#NEXUS [written Fri Jul 23 16:09:15 PDT 2010 by Mesquite version 2.72 (build 528) at Chloropyron.local/10.0.1.3] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=33; TAXLABELS Lippia_salviifolia Lantana_camara Lippia_integrifolia Phyla_lanceolata Xeroaloysia_ovatifolia Aloysia_virgata Acantholippia_salsoloides Aloysia_citriodora Verbena_officinalis Hierobotana_inflata Glandularia_microphylla Junellia Mulguraea_aspera Dipyrena_glaberrima Neosparton_ephedroides Lampaya_castellani Diostea_juncea Rhaphithamnus_venustus Priva_cordifolia 'Pitraea cuneato-ovata' Citharexylum_montevidense Baillonia_amabilis Citharexylum_ligustrinum Rehdera_trinervis Casselia_glaziovii Tamonea_boxiana Parodianthus_ilicifolius Bouchea_fluminensis Stachytarpheta_cayennensis Duranta_serratifolia Recordia_boliviana Petrea_racemosa Lantana_canescens ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Character_Matrix; DIMENSIONS NCHAR=8801; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Lippia_salviifolia 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Xeroaloysia_ovatifolia 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Aloysia_citriodora 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Glandularia_microphylla 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Junellia 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Dipyrena_glaberrima 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Lampaya_castellani 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'Pitraea cuneato-ovata' 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Baillonia_amabilis 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Citharexylum_ligustrinum 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Bouchea_fluminensis 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Stachytarpheta_cayennensis 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Duranta_serratifolia 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Recordia_boliviana 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Lantana_canescens 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; END; BEGIN SETS; CHARSET ccsA = 1 - 1026; CHARSET matK = 1027 - 2262; CHARSET ndhF = 2263 - 4369; CHARSET rbcL = 4370 - 4892; CHARSET rpoC2 = 4893 - 7018; CHARSET rps3 = 7019 - 7751; CHARSET trnL = 7752 - 8801; END; BEGIN TREES; Title 'Trees from "Verb.7gene.33tax.ML.tree.nex"'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Rhaphithamnus_venustus, 2 Xeroaloysia_ovatifolia, 3 Junellia, 4 Rehdera_trinervis, 5 Neosparton_ephedroides, 6 Citharexylum_montevidense, 7 Bouchea_fluminensis, 8 Baillonia_amabilis, 9 Phyla_lanceolata, 10 Verbena_officinalis, 11 Dipyrena_glaberrima, 12 Mulguraea_aspera, 13 Acantholippia_salsoloides, 14 Lippia_integrifolia, 15 Parodianthus_ilicifolius, 16 Aloysia_citriodora, 17 Duranta_serratifolia, 18 Petrea_volubilis, 19 'Pitraea cuneato-ovata', 20 Priva_cordifolia, 21 Stachytarpheta_cayennensis, 22 Glandularia_microphylla, 23 Casselia_glaziovii, 24 Lantana_canescens, 25 Diostea_juncea, 26 Recordia_boliviana, 27 Citharexylum_ligustrinum, 28 Tamonea_boxiana, 29 Aloysia_virgata, 30 Hierobotana_inflata, 31 Lampaya_castellani, 32 Lippia_salviifolia, 33 Lantana_camara; TREE Verb_7gene_33tax_ML = ((33:0.0020891537063482284,(9:0.006025270930143487,(((2:0.0032684217070588317,29:0.004039434564319258):0.003948504326939785,(((11:0.00617723765073979,(12:0.005133923856565882,((22:0.004165530215014775,(10:0.0026245864378270107,30:0.001904397906313218):0.001634952751997669):0.0035276451245962064,3:0.003994731639751005):0.002470250022242989):0.015368973339309722):0.0012685669387355516,(((31:0.004370374372576585,5:0.0034162030833963805):2.375993453326282E-4,25:0.0023816051760861883):0.013832032388792572,(((((4:0.020235270207810737,(27:0.0017771356925097702,(6:0.0022576470926517424,8:0.006008352181720954):2.2107752604910716E-4):0.0033303175072592023):0.008973365908512113,(15:0.03525784584167289,(23:0.01984684236465071,28:0.031370788577163064):0.005660463663110679):0.0017366013936915604):0.0037128745265210565,(18:0.02455591946761321,((26:0.007253499339863294,17:0.011535574090246288):9.567928596944603E-4,(21:0.009836905066612583,7:0.012957563026655242):0.004155291051601945):0.005659526336996244):0.0012113818111496972):0.004816134682145996,(20:0.01178180133776705,19:0.03778511102306612):0.024757539244976676):0.0014124538292589887,1:0.009628175150908448):0.0015427007065429536):0.0055757754105256905):0.009644787875295081,(16:0.005307460062514128,13:0.008037234595746783):0.005268632813142499):0.003643351376200672):0.011055526821364434,14:0.0015786693031096973):4.952447511916746E-4):0.0014805985178150758):6.612904468732076E-4,32:0.0010976920058041327,24:7.722141407362535E-4); 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(1,(((2,3)100.0,(4,5)99.6)100.0,(((6,(7,(8,9)52.1)99.4)100.0,(10,(11,12)100.0)70.39999999999999)100.0,((13,14)100.0,(15,((((16,17)100.0,((18,(19,(20,(21,22)65.8)100.0)78.3)100.0,(23,24)100.0)100.0)100.0,(25,(26,(27,(28,(29,30)99.8)100.0)100.0)100.0)98.9)100.0,(31,(32,33)83.89999999999999)100.0)98.4)88.1)100.0)94.3)100.0); END; BEGIN TREES; Title 'Trees from "Verb.7gene.33tax.bayes.tree.nex"'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Petrea_racemosa, 2 Bouchea_fluminensis, 3 Stachytarpheta_cayennensis, 4 Duranta_serratifolia, 5 Recordia_boliviana, 6 Lippia_salviifolia, 7 Lantana_canescens, 8 Lantana_camara, 9 Phyla_lanceolata, 10 Lippia_integrifolia, 11 Xeroaloysia_ovatifolia, 12 Aloysia_virgata, 13 Acantholippia_salsoloides, 14 Aloysia_citriodora, 15 Verbena_officinalis, 16 Hierobotana_inflata, 17 Glandularia_microphylla, 18 Junellia, 19 Mulguraea_aspera, 20 Dipyrena_glaberrima, 21 Neosparton_ephedroides, 22 Lampaya_castellani, 23 Diostea_juncea, 24 Rhaphithamnus_venustus, 25 Priva_cordifolia, 26 'Pitraea cuneato-ovata', 27 Citharexylum_montevidense, 28 Baillonia_amabilis, 29 Citharexylum_ligustrinum, 30 Rehdera_trinervis, 31 Casselia_glaziovii, 32 Tamonea_boxiana, 33 Parodianthus_ilicifolius; TREE Verb_7gene_33tax_bayes = (1:0.024957,((2:0.01318,3:0.010086)1.0:0.004332,(4:0.011869,5:0.007624)1.0:0.001121)1.0:0.00584,(((((((((((6:0.001202,7:0.001067)0.99:8.05E-4,8:0.00223)1.0:0.001647,9:0.006217)0.96:6.27E-4,10:0.001729)1.0:0.011327,(11:0.003445,12:0.00418)1.0:0.00413)1.0:0.00379,(13:0.00829,14:0.005507)1.0:0.005468)1.0:0.00987,(((((15:0.002939,16:0.002194)1.0:0.001894,17:0.004569)1.0:0.003897,18:0.004171)1.0:0.002632,19:0.005402)1.0:0.015655,20:0.006386)1.0:0.001438)1.0:0.005753,((21:0.003605,22:0.004563)0.84:3.89E-4,23:0.002559)1.0:0.014125)1.0:0.00169,24:0.009963)1.0:0.001556,(25:0.012188,26:0.038402)1.0:0.025173)1.0:0.004998,((((27:0.002519,28:0.006264)0.73:4.25E-4,29:0.001914)1.0:0.003499,30:0.021548)1.0:0.009162,((31:0.020247,32:0.031947)1.0:0.00599,33:0.037647)0.9:0.001911)1.0:0.003802)1.0:0.001396); END;