NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:15:50] [Matrix accession#: M3014] BEGIN TAXA; TITLE M3014; DIMENSIONS NTAX=38; TAXLABELS Neofusicoccum_ribis Mycosphaerella_suttoniae_STEU1346 Mycosphaerella_suttoniae_Ke.2.1 Mycosphaerella_suttoniae_CMW22485 Mycosphaerella_suttoniae_CMW22484 Mycosphaerella_suberosa Mycosphaerella_stramenticola_CPC12147 Mycosphaerella_stramenticola_CPC11438 Mycosphaerella_stramenticola_CMW22514 Mycosphaerella_stramenticola_CBS118872 Mycosphaerella_sp._CBS209.94 Mycosphaerella_sp._CBS208.94 Mycosphaerella_sp._CBS111036 Mycosphaerella_sp._CBS110678 Mycosphaerella_secundaria_CBS115608 Mycosphaerella_secundaria_CBS111002 Mycosphaerella_pseudosuberosa Mycosphaerella_pseudafricana Mycosphaerella_perpendicularis Mycosphaerella_parva_MURU249 Mycosphaerella_parva_MURU248 Mycosphaerella_ohnowa_CBS112896 Mycosphaerella_ohnowa_CBS110949 Mycosphaerella_nubilosa_MURU57 Mycosphaerella_nubilosa_MURU51 Mycosphaerella_mexicana Mycosphaerella_marksii Mycosphaerella_lateralis Mycosphaerella_jonkershoekensis Mycosphaerella_grandis_L.1.2.1 Mycosphaerella_grandis_CMW10189 Mycosphaerella_gamsii Mycosphaerella_fori Mycosphaerella_flexuosa_CBS111055 Mycosphaerella_flexuosa_CBS110743 Mycosphaerella_cryptica_MURU118 Mycosphaerella_cryptica_MURU115 Mycosphaerella_colombiensis ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M3014; DIMENSIONS NCHAR=625; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = N GAP = - ; MATRIX Neofusicoccum_ribis NNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAGGATCATTACCGAGTTGAT---TCGAG-----CTCC-GGCTC-GAC-TCTCCCACCC-AATGTGTA-CC--TA-CCTC-TGTTGCTTTGGCGG-G--CCGCGGTCCTCCGCACCGGCGCCT--CGGGGGGGCTGGCCA-GCGC--CCGCCAGAGGACCATAAAACTCCAGTCAGTGAA-CTTCGCAGTCTGAAAAACAAGTT-AA-T-AAACTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CAACCC-TCAAGCTCTGCTTGGTATTGGGCTCC-GTCCTCC-----ACGGACGCGCCTT--AAAGACC-------TCGGCGGTGGC--GTCTT--GC--CTC-AA-GCGTAGT-AG--AAA--ACACCTC---GCTT-TGGAGCGCAC-GGCGTCGCCCg-CCGgAcGAaCC-TT-TGAA-----------TTATTTCT--CAA-GGTTGACCTCGGATNNNNNNNNNNNN Mycosphaerella_suttoniae_STEU1346 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGC-GAGGGC----------GTCA-GGCCC-GACCTCC-GACCCT-TTTGTGT--CCTACA-CCC--TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCG-CC-----GCGT----CGGG-CCCCCC-TGA-GG---ACCC---TC------TAACCCT-GCGTCCTCTTG-CGTCTGAGTCG-TGAG-TAG----AAATTGAATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATAATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCCGGTATTCCGGAGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATCAAC-CCACCTCAAGCCTCGCTTGGTGTTGGGCGTC-GCGGCC-------GCCGCGCGCCCT--AATGTCC-------CCGGCCG-AG---CCGGCC-GT--CCCGAA-GCGTTGT-GGC-GTCTA-CTGTGCC--GCTTCC-GGG-ACC--GGTCTGG-----CGGTG-TG-CCGTC--AAA----------CCCCTT-CAT-CAAAGGTTGACCTCGGATCAGGCAGGGATA Mycosphaerella_suttoniae_Ke.2.1 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGG-GAGGGA----------GGCCG---CA-GACCTCC-GACCCT-TTTGTGT--CCTACA-CCC--TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCG-TC-----GCGT----CGGG-CCCCCC-TGA-GG---ACCC---TC------TAACCCT-GCGTcCTcCTG-CGTCTGAGTCG-TGAG-TAG----AAATTGAATCAAAACTTTCAACAATGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTCGGTATTCCGGAGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATCAAC-CCACCTCAAGCCTCGCTTGGTGTTGGGCGTC-GCGGCC-------GCCGCGCGCCCT--AATGTCC-------CCGGCCG-AA---GCCGCC-GT--CCCGAA-GCGTTGT-GGC-GTCTA-CTGTGCC--GCTTCC-GGG-ACC--GGTCTGG-----CGGTG-TG-CCGTC--AAa---------CCCCCTT-----CAAAGGTtGACCTCGGATCAAGCAGGGaTA Mycosphaerella_suttoniae_CMW22485 