NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:05:40]
[Matrix accession#: M1948]

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	TITLE M1948;
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		Lasiosphaeria_glabrata_SMH4617          NNNNNNNCCGACAACTTCGTCTTTGGCCAGTCCGGTGCTGGAAACAACTGGGCCAAGGGTCATTACACCGAGGGGGCCGAGCTGGTTGACCAAGTCCTTGACGTGGTCCGCCGCGAGGCTGAGGGCTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCCGGCATGGGTACCCTCCTTATCTCCAAGATTCGCGAAGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACCTTCTCCGTCGTACCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTAGAGCCGTACAATGCCACCCTCTCCGTCCACCAGCTGGTCGAGAACTCTGATGAGACTTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGTATGCGCACCTTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTACGGCGACCTCAACTACCTGGTTTCCGCCGTCATGTCGGGCGTTACCGTTTCTCTGCGCTTCCCTGGACAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCCGTCAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCCCTTACCAGCCGCGGTGCCCACTCCTTCCGTGCCGTCTCGGTCCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGACTTCCGCAATGGTCGTTACCTGACGTGCTCTGCCATCTTGTAAGTTATTTGCACTGCTTT::GATGTTTTGTC::::::::TGTCGGCGCTAACCGTCAAC:TAGCCGTGGCAAGGTGTCGATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAATGTGCAGAACAAGAATTCGTCCTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCTCTTTGCTCGATCCCCCCTCGCGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGTATTGGTGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG0
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		Lasiosphaeria_sorbina_GJS_L555          TTCCGTCCCGACAACTTCGTCTTTGGCCAGTCCGGTGCCGGAAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGCGCTGAGCTCGTCGATCAAGTTCTCGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAAGGCTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTGTCGGACACTGTCGTCGAGCCGTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCGGATGAGACCTTCTGCATTGACAATGAAGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTACGGCGACCTCAACTACCTTGTTTCCACCGTCATGTCTGGCGTCACTGTCTCTCTGCGCTTCCCTGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCCGTCAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTTACCAGCCGCGGCGCCCACTCCTTCCGTGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGATTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTCTTT:CCGCTAG::CTGATGTTTTGTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAACGTGCAGAACAAGAACTCGTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAACGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACTGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGTATCGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTATACTGGCGAGGGCATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG7
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		Lasiosphaeria_lanuginosa_SMH3277        NNNNNNNCCGACAACTTCGTCTTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGCGCTGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTCCAAGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCCGGTATGGGCACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACCGTCGTCGAGCCGTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTACGGCGATCTTAACTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTGCGCTTCCCTGGCCAGCTTAACTCCGATCTCCGCAAGCTCGCCGTCAACATGGTTCCGTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTCACCAGCCGCGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACTTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTCTTTGGCCCCAA::CTAATGTTTAGTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAATGTGCAGAACAAGAACTCTTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATTCCCCCCCGTGGCCTTAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCTACCGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGCATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG9
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		Lasiosphaeria_ovina_SMH3923             TTCCGTCCCGACAACTTGGTCTTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGTGCTGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTTCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTACGGCGATCTCAACTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTGCGCTTTCCTGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCTGTGAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTCACCAGCCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTCTTTG:CCCTAA:CC:AATGTTTTGTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAATGTACAGAACAAGAACTCGTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGTATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACCAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG8
		Lasiosphaeria_ovina_SMH4605             NNNNNNNCCGACAACTTCGTCTTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGTGCTGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTATGGCGATCTCAACTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTGCGCTTTCCTGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCTGTGAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTCACCAGCCGCGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTCTTTG:CCCTAA:CC:AATGTTTTGTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAATGTACAGAACAAGAACTCGTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGTATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG8
		Lasiosphaeria_ovina_CBS958.72           NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGTGCTGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTATGGCGATCTCAACTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTGCGCTTTCCTGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCTGTGAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTCACCAGCCGCGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTCTTTG:CCCTAA:CC:AATGTTTTGTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAATGTACAGAACAAGAACTCGTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGTATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG8
