#NEXUS
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BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  'Heliconiini, individuals, full dataset';
	DIMENSIONS  NCHAR=16457;
	FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?;
	MATRIX
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	Heliconius_doris_02_1939_Pe                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	Heliconius_doris_846_P                     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	Heliconius_erato_erato_NCS2556_FG          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	Heliconius_erato_favorinus_GS012_Pe        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	Heliconius_erato_hydara_440_FG             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	Heliconius_erato_hydara_NCS2609_FG         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	Heliconius_erato_notabilis_BC0140_E        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	Heliconius_erato_petiverana_618_P          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	Heliconius_hecale_02_1326_Pe               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	Heliconius_hecalesia_856_P                 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ACCTGAAGCAGGTATACAAGAGGTTAGTGAACGCTGTCAATGACATTGAGAAGAGGATTCCTTTCTCCCACCACGATCGTCTCGGTTTCCTTACCTTCTGCCCCACCAACCTGGGAACAACTGTGCGTGCCTCTGTGCACATTAAGCTGCCCAAGCTGGCCGCGGACAAGGCGAAGCTGGAGGAGGTGGCCTCTAAGTACCACTTGCAAGTGCGCGGAACCCGCGGCGAGCACACCGAGGCCGAGGGAGGCGTGTACGACATCTCCAACAAGAGGCGCATGGGCCTCACCGAGTACGACGCGGTGAAGGAGATGTACGAGGG?????????ACTTAGCAAAATTCAATCGAGTTAGTACAAAAATTGGTAGTTCTATGAAAAGCGTTGGAGAAGTTATGGCTATCGGTAGAAACTTTGAAGAAGCTTTTCAAAAAGCGTTACGGATGGTTGATGAGAATGTCAATGGTTTTGATCCTTACATAAAAGAAGTTAATGAAAATGAACTGAGAGAACCAACAGATAAACGAATGTTTGTCTTAGCAGCAGCTCTTAAGAAAAATTACAACATAGATAAGCTATATGAATTAACTAAAATTGATCGATGGTTTCTTGAAAAGCTAAAAAACATTGTAGAATATTATAAAATACTAGAATCGAGTAATTCTGGTTCCATTACATACGAAATTTTAAAAAGCGCAAAACAAATGGGTTTCTCGGACAAACAAATAGCTGTTGCAATTAAAAGTACAGAATTGGCTGTAAGGAAATTAAGAGAAGAATTTAAAATTACACCTTTTGTAAAACAAATTGACACAGTTGCTGCAGAATGGCCTGCATCAACGAACTATCTCTATCTTACATATAACGGTTGTTCTCACGACTTAGAGTTCCCAGGAGAATTCGTTATGGTGCTTGGATCAGGAGTATACCGAATAGGAAGTTCAGTTGAGTTTGACTGGTGTGCTGTAGGTTGCCTCCGAGAGTTAAAGAACCAAAGTAAAAAAACGATTATGGTAAATTATAACCCTGAAACAGTCAGTACAGATTACGATATGAGTGACAGATTGTATTTTGAAGAAATTTCATTTGAAGTTGTAATGGATATATACAATATTGAACAACCTTCCGGTGTCATTCTAT??????????????????????????????????????GTTAGAAGGTGTTGTGATGGAGTTGGCTGACTGTGCCCTGCCTCTTTTAGCTGGCGTATTACCCACTGCCAACCCTGAGGAAGCCTTCAAGGATGTGGCTGCTGCCTTCCTTGTTGGATCCATGCCTAGAAGAGAAGGTATGGAAAGAAAAGACCTCCTTTCTGCCAATGTACGCATTTTCAAAGAACAAGGGCAGGCTCTAGACAAAGTGGCTCGTAAAGATGTTAAAATTCTTGTTGTTGGTAACCCAGCTAACACAAATGCTTTTATTTGCTCTAAATATGCACCATCTATCCCCAAAGAGAACTTCACAGCTATGACCAGGTTGGATCAAAATCGTGCCCAATCTCAAATAGCTGCCAAAATTGGAGTGCCTGTTCAGGACGTAAAGAATGTTATAATTTGGGGAAACCACTCTTCAACCCAGTTCCCTGGTGCGTCTAATGCAGTAGTGAAAGTTGGAGGTGTAGAAAAGCCAGTGTCAGCTGTCATCAATGATGATGAATACTTAAAGTCATCATTTGTATCTATTGTTCAAAAGAGAGGTGCTGCTGTTATTGCAGCTAGGAAAATGTCATCAGCTCTATCTGCTGCCAAGGCTGCATCAGATCACATGAGGGACTGGTTCCTTGGATCTGGGGATCGCTGGGTCAGTATGGGAGTTATCTCAGATGGATCATATGGAGTACCCAGAGATGTTGTTTATTCATTCCCATTGAAAATCAGCAATGGA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGTAGAATCCACAGGTGTTTTCACAACCATTGATAAGGCCTCTGCTCACTTGGAGGGTGGTGCCAAGAAAGTCATCATCTCTGCACCCAGTGCTGATGCACCCATGTTTGTTGTTGGTGTCAACCAGGAATCTTACAACCCCTCTTACAAAGTCATCTCCAATGCTTCCTGCACAACCAACTGCTTGGCTCCCCTTGCCAAGGTTATCCATGACAACTTTGAGATTGTTGAGGGTTTGATGACAACAGTCCATGCCACTACTGCTACACAAAAGACTGTAGATGGACCCTCTGGTAAGTTGTGGCGTGATGGCCGTGGTGCCCAGCAAAACATCATTCCAGCAGCCACTGGTGCAGCTAAAGCAGTAGGCAAGGTTATCCCTGCTCTTAATGGAAAACTTACCGGTATGGCTTTCCGTGTGCCAGTTGCTAATGTATCTGTTGTTGACCTTACTGTGCGTTTGGGCAAACCTGCCAGCTATGATGCCATTAAGCAAAAGGTTAAGGAAGCTGCTGAAGGACCAATGAAGGGTATTCTTGGATATACTGAAGACCAAGTTGTATCTACAGACTTCATTGGAGACTCCCACTCCTCTATCTTTGATGCTGCTGCTGGTATCTCTCTTAATGACAACTTTGTCAAACTGATCAGCTGGTATGACAATGAGTATGGTTACTCAAGCCGTGTCATC???????????????????????????????????????????????ATTTTGCCATTTTTGGACATTGAACTACATGTTTATGACTTGGGAATGGAGAATCGTGACAAGACTGATGATCAAGTAACAATTGACTGTGCTAATGCTGTTAAGAAATACAATGTTGGTATTAAATGTGCAACAATCACTCCAGATGAGAAGAGAGTTGAAGAATTCAACTTGAAAAAGATGTGGAAGAGCCCTAACGGTACTATTCGTAATATTTTGGGGGGAACTGTGTTTAGGGAGGCTATTATTTGCAAGAATATTCCGCGACTTGTTACTGGTTGGGACAAACCTATTATTATAGGGCGTCATGCTCATGCTGATCAGTATAAAGCTACTGACTTCGTAGTTCCTGGACCAGGCAAACTGGAACTCGTCTTCTCTCCACCATCTGGAGAACCTATCCGCCATGTTGTGAACGAGTACAAAGGAGCAGGTGTGGCTCTTGGTATGTTCAACACTGACGAGTCTATTGTCGACTTCGCCCACTCTTCCTTCAAATATGCATTGGACAGAAAATACCCTCTATACTTGAGTACTAAGAACACTATTCTCAAAAAGTATGATGGTCGCTTCAAGGATATCTTCCAAGAGATCTATGACAATGAATATAAGAGCCAGTTCGAGAGTGCCGGTATTTGGTACGAACATAGGCGCGGAGGACCTCGTGGTCGTGGACGCGGCCGCGGTCGTGGCCGTGGACGTGGAAAGGAAGACCAGAAAGAATGGGTGCCAGTAACCAAGTTGGGTCGTCTCGTAAGAGAAGGAAAGATTGACAAACTTGAGAGCATTTACTTATTCTCTCTGCCAATTAAAGAGTTTGAGATCATTGACTTCTTCCTGGGAGCTTCATTGAATGATGAAGTGCTTAAGATCATGCCTGTGCAGAAACAAACCCGTGCCGGTCAGCGTACCCGTTTCAAGGCCTTCGTGGCTATTGGGGACAACAATGGACACATTGGTCTTGGCGTTAAATGCAGCAAGGAAGTGGCGACTGCTATTCGAGGAGCCATTATCTTGGCTAAACTCTCCGTACTTCCAGTGCGTAGAGGTTATTGGGGTA????????????????????????????GCATGGCTATTGATAGCATGCCATTGCCACAACCGGCTGACATTCCCGAAATCAAATTGTTCGGAAGATGGAGTTGTTATGACGTTCAAGTGTCTGATATGTCCTTGCAGGATCACATTTCTGTWAAGGAAAAGTTTGCTAAATACTTGCCACACTCGGCAGGACGATATGCTCACAAGAGGTTCCGCAAGGCGCAGTGCCCTATTGTTGAGCGTCTGACCAACTCTCTGATGATGCACGGTCGCAACAATGGCAAGAAGCTAATGGCCGTGCGTATCGTCAAACACGCTTTTGAGATCATCCATCTCCTTACTGGTGAAAACCCTCTCCAAGTACTTGTGACAGCTATCATTAATTCTGGACCTCGTGAAGATTCCACCAGGATTGGTCGTGCTGGTACAGTGCGTCGTCAAGCCGTGGACGTGTCGCCTCTGCGTCGTGTAAACCAGGCGATCTGGTTGTTGTGCACGGGAGCACGAGAGGCAGCATTCAGAAATATTAAGACTATTGCTGAATGTGTCGCTGATGAGCTCATTAACGCTGCTAAGGGCTCATCAAATTCTTATGCTATTAAGAAGAAAGATGAATTGGAACGT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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;