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGC-GAGGGC----------GTCA-GGCCC-GACCTCC-GACCCT-TTTGTGT--CCTACA-CCC--TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCG-CC-----GCGT----CGGG-CCCCCC-TGA-GG---ACCC---TC------TAACCCT-GCGTCCTCCTG-CGTCTGAGTCG-TGAG-TAG----AAATTGAATCAAAACTTTCAACAATGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCCGGTATTCCGGAGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATCAAC-CCACCTCAAGCCTCGCTTGGTGTTGGGCGTC-GCGGCC-------GCCGCGCGCCCT--AACGTCC-------CCGGCCG-AG---CCGGCC-GT--CCCGAA-GCGTTGT-GGC-GTCTA-CTGTGCC--GCTTCC-GGG-ACC--GGTCTGG-----CGGTG-CG-CCGTC--AAA---------CCCCCTT-CAT-CAAAGGTGGACCTCGGATCAGGCAGGGTTA Mycosphaerella_suttoniae_CMW22484 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGC-GAGGGC----------GTCA-GGCCC-GACCTCC-GACCCT-TTTGTGT--CCTACA-CCC--TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCG-CC-----GCGT----CGGG-CCCCCC-TGA-GG---ACCC---TC------TAACCCT-GCGTCCTCCTG-CGTCTGAGTCG-TGAG-TAG----AAATTGAATCAAAACTTTCAACAATGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCCGGTATTCCGGAGGGCATGCCTGTCCGAGCGTCATCAAC-CCACCTCAAGCCTCGCTTGGTGTTGGGCGTC-GCGGCC-------GCCGCGCGCCCT--AACGTCC-------CCGGCCG-AG---CCGGCC-GT--CCCGAA-GCGTTGT-GGC-GTCTA-CTGTGCC--GCTTCC-GGG-ACC--GGTCTGG-----CGGTG-CG-CCGTC--AAA---------CCCCCTT-CAT-CAAAGGTGGACCTCGGATCAGGCAGGGTTA Mycosphaerella_suberosa TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACAGAGTTCTGGGTC--------CTTCGGGGCCC-GTCCTCC-AACCCC--TTGTATA-CC---AACCA--TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCGTCC----GGC------CGATCGCCCCC-GGT-GG---ACCCC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCGGAGTCTAATGA-TA-----AA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTCGCTTGGTATTGGGCGCC-GCGGTCC------GCCGCGCGCCCC--AATGTCT-------CCGGCTC-AG---CCCAAC-GT-CCTCGAA-GCGATTT-GATTA-----CAA-TCCC-GCTAGC-AGGCACG--GA--GGG-----CG-CGACG-CCGCT--AAA-----------CACCC-CAT-CACAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_stramenticola_CPC12147 NNNNNNGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------TTC-GGCCC-AACCTCC-AACCCT--TTGTGAA-CC-AAAACCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TCT--GC--TGC----CAGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATAAACACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAT-GTGGCTTGCG--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------TCGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCTCA-GCGTTGT-GACTTAA--TTGGA-CC--GCTGGCGGAG-GAC--GG-GAGGTTT--CCAC---G-CCGTT--AAAA----------CACTTTT-T-CACAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_stramenticola_CPC11438 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------TTC-GGCCCCGACCTCC-AACCCT--TTGTGAA-CC-AAAACCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TCT--GC--TGC----CAGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATAAACACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAT-GTGGCTTGCG--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------TCGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCTCA-GCGTTGT-GACTTAA--TTGGA-CC--GCTGGCGGAG-GAC--GG-GAGGTTT--CCAC---G-CCGTT--AAAA----------CACTTTT-T-CACAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_stramenticola_CMW22514 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC-----------TTC-GGCCC-GACCTCC-AACCCT--TTGTGAA-CC-AAAACCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TCT--GC--TGC----CAGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATAAACACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAT-GTGGCTTGCG--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------TCGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCTCA-GCGTTGT-GACTTAA--TTGGA-CC--GCTGGCGGAG-GAC--GG-GAGGTTT--CCAC---G-CCGTT--AAAA----------CACTTTT-T-CAAAGGTTGACCTCNNNNNNNNNNNNNNNN Mycosphaerella_stramenticola_CBS118872 