#NEXUS BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=26; TAXLABELS Aphis_gossypii_AY227082 Dysaphis_apiifolia_petroselini_JF776569 Dysaphis_newskyi_ossiannilssoni_JF776568 Dysaphis_plantaginea_EU701636 Dysaphis_plantaginea_JF521490 Dysaphis_plantaginea_JN546627 Dysaphis_plantaginea_JN546628 Dysaphis_plantaginea_JN546629 'Dysaphis pyri CZ 05-43' 'Dysaphis pyri FR J11-05' 'Dysaphis pyri IT 09-20' 'Dysaphis pyri LT 04-107' 'Dysaphis pyri LT 04-133' 'Dysaphis pyri LT 04-25' 'Dysaphis pyri LT 05-104' 'Dysaphis pyri LT 11-43' 'Dysaphis pyri LT 11-58' 'Dysaphis pyri TR 11-32' 'Dysaphis pyri TR 11-33' 'Dysaphis pyri TR 11-37' 'Dysaphis reaumuri GE J11-12' 'Dysaphis reaumuri GE J11-13' 'Dysaphis reaumuri GE J11-23' 'Dysaphis reaumuri TR 11-23' Dysaphis_rumecicola_GU978795 Toxoptera_citricida_EF591607 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE 'Dysaphis-COI'; DIMENSIONS NCHAR=217; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Aphis_gossypii_AY227082 TTTTAGGAGCAATTAATTTCATCTGTACTATCTTAAATATAATACCTAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTATTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATATTATTAATTTTATCCTTACCTGTATTAGCTGGTGCTATTACTATATTATTAACAGATCGAAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGTGGGGGAGACCCTATTCT Dysaphis_apiifolia_petroselini_JF776569 TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACTATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCCATTTTATTAATTTTATCCTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATACTATTAACTGACCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGGATCCTAATTTT Dysaphis_newskyi_ossiannilssoni_JF776568 TTTTAGGAGCAATTAATTTCATTTGTACTATTTTAAACATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTTCCTTGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACAATACTATTAACTGACCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGGATCCCAATTTT Dysaphis_plantaginea_EU701636 TTCTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTTT Dysaphis_plantaginea_JF521490 TTCTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTTT Dysaphis_plantaginea_JN546627 TTCTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTTT Dysaphis_plantaginea_JN546628 TTCTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTTT Dysaphis_plantaginea_JN546629 TTCTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTCTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCTCTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATTTT 'Dysaphis pyri CZ 05-43' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri FR J11-05' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri IT 09-20' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri LT 04-107' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri LT 04-133' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri LT 04-25' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri LT 05-104' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri LT 11-43' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri LT 11-58' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri TR 11-32' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri TR 11-33' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis pyri TR 11-37' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAACAATATAAAATTAAATCAAATCCCTCTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTACTAATCTTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTCTTTGATCCAGCAGGAGGAGGTGATCCAATCCT 'Dysaphis reaumuri GE J11-12' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATTCTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATCTT 'Dysaphis reaumuri GE J11-13' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATTCTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATCTT 'Dysaphis reaumuri GE J11-23' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATTCTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATCTT 'Dysaphis reaumuri TR 11-23' TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACAATTTTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATTCCACTTTTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCTATTTTATTAATTCTATCTTTACCTGTATTAGCAGGTGCAATTACAATACTATTAACTGATCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCAATCTT Dysaphis_rumecicola_GU978795 