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Melampsora_epiphylla_TSH_R9837 TTAATACATGTTGAGCGCACTTTAATGTGACTCTTTGTATAACTATTACCCCCCAACCCAGAGGTGCATTGTGGCCTTTCACGAGGTTAGCAGTGTATCAGTACGTATCCCAAAGGCAACTTTGAGTTACATTACCCATCATTTACCCCCATTTACACTTAATAAGTTTTAAGAATGATACCTATAAT--TATATAACTTTCAGCAATGGATCTCTAGGCTCTCACGTCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGGTTATTCCGAAAGGTACACCTGTTTGAATGTCACGAAACCCCCCTCGGCTCTAATGCTTTCTAAAAGGATTAGAGACGGATTCTGAGTGTTGGCGTGAATACGCCTCGCTTTAAATATATCAGCACTTTTGGATGGTTTAGAATTAGTTCAAAAGACGTACTTGATGTTGTATTTATATTTCATTGAGGTAGTCTTTGGTCGTTACGACTATCCGCTAATCCGAAAACTTGAAGAATAGCTTAAATTTGTAATCTGGCACTTTTTACAAGTGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGCTGTTATCCGTACTGGACCATGTACAAGTCTGTTGAAAAGCAGCATCATTGAAGGTGAAAATCCTGTAGATGATATGGACTACCAGTATATTTGTGATACGGTTTCTAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAGTGGGTGGTAAATTCCATCTAAGGCTAAATATAAGTGAGAGACCGATAGCAAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGAAAATAGAGTTAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGTTTGAAGTTAGTTTTGTATTCGTTGGATCAGCTTCGCAAGGAGTGTATTCTGATGATAAGCAAGTCAACATCAGTCTATGAGTGTTGGATAAGGGTTTTGAGAATGTAGCAATTTAATTGTGTTATAGCTTGAGACTTGGATACGATGCTTTGGATTGAGATATGCCTGGGTACTTGACAAGCTCAAAGCCGAGCGAGAACGTGGTATCACCATCGATATTGCTCTCTGGAAATTCGAGACCCCCAAATACTTCGTTACCGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAAAAACATGATCACTGGAACTTCCCAGGCCGATTGTGCTATCTTGATCATTGCCTCCGGTGTCGGTGAATTCGAAGCCGGTATCTCCAAGGACGGTCAAACTCGTGAACACGCTCTCCTTGCCTTCACCCTCGGTGTTCGTCAACTTATCGTGGCCATCAACAAGATGGACACCTGCAAGTGGTCCGAGCAGAGATAC Melampsora_epiphylla_VMP891_1 TTAATACATGTTGAGCGCACTTTAATGTGACTCTTTGTATAACTATTACCCCCCAACCCAGAGGTGCATTGTGGCCTTTCACGAGGTTAGCAGTGTATCAGTACGTATCCCAAAGGCAACTTTGAGTTACATTACCCATAATTTACCCCCATTTACACTTAATAAGTTTTAAGAATGATACCTATAAT--TATATAACTTTCAGCAATGGATCTCTAGGCTCTCACGTCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATACGTAATGTGAATTGCATAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCTTTTGGTTATTCCGAAAGGTACACCTGTTTGAATGTCACGAAACCCCCCTCGGCTCTAATGCTTTCTAAAAGGATTAGAGACGGATTCTGAGTGTTGGCGTGAATACGCCTCGCTTTAAATATATCAGCACTTTTGGATGGTTTAGAATTAGTTCAAAAGACGTACTTGATGTTGTATTTATATTTCATTGAGGCAGTCTTTGGTCGTTACGACTATCCGCTAATCCGAAAACTTGAAGAATAGCTTAAATTTGTAATCTGGCACTTTTTACAAGTGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGCTGTTATCCGTACTGGACCATGTACAAGTCTGTTGAAAAGCAGCATCATTGAAGGTGAAAATCCTGTAGATGATATGGACTACCAGTATATTTGTGATACGGTTTCTAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAGTGGGTGGTAAATTCCATCTAAGGCTAAATATAAGTGAGAGACCGATAGCAAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGAAAATAGAGTTAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGTTTGAAGTTAGTTTTGTATTCGTTGGATCAGCTTCGCAAGGAGTGTATTCTGATGATAAGCAAGTCAACATCAGTCTATGAGTGTTGGATAAGGGTTTTGAGAATGTAGCAATTTAATTGTGTTATAGCTTGAGACTTGGATACGATGCTTTGGATTGAGATATGCCTGGGTACTTGACAAGCTCAAAGCCGAGCGAGAACGTGGTATCACCATCGATATTGCTCTCTGGAAATTCGAGACCCCCAAATACTTCGTTACCGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGATTTCATCAAAAACATGATCACTGGAACTTCCCAGGCCGATTGTGCTATCTTGATCATTGCCTCCGGTGTCGGTGAATTCGAAGCCGGTATCTCCAAGGATGGTCAAACTCGTGAACACGCTCTCCTTGCCTTCACCCTCGGTGTTCGTCAACTTATCGTGGCCATCAACAAGATGGACACCTGCAAGTGGTCCGAGCAGAGATAC ; END; [ BEGIN TREES; Title Whole_5; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Melampsora_sp._HMAS82384, 2 Melampsora_sp._HNMAP1339, 3 Melampsora_sp._HNMAP1697, 4 Melampsora_sp._HNMAP1710, 5 Melampsora_sp._HNMAP1716, 6 Melampsora_sp._HNMAP3111, 7 Melampsora_sp._HNMAP3140, 8 Melampsora_sp._HNMAP3149, 9 Melampsora_caprearum_NWC_9467, 10 Melampsora_epitea_NWC_9533, 11 Melampsora_epitea_NWC_KNW_1, 12 Melampsora_caprearum_TSH_R10194, 13 Melampsora_caprearum_TSH_R10513, 14 Melampsora_caprearum_TSH_R10727, 15 Melampsora_caprearum_TSH_R3879, 16 Melampsora_epitea_TSH_R3889, 17 Melampsora_caprearum_TSH_R7489, 18 Melampsora_epiphylla_TSH_R7643, 19 Melampsora_epiphylla_TSH_R7661, 20 Melampsora_epitea_TSH_R9620, 21 Melampsora_epiphylla_TSH_R9831, 22 Melampsora_caprearum_TSH_R9832, 23 'Melampsora laricis-urbaniana TSH R9834', 24 'Melampsora laricis-urbaniana TSH R9835', 25 Melampsora_epiphylla_TSH_R9836, 26 Melampsora_epiphylla_TSH_R9837, 27 Melampsora_epiphylla_VMP891_1; TREE PAUP_1 = 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((23:0.0,24:0.0):12.0,((9:2.0,((10:1.0,11:0.0,27:0.0):1.0,(25:0.0,(26:1.0,(18:1.0,19:2.0):12.0):1.0):1.0):2.0):3.0,(7:0.0,8:4.0,((1:0.0,2:0.0,3:0.0,4:0.0,5:0.0,6:0.0):1.0,((21:3.0,(16:0.0,20:1.0):2.0):1.0,(12:0.0,13:0.0,14:0.0,15:0.0,17:0.0,22:0.0):3.0):1.0):1.0):6.0):12.0); TREE PAUP_5 = ((23:0.0,24:0.0):12.0,((9:2.0,((10:1.0,11:0.0,27:0.0):1.0,(25:0.0,(26:1.0,(18:1.0,19:2.0):12.0):1.0):1.0):2.0):3.0,((16:0.0,20:1.0):1.0,(21:3.0,((12:0.0,13:0.0,14:0.0,15:0.0,17:0.0,22:0.0):3.0,((7:0.0,8:4.0):1.0,(1:0.0,2:0.0,3:0.0,4:0.0,5:0.0,6:0.0):1.0):1.0):1.0):1.0):6.0):12.0); END; ] BEGIN TREES; Title MLT_Whole; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Melampsora_sp._HMAS82384, 2 Melampsora_sp._HNMAP1339, 3 Melampsora_sp._HNMAP1697, 4 Melampsora_sp._HNMAP1710, 5 Melampsora_sp._HNMAP1716, 6 Melampsora_sp._HNMAP3111, 7 Melampsora_sp._HNMAP3140, 8 Melampsora_sp._HNMAP3149, 9 Melampsora_caprearum_NWC_9467, 10 Melampsora_epitea_NWC_9533, 11 Melampsora_epitea_NWC_KNW_1, 12 Melampsora_caprearum_TSH_R10194, 13 Melampsora_caprearum_TSH_R10513, 14 Melampsora_caprearum_TSH_R10727, 15 Melampsora_caprearum_TSH_R3879, 16 Melampsora_epitea_TSH_R3889, 17 