END;

BEGIN TREES;
	Title 'Heliconiini ML (individuals, full dataset)';
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Acraea_encedon_fj55_3,
		2 Acraea_encedon_fj556,
		3 Acraea_pseudegina_NW116_16,
		4 Actinote_stratonice_NW90_14,
		5 Actinote_surima_NW136_19,
		6 Agraulis_vanillae_8554_P,
		7 Agraulis_vanillae_NW152_16_DR,
		8 Argynnis_paphia_NW76_12,
		9 Cethosia_cyane_NW100_12,
		10 Cethosia_cydippe_NW137_4,
		11 Cethosia_myrina_NW106_8,
		12 Dione_glycera_PE57_Pe,
		13 Dione_juno_8727_Pe,
		14 Dione_moneta_8748a_Pe,
		15 Dione_moneta_8748b_Pe,
		16 Dione_moneta_NW2_1_Me,
		17 Dryadula_phaetusa_2921_P,
		18 Dryadula_phaetusa_NW108_23,
		19 Dryas_iulia_293_FG,
		20 Dryas_iulia_8648_Pe,
		21 Dryas_iulia_NW108_24_CR,
		22 Eueides_aliphera_555_P,
		23 Eueides_aliphera_8594_Pe,
		24 Eueides_aliphera_875_P,
		25 Eueides_aliphera_NW126_2_B,
		26 Eueides_heliconioides_8947_Pe,
		27 Eueides_isabella_780_P,
		28 Eueides_lampeto_8750_Pe,
		29 Eueides_lineata_2991_P,
		30 Eueides_lybia_02_2001_Pe,
		31 Eueides_lybia_556_P,
		32 Eueides_lybia_8691_Pe,
		33 Eueides_pavana_C9_B,
		34 Eueides_procula_2933_E,
		35 Eueides_procula_browni_AN7_V,
		36 Eueides_procula_browni_AN8_V,
		37 Eueides_procula_browni_AN9_V,
		38 Eueides_procula_edias_AN6_V,
		39 Eueides_tales_09_256_Pe,
		40 Eueides_tales_2948_E,
		41 Eueides_vibilia_320_FG,
		42 Eueides_vibilia_8699_Pe,
		43 Euptoieta_claudia_NW94_15,
		44 Heliconius_antiochus_P326,
		45 Heliconius_antiochus_S,
		46 Heliconius_aoede_09_347_Pe,
		47 Heliconius_aoede_8198_FG,
		48 Heliconius_aoede_8569_Pe,
		49 Heliconius_aoede_8572_Pe,
		50 Heliconius_astraea_MCZ116526_B,
		51 Heliconius_atthis_8162_E,
		52 Heliconius_besckei_1C_B,
		53 Heliconius_besckei_bes110_B,
		54 Heliconius_burneyi_8560_Pe,
		55 Heliconius_charithonia_2923_E,
		56 Heliconius_charithonia_8830_P,
		57 Heliconius_clysonymus_2_C,
		58 Heliconius_clysonymus_8037_P,
		59 Heliconius_clysonymus_9211_E,
		60 Heliconius_congener_9210_E,
		61 Heliconius_cydno_alithea_8509_E,
		62 Heliconius_cydno_chioneus_553_P,
		63 Heliconius_cydno_chioneus_557_P,
		64 Heliconius_cydno_cordula_2096_V,
		65 Heliconius_cydno_cordula_WOM007_C,
		66 Heliconius_cydno_weymeri_1690_P,
		67 Heliconius_cydno_weymeri_221_C,
		68 Heliconius_demeter_8562_Pe,
		69 Heliconius_doris_02_1939_Pe,
		70 Heliconius_doris_846_P,
		71 Heliconius_doris_847_P,
		72 Heliconius_doris_8645_Pe,
		73 Heliconius_doris_8684_Pe,
		74 Heliconius_doris_8697_Pe,
		75 Heliconius_egeria_MJ4001_FG,
		76 Heliconius_eleuchia_190_C,
		77 Heliconius_eleuchia_842_P,
		78 Heliconius_elevatus_09_163_Pe,
		79 Heliconius_elevatus_09_270_Pe,
		80 Heliconius_elevatus_434_FG,
		81 Heliconius_elevatus_503_FG,
		82 Heliconius_erato_chestertonii_WOM0059_C,
		83 Heliconius_erato_demophoon_8054_P,
		84 Heliconius_erato_emma_NCS1673_Pe,
		85 Heliconius_erato_erato_NCS2556_FG,
		86 Heliconius_erato_favorinus_GS012_Pe,
		87 Heliconius_erato_hydara_440_FG,
		88 Heliconius_erato_hydara_NCS2609_FG,
		89 Heliconius_erato_lattivita_WOM03_E,
		90 Heliconius_erato_notabilis_BC0140_E,
		91 Heliconius_erato_petiverana_618_P,
		92 Heliconius_eratosignis_09_256_Pe,
		93 Heliconius_ethilla_09_67_Pe,
		94 Heliconius_ethilla_3014_A,
		95 Heliconius_godmani_Vienna_C,
		96 Heliconius_hecale_02_1326_Pe,
		97 Heliconius_hecale_261_C,
		98 Heliconius_hecale_665_P,
		99 Heliconius_hecale_71_C,
		100 Heliconius_hecale_felix_8682_Pe,
		101 Heliconius_hecale_NW70_6,
		102 Heliconius_hecalesia_856_P,
		103 Heliconius_hecale_WOM_P,
		104 Heliconius_hecale_zuleika_8100_P,
		105 Heliconius_hecuba_8549_E,
		106 Heliconius_hecuba_8550_E,
		107 Heliconius_hermathena_94_15_Pe,
		108 Heliconius_hermathena_C3,
		109 Heliconius_heurippa_2417_C,
		110 Heliconius_heurippa_8_C,
		111 Heliconius_heurippa_WOM001_C,
		112 Heliconius_hewitsonii_P,
		113 Heliconius_hierax_8149_E,
		114 Heliconius_hierax_8154_E,
		115 Heliconius_himera_2842_E,
		116 Heliconius_himera_8076_P,
		117 Heliconius_hortense_MB9111,
		118 Heliconius_ismenius_666_P,
		119 Heliconius_leucadia_RB119,
		120 Heliconius_luciana_AN2_V,
		121 Heliconius_luciana_AN3_V,
		122 Heliconius_melpomene_amandus_2228_Bo,
		123 Heliconius_melpomene_cythera_2856_E,
		124 Heliconius_melpomene_ecuadorensis_9111_E,
		125 Heliconius_melpomene_malleti_16550_B,
		126 Heliconius_melpomene_melpomene_9317_FG,
		127 Heliconius_melpomene_melpomene_P,
		128 Heliconius_melpomene_meriana_13819_FG,
		129 Heliconius_melpomene_plesseni_9156_E,
		130 Heliconius_melpomene_rosina_546_P,
		131 Heliconius_melpomene_rosina_811_P,
		132 Heliconius_melpomene_rosina_845_P,
		133 Heliconius_melpomene_vulcanus_519_C,
		134 Heliconius_metharme_2949_E,
		135 Heliconius_nattereri_C2_B,
		136 Heliconius_numata_346_FG,
		137 Heliconius_numata_o203_m05_Pe,
		138 Heliconius_pachinus_3023_P,
		139 Heliconius_pachinus_3035_P,
		140 Heliconius_pardalinus_09_371_Pe,
		141 Heliconius_pardalinus_butleri_09_372_Pe,
		142 Heliconius_pardalinus_butleri_MJ2021_CR,
		143 Heliconius_pardalinus_sergestus_09_200_Pe,
		144 Heliconius_pardalinus_sergestus_09_202_Pe,
		145 Heliconius_peruvianus_EC190_E,
		146 Heliconius_peruvianus_EC288_E,
		147 Heliconius_ricini_1180_FG,
		148 Heliconius_sapho_260_C,
		149 Heliconius_sapho_2739_P,
		150 Heliconius_sapho_8126_E,
		151 Heliconius_sara_8211_FG,
		152 Heliconius_sara_850_P,
		153 Heliconius_sara_8571_Pe,
		154 Heliconius_sara_8862_P,
		155 Heliconius_telesiphe_16722_E,
		156 Heliconius_telesiphe_8525_E,
		157 Heliconius_timareta_09_57_Pe,
		158 Heliconius_timareta_8520_E,
		159 Heliconius_timareta_9178_E,
		160 Heliconius_timareta_9223_Pe,
		161 Heliconius_tristero_C15_C,
		162 Heliconius_wallacei_04_200_Pe,
		163 Heliconius_wallacei_286_FG,
		164 Heliconius_wallacei_flavescens_8132_E,
		165 Heliconius_wallacei_flavescens_8687_Pe,
		166 Heliconius_xanthocles_8609_Pe,
		167 Heliconius_xanthocles_8758_Pe,
		168 Heliconius_xanthocles_9106_E,
		169 Philaethria_constantinoi_MG4062_E,
		170 Philaethria_diatonica_8749a_Pe,
		171 Philaethria_diatonica_8749b_Pe,
		172 Philaethria_dido_8700_Pe,
		173 Philaethria_neildi_AN4_V,
		174 Philaethria_ostara_MG4260_E,
		175 Philaethria_pygmalion_MCZ115413_B,
		176 Philaethria_pygmalion_MCZ115415_B,
		177 Philaethria_wernickei_NW126_5_B,
		178 Podotricha_euchroia_NHM808498_C,
		179 Podotricha_telesiphe_8146_E,
		180 Vindula_arsinoe_NW69_4;
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END;


