#NEXUS [written Sat Dec 29 23:32:33 EST 2012 by Mesquite version 2.75 (build 566) at Simba.local/10.0.1.6] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=35; TAXLABELS Fabienna_sphaerica Aglauropsis_aeora Antipathes_galapagensis Montastraea_franksi Atolla_vanhoeffeni Phacellophora_camtschatika Craterolophus_convolvulus Haliclystus_sanjuanensis Carybdea_marsupialis_Auctorum_LabCulture_Hamburg Chiropsella_bronzie_Queensland_AUS Chironex_fleckeri_Northern_Territory_AUS Chironex_fleckeri_Qld_AUS Chironex_fleckeri_QLD_AUS2 cf._Chironex_sp._Palau Chironex_yamaguchii_Japan Chiropsalmus_quadrumanus_NC_USA Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil2 Alatina_mordens_Queensland_AUS Carukia_barnesi_Queensland_AUS Morbakka_virulenta_Japan Gerongia_rifkinae_Northern_Territory_AUS Malo_kingi_Queensland_AUS Carybdea_xaymacana_Auctorum_Caribbean_Panama Carybdea_xaymacana_Caribbean_Panama Carybdea_branchi_South_Africa Tamoya_cf._haplonema_Netherlands_Antilles 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Montastraea_franksi 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Craterolophus_convolvulus 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Haliclystus_sanjuanensis 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cf._Chironex_sp._Palau 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Chironex_yamaguchii_Japan 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Chiropsalmus_quadrumanus_NC_USA 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Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil 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Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil2 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Carukia_barnesi_Queensland_AUS 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Morbakka_virulenta_Japan 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Gerongia_rifkinae_Northern_Territory_AUS 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Malo_kingi_Queensland_AUS 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Carybdea_xaymacana_Auctorum_Caribbean_Panama 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Tamoya_cf._haplonema_Netherlands_Antilles 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Carybdea_arborifera_Hawaii 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Carybdea_brevipedalia_Japan 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Carybdea_brevipedalia_Japan2 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Copula_sivickisi_Japan GCTC-AAGCCTTGAATCTCCGTTGC-TCTGCGACGGCGAATTGTAGTCTCGAGAAG--CGTTTTCTAGGCGAATCCAGCTCGCCAAAGTTGCTTGGAACAGCACATCGAAGAGGGCGACAATCCCGTGTGCGGCGAAGCTGGATTGCTGACGATACGTTTTCCATGAGTCGGGTTGCTTGAGAATGCAGCCCTAAATGGGTGGTAAACTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCACGAGACCGATAGTGAACAAGTACCGTGAGGGAAAAATGAAAAGAACTTTGAAAAGAGAGTTAAAAAGTACGTGAAACCGTTAAAAGGGAAACGGATGGCGTTGGCAATGCATTG-GCGAGATTCAGGCGGGCGG-AGCTGGGACTGTTGGGTTTGTGGATTCG-CACGAACTGCA-TCCTTTCGGCTCTCGGCTTCCACCGTCGCATTTCCCGTCTGTGC-GTGTCAGCAACTGTTTGGC----TCGGGGTGAAAAGCGCCGGGGGATGGTAGGTGC-CGCTTC----GGCGT-CACTG-GATAGCCCTCG-G-----TGGCCGGACCTCG-GCTGGACAGAGGGTGGACTGCGTGCAGTGCACTTGAACTTCGGTCGGCTGCAGG------GGACGGCCG-CCTTGGCAGCGGTC--CAGGTTGCTGGCGAGT-ATATGACTTCATCCGACCCGTCTT-GAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGTACGCGAGTCTTGGGGTGATTGAAACCGAAGGGCGAAATGAAAGTA--AGCGGCGCATCATCGACCGAGCTTGTCTACTCTTAGACAGTTTTGAGTATGAGCGTACCTGTTGGTACCCG-AAAGATGGTGAACTATGCCTGAGCAGGGCGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAACTTTGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCCTCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGGGACT-------CGTAT-----ATCAGTTTTATCAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTAGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATTGGTAAGAAGCTCGACTTGCCTAATCGAAGCCGGGCAAT-GAATGAGAGTCCCTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGTCGAGTTAAGGCGCCTAAAGCGACGCTCATCAGATCCCACAAAAGGTGTTGGTTGATCCAGACAGCAGGACGGTGGCCATGGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACACACCTGCCGAATCAACTAGCCCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTCGTGCCTATACTCGACCGTCAG-AACAAA-TGCGAAG-TTCTGACGAGTAGGAGGGCGTGGATG-TCGTGACGCAGCCTATGGCGCGAGCCTGGGTGAAACGGCCTCTAGTGCAGATCTTGGTGGTAGTAGCAAATATTCAAATGAGAACTTTGAAGGCCGAAGTGGAGAAAGGTTCCATGTGAACAGCAGTTGGACATGGGTTAGTCGACCCTAAGAGATAGGGAAACTCCGTTTTAAAGCGCCCGATCT---TGGGCCGTCCTATCGAAAGGGAATCGGGTTAATATTCCCGAACCGG-AACGCGGATA-GCCCCGGA-AGTGCGGTAACGCAACCGAACTCGGAGACGTCGGCGAGAGCCCTGGGAAGAGTTCTCTTTTCTTGTTAACGGGCTGAC--ACCCTGGAATCAGATTGCCTGGAGATAGGGTTTGATGCCCGGTAAAGCACCACACCTCTTGTGGTGTCCGGTGTGCTCTCGACGGCCCTTGAAAATCCGAGGGAGTGAT-TGATTCTCGCGTCCGTTCGTACTCATAACCGCAGCAGGTCTCCAAGGTGAGCAGCCTCTGGCCGATAGAACAATGTAGGTAAGGGAAGTCGGCAAAATAGATCCGTAACTTCGGGAAAAGGATTGGCTCTAAGGATTGGGTC-TGTCGGGCTGGAACGTGAAGCAGGCAAGTCCAGCCTGGACTGGCCGTTGTTGCTGTGGTTGGACCAGGAGGGGTTT-CTTGTCGATCGGCCCAGCTTTGCTCGT---CAGGGCAGTTCGGCAGGCAATTAACAAT-CGACTTAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTTTAATTAAAACAAAGCATTGCGATGGCTGGAAACAGTGTTGACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAAAATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTTGAGCTTGACTCTAGTCTGACTCTGTGAAAAGACATGAGAGGTGTAGGATAAGTGGGAGCAG---CAATGCAACAGTGAAATACCACTACTCTTATCGTTTTTTTACTTATTTGGTGGAGCG-AAGGCGAGCCTCGT--GGCTC-ACTTTCTGGTCTTAAGACTCTTC----GCGAGTTGATTCGTGCCAAAGACACTGTCAGGTTGGGAGTTTGGCTGGGGCGGCACATCTGTCAAATGATAACGCAGGTGTCCTAAGGTGAGCTCAATGAGAACGGAAATCTCATGTAGAACAAAAGGGTAAAAGCTCACTTGATTTTGATTTTCAGTATGAATACAAACTGTGAAAGCATGGCCTATCGATCCCTTAGTCTTTAGGAGTTTTAAGCTAGGGGTGTCAGAAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATTGTGAAGCAGAATTCACCAAGCGTTGGATTGTTCACCCACTAATAGGGAACGTGAGCTGGGTTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGAAGTGTTGTTGCAATAGTAATTCTGCTCAGTACGAGAGGAACCGCAGATTCAGACAACTGGCACTTGCACTTAGCTGAAAAGCTAATGGTGCGAAGCTACCATCTGT-------CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTTAGTATAAGCAC-TTGTACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTACTTGATCGTATC---CTTACATGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCGAAAAGTCCCGACCTCTGGAAGGGATGTATTTATTAGACTAAAAGCCAATAC-CGGTT-TCCCA-----ACCG---GTTCTATTGGTGATTCATGATAACTTCTCGAATCGCACGGGCTT--GTACCGGCGATGTTTCATTCAAATATCTGCCCTATCAACTGTCGATGGTAAGGTAGTGGCTTACCATGGTTGCAACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACAGGGAGGTAGTGACAAGAACTAACAATATGGGGCC-TTTCT-GGTCTCATAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCTTTAACGAGGATCTATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATT-CCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGTCGGAGTTGACGGTCTGCCGCAAGGTATGTTACTGTCCACTCTGTCCTTCTTCGCAAGGACTTCACATATCCTTGATTGGCTGTGTGTAGGATTTGCGACGTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGC--ATATTAGCTTGAATACATGAGCATGGAATAATGGAACAGGACTTCGGTCCCGTTTTGTTGGTTTCCAGGACCGACGTAATGATTAAGAGGGACAATTGGGGGCATTCGTATTTCGTTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTACGAAAGACGAACAACTGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGAGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTTCTAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATCAGCGGGCGTTATTGTATGACCCCGTTGGCACCTTATGGGAAACCCAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAACCTCACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATCCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGTTACGCGATTCTTGAATCGCGGTTAACWTCTTAGAGGGACTATTGGTGTTTAACCAAAGTCAGGAAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACGATGGTAGCGAGTCTGACCCTTCACCGGAAGGTGTGGGTAATCTTTTGAAACATCGTCGTGATGGGGATAGATCATTGCAATTATTGATCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGGAATCCGGATTGGCAG-CCCTC?GGTCGGCAACG----GCC--TATG-GGCTACCGAGAAGCTTTTCAAACC-CGATCATTTAGAGG------------------------- ; END; BEGIN TREES; Title 'S1 UPGMA cluster analysis (Distance: Distances from Character Matrix)'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Fabienna_sphaerica, 2 Aglauropsis_aeora, 3 Antipathes_galapagensis, 4 Montastraea_franksi, 5 Atolla_vanhoeffeni, 6 Phacellophora_camtschatika, 7 Craterolophus_convolvulus, 8 Haliclystus_sanjuanensis, 9 Carybdea_marsupialis_Auctorum_LabCulture_Hamburg, 10 Chiropsella_bronzie_Queensland_AUS, 11 Chironex_fleckeri_Northern_Territory_AUS, 12 Chironex_fleckeri_Qld_AUS, 13 Chironex_fleckeri_QLD_AUS2, 14 cf._Chironex_sp._Palau, 15 Chironex_yamaguchii_Japan, 16 Chiropsalmus_quadrumanus_NC_USA, 17 Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil, 18 Chiropsalmus_quadrumanus_Brazil2, 19 Alatina_mordens_Queensland_AUS, 20 Carukia_barnesi_Queensland_AUS, 21 Morbakka_virulenta_Japan, 22 Gerongia_rifkinae_Northern_Territory_AUS, 23 Malo_kingi_Queensland_AUS, 24 Carybdea_xaymacana_Auctorum_Caribbean_Panama, 25 Carybdea_xaymacana_Caribbean_Panama, 26 Carybdea_branchi_South_Africa, 27 Tamoya_cf._haplonema_Netherlands_Antilles, 28 Tamoya_haplonema_Auctorum_North_Carolina_USA, 29 Carybdea_rastonii_South_Australia, 30 Carybdea_rastonii_Auctorum_New_South_Wales_AUS, 31 Carybdea_arborifera_Hawaii, 32 Carybdea_brevipedalia_Japan, 33 Carybdea_brevipedalia_Japan2, 34 Tripedalia_cystophora_Indonesia, 35 Copula_sivickisi_Japan; TREE Fig._S1 = (((3,4),((7,8),((1,2),(5,6)))),((9,19),(((16,(17,18)),(10,((14,15),(11,(12,13))))),((20,(21,(22,23))),(25,(24,((34,35),((27,28),(26,((29,30),(31,(32,33)))))))))))); END;