#NEXUS

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	Punctelia_rudecta_1240_Japana               ?CTCCCGGGGGCTTTCGCCCCTAACTCTTCACCCATTGTCTACATACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGATTCCTCCCGCGCTGGCTTTCGGGTTGGTAAGCGTCCGTCAGAGGCCCATTCAAATCCTTTTTATCAGTGTCGTCCGAGTATAT----AAAAATATTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGCGGCGTGCCCGAAACGCAGTGGCGGTCCGACGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGTCGTGACCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAA?ATCGACGATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTTCATATAAATTATGATAATTAAAGGGACTAATTTACTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGG?GAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCC?CCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACC?GTAG?GAAGTATGTTGTTTAATTTGATAGTCCGCAAAAAACCTTACC?CAATTTGAATATTTATATTTTTTTTTTATTGTTTTCTTCTTAATTTTCTTCTAATAACGTGTTCAGCA--TGTAAAAAGAAGAAAGTTAATAAAGAGACAATAATATATATTTACAAGCGTTGCACGGC?GTCTTCAGTTAATGTCG?GAGACTTTGG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGATCTGTGAAACCACCATGGCATTAGACGATGAAGCCCCGTCGGACAAGACGAAAGAGCCAAAGCATGACCATGGTGGTTGTGGAAACATACAACCTGAAGTACGACGGGAGGGACTCCGACTGACTGGGACTTGGAAAGCCCAAAAGGGCGACAAGGAAAAC?AGGGTCAGCAGCCGGAGAA?AAACCCATTACGCCACAAATGGCCCTCAATATCTTCCGCCACATATCTACAGAAGATATCAAACGAATGGGATTAAGCAATGACTATGCACGTCCCGAATGGATGATCATCACTGTACTTCCCGTGCCACCTCCGCCTGTACGGCCTASCATCTCTGTGGACGGAGGTAACGGTCCCCGTGGCGAAGACGACTTGAC?TACAAGCTAGGTGATATCATCCGTGCGAACGGCAACGTGCGGCGTTGCGAAACAGAGGGCTCTCCTGCGCACGTCGTCAATGAGTTCGAGCAGTTGTTGCAATTTCACGTTGCTACATACATGGACAACGAC
	Punctelia_rudecta_1343_Chile                GCTCCCGGGGGCT?CGGCCCC?AACTCTTCACCCATTGTGTACATACCTTTGTTGCTTTGGCC?ACCTCGGGATTCCTCCCGCGCTGGCTTTCGGGTTGGTAAGCGTCCGTCAGAGGCCCATTCAAATCCTTTTTATCAGTGTCGTCCGAGTATAT----AAAAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGCGGCGTGCTCGAAACGCAGTGGCGGTCCGACGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTATCCCGCTTTGAAAGCTCGCGTCGTGACTGGCCAGACAACCCCATTAGCTTC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Punctelia_rudecta_3146_India                ?????????????????????????TCTTCACACGTTGTCTACGTAC????GTTGSTTTGGCGGACCTCGG?ATTCCTCCCGCGCTGGCTTTCGGGTTGGTAAGCGTCCGTCAGAGGCCCATTCAAATCCTTTTTATCAGTGTCGTCCGAGTATAT----AAAAATATTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGCGGCGTGCCCGAAACGCAGTGGCGGTCCGACGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGTCGTGACCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTC??????????????????????????????????CTATG?CGAATAAAATTCTAGG?AGAA????GATAATGTCCTTG?CTGCCTAT?TGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTTCATATAAATTATGATAATTAAAGGGACTAATTTACTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAGTCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATATTTTTTTTTT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCGGCTTTGCAAACCTAAAATGATCTGTGAAACCACCATGGCATTAGACGATGAAGCCCCGTCGGACAAGACGAAAGAGCCAAAGCATGACCATGGTGGTTGTGGAAACATACAACCTGAAGTACGACGGGAGGGACTCCGACTGACTGGGACTTGGAAAGCCCAAAAGGGCGACGAGGAAAACGAGGGTCAGCAGCCGGAGAAGAAACCCATTACGCCACAAATGGCCCTCAATATCTTCCGCCACATATCTACAGAAGATATCAAACGAATGGGATTAAGCAATGACTATGCACGTCCCGAATGGATGATCATCACTGTACTTCCCGTGCCACCTCCGCCTGTACGGCCTAGCATCTCTGTGGACGGAGGTAACGGTCCCCGTGGCGAAGACGACTTGACATACAAGCTAGGTGATATCATCCGTGCGAACGGCAACGTGCGGCGTTGCGAAACAGAGGGCTCTCCTGCGCACGTCGTCAATGAGTTCGAGCAGTTGTTGCAATTTCACGTTGCTACATACATGGACAACGAC