BEGIN TREES;
	Title BEAST_1000_sample;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Acraea_encedon_fj55_3,
		2 Acraea_encedon_fj556,
		3 Acraea_pseudegina_NW116_16,
		4 Actinote_stratonice_NW90_14,
		5 Actinote_surima_NW136_19,
		6 Agraulis_vanillae_8554_P,
		7 Agraulis_vanillae_NW152_16_DR,
		8 Argynnis_paphia_NW76_12,
		9 Cethosia_cyane_NW100_12,
		10 Cethosia_cydippe_NW137_4,
		11 Cethosia_myrina_NW106_8,
		12 Dione_glycera_PE57_Pe,
		13 Dione_juno_8727_Pe,
		14 Dione_moneta_8748a_Pe,
		15 Dione_moneta_8748b_Pe,
		16 Dione_moneta_NW2_1_Me,
		17 Dryadula_phaetusa_2921_P,
		18 Dryadula_phaetusa_NW108_23,
		19 Dryas_iulia_293_FG,
		20 Dryas_iulia_8648_Pe,
		21 Dryas_iulia_NW108_24_CR,
		22 Eueides_aliphera_555_P,
		23 Eueides_aliphera_8594_Pe,
		24 Eueides_aliphera_875_P,
		25 Eueides_aliphera_NW126_2_B,
		26 Eueides_heliconioides_8947_Pe,
		27 Eueides_isabella_780_P,
		28 Eueides_lampeto_8750_Pe,
		29 Eueides_lineata_2991_P,
		30 Eueides_lybia_02_2001_Pe,
		31 Eueides_lybia_556_P,
		32 Eueides_lybia_8691_Pe,
		33 Eueides_pavana_C9_B,
		34 Eueides_procula_2933_E,
		35 Eueides_procula_browni_AN7_V,
		36 Eueides_procula_browni_AN8_V,
		37 Eueides_procula_browni_AN9_V,
		38 Eueides_procula_edias_AN6_V,
		39 Eueides_tales_09_256_Pe,
		40 Eueides_tales_2948_E,
		41 Eueides_vibilia_320_FG,
		42 Eueides_vibilia_8699_Pe,
		43 Euptoieta_claudia_NW94_15,
		44 Heliconius_antiochus_P326,
		45 Heliconius_antiochus_S,
		46 Heliconius_aoede_09_347_Pe,
		47 Heliconius_aoede_8198_FG,
		48 Heliconius_aoede_8569_Pe,
		49 Heliconius_aoede_8572_Pe,
		50 Heliconius_astraea_MCZ116526_B,
		51 Heliconius_atthis_8162_E,
		52 Heliconius_besckei_1C_B,
		53 Heliconius_besckei_bes110_B,
		54 Heliconius_burneyi_8560_Pe,
		55 Heliconius_charithonia_2923_E,
		56 Heliconius_charithonia_8830_P,
		57 Heliconius_clysonymus_2_C,
		58 Heliconius_clysonymus_8037_P,
		59 Heliconius_clysonymus_9211_E,
		60 Heliconius_congener_9210_E,
		61 Heliconius_cydno_alithea_8509_E,
		62 Heliconius_cydno_chioneus_553_P,
		63 Heliconius_cydno_chioneus_557_P,
		64 Heliconius_cydno_cordula_2096_V,
		65 Heliconius_cydno_cordula_WOM007_C,
		66 Heliconius_cydno_weymeri_1690_P,
		67 Heliconius_cydno_weymeri_221_C,
		68 Heliconius_demeter_8562_Pe,
		69 Heliconius_doris_02_1939_Pe,
		70 Heliconius_doris_846_P,
		71 Heliconius_doris_847_P,
		72 Heliconius_doris_8645_Pe,
		73 Heliconius_doris_8684_Pe,
		74 Heliconius_doris_8697_Pe,
		75 Heliconius_egeria_MJ4001_FG,
		76 Heliconius_eleuchia_190_C,
		77 Heliconius_eleuchia_842_P,
		78 Heliconius_elevatus_09_163_Pe,
		79 Heliconius_elevatus_09_270_Pe,
		80 Heliconius_elevatus_434_FG,
		81 Heliconius_elevatus_503_FG,
		82 Heliconius_erato_chestertonii_WOM0059_C,
		83 Heliconius_erato_demophoon_8054_P,
		84 Heliconius_erato_emma_NCS1673_Pe,
		85 Heliconius_erato_erato_NCS2556_FG,
		86 Heliconius_erato_favorinus_GS012_Pe,
		87 Heliconius_erato_hydara_440_FG,
		88 Heliconius_erato_hydara_NCS2609_FG,
		89 Heliconius_erato_lattivita_WOM03_E,
		90 Heliconius_erato_notabilis_BC0140_E,
		91 Heliconius_erato_petiverana_618_P,
		92 Heliconius_eratosignis_09_256_Pe,
		93 Heliconius_ethilla_09_67_Pe,
		94 Heliconius_ethilla_3014_A,
		95 Heliconius_godmani_Vienna_C,
		96 Heliconius_hecale_02_1326_Pe,
		97 Heliconius_hecale_261_C,
		98 Heliconius_hecale_665_P,
		99 Heliconius_hecale_71_C,
		100 Heliconius_hecale_felix_8682_Pe,
		101 Heliconius_hecale_NW70_6,
		102 Heliconius_hecalesia_856_P,
		103 Heliconius_hecale_WOM_P,
		104 Heliconius_hecale_zuleika_8100_P,
		105 Heliconius_hecuba_8549_E,
		106 Heliconius_hecuba_8550_E,
		107 Heliconius_hermathena_94_15_Pe,
		108 Heliconius_hermathena_C3,
		109 Heliconius_heurippa_2417_C,
		110 Heliconius_heurippa_8_C,
		111 Heliconius_heurippa_WOM001_C,
		112 Heliconius_hewitsonii_P,
		113 Heliconius_hierax_8149_E,
		114 Heliconius_hierax_8154_E,
		115 Heliconius_himera_2842_E,
		116 Heliconius_himera_8076_P,
		117 Heliconius_hortense_MB9111,
		118 Heliconius_ismenius_666_P,
		119 Heliconius_leucadia_RB119,
		120 Heliconius_luciana_AN2_V,
		121 Heliconius_luciana_AN3_V,
		122 Heliconius_melpomene_amandus_2228_Bo,
		123 Heliconius_melpomene_cythera_2856_E,
		124 Heliconius_melpomene_ecuadorensis_9111_E,
		125 Heliconius_melpomene_malleti_16550_B,
		126 Heliconius_melpomene_melpomene_9317_FG,
		127 Heliconius_melpomene_melpomene_P,
		128 Heliconius_melpomene_meriana_13819_FG,
		129 Heliconius_melpomene_plesseni_9156_E,
		130 Heliconius_melpomene_rosina_546_P,
		131 Heliconius_melpomene_rosina_811_P,
		132 Heliconius_melpomene_rosina_845_P,
		133 Heliconius_melpomene_vulcanus_519_C,
		134 Heliconius_metharme_2949_E,
		135 Heliconius_nattereri_C2_B,
		136 Heliconius_numata_346_FG,
		137 Heliconius_numata_o203_m05_Pe,
		138 Heliconius_pachinus_3023_P,
		139 Heliconius_pachinus_3035_P,
		140 Heliconius_pardalinus_09_371_Pe,
		141 Heliconius_pardalinus_butleri_09_372_Pe,
		142 Heliconius_pardalinus_butleri_MJ2021_CR,
		143 Heliconius_pardalinus_sergestus_09_200_Pe,
		144 Heliconius_pardalinus_sergestus_09_202_Pe,
		145 Heliconius_peruvianus_EC190_E,
		146 Heliconius_peruvianus_EC288_E,
		147 Heliconius_ricini_1180_FG,
		148 Heliconius_sapho_260_C,
		149 Heliconius_sapho_2739_P,
		150 Heliconius_sapho_8126_E,
		151 Heliconius_sara_8211_FG,
		152 Heliconius_sara_850_P,
		153 Heliconius_sara_8571_Pe,
		154 Heliconius_sara_8862_P,
		155 Heliconius_telesiphe_16722_E,
		156 Heliconius_telesiphe_8525_E,
		157 Heliconius_timareta_09_57_Pe,
		158 Heliconius_timareta_8520_E,
		159 Heliconius_timareta_9178_E,
		160 Heliconius_timareta_9223_Pe,
		161 Heliconius_tristero_C15_C,
		162 Heliconius_wallacei_04_200_Pe,
		163 Heliconius_wallacei_286_FG,
		164 Heliconius_wallacei_flavescens_8132_E,
		165 Heliconius_wallacei_flavescens_8687_Pe,
		166 Heliconius_xanthocles_8609_Pe,
		167 Heliconius_xanthocles_8758_Pe,
		168 Heliconius_xanthocles_9106_E,
		169 Philaethria_constantinoi_MG4062_E,
		170 Philaethria_diatonica_8749a_Pe,
		171 Philaethria_diatonica_8749b_Pe,
		172 Philaethria_dido_8700_Pe,
		173 Philaethria_neildi_AN4_V,
		174 Philaethria_ostara_MG4260_E,
		175 Philaethria_pygmalion_MCZ115413_B,
		176 Philaethria_pygmalion_MCZ115415_B,
		177 Philaethria_wernickei_NW126_5_B,
		178 Podotricha_euchroia_NHM808498_C,
		179 Podotricha_telesiphe_8146_E,
		180 Vindula_arsinoe_NW69_4;
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END;


