,((((86:0.00255,87:0.003301):0.007704,(96:0.010678,98:0.013208):0.003506):0.031133,((91:0.019482,97:0.020666):0.002211,(95:0.031927,(99:0.012656,(92:0.015519,(93:0.016662,94:0.01101):0.00209):0.001438):0.008031):0.015988):0.005386):0.013228,((132:0.01449,(105:0.005753,106:0.009442):0.031176):0.014669,((131:0.0,(129:0.0,130:0.0):0.0):0.04173,((126:0.002538,(123:0.002683,(124:0.0,125:0.0):0.007166):0.0):0.019394,((6:0.009514,((135:0.009412,139:0.009591):0.002308,(137:0.0,138:0.001409):0.008472):0.000766):0.004323,((114:0.0,115:0.000661):0.030698,(42:0.01548,(88:0.0,(89:0.001296,90:0.0):0.0):0.028869):0.02073):0.001644):0.0088):0.011362):0.000000235215):0.003025):0.005274):0.003815,(((140:0.054272,141:0.045088):0.021257,((116:0.053431,(4:0.060873,(112:0.050694,(102:0.039077,(119:0.026696,133:0.029762):0.00571):0.025473):0.006449):0.014079):0.009178,((121:0.020033,122:0.018293):0.015481,((74:0.0,75:0.000678):0.061275,((23:0.027651,(22:0.028315,(19:0.017599,(21:0.023154,(20:0.010264,24:0.016584):0.014129):0.007674):0.008767):0.00194):0.02236,((1:0.019776,((142:0.0,143:0.0):0.022078,(63:0.016589,(72:0.0,73:0.0):0.012273):0.001885):0.000000235216):0.008284,((2:0.007187,3:0.00289):0.032867,(67:0.014414,(66:0.01321,(64:0.0,65:0.0):0.02815):0.003311):0.010627):0.005966):0.025625):0.000000471141):0.001763):0.000000235121):0.011447):0.004797,(((127:0.047457,(35:0.034515,(34:0.012178,36:0.010184):0.016218):0.020844):0.013374,((27:0.040481,(25:0.035711,26:0.036868):0.0056):0.010284,((28:0.014305,29:0.021598):0.066284,(104:0.03099,(111:0.031599,128:0.025285):0.006625):0.00000118164):0.009331):0.025966):0.012649,((100:0.037226,101:0.044179):0.050602,(((37:0.017459,56:0.036217):0.038919,(38:0.035917,(44:0.000426,48:0.002851):0.025729):0.010356):0.022927,((51:0.017592,53:0.051188):0.00000124851,((55:0.018857,(45:0.013499,(39:0.014126,(50:0.009311,(49:0.009488,(54:0.001165,61:0.002604):0.020344):0.007694):0.0):0.004174):0.002006):0.011424,(59:0.030788,(((43:0.008583,62:0.008032):0.00337,(46:0.009148,57:0.007345):0.001156):0.008026,(58:0.017762,(52:0.010031,(47:0.007828,60:0.00423):0.000000362531):0.008817):0.004589):0.000748):0.000476):0.009917):0.025304):0.004156):0.00000100985):0.005539):0.001251):0.000789):0.013649):0.011737)[% 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