	Punctelia_rudecta_3147_Japana               ??TCCCGGGGGCTTTCTCCCCTAACTCTTCACCCATTGTCTACATACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGATTCCTCCCGCGCTGGCTTTCGGGTTGGTAAGCGTCCGTCAGAGGCCCATTCAAATCCTTTTTATCAGTGTCGTCCGAGTATAT----AAAAATATTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGCGGCGTGCCCGAAACGCAGTGGCGGTCCGACGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGTCGTGACCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTCCTCTTTCATCATCGCACAGATGATGCA?GATCGACGATGTCCAATAAAATTCTCGGGAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCASCAGTC?CGGTAATACGTAGAACACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGGTTAAAGGGTWCCTAGACGGTA?ATCAAGCTTTTTCATAT?AATTATGATAATTAAAGGGACTAATTTACTAGAGTTACTTAC?AGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCCAA?GAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCCTCCCCTTATGGGAT?ACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTGTAACCAACCGGATTAGATACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATGTAAGCTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCA?GAGTAATTTGGCAACATTGGAAT?GAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTGCGGCTTTGCAACCCTAAAATGATCTGTGAAACCACCATGGCATTAGACGATGAAGCCCCGTCGGACAAGACGAAAGAGCCAAAGCATGACCATGGTGGTTGTGGAAACATACAACCTGAAGTACGACGGGAGGGACTCCGACTGACTGGGACTTGGAAAGCCCAAAAGGGCGACGAGGAAAACGAGGGTCAGCAGCCGGAGAAGAAACCCATTACGCCACAAATGGCCCTCAATATCTTCCGCCACATATCTACAGAAGATATCAAACGAATGGGATTAAGCAATGACTATGCACGTCCCGAATGGATGATCATCACTGTACTTCCCGTGCCACCTCCGCCTGTACGGCCTAGCATCTCTGTGGACGGAGGTAACGGTCCCCGTGGCGAAGACGACTTGACATACAAGCTAGGTGATATCATCCGTGCGAACGGCAACGTGCGGCGTTGCGAAACAGAGGGCTCTCCTGCGCACGTCGTCAATGAGTTCGAGCAGTTGTTGCAATTTCACGTTGCTACATACATGGACAACGAC
	Punctelia_rudecta_3149_Japana               ??????????????????????????TTTCACCCGTTGTCTACGTACCTTCGTTG?TTTGGCGGACCTCGGGATTCCTCCCGCGCTGGCTTTCGGGTTGGTAAGCGTCCGTCAGAGGCCCATTCAAATCCTTTTTATCAGTGTCGTCCGAGTATAT----AAAAATATTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGCGGCGTGCCCGAAACGCAGTGGCGGTCCGACGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGTCGTGACCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGCGGCTTTGCAAACCTAAAATGATCTGTGAAACCACCATGGCATTAGACGATGAAGCCCCGTCGGACAAGACGAAAGAGCCAAAGCATGACCATGGTGGTTGTGGAAACATACAACCTGAAGTACGACGGGAGGGACTCCGACTGACTGGGACTTGGAAAGCCCAAAAGGGCGACGAGGAAAACGAGGGTCAGCAGCCGGAGAAGAAACCCATTACGCCACAAATGGCCCTCAATATCTTCCGCCACATATCTACAGAAGATATCAAACGAATGGG?TTAAGCAATGACTATGCACGTCCCGAATGGATGATCATCACTGTACTTCCCGTGCCACCTCCGCCTGTACGGCCTAGCATCTCTGTGGACGGAGGTAACGGTCCCCGTGGCGAAGACGACTTGACATACAAGCTAGGTGATATCATCCGTGCGAACGGCAA?GTGCGGCGTTGCGAAACAGAGGGCTCTCCTGCGCACGTCGTCAATGAGTTCGAGCAGTTGTTGCAATTTCACGTTGCTACATACATGGACAACGAC
	Punctelia_rudecta_3150_Kenya                ?????????????????CC???AATTCTTCACCCGTTGTCTACGTACCTT?GTTG?TTTGGCGGACCTCGGGATTCCTCCCGCGCTGGCTTTCGGGTTGGTAAGCGTCCGTCAGAGGCCCATTCAAATCCTTTTTATCAGTGTCGTCCGAGTATAT----AAAAATATTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGCGGCGTGCCCGAAACGCAGTGGCGGTCCGACGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGTCGTGACCGGCCAGACAACCCCATTAGCTT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TAACCAACATGATTAGATACCCTTGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCCCCTCATGAGTAATTTGTCAACCTTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTTTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAGTCCGCAAAAAACCTTACCACAATTAGAATATTTATATTTTTTTTTTATTGTTTTCTTCTTAATTTTCTTCTAATAACGTGTTCAGCA--TGTAAAAAGAAGAAAGTTAATAAAGAGACAATAATATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGACTTTGGTTAGTTCCA?TAA?????????????????????????????????????????????????GCGGCTTTGCAAACCTAAAATGATCTGTGAAACCACCATGGCATTAGACGATGAAGCCCCGTCGGACAAGACGAAAGAGCCAAAGCATGACCATGGTGGTTGTGGAAACATACAACCTGAAGTACGACGGGAGGGACTCCGACTGACTGG?ACTTGGAAAGCCCAAAAGGGCGACGAGGAAAACGAGGGTCAGCAGCCGGAGAAGAAACCCATTACGCCACAAATGGCCCT?AATATCTTCCGCCACATATCTACAGAAGATATCAAACGAATGGG?TTAAGCAATGACTATGCACGTCCCGAATGGATGATCATCACTGTACTTCCCGTGCCACCTCCGCCTGTACGGCCTAGCATCTCTGTGGACGGAGGTAACGGTCCCCGTGGCGAAGACGACTTGACATACAAGCTTGGTGATATCATCCGTGCGAACGGCAATGTGCGGCGTTGCGAAACAGAGGGCTCTCCTGCGCACGTCGTCAATGAGTTCGAGCAGTTGTTGCAATTTCACGTTGCTACATACATGGACAACGAC
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	Punctelia_rudecta_3521_USA                  GCTCCCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCACTGTATACGTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACTTCGGGGT-CTTTCCGCGCTGACTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCCATTCAAATCCGCTTTATCAGTGACGTCCGAGTATATATAAAAAAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGTACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCTCTCGCCCCCGCGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTTCGGTGCGACTTTAAGCGTTGTAAATTCTATCCCGCTTTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCCTATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGACTATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTACATATAAATTATGTTAATTAAA-GGACTAATTTGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAATGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGAC?AATGCTTTGTGTCACACACAGGATTA?ATACCCTAGTATTTGAA??CAAAAATGATGAATGTAATAGATTAGATA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGCGGCTTTGCAAACCTAAAATGATCTGTGAAACCACCATGGCATTAGACGATGAAGCCCCGTCGGACAAGACGAAAGAGCCAAAGCATGACCATGGTGGTTGTGGAAACATACAACCTGAAGTACGACGGGAGGGACTCCGACTGACTGGTACATGGAAAGCCCAAAAGGGCGACGAGGAAAACGAGGGTCAGCAGCCGGAGAAGAAACCCATTACGCCACAAATGGCCCTTAATATCTTCCGCCACATATCTACAGAAGATATCAAACGAATGGGGTTAAGCAATGACTATGCACGTCCCGAATGGATGATCATCACTGTACTTCCCGTGCCACCTCCGCCTGTACGGCCTAGCATCTCTGTGGACGGAGGTAACGGTCCCCGTGGCGAAGACGACTTGACATACAAGCTTGGTGATATCATCCGTGCGAACGGCAATGTGCGGCGTTGCGAAACAGAGGGCTCTCCTGCGCACGTCGTCAATGAGTTCGAGCAGTTGTTGCAATTTCACGTTGCTACATACATGGACAAGAAC
	Punctelia_rudecta_3522_USA                  ?CTCCCGGGGGTTTC??CCCCCAACTCTTCACCCACTGTATACGTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACTTCGGGGT-CTTCCCGCGCTGACTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTC?TATGCCCATTCAAATCCGCTTTATCAGTGACGTCCGAGTATATATATAAAAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATC?ATGAAGAACGCA?CGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGTACCCCTCAAGCGTACCTGGGTATTGGGCTCTCGCCCCCGCGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGTGTGACTTTAAGCGTTGTAAATTCTATCCCGCTTTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCCTATTAGCTTC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGCGGCTTTGCAAACCTAAAATGATCTGTGAAACCACCATGGCATTAGACGATGAAGCCCCGTCGGACAAGACGAAAGAGCCAAAGCATGACCATGGTGGTTGTGGAAACATACAACCTGAAGTACGACGGGAGGGACTCCGACTGACTGGTACATGGAAAGCCCAAAAGGGCGACGAGGAAAACGAGGGTCAGCAGCCGGAGAAGAAACCCATYACGCCACAAATGGCCCTTAATATCTTCCGCCACATATCTACAGAAGATATCAAACGAATGGGGTTAAGCAATGACTATGCACGTCCCGAATGGATGATCATCACTGTACTTCCCGTGCCACCTCCGCCTGTACGGCCTAGCATCTCTGTGGACGGAGGTAACGGTCCCCGTGGCGAAGACGACTTGACATACAARCTTGGTGATATCATCCGTGCGAACGGCAATGTGCGGCGTTGCGAAACAGAGGGCTCTCCTGCKCACGTCGTCAATGAGTTCGAGGA????????????????????????????????????????