BEGIN TREES;
	Title MDC_consensus_100_bootstraps;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Acraea_encedon_fj55_3,
		2 Acraea_encedon_fj556,
		3 Acraea_pseudegina_NW116_16,
		4 Actinote_stratonice_NW90_14,
		5 Actinote_surima_NW136_19,
		6 Agraulis_vanillae_8554_P,
		7 Agraulis_vanillae_NW152_16_DR,
		8 Argynnis_paphia_NW76_12,
		9 Cethosia_cyane_NW100_12,
		10 Cethosia_cydippe_NW137_4,
		11 Cethosia_myrina_NW106_8,
		12 Dione_glycera_PE57_Pe,
		13 Dione_juno_8727_Pe,
		14 Dione_moneta_8748a_Pe,
		15 Dione_moneta_8748b_Pe,
		16 Dione_moneta_NW2_1_Me,
		17 Dryadula_phaetusa_2921_P,
		18 Dryadula_phaetusa_NW108_23,
		19 Dryas_iulia_293_FG,
		20 Dryas_iulia_8648_Pe,
		21 Dryas_iulia_NW108_24_CR,
		22 Eueides_aliphera_555_P,
		23 Eueides_aliphera_8594_Pe,
		24 Eueides_aliphera_875_P,
		25 Eueides_aliphera_NW126_2_B,
		26 Eueides_heliconioides_8947_Pe,
		27 Eueides_isabella_780_P,
		28 Eueides_lampeto_8750_Pe,
		29 Eueides_lineata_2991_P,
		30 Eueides_lybia_02_2001_Pe,
		31 Eueides_lybia_556_P,
		32 Eueides_lybia_8691_Pe,
		33 Eueides_pavana_C9_B,
		34 Eueides_procula_2933_E,
		35 Eueides_procula_browni_AN7_V,
		36 Eueides_procula_browni_AN8_V,
		37 Eueides_procula_browni_AN9_V,
		38 Eueides_procula_edias_AN6_V,
		39 Eueides_tales_09_256_Pe,
		40 Eueides_tales_2948_E,
		41 Eueides_vibilia_320_FG,
		42 Eueides_vibilia_8699_Pe,
		43 Euptoieta_claudia_NW94_15,
		44 Heliconius_antiochus_P326,
		45 Heliconius_antiochus_S,
		46 Heliconius_aoede_09_347_Pe,
		47 Heliconius_aoede_8198_FG,
		48 Heliconius_aoede_8569_Pe,
		49 Heliconius_aoede_8572_Pe,
		50 Heliconius_astraea_MCZ116526_B,
		51 Heliconius_atthis_8162_E,
		52 Heliconius_besckei_1C_B,
		53 Heliconius_besckei_bes110_B,
		54 Heliconius_burneyi_8560_Pe,
		55 Heliconius_charithonia_2923_E,
		56 Heliconius_charithonia_8830_P,
		57 Heliconius_clysonymus_2_C,
		58 Heliconius_clysonymus_8037_P,
		59 Heliconius_clysonymus_9211_E,
		60 Heliconius_congener_9210_E,
		61 Heliconius_cydno_alithea_8509_E,
		62 Heliconius_cydno_chioneus_553_P,
		63 Heliconius_cydno_chioneus_557_P,
		64 Heliconius_cydno_cordula_2096_V,
		65 Heliconius_cydno_cordula_WOM007_C,
		66 Heliconius_cydno_weymeri_1690_P,
		67 Heliconius_cydno_weymeri_221_C,
		68 Heliconius_demeter_8562_Pe,
		69 Heliconius_doris_02_1939_Pe,
		70 Heliconius_doris_846_P,
		71 Heliconius_doris_847_P,
		72 Heliconius_doris_8645_Pe,
		73 Heliconius_doris_8684_Pe,
		74 Heliconius_doris_8697_Pe,
		75 Heliconius_egeria_MJ4001_FG,
		76 Heliconius_eleuchia_190_C,
		77 Heliconius_eleuchia_842_P,
		78 Heliconius_elevatus_09_163_Pe,
		79 Heliconius_elevatus_09_270_Pe,
		80 Heliconius_elevatus_434_FG,
		81 Heliconius_elevatus_503_FG,
		82 Heliconius_erato_chestertonii_WOM0059_C,
		83 Heliconius_erato_demophoon_8054_P,
		84 Heliconius_erato_emma_NCS1673_Pe,
		85 Heliconius_erato_erato_NCS2556_FG,
		86 Heliconius_erato_favorinus_GS012_Pe,
		87 Heliconius_erato_hydara_440_FG,
		88 Heliconius_erato_hydara_NCS2609_FG,
		89 Heliconius_erato_lattivita_WOM03_E,
		90 Heliconius_erato_notabilis_BC0140_E,
		91 Heliconius_erato_petiverana_618_P,
		92 Heliconius_eratosignis_09_256_Pe,
		93 Heliconius_ethilla_09_67_Pe,
		94 Heliconius_ethilla_3014_A,
		95 Heliconius_godmani_Vienna_C,
		96 Heliconius_hecale_02_1326_Pe,
		97 Heliconius_hecale_261_C,
		98 Heliconius_hecale_665_P,
		99 Heliconius_hecale_71_C,
		100 Heliconius_hecale_felix_8682_Pe,
		101 Heliconius_hecale_NW70_6,
		102 Heliconius_hecalesia_856_P,
		103 Heliconius_hecale_WOM_P,
		104 Heliconius_hecale_zuleika_8100_P,
		105 Heliconius_hecuba_8549_E,
		106 Heliconius_hecuba_8550_E,
		107 Heliconius_hermathena_94_15_Pe,
		108 Heliconius_hermathena_C3,
		109 Heliconius_heurippa_2417_C,
		110 Heliconius_heurippa_8_C,
		111 Heliconius_heurippa_WOM001_C,
		112 Heliconius_hewitsonii_P,
		113 Heliconius_hierax_8149_E,
		114 Heliconius_hierax_8154_E,
		115 Heliconius_himera_2842_E,
		116 Heliconius_himera_8076_P,
		117 Heliconius_hortense_MB9111,
		118 Heliconius_ismenius_666_P,
		119 Heliconius_leucadia_RB119,
		120 Heliconius_luciana_AN2_V,
		121 Heliconius_luciana_AN3_V,
		122 Heliconius_melpomene_amandus_2228_Bo,
		123 Heliconius_melpomene_cythera_2856_E,
		124 Heliconius_melpomene_ecuadorensis_9111_E,
		125 Heliconius_melpomene_malleti_16550_B,
		126 Heliconius_melpomene_melpomene_9317_FG,
		127 Heliconius_melpomene_melpomene_P,
		128 Heliconius_melpomene_meriana_13819_FG,
