NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:04:34] [Matrix accession#: M1803] BEGIN TAXA; TITLE M1803; DIMENSIONS NTAX=52; TAXLABELS Urospora_penicilliformis Ulvaria_3.3DMK Ulva_WA1.3b Ulva_rigida Ulva_curvata Ulva_californica Ulothrix_zonata_UTEX745 Ulothrix_zonata_SAG Pseudoneochloris_marina Pseudendoclonium_basilense Pseudendocloniopsis_botryoides Planophila_laetevirens Phaeophila_dendroides_WA2.4a1 Phaeophila_dendroides_WA1.15D Phaeophila_dendroides_MA2.4a1 Phaeophila_dendroides_FR1.2a2 Percursaria_WA4.20a Percursaria_percursa Oltmannsiellopsis_viridis Ochlochaete_hystrix_MA1.8d1 Ochlochaete_hystrix_MA1.08d2 Monostroma_grevillei Halochlorococcum_moorei Gomontia_polyrhiza Gloeotilopsis_sarcinoidea Gloeotilopsis_planctonica Gloeotilopsis_paucicellularis Eugomontia_sacculata Enteromorpha_sp._WA4.20b Ulva_intestinalis Ulva_intestinalis_SY0104 Endophyton_ramosum Desmochloris_halophila Dangemannia_microcystis Collinsiella_tuberculata Bolbocoleon_piliferum_WAz1 Bolbocoleon_piliferum_WA2.9b2a Bolbocoleon_piliferum_WA1.7b Bolbocoleon_piliferum_WA1.6a Bolbocoleon_piliferum_MA3.1b1 Acrosiphonia_sp Acrosiphonia_duriuscula Acrosiphonia_arcta Acrochaete_viridis_MA1.2d2 Acrochaete_viridis_MA1.2a1 Entocladia_tenuis_WA2.22b3 Entocladia_tenuis_Ma2.6a1 Acrochaete_repens_MA1.1c2a Acrochaete_repens_MA1.1a1 Acrochaete_leptochaete_NY1b Acrochaete_leptochaete_MBLPoly1 Acrochaete_endozoica ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M1803; DIMENSIONS NCHAR=1561; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? 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Planophila_laetevirens 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Phaeophila_dendroides_WA2.4a1 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Percursaria_percursa 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Oltmannsiellopsis_viridis 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Monostroma_grevillei TTATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTAGAGTTTATTTGATGG-TACCTTGCTACTTGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATCCATGCGTAAATCCCGACTCACGAAGGGACGTATTTATTAGATCCAAGACCGACCGTGCT-TGCACG-CTCTTGGTGAATCATGATAACTTCACGAATCGCATGGCCTCGTGCCGGCGATGTTTCATTCAACTTTCTGCCCTATCAA-TTTCGACGGTAGTATAGAGGACTACCGTGGTAGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACAGGGAGGTAGTGACAA-----------TAAATATCAATACTGGGCCTTC--GGGTCCGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGGCCTGCCTTGCTGTCGTCGACGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGAATATAATAGCATGGGATAACACGACAGGACTCTGG-CCTATCGTGTTGGTCTGTAGGACCGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTTGTATTCCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGGAAGACAAACATCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCGGGTGTTTGTTT-GATGACTCCGCCAGCACCTTATGAGAAATC-AAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGG-AGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACATAGGAAGGATTGACAGATTGATAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTGACTGCTGCTTCGGCAGTCGGCACACTTCTTAGAGGGACTGTTGGCGTCTAGCCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCTCTT-AGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATACGTTCAACAAGCT-CCTTGGGCGAAAGGTCCGGGTAATCTT-TGAAACCGTATCGTGATGGGGATAGAACATTGCAATTATTGTTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGTGAGTCATCATCTCGCGTTGATTACGT-CCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGTGCTGGTGAANACTTCGGATTGGTGAAAAGTTGT Halochlorococcum_moorei TTATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTAGAGTTTATTTGATGG-TACCTTACTACTCGGATAACCGTAGTAAAGCTACAGCTAATACGTGCGTAAATCCCGACTCACGAAGGGACGTATTTATTAGATTCAAGACCGACCGTGCT-TGCACG-ATCTTGGTGAATCATGGTAACTTCACGAATCGCATGGCCTCGTGCCGGCGATGTTTCATTCAACTTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGTAGTATAGAGGACTACCGTGGTAGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACAGGGAGGTAGTGACAA-----------TAAATATCAAAGGCCGGCCTTA--TGGTCGGCCTATTGGAATGAGTACAATTTAAAATCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGGCCCGCCTTGCTGTCGTCGACGATGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGAATATGATAGCATGGGATAACACGACAGGACTCTGG-CCTATCGTGTTGGTCTGTAGGACCGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTCCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGGAAGACGAACATCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCGGACGTTTGTTG-AATGACTCCGCCAGCACCTCATGAGAAATC-AAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGG-AGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACATAGGAAGGATTGACAGATTGATAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTGGCGATTGCTTTGGCAGTCGGTACACTTCTTAGAGGGACTGTTGGCGTCTAGCCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTT-AGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATACGTTCAACGAGCT-CCTTGTCCGAAAGGTCTGGGTAATCTT-TGAAACCGTATCGTGATGGGGATAGAACATTGCAATTATTGTTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCATCTCGCGTTGATTACGT-CCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAACGTGCTGGTGAAGCGTTAGGACTGGCGGGAATTTCG