	Punctelia_rudecta_3910_Chile                GCTCCCGGGGGCTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCATTGTGTACATACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGATTCCTCCCGCGCTGGCTTTCGGGTTGGTAAGCGTCCGTCAGAGGCCCATTCAAATCCTTTTTATCAGTGTCGTCCGAGTATAT----AAAAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACA?TGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGCGGCGTGCTCGAAACGCAGTGGCGGTCCGACGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTATCCCGCTTTGAAAGCTCGCG?CGTGA?CGGCCAGACAACCCCAT?AGCT?C???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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	Punctelia_rudecta_Normo_B                   GCTCCCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCACTGTATACGTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACTTC-GGGGTCTTCCCGCGCTGACTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCCATTCAAACCCGCTTTATCAGTGACGTCCGAGTATATATATAAAAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGTACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCTCTCGCCCCCGCGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGTGTGACTTTAAGCGTTGTAAATTCTATCCCGCTTTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCCTATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGACTATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTACATATAAATTATGTTAATTAAA-GGACTAATTTGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAGGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATGATCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATA--TTTTTTTTATTGTTTTCTTCTTAATTTTCTTCTAATAACATATTCAACA--TGTAAAAAGAAGAAAGTTAATAAAGAGGCAATAATATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGACTTTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATTTTTATATAGAGTAGTTCCCCGCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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	Punctelia_subpraesignis_H                   GCTCCCGGGGGCTCCGGCCCCCACCTCTTCACCCATTGTTCATTCACCCTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGTCTCTCCCGCGCTGGCTTCCGGGTCAGTGAGCGTCCGCCAGAGGCCCATCCAAATCCTTTTTATCAGTGACGTCCGAGTATATATAAATAAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCCCAGCTTGGTATTGGGTTCTCGCCCCCGTGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGAGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTCTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Punctelia_subrudecta_10241_N                GCTCCCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCACTGCCTACATACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGTTCCTCCCGCGCTGTCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCTATTTAAACCCTCTTTAATAGTGACGTCCGAGAGTATATATAAA--TAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGAGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGACTATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTTCATATAAATTATGATAATAAAAGGGACTAATTTGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGGAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAGTCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATA-TTTTTTTTTATTGTTTTCTTCTTAATTTTCTTCTAATTACATATTCAGCA--TGTAAAAACAAGAAAGTTAATAAAAAGACAATAATATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGACTTTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATTTTTATATAGAGTAGTTCCCCGCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Punctelia_subrudecta_10242_N                GCTCCCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCACTGCCTACATACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGTTCCTCCCGCGCTGTCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCTATTTAAACCCTCTTTAATAGTGACGTCCGAGAGTATATATAAA--TAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCATCGCCCCCGAGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGACTATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTTCATATAAATTATGATAATAAAAGGGACTAATTTGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGGAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAGTCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATA-TTTTTTTTTATTGTTTTCTTCTTAATTTTCTTCTAATTACATATTCAGCA--TGTAAAAACAAGAAAGTTAATAAAAAG?CAATAATATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGACTTTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATTTTTATATAGAGTAGTTCCCCGCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Punctelia_subrudecta_10243_N                GCTCCCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCACTGCCTACATACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGTTCCTCCCGCGCTGTCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCTATTTAAACCCTCTTTAATAGTGACGTCCGAGAGTATATATAAA--TAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGAGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGACTATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTTCATATAAATTCTGATAATAAAAGGGACTAATTTGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGGAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAGTCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATA-TTTTTTTTTATTGTTTTCTTCTTAATTTTCTTCTAATTACATATTCAGCA--TGTAAAAACAAGAAAGTTAATAAAAAGACAATAATATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGACTTTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATTTTTATATAGAGTAGTTCCCCGCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Punctelia_subrudecta_10244_N                GCTCCCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCACTGCCTACATACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGTTCCTCCCGCGCTGTCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCTATTTAAACCCTCTTTAATAGTGACGTCCGAGAGTATATATAAA--TAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGAGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCC?ATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGACTATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTTCATATAAATTATGATAATAAAAGGGACTAATTTGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGGAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAGTCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATA-TTTTTTTTTATTGTTTTCTTCTTAATTTTCTTCTAATTACATATTCAGCA--TGTAAAAACAAGAAAGTTAATAAAAAGACAATAATATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGACTTTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATTTTTATATAGAGTAGTTCCCCGCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Punctelia_subrudecta_10245_N                GCTCCCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCACTGCCTACATACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGTTCCTCCCGCGCTGTCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCTATTTAAACCCTCTTTAATAGTGACGTCCGAGAGTATATATAAA--TAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGAGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGACTATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTTCATATAAATTATGATAATAAAAGGGACTAATTTGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGGAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAGTCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATA-TTTTTTTTTATTGTTTTCTTCTTAATTTTCTTCTAATTACATATTCAGCA--TGTAAAAACAAGAAAGTTAATAAAAAGACAATAATATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGACTTTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATTTTTATATAGAGTAGTTCCCCGCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Punctelia_subrudecta_10250_N                GCTCCCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCACTGCCTACATACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGTTCCTCCCGCGCTGTCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCTATTTAAACCCTCTTTAATAGTGACGTCCGAGAGTATATATAAA--TAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGAGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGACTATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTTCATATAAATTATGATAATAAAAGGGACTAATTTGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGGAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAGTCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATA-TTTTTTTTTATTGTTTTCTTCTTAATTTTCTTCTAATTACATATTCAGCA--TGTAAAAACAAGAAAGTTAATAAAAAGACAATAATATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGACTTTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTACTTTATTTTTATATAGAGTAGTTCCCCGCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Punctelia_subrudecta_3219_Australia         GCTCCCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCATTGTCTACCTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGTCC-CCCCGCGCTGGCTCTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCGGAGGCCCATTCAAATTCTCTTTATCAGTGACGTCCGAGTATATATAAAAA--TAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGACTATGTTGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTACATATAAATTATGATAATTAAA-GGACTAATTTACTAGAGTTACTTACGAGGGGGCATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGCGGCTTTGCAAACCTAAAATGATCTGTGAAACCACCATGGCATTAGACGATGAAGCCCCGTCGCACAAGACGAAAGAGCCAAAGCATGACCATGGTGGTTGTGGAAACATACAACCTGAAGTACGACGGGAGGGACTCCGACTGACTGGTACATGGAAAGCCCAAAAGGGCGACGAGGAAAACGAGGGTCAGCAGCCGGAGAAGAAACCCAT?ACGCCACAAATGGCCCTTAATATCTTCCGCCACATATCTACAGAAGATATCAAACGAATGGGGTTAAGCAATGACTATGCACGTCCCGAATGGATGATCATCACTGTACTTCCCGTGCCACCTCCGCCTGTACGGCCTAGCATCTCTGTGGACGGAGGTAACGGTCCCCGTGGCGAAGACGACTTGACATACAAGCTTGGTGATATCATCCGTGCGAACGGCAA?GTGCGGCGTTGCGAAACAGAGGGCTCTCCTGCGCACGTCGTCAATGAGTTCGAGCAGTTGTTGCAATTTCACGTTGCTACATACATGGACAACGAC
	Punctelia_subrudecta_PARS3_N                GCTCCCGGGGGTTTCGGCCCCCAACTCTTCACCCACTGCCTACATACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGTTCCTCCCGCGCTGTCTTTCGGGTCGGTGAGCGTCCGTCAGAGGCCTATTTAAACCCTCTTTAATAGTGACGTCCGAGAGTATATATAAA--TAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGCACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCCTTCGCCCCCGAGGCGTGCCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGCGTGACTTTAAGCGTAGTAAATTTTCTCCCGCTTTGAAAGCTCGCGCCGTGGCCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGACTATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTTCATATAAATTCTGATAATAAAAGGGACTAATTKGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTCGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGGAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAG????????????????????????????????????????????????????????????????--???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGCGGCTTTGCAAACCTAAAATGATATGTGAAACCACCATGGCATTAGACGACGAAGCCCCGTCAGACAAGACGAAAGAGCCAAAGCATGACCATGGTGGTTGTGGAAACATACAACCTGAAGTACGACGGGAGGGACTCCGACTGACTGGTACATGGAAAGCTCAAAAAGGTGACGAGGAGAATGAGGGTCAGCAGCCGGAGAAGAAACCCATTACCCCACAAATGGCCCTTAATATCTTCCGCCACATATCTACAGAAGATATCAAACGAATGGGGTTAAGTAATGACTATGCACGTCCCGAATGGATGATCATTACTGTACTTCCCGTGCCACCTCCGCCTGTACGGCCTAGCATCTCTGTGGACGGAGGTAACGGTCCCCGTGGCGAAGACGACTTGACATACAAGCTTGGTGATATCATCCGTGCGAACGGCAACGTGCGGCGTTGCGAWACAGAGGGCTCTCCTGCGCACGTCGTCAATGAGTTCGAGCAGTTGTTGCAATTTCACGTTGCTACATACATGGACAACGGA
	Punctelia_toxodes_1119_South_Africa         ???????????????????????ACTCTTCACACACTGTCTACGTACCTTTGTTGCTTTGGCGGACCTCGGGGTACCTCCCGCGCTGGCTTTCGGGTCGGTGAGTGTCCGTCAGGGGCCCATTTAAATCCTCTTTATCAGTGACGTCCGAGTATATAT??ACAAATCGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTCGGCATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTGTACCCCTCAAGCGTAGCTTGGTATTGGGCTCTCGCCCCCGCGGCGTACCCGAAAAGCAGTGGCGGTCCGGTGTGACTTTAAGCGTAGTAAACTCTATCCCGCTTTGAAAGTTCGCATCATGGCCGGCCAGACAACCCCATTAGCTTCTACTTGCATCATTGTACAGATGATGCAAGATCGA?TATGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAATTATGATAATGACATTGTCTGCCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATGTTTAATCGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAGATCAAGCTTTTACATATAAATTATGATAATTAAA-GGACTAATTTGCTAGAGTTACTTACGAGGGGGTATTAAAGTACTGCTGGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCTCTTTTCGAAAGAAAAATCATGGCACAGGTATAGGCGAAGGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTGTAACAAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTTGAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGATTAGATATATAAGTTTATTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCATGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATGGTCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATATTTATA-TTTTTTTTTATTGTTTTCTTCTTAATTTTCTTCTAATAACATGTTCAACA--TGTAAAAAGAAGAAAGTTAATAAAGAGGCAATAATATATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGCGAGACTTTGGTTAGTTCCATTAAATTAACATAAACCCTTACTTTATTTTTATATAGAGTAGATGGACG????????????????????????TGATTCGTGA???C?CCWTGGCATTAGACGATGAAGCCCCGTC?GACAGAGCGAAGGAGCCAAAGCWTGACCATGGTGGTTGTGGAAACATACAACCKGAAGTACGACGGGAGGGACTCC?A?TGACTGGTACWTGGAAAGCCCAAAAGGGCGACGAGGAAAACGAGGGTCAGCAGCCGGAGAAGAAACCCATTACGCCACAAATGGCCCTCAATATCTTCCGCCACATATCTACAGAAGATATCAAACGAATGGGGTTAAGCAATGACTATGCACGTCCCGAATGGATGATCATCACTGTACTTCCCGTGCCACCTCCGCCTGTACGGCCTAGCATCTCTGTGGACGGAGGTAACGGTCCCCGTGGCGAAGACGACTTGACATATAAGCTTGGTGATATCATCCGTGCGAACSGCAATGTGCGGCGTTGCGAAACAGAGGGCTCTCCTG??CACGTCGTC?A?GAGTTC?????????????????????????????????????????????