		129 Heliconius_melpomene_plesseni_9156_E,
		130 Heliconius_melpomene_rosina_546_P,
		131 Heliconius_melpomene_rosina_811_P,
		132 Heliconius_melpomene_rosina_845_P,
		133 Heliconius_melpomene_vulcanus_519_C,
		134 Heliconius_metharme_2949_E,
		135 Heliconius_nattereri_C2_B,
		136 Heliconius_numata_346_FG,
		137 Heliconius_numata_o203_m05_Pe,
		138 Heliconius_pachinus_3023_P,
		139 Heliconius_pachinus_3035_P,
		140 Heliconius_pardalinus_09_371_Pe,
		141 Heliconius_pardalinus_butleri_09_372_Pe,
		142 Heliconius_pardalinus_butleri_MJ2021_CR,
		143 Heliconius_pardalinus_sergestus_09_200_Pe,
		144 Heliconius_pardalinus_sergestus_09_202_Pe,
		145 Heliconius_peruvianus_EC190_E,
		146 Heliconius_peruvianus_EC288_E,
		147 Heliconius_ricini_1180_FG,
		148 Heliconius_sapho_260_C,
		149 Heliconius_sapho_2739_P,
		150 Heliconius_sapho_8126_E,
		151 Heliconius_sara_8211_FG,
		152 Heliconius_sara_850_P,
		153 Heliconius_sara_8571_Pe,
		154 Heliconius_sara_8862_P,
		155 Heliconius_telesiphe_16722_E,
		156 Heliconius_telesiphe_8525_E,
		157 Heliconius_timareta_09_57_Pe,
		158 Heliconius_timareta_8520_E,
		159 Heliconius_timareta_9178_E,
		160 Heliconius_timareta_9223_Pe,
		161 Heliconius_tristero_C15_C,
		162 Heliconius_wallacei_04_200_Pe,
		163 Heliconius_wallacei_286_FG,
		164 Heliconius_wallacei_flavescens_8132_E,
		165 Heliconius_wallacei_flavescens_8687_Pe,
		166 Heliconius_xanthocles_8609_Pe,
		167 Heliconius_xanthocles_8758_Pe,
		168 Heliconius_xanthocles_9106_E,
		169 Philaethria_constantinoi_MG4062_E,
		170 Philaethria_diatonica_8749a_Pe,
		171 Philaethria_diatonica_8749b_Pe,
		172 Philaethria_dido_8700_Pe,
		173 Philaethria_neildi_AN4_V,
		174 Philaethria_ostara_MG4260_E,
		175 Philaethria_pygmalion_MCZ115413_B,
		176 Philaethria_pygmalion_MCZ115415_B,
		177 Philaethria_wernickei_NW126_5_B,
		178 Podotricha_euchroia_NHM808498_C,
		179 Podotricha_telesiphe_8146_E,
		180 Vindula_arsinoe_NW69_4;
	TREE 'Consensus tree of 100 trees from Stored Trees (Trees "MDC 100 bootstrap trees" from file Heliconiini.nex)+++' = ((180,(43,8)100[%consensusFrequency = 1.0 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ],((3,(1,(5,4)100[%consensusFrequency = 1.0 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ])100,((10,(9,11)73[%consensusFrequency = 0.73 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ],((((6,(14,(13,12)53[%consensusFrequency = 0.53 ])91[%consensusFrequency = 0.91 ])94[%consensusFrequency = 0.94 ],(17,(19,179)58[%consensusFrequency = 0.58 ],(170,(177,172)66[%consensusFrequency = 0.66 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ])68[%consensusFrequency = 0.68 ])61[%consensusFrequency = 0.61 ],((22,(30,39)100[%consensusFrequency = 1.0 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ],(26,29,27,(34,41,28,33)53[%consensusFrequency = 0.53 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ])52[%consensusFrequency = 0.52 ],((((57,(155,117)73[%consensusFrequency = 0.73 ])91[%consensusFrequency = 0.91 ],(102,(82,(116,107)78[%consensusFrequency = 0.78 ])78[%consensusFrequency = 0.78 ])86[%consensusFrequency = 0.86 ])88[%consensusFrequency = 0.88 ],(((68,92)100[%consensusFrequency = 1.0 ],(147,(145,55)99[%consensusFrequency = 0.99 ])61[%consensusFrequency = 0.61 ])85[%consensusFrequency = 0.85 ],(151,44,148,76,60,(119,112)51[%consensusFrequency = 0.51 ])99[%consensusFrequency = 0.99 ])97[%consensusFrequency = 0.97 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ],(((46,134)100[%consensusFrequency = 1.0 ],(75,(162,54)100[%consensusFrequency = 1.0 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ],(106,(69,(113,166)100[%consensusFrequency = 1.0 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ])100[%consensusFrequency = 1.0 ])98[%consensusFrequency = 0.98 ],((122,((157,138)65[%consensusFrequency = 0.65 ],(61,(109,161)95[%consensusFrequency = 0.95 ])65[%consensusFrequency = 0.65 ])95[%consensusFrequency = 0.95 ])95[%consensusFrequency = 0.95 ],((93,135)66[%consensusFrequency = 0.66 ],(136,52,118)52[%consensusFrequency = 0.52 ],(140,96,(51,78)64[%consensusFrequency = 0.64 ])53[%consensusFrequency = 0.53 ])94[%consensusFrequency = 0.94 ])98[%consensusFrequency = 0.98 ])89[%consensusFrequency = 0.89 ])71[%consensusFrequency = 0.71 ])98[%consensusFrequency = 0.98 ])98[%consensusFrequency = 0.98 ])100)[%consensusFrequency = 1.0 ] [% ] [%  setBetweenDouble = consensusFrequency ];