Melampsora_caprearum_TSH_R7489, 18 Melampsora_epiphylla_TSH_R7643, 19 Melampsora_epiphylla_TSH_R7661, 20 Melampsora_epitea_TSH_R9620, 21 Melampsora_epiphylla_TSH_R9831, 22 Melampsora_caprearum_TSH_R9832, 23 'Melampsora laricis-urbaniana TSH R9834', 24 'Melampsora laricis-urbaniana TSH R9835', 25 Melampsora_epiphylla_TSH_R9836, 26 Melampsora_epiphylla_TSH_R9837, 27 Melampsora_epiphylla_VMP891_1; TREE PAUP_1 = ((23:0.0,24:0.0):0.011074,((9:0.00159,((10:7.53E-4,11:0.0,27:0.0):7.53E-4,(25:0.0,(26:7.43E-4,(18:7.52E-4,19:0.001504):0.009493):7.53E-4):7.44E-4):0.001432):6.24E-4,((12:0.0,13:0.0,14:0.0,15:0.0,17:0.0,22:0.0):0.001544,((21:0.003081,(16:0.0,20:7.57E-4):7.61E-4):7.61E-4,(7:0.0,8:0.003068,(1:0.0,2:0.0,3:0.0,4:0.0,5:0.0,6:0.0):0.001525):7.66E-4):0.001514):0.004063):0.011074); END; BEGIN TREES; Title Consensus_of_5_MPTs_Whole; LINK Taxa = Taxa; [!Parameters: Consensus tree of trees from Other Tree Blocks] TRANSLATE 1 Melampsora_sp._HMAS82384, 2 Melampsora_sp._HNMAP1339, 3 Melampsora_sp._HNMAP1697, 4 Melampsora_sp._HNMAP1710, 5 Melampsora_sp._HNMAP1716, 6 Melampsora_sp._HNMAP3111, 7 Melampsora_sp._HNMAP3140, 8 Melampsora_sp._HNMAP3149, 9 Melampsora_caprearum_NWC_9467, 10 Melampsora_epitea_NWC_9533, 11 Melampsora_epitea_NWC_KNW_1, 12 Melampsora_caprearum_TSH_R10194, 13 Melampsora_caprearum_TSH_R10513, 14 Melampsora_caprearum_TSH_R10727, 15 Melampsora_caprearum_TSH_R3879, 16 Melampsora_epitea_TSH_R3889, 17 Melampsora_caprearum_TSH_R7489, 18 Melampsora_epiphylla_TSH_R7643, 19 Melampsora_epiphylla_TSH_R7661, 20 Melampsora_epitea_TSH_R9620, 21 Melampsora_epiphylla_TSH_R9831, 22 Melampsora_caprearum_TSH_R9832, 23 'Melampsora laricis-urbaniana TSH R9834', 24 'Melampsora laricis-urbaniana TSH R9835', 25 Melampsora_epiphylla_TSH_R9836, 26 Melampsora_epiphylla_TSH_R9837, 27 Melampsora_epiphylla_VMP891_1; TREE 'Default Bush+' = ((23:0.0,24:0.0):12.4[%consensusFrequency = 1.0 ],((9:2.2,((10:1.0,11:0.0,27:0.0):0.6[%consensusFrequency = 1.0 ],(25:0.0,(26:1.0,(18:1.0,19:2.0):6.0[%consensusFrequency = 1.0 ]):0.5[%consensusFrequency = 1.0 ]):1.0[%consensusFrequency = 0.8 ]):2.0[%consensusFrequency = 1.0 ]):2.0[%consensusFrequency = 1.0 ],((21:3.4,(16:0.0,20:1.0):0.6[%consensusFrequency = 1.0 ]):1.25[%consensusFrequency = 0.6 ],(12:0.0,13:0.0,14:0.0,15:0.0,17:0.0,22:0.0):2.6[%consensusFrequency = 1.0 ],((7:0.0,8:4.0):0.6666666666666666[%consensusFrequency = 0.6 ],(1:0.0,2:0.0,3:0.0,4:0.0,5:0.0,6:0.0):0.7[%consensusFrequency = 1.0 ]):0.5[%consensusFrequency = 0.8 ]):2.8[%consensusFrequency = 1.0 ]):12.4[%consensusFrequency = 1.0 ]):0.0[%consensusFrequency = 1.0 ] [% ] [% setBetweenBits = selected setBetweenDouble = consensusFrequency ]; END;