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------TTC-GGCCC-AACCTCC-AACCCT--TTGTGAA-CC-AAAACCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TCT--GC--TGC----CAGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATAAACACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAT-GTGGCTTGCG--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------TcGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTcTCA-GCGTTGT-GACTTAA--TtGGA-CC--GCTGGCGGAG-GAC--GG-GAGGTTT--CCAC---G-CCGTT--AAAA----------CACTTTT-T-CAAAGGTTGACCTCNNNNNNNNNNNNNNNN Mycosphaerella_sp._CBS209.94 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC----------CTTC-GGCCC-GACCTCC-AACCCT--TTGTGAA-CC-AAAACCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TCT--GC--TGC----CAGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATAAACACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAT-GTGGCTTGCG--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------TCGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCTCA-GCGTTGT-GACTTAC--TTGGA-CC--GCTGGCGGAG-GAC--GG-GAGGTTT--CCAC---G-CCGTT--AAAA----------CACTTTT-T-CACAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_sp._CBS208.94 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC----------CTTC-GGCCC-GACCTCC-AACCCT--TTGTGAA-CC-AAAACCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TCT--GC--TGC----CAGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATAAACACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAT-GTGGCTTGCG--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------TCGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCTCA-GCGTTGT-GACTTAC--TTGGA-CC--GCTGGCGGAG-GAC--GG-GAGGTTT--CCAC---G-CCGTT--AAAA----------CACTTTT-T-CACAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_sp._CBS111036 NNNNNNGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC-----------TCC-GGCCC-GACCTCC-AACCCC--ATGTGAATCT--CA-CCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCCTCT--G-GGTGC----CGGG-GCCCCC-GGC-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TGTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAAATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAG-GCGGCTTC-GC-GGCCGCCTGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-GA---CGGATC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GACTTCA--TTGGA-CC--GCTTGC-GAG-TAC--GG-GATGT----CCTC---GGCCGTT--AAA-----------CCCTTTTAT-CAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_sp._CBS110678 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC-----------TCC-GGCCC-GACCTCC-AACCCC--ATGTGAACCT--CA-CCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCCTCT--G-GGTGC----CGGG-GCCCCC-GGC-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TGTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAAATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAG-GCGGCTTC-GC-GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-GA---CGGATC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GACTTCG--TTGGA-CC--GCTTGC-GAG-TAC--GG-GACGT----CCTC---GGCCGTT--AAA-----------CCCTTTTAT-CAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_secundaria_CBS115608 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------TCC-GGCCC-AACCTCC-AACCCT--TTGTGAATTC--GA-CCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCCTCT--G-GGTGC----CGGG-GCCCCC-GGT-GG---ACACC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT---ATGA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGTGAG-GCGGCTTCAC--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GACTTAA--TTGGA-CC--GCTTGC-GAG-CAT--GG-GACGT----CCTC---GGCCGTT--AAA----------CTTATTACAC---AAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_secundaria_CBS111002 NNNNNNGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------TCC-GGCCC-AACCTCC-AACCCT--TTGTGAATTC--GA-CCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCCTCT--G-GGTGC----CGGG-GCCCCC-GGT-GG---ACACC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT---ATGA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGTGAG-GCGGCTTCAC--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GACTTAA--TTGGA-CC--GCTTGC-GAG-CAT--GG-GACGT----CCTC---GGCCGTT--AAA----------CTTATTACAC---AAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_pseudosuberosa TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGCGC----------CTCCGGGCGC-GACCTCC-AACCCC--ATGTTAT-CT---GACCA--TGTTGCCTCGGGGGTG-CCCC-GG-CCGCCC----GGC------CGATCGCCCCC-GGT-GG---ACCCC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCGGAGTCTGATGA-TA-----AA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATCCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTCGCTTGGTATTGGGCGCC-GCGGTCC------GCCGCCCGCCCC--AATGTCT-------CCGGCTC-AG---CCAAAC-GT-CCTCGAA-GCGATTT-GATCA-----CCA-TCCC-GCTAGC-AGGCACG--GA--GGG-----CG-CGACG-CCGCT--AAA-----------CACCC-CAT-CACAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_pseudafricana NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------CCTTGGCCC-GACCTCC-AACCCT-TTTGTGTATCT-CGA-CCC--TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCT-TC--G-GGCGT----CGGG-GCCCCC-GGC-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGTCT-TAT-ATG-----AA-TTAAATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTA-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGTC-GCGGCC-------GCCGCGCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-GG---TCTCTT-AC--CTCTAA-GCGTTGT-GACA-CA-ATCTA-TCC--GCTTCGCGAGTGT---GG--CGG-----CC-CG-CG-CCGTT--AAACG------------ATTTTATCTGATGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_perpendicularis NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------TCC-GGCCC-GACCTCC-AACCCT--TTGTGAA-CC-AAAACCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TCT--GC--TGC----CGGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATAAACACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAT-GTGGCTTCCG--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------TTGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCCCA-GCGTTGT-GACTTAA--TTGGA-CC--GCTGGCGGAG-GAC--GG-GAGGTCT--CCAC---G-CCGTT--AAA-----------CACTTTT-T-CACAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_parva_MURU249 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC----------CTCCGGGCTC-GACCTCC-AACCCC-ATTGTATT-CCGA---CCTCTTGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TTC--G-GGCGT----CGGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCA---TC------AAACTCT-GCATC--TTTGACGTCTGAGT----AAA-TA-TT-GAA-TCAA-TCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGCC-GCGG-TTT-----GCCGCGCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-AG---CCAACT-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GGTTTAA--TCA--TCC--GCTTGC-GAG-ATC--GA-AGG------CGAC---GGCCGTT--AAA-------------CTT--ATTCAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_parva_MURU248 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC-----------TCCGGGCTC-GACCTCC-AACCCC-ATTGTATT-CCGA---CCTCTTGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TTC--G-GGCGT----CGGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCA---TC------AAACTCT-GCATC--TTTGACGTCTGAGT----AAA-TA-TT-GAA-TCAA-TCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGCC-GCGG-TTT-----GCCGCGCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-AG---CCAACT-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GGTTTAA--TCA--TCC--GCTTGC-GAG-ATC--GA-AGG------CGAC---GGCCGTT--AAA-------------CTT--ATTCAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_ohnowa_CBS112896 