END;


BEGIN TREES;
	Title BUCKy_concordance;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Acraea_encedon_fj55_3,
		2 Acraea_encedon_fj556,
		3 Acraea_pseudegina_NW116_16,
		4 Actinote_stratonice_NW90_14,
		5 Actinote_surima_NW136_19,
		6 Agraulis_vanillae_8554_P,
		7 Agraulis_vanillae_NW152_16_DR,
		8 Argynnis_paphia_NW76_12,
		9 Cethosia_cyane_NW100_12,
		10 Cethosia_cydippe_NW137_4,
		11 Cethosia_myrina_NW106_8,
		12 Dione_glycera_PE57_Pe,
		13 Dione_juno_8727_Pe,
		14 Dione_moneta_8748a_Pe,
		15 Dione_moneta_8748b_Pe,
		16 Dione_moneta_NW2_1_Me,
		17 Dryadula_phaetusa_2921_P,
		18 Dryadula_phaetusa_NW108_23,
		19 Dryas_iulia_293_FG,
		20 Dryas_iulia_8648_Pe,
		21 Dryas_iulia_NW108_24_CR,
		22 Eueides_aliphera_555_P,
		23 Eueides_aliphera_8594_Pe,
		24 Eueides_aliphera_875_P,
		25 Eueides_aliphera_NW126_2_B,
		26 Eueides_heliconioides_8947_Pe,
		27 Eueides_isabella_780_P,
		28 Eueides_lampeto_8750_Pe,
		29 Eueides_lineata_2991_P,
		30 Eueides_lybia_02_2001_Pe,
		31 Eueides_lybia_556_P,
		32 Eueides_lybia_8691_Pe,
		33 Eueides_pavana_C9_B,
		34 Eueides_procula_2933_E,
		35 Eueides_procula_browni_AN7_V,
		36 Eueides_procula_browni_AN8_V,
		37 Eueides_procula_browni_AN9_V,
		38 Eueides_procula_edias_AN6_V,
		39 Eueides_tales_09_256_Pe,
		40 Eueides_tales_2948_E,
		41 Eueides_vibilia_320_FG,
		42 Eueides_vibilia_8699_Pe,
		43 Euptoieta_claudia_NW94_15,
		44 Heliconius_antiochus_P326,
		45 Heliconius_antiochus_S,
		46 Heliconius_aoede_09_347_Pe,
		47 Heliconius_aoede_8198_FG,
		48 Heliconius_aoede_8569_Pe,
		49 Heliconius_aoede_8572_Pe,
		50 Heliconius_astraea_MCZ116526_B,
		51 Heliconius_atthis_8162_E,
		52 Heliconius_besckei_1C_B,
		53 Heliconius_besckei_bes110_B,
		54 Heliconius_burneyi_8560_Pe,
		55 Heliconius_charithonia_2923_E,
		56 Heliconius_charithonia_8830_P,
		57 Heliconius_clysonymus_2_C,
		58 Heliconius_clysonymus_8037_P,
		59 Heliconius_clysonymus_9211_E,
		60 Heliconius_congener_9210_E,
		61 Heliconius_cydno_alithea_8509_E,
		62 Heliconius_cydno_chioneus_553_P,
		63 Heliconius_cydno_chioneus_557_P,
		64 Heliconius_cydno_cordula_2096_V,
		65 Heliconius_cydno_cordula_WOM007_C,
		66 Heliconius_cydno_weymeri_1690_P,
		67 Heliconius_cydno_weymeri_221_C,
		68 Heliconius_demeter_8562_Pe,
		69 Heliconius_doris_02_1939_Pe,
		70 Heliconius_doris_846_P,
		71 Heliconius_doris_847_P,
		72 Heliconius_doris_8645_Pe,
		73 Heliconius_doris_8684_Pe,
		74 Heliconius_doris_8697_Pe,
		75 Heliconius_egeria_MJ4001_FG,
		76 Heliconius_eleuchia_190_C,
		77 Heliconius_eleuchia_842_P,
		78 Heliconius_elevatus_09_163_Pe,
		79 Heliconius_elevatus_09_270_Pe,
		80 Heliconius_elevatus_434_FG,
		81 Heliconius_elevatus_503_FG,
		82 Heliconius_erato_chestertonii_WOM0059_C,
		83 Heliconius_erato_demophoon_8054_P,
		84 Heliconius_erato_emma_NCS1673_Pe,
		85 Heliconius_erato_erato_NCS2556_FG,
		86 Heliconius_erato_favorinus_GS012_Pe,
		87 Heliconius_erato_hydara_440_FG,
		88 Heliconius_erato_hydara_NCS2609_FG,
		89 Heliconius_erato_lattivita_WOM03_E,
		90 Heliconius_erato_notabilis_BC0140_E,
		91 Heliconius_erato_petiverana_618_P,
		92 Heliconius_eratosignis_09_256_Pe,
		93 Heliconius_ethilla_09_67_Pe,
		94 Heliconius_ethilla_3014_A,
		95 Heliconius_godmani_Vienna_C,
		96 Heliconius_hecale_02_1326_Pe,
		97 Heliconius_hecale_261_C,
		98 Heliconius_hecale_665_P,
		99 Heliconius_hecale_71_C,
		100 Heliconius_hecale_felix_8682_Pe,
		101 Heliconius_hecale_NW70_6,
		102 Heliconius_hecalesia_856_P,
		103 Heliconius_hecale_WOM_P,
		104 Heliconius_hecale_zuleika_8100_P,
		105 Heliconius_hecuba_8549_E,
		106 Heliconius_hecuba_8550_E,
		107 Heliconius_hermathena_94_15_Pe,
		108 Heliconius_hermathena_C3,
		109 Heliconius_heurippa_2417_C,
		110 Heliconius_heurippa_8_C,
		111 Heliconius_heurippa_WOM001_C,
		112 Heliconius_hewitsonii_P,
		113 Heliconius_hierax_8149_E,
		114 Heliconius_hierax_8154_E,
		115 Heliconius_himera_2842_E,
		116 Heliconius_himera_8076_P,
		117 Heliconius_hortense_MB9111,
		118 Heliconius_ismenius_666_P,
		119 Heliconius_leucadia_RB119,
		120 Heliconius_luciana_AN2_V,
		121 Heliconius_luciana_AN3_V,
		122 Heliconius_melpomene_amandus_2228_Bo,
		123 Heliconius_melpomene_cythera_2856_E,
		124 Heliconius_melpomene_ecuadorensis_9111_E,
		125 Heliconius_melpomene_malleti_16550_B,
		126 Heliconius_melpomene_melpomene_9317_FG,
		127 Heliconius_melpomene_melpomene_P,
		128 Heliconius_melpomene_meriana_13819_FG,
		129 Heliconius_melpomene_plesseni_9156_E,
		130 Heliconius_melpomene_rosina_546_P,
		131 Heliconius_melpomene_rosina_811_P,
		132 Heliconius_melpomene_rosina_845_P,
		133 Heliconius_melpomene_vulcanus_519_C,
		134 Heliconius_metharme_2949_E,
		135 Heliconius_nattereri_C2_B,
		136 Heliconius_numata_346_FG,
		137 Heliconius_numata_o203_m05_Pe,
		138 Heliconius_pachinus_3023_P,
		139 Heliconius_pachinus_3035_P,
		140 Heliconius_pardalinus_09_371_Pe,
		141 Heliconius_pardalinus_butleri_09_372_Pe,
		142 Heliconius_pardalinus_butleri_MJ2021_CR,
		143 Heliconius_pardalinus_sergestus_09_200_Pe,
		144 Heliconius_pardalinus_sergestus_09_202_Pe,
		145 Heliconius_peruvianus_EC190_E,
		146 Heliconius_peruvianus_EC288_E,
		147 Heliconius_ricini_1180_FG,
		148 Heliconius_sapho_260_C,
		149 Heliconius_sapho_2739_P,
		150 Heliconius_sapho_8126_E,
		151 Heliconius_sara_8211_FG,
		152 Heliconius_sara_850_P,
		153 Heliconius_sara_8571_Pe,
		154 Heliconius_sara_8862_P,
		155 Heliconius_telesiphe_16722_E,
		156 Heliconius_telesiphe_8525_E,
		157 Heliconius_timareta_09_57_Pe,
		158 Heliconius_timareta_8520_E,
		159 Heliconius_timareta_9178_E,
		160 Heliconius_timareta_9223_Pe,
		161 Heliconius_tristero_C15_C,
		162 Heliconius_wallacei_04_200_Pe,
		163 Heliconius_wallacei_286_FG,
		164 Heliconius_wallacei_flavescens_8132_E,
		165 Heliconius_wallacei_flavescens_8687_Pe,
		166 Heliconius_xanthocles_8609_Pe,
		167 Heliconius_xanthocles_8758_Pe,
		168 Heliconius_xanthocles_9106_E,
		169 Philaethria_constantinoi_MG4062_E,
		170 Philaethria_diatonica_8749a_Pe,
		171 Philaethria_diatonica_8749b_Pe,
		172 Philaethria_dido_8700_Pe,
		173 Philaethria_neildi_AN4_V,
		174 Philaethria_ostara_MG4260_E,
		175 Philaethria_pygmalion_MCZ115413_B,
		176 Philaethria_pygmalion_MCZ115415_B,
		177 Philaethria_wernickei_NW126_5_B,
		178 Podotricha_euchroia_NHM808498_C,
		179 Podotricha_telesiphe_8146_E,
		180 Vindula_arsinoe_NW69_4;
	TREE 'Imported tree 0++' = (17:0.5,((30:1.0,39:1.0):0.971,(((56:1.0,((148:1.0,154:1.0):0.807,(68:1.0,92:1.0):0.76):0.257):0.583,((155:1.0,59:1.0):0.815,(107:1.0,((82:1.0,91:1.0):0.174,((86:1.0,90:1.0):0.041,((84:1.0,89:1.0):0.186,(85:1.0,88:1.0):0.234):0.062):0.098):0.472):0.628):0.287):0.925,(46:1.0,((106:1.0,((113:1.0,168:1.0):0.743,(69:1.0,(73:1.0,74:1.0):0.552):0.974):0.757):0.846,((54:1.0,162:1.0):0.998,((53:1.0,(93:1.0,((96:1.0,103:1.0):0.541,((143:1.0,144:1.0):0.542,(140:1.0,(141:1.0,79:1.0):0.148):0.131):0.15):0.109):0.189):0.148,(((157:1.0,(159:1.0,160:1.0):0.315):0.09,((139:1.0,65:1.0):0.143,(61:1.0,66:1.0):0.092):0.02):0.112,((125:1.0,(122:1.0,129:1.0):0.18):0.125,((126:1.0,128:1.0):0.47,((123:1.0,133:1.0):0.126,(127:1.0,130:1.0):0.159):0.06):0.13):0.103):0.267):0.862):0.314):0.307):0.477):0.991):0.5);