Gomontia_polyrhiza TTATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTAGAGTTTATTTGATGG-TACCTTGCTACTTGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATCCATGCGTAAATCCCGACTCACGAAGGGACGTATTTATTAGATCCAAGACCGACCGTGCT-TGCACG-CTCTTGGTGAATCATGATAACTTCACGAATCGCATGGCCTCGTGCCGGCGATGTTTCATTCAACTTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGTAGTATAGAGGACTACCGTGGTAGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACAGGGAGGTAGTGACAA-----------TAAATATCAATACTGGGCCTTC--GGGTCCGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGGCCTGCCTTGCTGTCGTCGACGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGAATATAATAGCATGGGATAACACGACAGGACTCTGG-CCTATCGTGTTGGTCTGTAGGACCGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTTGTATTCCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGGAAGACAAACATCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCGGGTGTTTGTTT-GATGACTCCGCCAGCACCTTATGAGAAATC-AAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGG-AGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACATAGGAAGGATTGACAGATTGATAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTGACTGCTGCTTCGGCAGCCGGCACACTTCTTAGAGGGACTGTTGGCGTCTAGCCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTT-AGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATACGTTCAACAAGCT-CCTTGGGCGAAAGGTCCGGGTAATCTT-TGAAACCGTATCGTGATGGGGATAGAACATTGCAATTATTGTTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGTGAGTCATCATCTCGCGTTGATTACGT-CCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGTGCTGGTGAAGACTTCGGATTGGTGAGAAGTTGT Gloeotilopsis_sarcinoidea 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Gloeotilopsis_planctonica 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Gloeotilopsis_paucicellularis 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Eugomontia_sacculata 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Enteromorpha_sp._WA4.20b 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Ulva_intestinalis 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Ulva_intestinalis_SY0104 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Endophyton_ramosum 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Desmochloris_halophila 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Dangemannia_microcystis 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Collinsiella_tuberculata 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Bolbocoleon_piliferum_WAz1 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Bolbocoleon_piliferum_MA3.1b1 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Acrosiphonia_sp 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Acrosiphonia_duriuscula 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Acrosiphonia_arcta 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Acrochaete_leptochaete_MBLPoly1 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Acrochaete_endozoica TTATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTAGAGTTTATTTGATGG-TACCACACTACTCGGATAACCGTTCTAAATGAACAGCTAATACGTGCGTAACTCCCGACTCACGAAGGGACGTATTTATTAGATTCGAGACCGACCGTGCTCTGCACG-TTCTTGGTGAATCATGGTAACTTCACGAATCGCAGGGT-TCATCCCGGCGATGTTTCATTCAACTTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGTAGTATAGAGGACTACCGTGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACAGGGAGGTAGTGACAA-----------TAAATATCAGTTCTGGGCCA-A--CGGTCCGGTGATTGGAATGAGTACAATCTAAACACCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGGCCTACCTTCTTGCTGTCAGCGATGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGAATATAATAGCATGGGATAACACGACAGGACTCTGG-CCTATCGTGTTGGTCTATAGGACCAGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTCCGTTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTACGGAAGACGAACATCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTGAGGGATCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCGGGTGTTTTTTT-GATGACTCCGCCAGCACCTCATGAGAAATC-AAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGG-AGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACATAGGAAGGATTGACAGATTGATAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCCGCCTGCTAAATAGTGGCGTCTGCATCTGCAGTCG-AACACTTCTTAGAGGGACTGTTGGCGTCTAGCCAATGGAAGTTGGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTT-AGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATACGTTCAACAAGCT-CCTTGGCCGAAAGGTCCGGGTAATCTT-TGAAACCGTATCGTGATGGGGATAGAACATTGCAATTTTTGTTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCATCTCGCGTTGATTACGT-CCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAACGTGCTGGTGAAGCGTTAGGACTGGCGGGAATTTCG 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