NEXUS
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[Matrix accession#: M1226]

BEGIN TAXA;
	TITLE M1226;
	DIMENSIONS  NTAX=15;
	TAXLABELS
		'Phytophthora phaseoli -Maryland'	'Phytophthora pseudotsugae -Oregon'	'Phytophthora nicotianae -Australia'	'Phytophthora mirabilis -Mexico 1'	'Phytophthora megasperma -California 1'	'Phytophthora infestans -West Virginia'	'Phytophthora infestans -Mexico'	'Phytophthora ilicis -Canada'	'Phytophthora hibernalis -Australia'	'Phytophthora gonapodyides -New York'	'Phytophthora fragariae -Maryland'	'Phytophthora colocasiae -China'	'Phytophthora capsici -Florida'	'Phytophthora cactorum -New York'	'Pythium aphanidermatum -Mexico'
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M1226;
	DIMENSIONS NCHAR=1299;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		'Phytophthora phaseoli -Maryland'             ATGAATTTTCAAAATATAAAACAATGGTCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTTGGTACAACATTTTCTCTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACCGCACATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATCGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATAGGTGCTCCGGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTGCCTCCTTCTTTATTATTATTAGTTTCTTCAGCTATCGTTGAATCTGGGGCTGGTACTGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCTAGTGTTCAAGCACATTCAGGACCTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACAATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTATATTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTACTAGCTGGGGCAATTACTATGTTACTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCATTTTATGATCCATCAGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAGGTTTATGTTTTAATTTTACCGGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCATCTTTTGCAAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCTATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCGCACCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACACGCGCTTACTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCGGTACCAACGGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTCTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTATGGGCGGAGTAACTGGTGTAGTTATGTCTAATTCGGGTTTAGATATTGCGTTACATGATACTTATTATATTGTGGGGCATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCTGAAATTTTAGGACAAATCCATTTTTGGTTATTTTTTATTGGGGTAAATGTTACTTTT
		'Phytophthora pseudotsugae -Oregon'           ATGAATTTTCAAAATATAAATAAATGGGCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTTGGTACAACATTATCTCTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTCATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACAGCACATGCTTTTATTATGGTGTTTTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATAGGTGGTTTTGGTAACTGGTTTGTTCCTTTAATGATTGGTGCTCCTGATATGGCATTTCCTCGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTTGAATCAGGTGCAGGTACTGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCTAGTGTACAAGCACACTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACTATATACAATATGAGAGCTCCTGGATTAAGTTTCCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTATATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGAGCTATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCATCTGGAGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAAGTTTATGTTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCTATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACAAGAGCTTATTTTTCAGCTGCTACTATGATTATTGCCGTACCTACAGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCATTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTCGTTATGGGTGGAGTAACTGGTGTAGTTATGTCAAATTCAGGTTTAGATATTGCAATACATGATACTTATTATATTGTTGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTATTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCTGAAGTTTTAGGTCAAATACATTTTTGGTTATTCTTTATTGGAGTAAATGTTACTTTC
		'Phytophthora nicotianae -Australia'          ATGAATTTTCAAAATATAAATAAATGGTCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTAGGTACAACACTATCTCTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCTGGTAATCAAATTTTTATGGGTAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACAGCACATGCTTTTATTATGGTATTTTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGGTTTGGTAACTGGTTTGTACCTTTAATGATAGGTGCTCCTGATATGGCATTTCCTCGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTAGAATCTGGTGCTGGTACTGGTTGGACTGTTTATCCCCCATTATCTAGTGTACAAGCACATTCAGGTCCTTCTGTAGATTTAGCGATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTATGGTCTATATTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATGTTATTAACAGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCATCTGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAAGTTTATGTATTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCTGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTCGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACATCATATGTTTACAGTTGGTTTAGATGTAGATACAAGAGCTTATTTTTCTGCAGCTACTATGATTATTGCGGTACCAACAGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCAACCTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCATTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTATGGGTGGAGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACACTTCCATTATGTTTTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCAGAAGTTTTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGAGTAAATGTTACTTTT
		'Phytophthora mirabilis -Mexico 1'            ATGAATTTTCAAAATATAAATAAATGGTCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTTGGTACAACATTTTCTCTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACCGCACATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATCGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATAGGTGCTCCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCCCCTTCTTTATTATTATTAGTTTCTTCAGCTATCGTTGAATCTGGGGCTGGTACTGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCTAGTGTTCAAGCACATTCAGGACCTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACAATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTATATTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTACTGGCTGGGGCAATTACTATGTTACTAACTGATAGAAATTTAAACACTTCATTTTATGATCCATCAGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAGGTTTATGTTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCATCTTTTGCAAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCTATGTTATCTATCGGTTTACTAGGTTCAATTGTATGGGCGCACCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACACGCGCTTACTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCGGTACCCACGGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTCTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTATGGGCGGAGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCGGGTTTAGATATTGCATTACATGATACCTATTATATTGTGGGGCATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCTGAAATTTTAGGACAAATTCATTTTTGGTTATTTTTTATTGGGGTAAATGTTACTTTT
		'Phytophthora megasperma -California 1'       ATGAATTTTAAAAATATAAATAAATGTCAACTCGACTGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGTACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTATTGTTGGTACAACCTTATCACTTTTAATCCGTATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCACCAATTATATAATGTTGTTGTTACAGCACATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATAGGAGCACCTGATATGGCTTTCCCACGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCACCAGCGTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTTGAATCAGGTGCTGGTACTGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCAAGTGTACAAGCACACTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACGGGTATTTCATCATTATTAGGTGCGATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCCGGTTTAAGTTTCCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACCGCTTTTCTTTTATTATTAACATTACCCGTTTTAGCTGGTGCCATTACCATGTTATTAACAGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCATCTGGTGGAGGGGATCCCGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTGCTGCCGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTCGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTGTATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTTTCAGCCGCTACTATGATTATTGCTGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTGTTGGTGGTGTAACTGGAGTAGCAATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCAATTCATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAAATATCCTGAAATTTTAGGTCAAATCCATTTTTGGTTATTCTTTATAGGTGTAAATATTACCTTT
		'Phytophthora infestans -West Virginia'       ATGAATTTTCAAAATATAAATAAATGGTCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTTGGTACAACATTTTCTCTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACCGCACATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATCGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTATTCCTTTAATGATAGGTGCTCCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCTTCTTTATTATTATTAGTTTCTTCAGCTATCGTTGAATCTGGGGCTGGTACTGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCTAGTGTTCAAGCACATTCAGGACCTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACAATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTATATTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTACTAGCTGGGGCAATTACTATGTTACTAACTGATAGAAATTTAAACACTTCATTTTATGATCCATCAGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATCTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAGGTTTATGTTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATCAGTCAAGTTTCTGCATCTTTTGCAAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCTATGTTATCTATAGGTTTACTAGGTTCAATTGTATGGGCGCACCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACACGCGCTTACTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCGGTACCAACGGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTCTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTATGGGCGGAGTAACTGGTGTAGCTATGTCGAATTCGGGTTTAGATATTGCATTACATGATACCTATTATATTGTGGGGCATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCTGAAATTTTAGGACAAATTCATTTTTGGTTATTTTTTATTGGGGTAAATGTTACCTTT
		'Phytophthora infestans -Mexico'              ATGAATTTTCAAAATATAAATAAATGGTCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTTGGTACAACATTTTCTCTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACCGCACATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATCGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTATTCCTTTAATGATAGGTGCTCCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCTTCTTTATTATTATTAGTTTCTTCAGCTATCGTTGAATCTGGGGCTGGTACTGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCTAGTGTTCAAGCACATTCAGGACCTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACAATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTATATTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTACTAGCTGGGGCAATTACTATGTTACTAACTGATAGAAATTTAAACACTTCATTTTATGATCCATCAGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATCTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAGGTTTATGTTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATCAGTCAAGTTTCTGCATCTTTTGCAAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCTATGTTATCTATAGGTTTACTAGGTTCAATTGTATGGGCGCACCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACACGCGCTTACTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCGGTACCAACGGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTCTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTATGGGCGGAGTAACTGGTGTAGCTATGTCGAATTCGGGTTTAGATATTGCATTACATGATACCTATTATATTGTGGGGCATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCTGAAATTTTAGGACAAATTCATTTTTGGTTATTTTTTATTGGGGTAAATGTTACCTTT