;
END;

begin mrbayes;
set autoclose = yes;
CHARSET ITS =   1 -476;
CHARSET mtSSU =   477 -1278;
charset rpb1 =  1279 -1815;
PARTITION split =  3 :  ITS ,  mtSSU ,  rpb1;
set partition = split;
unlink statefreq = ( all )  revmat = ( all )  shape = ( all )  pinvar = ( all );
lset applyto = ( all )  ngammacat = 4;
Lset applyto = ( 1 )  nst = 6 rates = gamma;
Lset applyto = ( 2 )  nst = 2 rates = gamma;
Lset applyto = ( 3 )  nst = 2 rates = gamma;
prset applyto = ( 1 , 3 )  statefreqpr = fixed ( equal );
prset applyto = ( 2 )  statefreqpr = dirichlet ( 1 , 1 , 1 , 1 );
outgroup Flavopunctelia_flaventior;
mcmc nruns = 2 nchains = 8 ngen = 10000000 relburnin = yes burninfrac = 0.25 samplefreq = 1000 printfreq = 1000 savebrlens = yes;
sumt contype = allcompat;
END;


BEGIN TREES;
	Title Punctelia_MrBayes;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
[0] 		1 Flavopunctelia_flaventior,
[1] 		2 Flavopunctelia_soredicar_T,
[2] 		3 Punctelia_appalachiensis_10253_K,
[3] 		4 Punctelia_appalachiensis_3520Us_P,
[4] 		5 Punctelia_bolliana,
[5] 		6 Punctelia_borreri_030736_I,
[6] 		7 Punctelia_borreri_080105_I,
[7] 		8 Punctelia_borreri_090011_J,
[8] 		9 Punctelia_borreri_10237_I,
[9] 		10 Punctelia_borreri_10238_I,
[10] 		11 Punctelia_borreri_10240_I,
[11] 		12 Punctelia_borreri_10246_I,
[12] 		13 Punctelia_borreri_10254_I,
[13] 		14 Punctelia_borreri_10255_I,
[14] 		15 Punctelia_borreri_16125_I,
[15] 		16 Punctelia_borreri_3215_Australia,
[16] 		17 Punctelia_borreri_3216_Australia,
[17] 		18 Punctelia_caseana_3161_USA,
[18] 		19 Punctelia_caseana_3162_USA,
[19] 		20 Punctelia_caseana_3163_USA,
[20] 		21 Punctelia_caseana_NY160_C,
[21] 		22 Punctelia_caseana_NY284_C,
[22] 		23 Punctelia_caseana_NY48_C,
[23] 		24 Punctelia_guanchica_1187_Canary,
[24] 		25 Punctelia_guanchica_1188_Canary,
[25] 		26 Punctelia_guanchica_1189_Canary,
[26] 		27 Punctelia_guanchica_3136_Canary,
[27] 		28 Punctelia_guanchica_3138_Canary,
[28] 		29 Punctelia_guanchica_3139_Canary,
[29] 		30 Punctelia_guanchica_3141_Canary,
[30] 		31 Punctelia_guanchica_3142_Canary,
[31] 		32 Punctelia_guanchica_3143_Canary,
[32] 		33 Punctelia_hypoleucites_1179_Kenya,
[33] 		34 Punctelia_hypoleucites_3911_Cuba,
[34] 		35 Punctelia_hypoleucites_AFTOL_B,
[35] 		36 Punctelia_jeckeri_10249_D,
[36] 		37 Punctelia_jeckeri_10251_D,
[37] 		38 Punctelia_jeckeri_NY276_D,
[38] 		39 Punctelia_jeckeri_NY323_D,
[39] 		40 Punctelia_missouriensis_L,
[40] 		41 Punctelia_perreticulata_10_M,
[41] 		42 Punctelia_perreticulata_16_M,
[42] 		43 Punctelia_pseudocoralloidea_3217_Australia,
[43] 		44 Punctelia_pseudocoralloidea_3218_Australia,
[44] 		45 Punctelia_pseudocoralloidea_E,
[45] 		46 Punctelia_reddenda_10247_G,
[46] 		47 Punctelia_rudecta_10256_A,
[47] 		48 Punctelia_rudecta_1190_USA,
[48] 		49 Punctelia_rudecta_1193_Kenya,
[49] 		50 Punctelia_rudecta_1195_Kenya,
[50] 		51 Punctelia_rudecta_1196_Kenya,
[51] 		52 Punctelia_rudecta_1197_Kenya,
[52] 		53 Punctelia_rudecta_1239_Japana,
[53] 		54 Punctelia_rudecta_1240_Japana,
[54] 		55 Punctelia_rudecta_1343_Chile,
[55] 		56 Punctelia_rudecta_3146_India,
[56] 		57 Punctelia_rudecta_3147_Japana,
[57] 		58 Punctelia_rudecta_3149_Japana,
[58] 		59 Punctelia_rudecta_3150_Kenya,