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC-----------TCC-GGCCC-GACCTCC-AACCCC--ATGTGAA-TC-TCA-CCTC-TGTTGCCTCGGGGGTG-ACCC-GG-CCCTCT--G-GGTGC----CGGG-GCCCCC-GGC-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TGTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAAATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAG-GCGGCTT-CGC-GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-GA---CGGATC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GACTTCG--TTGGA-CC--GCTTGC-GAG-TAC--GG-GACGT----CCTC---GGCCGTT--AAA-----------CCCTTTTAT-CAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_ohnowa_CBS110949 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC-----------TCC-GGCCC-GACCTCC-AACCCC--ATGTGAA-TC-TCA-CCTC-TGTTGCCTCGGGGGTG-ACCC-GG-CCCTCT--G-GGTGC----CGGG-GCCCCC-GGC-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TGTG-CGTCTGAGT----AAA-TA-TTTGAA-TCAAATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATCGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAG-GCGGCTT-CGC-GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-GA---CGGATC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GACTTCG--TTGGA-CC--GCTTGC-GAG-TAC--GG-GACGT----CCTC---GGCCGTT--AAA-----------CCCTTTTAT-CAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_nubilosa_MURU57 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACTGAGT-GCGGGC-----------GCCA-GCCC-GACCTCC-AACCCC--ATGTTTT-CC--CA-CCA--CGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCA-CC-----GCGC----CGGG-GCCCTC-GCA-GG---ACGCC--TC-------AACGCT-GCATC--TGTG-CGTCGGAGT----AATACAAC--CAA-TCAA-TTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGGTATTCCGGAGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCCAGCCTTGCTGGGTCTTGGGCGCC-GCGGCC-------TCCGCGCGCCTC--AATGTCT-------CCGGCCG-AG---CCGACC-GT--CTCTCA-GCGTTGT-GGC-ACC-A-CTGTTTC--GCTGACGGGG-ACC--GGTCTGG-----CGGCG-CG-CCGTT--AAA-----------CCCTTTCAC-CAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_nubilosa_MURU51 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACTGAGT-GCGGGC-----------GCCA-GCCC-GACCTCC-AACCCC--ATGTTTT-CC--CA-CCA--CGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCA-CC-----GCGC----CGGG-GCCCTC-GCA-GG---ACGCC--TC-------AACGCT-GCATC--TGTG-CGTCGGAGT----AATACAAC--CAA-TCAA-TTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGGTATTCCGGAGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCCAGCCTCGCTGGGTCTTGGGCGCC-GCGGCC-------TCCGCGCGCCTC--AATGTCT-------CCGGCCG-AG---CCGACC-GT--CTCTCA-GCGTTGT-GGC-ACC-A-CTGTTTC--GCTGACGGGG-ACC--GGTCTGG-----CGGCG-CG-CCGTT--AAA-----------CCCTTTCAC-CAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_mexicana TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC-----------CCCCGGCCC-GACCTCC-TACCCC--ATGTGA--CC-TCA-CTA--TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCT-TC--G-GGC------TGTTTGCCCCC-GGC-GG---ACACC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCGGAGTCT-TATGATA-----AA-TC-AATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTCGCTTGGTATTGGGCGCC-GCGGCCT------TCCGCGCGCCCC--AATGTCT-------CCGGCTG-AG---CCATCT-AT--CTCAGA-GCGTTGT-GG--TAA-A-C-GTTCC--GCTTGC-GAGTGC---GA--TGG-----CTGTG-CG-CCGTT--AAA---------CCCCTTTTCTATCAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_marksii TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGT-----------TTC-GGCCC-GACCTCC-AACCCT--TTGTGAA-TC-A-AACCT---GTTGCTTCGGGGGCG-ACCC-TG-CCGTTC--GCGGCG-----CG-GCGCCCCC-GGG-GG---A-AA---TC------AAACACT-GCGTCAATTTG-TGTCGGAGT----ACT-TG-TT--AA-TAAA--CAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCGTGGTATTCCGCGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCGAGTCTGACTCGGTATTGGGCGTC-GCG--TTT---CGA-TGCGCGCCTT--AAAGTTT-------CCGGCTG-GA---CCGTCC-GT--CTCCGA-GCGTTGT-GGCAT-----CTGTCTC--GCTAGG-GAGCCGC--GG-AGGG-----CGTT---GGCCGTT--AAA-----------CACCC-CAT-CAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_lateralis TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCAGAA-GACGCCTCGGCGGAAACGCCGGGGCC-TTCGTCC-AACCCT--TTGTGAA-CG--TA-TCTC-TATTGCCCCGGGGG-A-ACCC-CG-CCTGTC-ACGGGCGT-----GG--GCCCCC-GGC-GG----CCA-ACTC------AAACTCT-GTTTTT-ATTGCCGTCTGAGT-----AA-CAAA--CAAATCAAAACAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCAACCAA-TCCAGCCCCGCTGGGTATTGGGCGTC-GCGGCCT------GCCGCGCGCCTC--AAAGTCT-------ACGGCGG-AA---GCCGCCCGTTCCTCT---GCGTGAT-GACA-CA--TC-GT--C--GCTTGG-GAC-ACG--GGGGTGAG----CG-C-----CCGGA--AAACATCGGCGGAGACGTCGATTTCAA-GGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_jonkershoekensis NNNNNNNNNNNNNNNNNGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC----------CCCCGGGCTC-GACCTCC-AACCCC-ATTGTTGT-CC--GA-CCAC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCTTC---G-GGCGG----CGGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCA---TT------AAACTCT-GCATC--TTTGACGTCTGAGT----ACA--AATT-GAA-TC-AATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGCATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGTC-GCG---TCCG-----CGCGCGCCTT--AAAGTCT-------CCGGCTG-GC--CCTCAATCGT--GTCGCA-GCGTCGT-GATTAGA--TAC---CC--GCTTC--GAATTCC-ACGTGA-GTGCG-CCACG--GGCCGTT--AAA-----------CACTTTC---TACAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_grandis_L.1.2.1 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC----------CTCCGGGCTC-GACCTCC-AACCCC-ATTGTATT-CCGA---CCTCTTGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TTC--G-GGCGT----CGGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCA---TC------AAACTCT-GCATC--TTTGACGTCTGAGT----AAA-TA-TT-GAA-TCAA-TCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGCC-GCGG-TTT-----GCCGCGCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-AG---CCAACT-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GGTTTAA--TCA--TCC--GCTTGT-GAG-ATC--GA-AGG------CGAC---GGCCGTT--AAA-------------CTT--ATTCAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_grandis_CMW10189 TCCGTAGGTGAAACTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC----------CTCCGGGCTC-GACCTTCCAACCCC-ATTGTATT-CCGA---CCTCTTGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-TTC--G-GGCGT----CGGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCA---TC------AAACTCT-GCATC--TTTGACGTCTGAGT----AAA-TA-TT-GAA-TCAA-TCAAAACTTTTAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGCC-GCGG-TTT-----GCCGCGCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-AG---CCAACT-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GGTTTAA--TCA--TCC--GCTTGT-GAG-ATC--GA-AGG------CGAC---GGCCGTT--AAA-------------CTT--ATTCAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_gamsii NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC-----------TCC-GGCCC-GACCTCC-AACCCT-TTTGTGAA-CC-AAAACCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CC-CTT----GTTGC----CGGG-GCCCCC-GGT-GG---ACCAC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-TGTCCGAGT----CAA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATAAACACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAC-GCGGCCTCCG--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------TCGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCTCA-GCGTTGT-GACTTAA--CTGGA-CC--GCTGGCGGAC-GAC--GG-GAGGTTT--CCGC---G-CCGTT--AAA-----------CACTTTT-T-CACAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_fori TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------TCAC-GCCC-GACCTCC-AACCCT--TTGTGAA-C--ACA-TCT--TGTTGCTTCGGGGGCG-ACCC-TG-CCG-GCCC-TG-CGTCG-CCGGGCGCCCCC-GgA-GG---TCT----CC------AAACACT-GCATC--TTTG-CGTCGGAGT-TT-AAA-CA-----AA-TTAAA-CAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCGAAGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGTC-GCGGC--------TCCGCGCGCCTT--AAAGTCT-------CCGGCTG-AG---CCATTC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GGATTTT--TCAA-TTC--GCTTCG-GAG-TGC--GG-GTGG-----CCGC---GGCCGTT--AAA------------TCTTT-ATTCAAAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_flexuosa_CBS111055 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------TCC-GGCCC-AACCTCC-AACCCT--TTGTGAATTC--GA-CCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCCTCT--G-GGTGC----CGGG-GCCCCC-GGC-GG---ACACC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT---ATGA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAG-GCGGCTTCAC--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GACTTAA--TTGGA-CC--GCTTGT-GAG-TAT--GG-GACGT----CCTC---GGCCGTT--AAA----------CTTATTACAC---AAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_flexuosa_CBS110743 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------TCC-GGCCC-AACCTCC-AACCCT--TTGTGAATTC--GA-CCTC-TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCCTCT--G-GGTGC----TGGG-GCCCCC-GGC-GG---ACACC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT---ATGA-TA-TTTGAA-TCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGAG-GCGGCTTCAC--GGCCGCCCGCCTC--AAAGTCT-------CCGGCTG-GA---CCGACC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GACTTAA--TTGGA-CC--GCTTGT-GAG-TAT--GG-GACGT----CCTC---GGCCGTT--AAA----------CTTATTACAC---AAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_cryptica_MURU118 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC-----------GCCC-GCCC-GACCTCC-AACCCC--ATGTTTT-CC---AACCA--TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCG-CC-----GTGC----CGGG-GCCCCC-GGC-GG---ACCCC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT--GATAACGAA----AAATCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGGTATTCCGGAGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTA-CACCCC-TCCAGCCTCGCTGGGTGTTGGGCATC-GCGGCC-------TCCGCGCGCCTC--AATGTCT-------CCGGCCG-AG---CCGACC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GGC-ACA-A-CTGTTTC--GCTTCC-GGG-ACC--GGTCCGG-----CGTCG-CG-CCGTC--AA--------CCCCCTCTCTCAC----AGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_cryptica_MURU115 TCCGTAGGTGAACCTGCGGAGGGATCATTACCGAGT-GAGGGC-----------GCCC-GCCC-GACCTCC-AACCCC--ATGTTTT-CC---AACCA--TGTTGCCTCGGGGGCG-ACCC-GG-CCG-CC-----GTGC----CGGG-GCCCCC-GGC-GG---ACCCC--TC-------AACTCT-GCATC--TTTG-CGTCTGAGT--GATAACGAA----AAATCAA-TCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGGTATTCCGGAGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTA-CACCCC-TCCAGCCTCGCTGGGTGTTGGGCATC-GCGGCC-------TCCGCGCGCCTC--AATGTCT-------CCGGCCG-AG---CCGACC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GGC-ACA-A-CTGTTTC--GCTTCC-GGG-ACC--GGTCCGG-----CGTCG-CG-CCGTC--AA--------CCCCCTCTCTCAC----AGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA Mycosphaerella_colombiensis NNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGATCATTACTGAGT-GAGGGC-----------TCCGGGTCC-GACCTCC-AACCCT--TTGTGAA-CC---AATCT--TGTTGCTTCGGGGGCG-ACCC-TG-CCGCTT---CGGCGGTG--CGG-CGCCCCC-GGA-GG----CCA---TC------AAACACT-GCATC--ATTG-CGTCGGAGT----AAAAG-----TAAATGAAA-CAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTT-CACCAC-TCAAGCCTGGCTTGGTATTGGGCGTC-GCGGT--------GCCGCGCGCCTT--AAAGTCTT------CCGGCTG-AG---CTGTCC-GT--CTCTAA-GCGTTGT-GGC--AA---CTA-TTC--GCTTCG-GAG-GCC--GG-GCGG-----CCGC---GGCCGTT--AAA------------TCTTTCAC---AAGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGGATA ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions = N: 1 - 625 ; CODESET * UNTITLED = Universal: all ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS GAPMODE = NEWSTATE ; END;