END;


BEGIN TREES;
	Title ML_gene_phylogenies;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Acraea_encedon_fj55_3,
		2 Acraea_encedon_fj556,
		3 Acraea_pseudegina_NW116_16,
		4 Actinote_stratonice_NW90_14,
		5 Actinote_surima_NW136_19,
		6 Agraulis_vanillae_8554_P,
		7 Agraulis_vanillae_NW152_16_DR,
		8 Argynnis_paphia_NW76_12,
		9 Cethosia_cyane_NW100_12,
		10 Cethosia_cydippe_NW137_4,
		11 Cethosia_myrina_NW106_8,
		12 Dione_glycera_PE57_Pe,
		13 Dione_juno_8727_Pe,
		14 Dione_moneta_8748a_Pe,
		15 Dione_moneta_8748b_Pe,
		16 Dione_moneta_NW2_1_Me,
		17 Dryadula_phaetusa_2921_P,
		18 Dryadula_phaetusa_NW108_23,
		19 Dryas_iulia_293_FG,
		20 Dryas_iulia_8648_Pe,
		21 Dryas_iulia_NW108_24_CR,
		22 Eueides_aliphera_555_P,
		23 Eueides_aliphera_8594_Pe,
		24 Eueides_aliphera_875_P,
		25 Eueides_aliphera_NW126_2_B,
		26 Eueides_heliconioides_8947_Pe,
		27 Eueides_isabella_780_P,
		28 Eueides_lampeto_8750_Pe,
		29 Eueides_lineata_2991_P,
		30 Eueides_lybia_02_2001_Pe,
		31 Eueides_lybia_556_P,
		32 Eueides_lybia_8691_Pe,
		33 Eueides_pavana_C9_B,
		34 Eueides_procula_2933_E,
		35 Eueides_procula_browni_AN7_V,
		36 Eueides_procula_browni_AN8_V,
		37 Eueides_procula_browni_AN9_V,
		38 Eueides_procula_edias_AN6_V,
		39 Eueides_tales_09_256_Pe,
		40 Eueides_tales_2948_E,
		41 Eueides_vibilia_320_FG,
		42 Eueides_vibilia_8699_Pe,
		43 Euptoieta_claudia_NW94_15,
		44 Heliconius_antiochus_P326,
		45 Heliconius_antiochus_S,
		46 Heliconius_aoede_09_347_Pe,
		47 Heliconius_aoede_8198_FG,
		48 Heliconius_aoede_8569_Pe,
		49 Heliconius_aoede_8572_Pe,
		50 Heliconius_astraea_MCZ116526_B,
		51 Heliconius_atthis_8162_E,
		52 Heliconius_besckei_1C_B,
		53 Heliconius_besckei_bes110_B,
		54 Heliconius_burneyi_8560_Pe,
		55 Heliconius_charithonia_2923_E,
		56 Heliconius_charithonia_8830_P,
		57 Heliconius_clysonymus_2_C,
		58 Heliconius_clysonymus_8037_P,
		59 Heliconius_clysonymus_9211_E,
		60 Heliconius_congener_9210_E,
		61 Heliconius_cydno_alithea_8509_E,
		62 Heliconius_cydno_chioneus_553_P,
		63 Heliconius_cydno_chioneus_557_P,
		64 Heliconius_cydno_cordula_2096_V,
		65 Heliconius_cydno_cordula_WOM007_C,
		66 Heliconius_cydno_weymeri_1690_P,
		67 Heliconius_cydno_weymeri_221_C,
		68 Heliconius_demeter_8562_Pe,
		69 Heliconius_doris_02_1939_Pe,
		70 Heliconius_doris_846_P,
		71 Heliconius_doris_847_P,
		72 Heliconius_doris_8645_Pe,
		73 Heliconius_doris_8684_Pe,
		74 Heliconius_doris_8697_Pe,
		75 Heliconius_egeria_MJ4001_FG,
		76 Heliconius_eleuchia_190_C,
		77 Heliconius_eleuchia_842_P,
		78 Heliconius_elevatus_09_163_Pe,
		79 Heliconius_elevatus_09_270_Pe,
		80 Heliconius_elevatus_434_FG,
		81 Heliconius_elevatus_503_FG,
		82 Heliconius_erato_chestertonii_WOM0059_C,
		83 Heliconius_erato_demophoon_8054_P,
		84 Heliconius_erato_emma_NCS1673_Pe,
		85 Heliconius_erato_erato_NCS2556_FG,
		86 Heliconius_erato_favorinus_GS012_Pe,
		87 Heliconius_erato_hydara_440_FG,
		88 Heliconius_erato_hydara_NCS2609_FG,
		89 Heliconius_erato_lattivita_WOM03_E,
		90 Heliconius_erato_notabilis_BC0140_E,
		91 Heliconius_erato_petiverana_618_P,
		92 Heliconius_eratosignis_09_256_Pe,
		93 Heliconius_ethilla_09_67_Pe,
		94 Heliconius_ethilla_3014_A,
		95 Heliconius_godmani_Vienna_C,
		96 Heliconius_hecale_02_1326_Pe,
		97 Heliconius_hecale_261_C,
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		100 Heliconius_hecale_felix_8682_Pe,
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		102 Heliconius_hecalesia_856_P,
		103 Heliconius_hecale_WOM_P,
		104 Heliconius_hecale_zuleika_8100_P,
		105 Heliconius_hecuba_8549_E,
		106 Heliconius_hecuba_8550_E,
		107 Heliconius_hermathena_94_15_Pe,
		108 Heliconius_hermathena_C3,
		109 Heliconius_heurippa_2417_C,
		110 Heliconius_heurippa_8_C,
		111 Heliconius_heurippa_WOM001_C,
		112 Heliconius_hewitsonii_P,
		113 Heliconius_hierax_8149_E,
		114 Heliconius_hierax_8154_E,
		115 Heliconius_himera_2842_E,
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		117 Heliconius_hortense_MB9111,
		118 Heliconius_ismenius_666_P,
		119 Heliconius_leucadia_RB119,
		120 Heliconius_luciana_AN2_V,
		121 Heliconius_luciana_AN3_V,
		122 Heliconius_melpomene_amandus_2228_Bo,
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		165 Heliconius_wallacei_flavescens_8687_Pe,
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		175 Philaethria_pygmalion_MCZ115413_B,
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END;