		Lasiosphaeria_ovina_SMH4124             NNNNNNCCCGACAACTTCGTCTTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGTGCTGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTTCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTACGGCGATCTCAACTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTGCGCTTTCCTGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCTGTGAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTCACCAGCCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTCTTTG:CCCTAA:CC:AATGTTTTGTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAATGTACAGAACAAGAACTCGTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGTATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG8
		Lasiosphaeria_ovina_SMH2670             NNNNNNCCCGACAACTTCGTCTTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGTGCTGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTTCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTACGGCGATCTCAACTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTGCGCTTTCCTGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCTGTGAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTCACCAGCCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTCTTTG:CCCTAA:CC:AATGTTTTGTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAATGTACAGAACAAGAACTCGTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGTATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG8
		Lasiosphaeria_ovina_SMH1538             NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGTGCTGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTTCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTACGGCGATCTCAACTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTGCGCTTTCCTGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCTGTGAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTCACCAGCCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTCTTTG:CCCTAA:CC:AATGTTTTGTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAATGTACAGAACAAGAACTCGTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGTATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN8
		Lasiosphaeria_ovina_SMH2635             NNNNNNCCCGACAACTTCGTCTTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGTGCTGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTTCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTACGGCGATCTCAACTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTGCGCTTTCCTGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCTGTGAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTCACCAGCCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTCTTTG:CCCTAA:CC:AATGTTTTGTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAATGTACAGAACAAGAACTCGTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGTATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG8
		Lasiosphaeria_ovina_SMH3286             TTCCGTCCCGACAACTTCGTCTTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGTGCTGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTTCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTACGGCGATCTCAACTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTGCGCTTTCCTGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCTGTGAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTCACCAGCCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCCGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTCTTTG:CCCTAA:CC:AATGTTTTGTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAAGACCAGATGCGCAATGTACAGAACAAGAACTCGTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAGGAGCTCTTCAAGCGTATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG8
		Lasiosphaeria_lanuginosa_TL5656         NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAATTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGCGCTGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTTCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGAGGTGGAACTGGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTCGAGCCGTACAACGCCACCCTCTCTGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATCGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCGTACGGCGATCTCAACTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTGCGCTTCCCTGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCCGTCAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTCCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTTACCAGCCGCGGTGCCCACTCTTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTGAGTTGTTTG:CCCTAG::CTAATATT::GTC::::::::TACCGCCGCTGACCGTATACCTAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAAATGCGCAATGTGCAGAACAAGAACTCGTCCTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTCTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAGGAGCTCTTTAAGCGTATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGCATGGACAAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAGB
		Lasiosphaeria_lanuginosa_SMH2390        NNNNNNNNNNNNNNNTTCGTCTTTGGTCAGTCCGGTGCTGGCAACAACTGGGCCAAGGGTCATTATACCGAGGGCGCCGAGCTTGTTGACCAAGTTCTTGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTCCAGGGCTTCCAGATCACCCACTCTCTCGGTGGTGGAACTGGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATTCGCGAGGAGTTCCCCGACCGCATGATGGCTACTTTCTCCGTCGTACCCTCCCCCAAGGTCTCGGACACTGTCGTCGAGCCGTACAACGCCACCCTCTCCGTCCATCAGCTGGTTGAGAACTCCGATGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGCTCTCTACGACATTTGCATGCGGACCCTGAAGCTGTCCAACCCTTCATACGGCGATCTCAATTACCTTGTTTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACTGTTTCTCTCCGCTTCCCCGGCCAGCTTAACTCTGATCTCCGCAAGCTCGCCGTTAACATGGTTCCTTTCCCGCGTCTTCATTTCTTCATGGTCGGCTTTGCGCCTCTTACCAGCCGCGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCTCGGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCCGCCTCCGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCATCTTGTAAGTTGTTTG:CCCTAA::CTAATGTTTTGTC::::::::TACCGCCGCTGACCCTATAC:TAGCCGTGGCAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAATGTGCAGAACAAGAACTCGTCTTACTTTGTCGAGTGGATTCCCAACAATGTGCAGACGGCGCTTTGCTCGATCCCCCCCCGTGGCCTCAAGATGTCGTCGACCTTTGTCGGCAACTCGACCGCCATCCAAGAGCTCTTCAAGCGTATTGGCGAGCAGTTCACTGCCATGTTCCGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGCGAGGGTATGGACCAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAG3
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 1: 1 - 1048 \ 3 , 
 2: 2 - 1049 \ 3 , 
 3: 3 - 1050 \ 3 1050 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 
 EXSET * ambregs = 1 - 21 697 - 765 1030 - 1050 CONSTANT ; 
 