[59] 		60 Punctelia_rudecta_3152_USA,
[60] 		61 Punctelia_rudecta_3153_USA,
[61] 		62 Punctelia_rudecta_3154_USA,
[62] 		63 Punctelia_rudecta_3155_USA,
[63] 		64 Punctelia_rudecta_3156_USA,
[64] 		65 Punctelia_rudecta_3157_USA,
[65] 		66 Punctelia_rudecta_3158_USA,
[66] 		67 Punctelia_rudecta_3159_USA,
[67] 		68 Punctelia_rudecta_3160_USA,
[68] 		69 Punctelia_rudecta_3164_USA,
[69] 		70 Punctelia_rudecta_3519_USA,
[70] 		71 Punctelia_rudecta_3521_USA,
[71] 		72 Punctelia_rudecta_3522_USA,
[72] 		73 Punctelia_rudecta_3910_Chile,
[73] 		74 Punctelia_rudecta_7661_B,
[74] 		75 Punctelia_rudecta_AFTOL9_B,
[75] 		76 Punctelia_rudecta_Normo_B,
[76] 		77 Punctelia_ruderata_3145_India,
[77] 		78 Punctelia_sticta_Peru_F,
[78] 		79 Punctelia_subflava_E,
[79] 		80 Punctelia_subpraesignis_H,
[80] 		81 Punctelia_subrudecta_10241_N,
[81] 		82 Punctelia_subrudecta_10242_N,
[82] 		83 Punctelia_subrudecta_10243_N,
[83] 		84 Punctelia_subrudecta_10244_N,
[84] 		85 Punctelia_subrudecta_10245_N,
[85] 		86 Punctelia_subrudecta_10250_N,
[86] 		87 Punctelia_subrudecta_3219_Australia,
[87] 		88 Punctelia_subrudecta_PARS3_N,
[88] 		89 Punctelia_toxodes_1119_South_Africa;
	TREE TREE1 = ((1:0.024687,2:0.033592):0.024618,(33:0.043722,((4:0.026801,5:0.018181):0.004456,((78:0.018534,(46:0.028375,(80:0.018554,((17:0.004211,(8:0.005345,16:0.007304):0.001665):0.00261,((7:0.003956,12:0.001842):0.001672,((6:0.001548,15:0.001719):0.00374,(9:0.001532,((10:0.000617,11:0.000694):0.001463,(13:0.000681,14:0.0027):0.000694):0.001006):0.002756):0.001134):0.004407):0.006028):0.008575):0.008466):0.015182,((((41:0.001011,42:0.001785):0.013679,(82:0.001714,(86:0.000668,((84:0.000704,85:0.000669):0.000696,(81:0.000691,(83:0.000728,88:0.001022):0.001885):0.000776):0.00079):0.000894):0.019664):0.003545,((40:0.004734,(55:0.004993,73:0.002513):0.006346):0.007339,(((56:0.001898,77:0.023975):0.002374,(58:0.002825,59:0.008266):0.005678):0.003005,((49:0.000537,52:0.003926):0.000549,((3:0.001401,50:0.001118):0.001167,(54:0.001195,(53:0.006374,(51:0.003876,57:0.01825):0.002015):0.001873):0.000963):0.000731):0.002169):0.003755):0.013266):0.005613,((((44:0.002508,87:0.001585):0.001418,(43:0.000603,(45:0.003122,79:0.00322):0.00062):0.001055):0.010087,((38:0.001556,(39:0.001569,(36:0.000697,37:0.000947):0.001907):0.00181):0.005527,((34:0.005731,(22:0.001664,23:0.003957):0.003752):0.004644,(21:0.003846,(20:0.000501,(18:0.00122,19:0.001226):0.001245):0.000932):0.003713):0.001416):0.010603):0.004453,(89:0.025982,((47:0.001208,((30:0.000539,(24:0.001183,28:0.001678):0.001247):0.00074,((25:0.000675,26:0.003581):0.000551,(31:0.004672,(32:0.002048,(27:0.002867,29:0.001184):0.001602):0.001426):0.001128):0.000508):0.001117):0.003429,(((72:0.0075,(67:0.00885,70:0.002413):0.00412):0.00375,((60:0.00052,(35:0.007781,76:0.001804):0.003557):0.000446,(61:0.000506,(62:0.000518,63:0.001955):0.001814):0.000679):0.000588):0.001206,(75:0.001797,((48:0.002912,71:0.009876):0.000988,(64:0.001236,(65:0.000517,(74:0.001733,(69:0.003985,(66:0.000521,68:0.001239):0.00053):0.001062):0.001041):0.001042):0.001049):0.000508):0.002877):0.00369):0.00535):0.005298):0.00237):0.004025):0.003515):0.00234):0.024618);

END;