BEGIN LABELS;
	CHARGROUPLABEL 'Co I/II codon positions 1 and 2' COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL 'Co I/II codon position 3' COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL 'tRNA-Leu' COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL 16S;
	CHARGROUPLABEL Ef1a COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Wg COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Dpp COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL ArgK COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Cad COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Cmdh COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Ddc COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Gapdh COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Idh COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Rps2 COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Rps5 COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Aact COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Cat COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Gts COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Hsp40 COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Lam COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Tada3 COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Trh COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Vas COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Hcl COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix2;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix3;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix4;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix5;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix6;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix7;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix8;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix9;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix10;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix11;


END;

BEGIN SETS;
	CHARSET cox12   =   1 -  1489;
	CHARSET cox3   =   1490 -  2235;
	CHARSET tRNA   =   2235 -  2311;
	CHARSET 16S   =   2312 -  2845;
	CHARSET ef1a   =   2846 -  4034;
	CHARSET wg   =   4035 -  4408;
	CHARSET dpp   =   4409 -  4723;
	CHARSET argK   =   4724 -  5331;
	CHARSET cad   =   5332 -  6141;
	CHARSET cmdh   =   6142 -  6931;
	CHARSET ddc   =   6932 -  7270;
	CHARSET gapdh   =   7271 -  7992;
	CHARSET idh   =   7993 -  8670;
	CHARSET rps2   =   8671 -  9088;
	CHARSET rps5   =   9089 -  9703;
	CHARSET aact   =   9704 -  10446;
	CHARSET cat   =   10447 -  11185;
	CHARSET gts   =   11186 -  12121;
	CHARSET hsp40   =   12122 -  12660;
	CHARSET lam   =   12661 -  13540;
	CHARSET tada3   =   13541 -  14297;
	CHARSET trh   =   14298 -  14974;
	CHARSET vas   =   14975 -  15696;
	CHARSET hcl   =   15697 -  16457;

	CHARPARTITION * UNTITLED  =  'Co I/II codon positions 1 and 2' :  1 -  1489, 'Co I/II codon position 3' :  1490 -  2234, 'tRNA-Leu' :  2235 -  2311, 16S :  2312 -  2845, Ef1a :  2846 -  4034, Wg :  4035 -  4408, Dpp :  4409 -  4723, ArgK :  4724 -  5331, Cad :  5332 -  6141, Cmdh :  6142 -  6931, Ddc :  6932 -  7270, Gapdh :  7271 -  7992, Idh :  7993 -  8670, Rps2 :  8671 -  9088, Rps5 :  9089 -  9703, Aact :  9704 -  10446, Cat :  10447 -  11185, Gts :  11186 -  12121, Hsp40 :  12122 -  12660, Lam :  12661 -  13540, Tada3 :  13541 -  14297, Trh :  14298 -  14974, Vas :  14975 -  15696, Hcl :  15697 -  16457;

END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
	TYPESET * UNTITLED   =  unord:  1 -  16457;

END;

BEGIN CODONS;
	CODESET * UNTITLED   =  universal:  1 -  16457;


END;

BEGIN MESQUITECHARMODELS;
	ProbModelSet * UNTITLED   =  'Jukes-Cantor':  1 -  16457;
END;

Begin MESQUITE;
		MESQUITESCRIPTVERSION 2;
		TITLE AUTO;
		tell ProjectCoordinator;
		timeSaved 1395293482903;
		getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa;
		tell It;
			setID 0 7675146392138498283;
		endTell;
		getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters;
		tell It;
			setID 0 692453753269332412;
			mqVersion 275;
			checksumv 0 3 2340608590 null  getNumChars 16457 numChars 16457 getNumTaxa 180 numTaxa 180   short true   bits 2305843009213693967   states 15   sumSquaresStatesOnly 4.3314185E7 sumSquares -5.054407876196415E21 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true   NumFiles 1 NumMatrices 1;
			mqVersion;
		endTell;
		getWindow;
		tell It;
			suppress;
			setResourcesState true false 327;
			setPopoutState 400;
			setExplanationSize 0;
			setAnnotationSize 0;
			setFontIncAnnot 0;
			setFontIncExp 0;
			setSize 952 498;
			setLocation 206 56;
			setFont SanSerif;
			setFontSize 10;
			getToolPalette;
			tell It;
			endTell;
			setActive;
			desuppress;
		endTell;
		getEmployee  #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowCoord.BasicDataWindowCoord;
		tell It;
			showDataWindow #692453753269332412 #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindowMaker;
			tell It;
				getWindow;
				tell It;
					setExplanationSize 30;
					setAnnotationSize 20;
					setFontIncAnnot 0;
					setFontIncExp 0;
					setSize 0 -67;
					setLocation 206 56;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					getToolPalette;
					tell It;
					endTell;
					setTool mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindow.arrow;
					colorCells  #mesquite.charMatrices.ColorByState.ColorByState;
				tell It;
					setStateLimit 9;
					toggleUniformMaximum on;
				endTell;
					colorRowNames  #mesquite.charMatrices.TaxonGroupColor.TaxonGroupColor;
					colorColumnNames  #mesquite.charMatrices.CharGroupColor.CharGroupColor;
					colorText  #mesquite.charMatrices.NoColor.NoColor;
					setBackground White;
					toggleShowNames on;
					toggleShowTaxonNames on;
					toggleTight off;
					toggleThinRows off;
					toggleShowChanges off;
					toggleSeparateLines off;
					toggleShowStates on;
					toggleAutoWCharNames off;
					toggleAutoTaxonNames off;
					toggleShowDefaultCharNames off;
					toggleConstrainCW on;
					toggleBirdsEye off;
					toggleShowPaleGrid off;
					toggleShowPaleCellColors off;
					togglePaleInapplicable on;
					toggleShowBoldCellText off;
					toggleAllowAutosize off;
					toggleColorsPanel off;
					toggleLinkedScrolling on;
					toggleScrollLinkedTables off;
				endTell;
				getWindow;
				tell It;
					forceAutosize;
				endTell;
				hideWindow;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.ColorCells.ColorCells;
				tell It;
					setColor Red;
					removeColor off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.categ.StateNamesStrip.StateNamesStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.AnnotPanel.AnnotPanel;
				tell It;
					togglePanel off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.CharReferenceStrip.CharReferenceStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.QuickKeySelector.QuickKeySelector;
				tell It;
					autotabOff;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.charMatrices.SelSummaryStrip.SelSummaryStrip;
				tell It;
					showStrip off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.align.AlignToDropped.AlignToDropped;
				tell It;
					gapCosts 8 3 2 2;
					subCosts  10 5 10 10 10 5 5 10 10 10 5 10;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.molec.ColorByAA.ColorByAA;
				tell It;
					emphasizeDegeneracy off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.molec.SequenceInfoEditor.SequenceInfoEditor;
				tell It;
					panelOpen false;
				endTell;
			endTell;
		endTell;
		endTell;
end;