 
 USERTYPE 1st_Pos STEPMATRIX = 5 
 A C G T: 
 . 1.70 1.30 inf inf 
 1.70 . 2.40 0.79 inf 
 1.30 2.40 . inf inf 
 inf 0.79 inf . inf 
 inf inf inf inf . 
 ; 
 
 
 USERTYPE 3rd_Pos STEPMATRIX = 5 
 A C G T: 
 . 3.16 2.70 3.00 inf 
 3.16 . 1.81 0.63 inf 
 2.70 1.81 . 1.93 inf 
 3.00 0.63 1.93 . inf 
 inf inf inf inf . 
 ; 
 
 
 
 USERTYPE Region#1 STEPMATRIX = 14 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 B D E F 
 . 15.00 22.00 14.00 30.00 15.00 14.00 14.00 15.00 17.00 26.00 37.00 25.00 22.00 
 15.00 . 22.00 8.00 29.00 11.00 8.00 10.00 9.00 11.00 22.00 33.00 17.00 19.00 
 22.00 22.00 . 21.00 28.00 24.00 23.00 23.00 22.00 26.00 21.00 31.00 22.00 24.00 
 14.00 8.00 21.00 . 30.00 8.00 4.00 7.00 4.00 6.00 21.00 32.00 20.00 20.00 
 30.00 29.00 28.00 30.00 . 29.00 30.00 29.00 30.00 31.00 32.00 32.00 28.00 29.00 
 15.00 11.00 24.00 8.00 29.00 . 7.00 1.00 6.00 8.00 24.00 32.00 19.00 18.00 
 14.00 8.00 23.00 4.00 30.00 7.00 . 6.00 3.00 5.00 22.00 33.00 19.00 19.00 
 14.00 10.00 23.00 7.00 29.00 1.00 6.00 . 5.00 7.00 23.00 31.00 18.00 17.00 
 15.00 9.00 22.00 4.00 30.00 6.00 3.00 5.00 . 4.00 22.00 32.00 17.00 17.00 
 17.00 11.00 26.00 6.00 31.00 8.00 5.00 7.00 4.00 . 27.00 36.00 24.00 22.00 
 26.00 22.00 21.00 21.00 32.00 24.00 22.00 23.00 22.00 27.00 . 29.00 26.00 28.00 
 37.00 33.00 31.00 32.00 32.00 32.00 33.00 31.00 32.00 36.00 29.00 . 28.00 30.00 
 25.00 17.00 22.00 20.00 28.00 19.00 19.00 18.00 17.00 24.00 26.00 28.00 . 5.00 
 22.00 19.00 24.00 20.00 29.00 18.00 19.00 17.00 17.00 22.00 28.00 30.00 5.00 . 
 ; 
 
 
 TYPESET * 1st_2nd_3rd_Pos = 1st_Pos: 1 - 1048 \ 3 , 3rd_Pos: 3 - 1050 \ 3 1050 , Region#1: 1051 ; 
 
 END;