TTTTAGGAGCAATTAATTTTATTTGTACTATTTTAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATCCCACTTTTTCCATGATCAATTTTAATTACAGCCATTTTATTAATTCTATCCTTACCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACAATACTATTAACTGACCGTAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGAGGAGATCCTATCTT Toxoptera_citricida_EF591607 TTCTAGGAGCAATTAATTTCATTTGTACAATTATAAATATAATACCAAATAATATAAAATTAAATCAAATCCCTTTATTCCCATGATCAATTTTAATTACAGCAATTTTATTAATTTTATCTTTACCAGTTTTAGCCGGTGCTATTACCATACTATTAACTGATCGAAATCTTAATACTTCATTTTTTGATCCAGCAGGAGGGGGAGACCCTATTCT ; END; BEGIN TREES; Title 'Dysaphis-COI-BI'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Aphis_gossypii_AY227082, 2 Dysaphis_apiifolia_petroselini_JF776569, 3 Dysaphis_newskyi_ossiannilssoni_JF776568, 4 Dysaphis_plantaginea_EU701636, 5 Dysaphis_plantaginea_JF521490, 6 Dysaphis_plantaginea_JN546627, 7 Dysaphis_plantaginea_JN546628, 8 Dysaphis_plantaginea_JN546629, 9 'Dysaphis pyri CZ 05-43', 10 'Dysaphis pyri FR J11-05', 11 'Dysaphis pyri IT 09-20', 12 'Dysaphis pyri LT 04-107', 13 'Dysaphis pyri LT 04-133', 14 'Dysaphis pyri LT 04-25', 15 'Dysaphis pyri LT 05-104', 16 'Dysaphis pyri LT 11-43', 17 'Dysaphis pyri LT 11-58', 18 'Dysaphis pyri TR 11-32', 19 'Dysaphis pyri TR 11-33', 20 'Dysaphis pyri TR 11-37', 21 'Dysaphis reaumuri GE J11-12', 22 'Dysaphis reaumuri GE J11-13', 23 'Dysaphis reaumuri GE J11-23', 24 'Dysaphis reaumuri TR 11-23', 25 Dysaphis_rumecicola_GU978795, 26 Toxoptera_citricida_EF591607; TREE 'Dysaphis-COI-BI' = ((1:0.026682,26:0.026693)0.95:0.009863,((25:0.018829,(3:0.009504,2:0.009504)1.00:0.010049)0.86:0.00854,(((8:8.28E-4,7:8.18E-4,6:7.85E-4,4:8.19E-4,5:8.23E-4)1.00:0.009802,(21:9.39E-4,22:9.24E-4,23:9.05E-4,24:9.2E-4)1.00:0.00957)0.95:0.011184,(14:7.91E-4,12:7.55E-4,13:8.16E-4,9:7.51E-4,15:8.1E-4,11:0.002237,18:7.55E-4,19:8.06E-4,20:7.91E-4,16:7.74E-4,10:8.24E-4,17:8.21E-4)1.00:0.020079)0.56:0.006709)0.89:0.008117); END; BEGIN TREES; Title 'Dysaphis-COI-MP'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Aphis_gossypii_AY227082, 2 Dysaphis_apiifolia_petroselini_JF776569, 3 Dysaphis_newskyi_ossiannilssoni_JF776568, 4 Dysaphis_plantaginea_EU701636, 5 Dysaphis_plantaginea_JF521490, 6 Dysaphis_plantaginea_JN546627, 7 Dysaphis_plantaginea_JN546628, 8 Dysaphis_plantaginea_JN546629, 9 'Dysaphis pyri CZ 05-43', 10 'Dysaphis pyri FR J11-05', 11 'Dysaphis pyri IT 09-20', 12 'Dysaphis pyri LT 04-107', 13 'Dysaphis pyri LT 04-133', 14 'Dysaphis pyri LT 04-25', 15 'Dysaphis pyri LT 05-104', 16 'Dysaphis pyri LT 11-43', 17 'Dysaphis pyri LT 11-58', 18 'Dysaphis pyri TR 11-32', 19 'Dysaphis pyri TR 11-33', 20 'Dysaphis pyri TR 11-37', 21 'Dysaphis reaumuri GE J11-12', 22 'Dysaphis reaumuri GE J11-13', 23 'Dysaphis reaumuri GE J11-23', 24 'Dysaphis reaumuri TR 11-23', 25 Dysaphis_rumecicola_GU978795, 26 Toxoptera_citricida_EF591607; TREE 'Dysaphis-COI-MP' = (1,26,((11,(10,(((((17,20)0.0301,(15,14)0.0265)0.0048,(16,18)0.0263)0.0026,(19,9)0.0203)0.0064,(13,12)0.0247)0.0629)0.6608)0.9987,(((6,((8,7)0.1055,(4,5)0.1067)0.1849)0.8618,(21,(22,(23,24)0.1682)0.2332)0.8328)0.3562,(25,(3,2)0.7606)0.3799)0.3096)0.7768); END; BEGIN TREES; Title 'Dysaphis-COI-ML'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Aphis_gossypii_AY227082, 2 Dysaphis_apiifolia_petroselini_JF776569, 3 Dysaphis_newskyi_ossiannilssoni_JF776568, 4 Dysaphis_plantaginea_EU701636, 5 Dysaphis_plantaginea_JF521490, 6 Dysaphis_plantaginea_JN546627, 7 Dysaphis_plantaginea_JN546628, 8 Dysaphis_plantaginea_JN546629, 9 'Dysaphis pyri CZ 05-43', 10 'Dysaphis pyri FR J11-05', 11 'Dysaphis pyri IT 09-20', 12 'Dysaphis pyri LT 04-107', 13 'Dysaphis pyri LT 04-133', 14 'Dysaphis pyri LT 04-25', 15 'Dysaphis pyri LT 05-104', 16 'Dysaphis pyri LT 11-43', 17 'Dysaphis pyri LT 11-58', 18 'Dysaphis pyri TR 11-32', 19 'Dysaphis pyri TR 11-33', 20 'Dysaphis pyri TR 11-37', 21 'Dysaphis reaumuri GE J11-12', 22 'Dysaphis reaumuri GE J11-13', 23 'Dysaphis reaumuri GE J11-23', 24 'Dysaphis reaumuri TR 11-23', 25 Dysaphis_rumecicola_GU978795, 26 Toxoptera_citricida_EF591607; TREE 'Dysaphis-COI-ML' = (((11,(17,((((12,9)0.0600,(20,16)0.0710)0.0060,((13,15)0.0660,(19,10)0.0700)0.0050)0.0010,(14,18)0.0750)0.0510)0.6390)0.9570,(((21,22)0.2320,(23,24)0.2310)0.8290,(7,((8,5)0.1700,(6,4)0.1820)0.1110)0.9300)0.3670)0.2670,(25,(3,2)0.8880)0.4920,(1,26)0.8640); END;