		'Phytophthora ilicis -Canada'                 ATGAATTTTCAAAATATAAATAAATGGTCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGTACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTAGGTACAACATTATCACTTTTAATCCGAATGGAATTGGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACTGCGCATGCTTTTATTATGGTTTTTTTTTTAGTTATGCCAGCTTTAATTGGAGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCATTAATGATTGGTGCACCTGATATGGCTTTCCCACGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTAGAATCAGGTGCTGGTACAGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCTAGTGTACAAGCACACTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCTTCATTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCCCCCGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTGTATTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCCGGTGCAATTACAATGTTGTTAACCGATAGAAATTTAAATACTTCATTTTATGATCCTTCTGGTGGAGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCAGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCTATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACACCATATGTTTACGGTTGGTTTAGATGTAGATACTCGTGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTATGGGAGGTGTAACTGGAGTAGTAATGTCAAATTCTGGTTTAGATATAGCGATCCACGATACTTATTATATTGTAGGTCATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATTTTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGGAAAATATCTGGCCGTAGATATCCTGAAATTTTAGGTCAAATCCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGAGTAAATGTAACCTTT
		'Phytophthora hibernalis -Australia'          ATGAATTTTCAAAGTATAAATAAATGGTCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTATTGTTGGTACAACTTTATCTCTTTTAATTCGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGTAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACTGCCCATGCTTTTATTATGGTTTTTTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGGTTTGGTAACTGGTTCGTTCCTTTAATGATAGGGGCTCCAGATATGGCTTTTCCACGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCCGCTTTATTATTATTAGTATCATCAGCTATTGTGGAATCTGGAGCAGGTACTGGTTGGACAGTTTATCCACCTTTATCAAGTGTACAAGCACATTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCAATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCGGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACCTTACCTGTTTTAGCAGGTGCAATTACTATGTTATTAACAGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGACCCCTCTGGAGGTGGTGATCCCGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTACTTAGGTATGGTTTATGCTATGTTATCTATAGGTCTATTAGGTTCTATTGTATGGGCACACCATATGTTTACTGTAGGTTTAGATGTAGATACTCGAGCTTATTTTTCTGCAGCTACTATGATTATAGCGGTACCTACCGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGCGGTTCATTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTATGGGTGGTGTAACTGGTGTGGTTATGTCTAATTCGGGTTTAGATATTGCATTACACGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATTTTTACAGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATATCTGGACGTAGATATCCTGAGATTTTAGGCCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGAGTAAATGTAACTTTT
		'Phytophthora gonapodyides -New York'         ATGAATTTTAAAAATATAAATAAATGGTCAACTCGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGTACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTATTGTTGGTACAACCTTATCACTTTTAATCCGTATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCACCAATTATATAATGTTGTTGTTACTGCACATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCATTAATTGGTGGTTTTGGAAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATAGGTGCTCCTGATATGGCTTTCCCACGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCACCAGCATTATTATTATTAGTGTCATCAGCTATTGTCGAATCTGGTGCTGGGACTGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCAAGTGTACAAGCACACTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACGGGTATTTCATCATTATTGGGTGCAATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCACAGATTACCCCTATTTGTTTGGTCTGTGTTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACATTACCCGTATTAGCTGGTGCCATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCGTTTTACGATCCATCTGGAGGAGGTGATCCGGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCTGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTGCCGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTCGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTGTATTGTCTGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTCGAGCTTATTTCTCAGCAGCGACTATGATTATTGCTGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTATGGGTGGTGTAACCGGAGTAGCAATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCAATTCATGATACATATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCCGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCTGAAGTTTTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGTGTAAATATTACCTTT
		'Phytophthora fragariae -Maryland'            ATGAATTTTCAAAATATAAATAAATGGTCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATCGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCGGGTATTGTTGGTACAACTTTATCACTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCGGGTAATCAGATTTTAATGGGAAATCATCAATTATATAATGTAGTTGTAACTGCACATGCCTTTATAATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCCTTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTACCTTTAATGATTGGTGCTCCAGATATGGCTTTTCCACGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTTGAATCTGGTGCGGGTACAGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCAAGTGTACAAGCACATTCAGGACCTTCAGTAGATTTGGCAATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCTTCATTATTAGGTGCTATAAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCAGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTATTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTACTAACTTTACCGGTATTAGCTGGAGCAATTACAATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCTGGTGGGGGAGATCCAGTACTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCCGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCATCAGCATTTGCTAAAAAAAATATATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCGCATCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGGGCATATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCTGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATCTTATTATTTGTTATGGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCAAATTCTGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGCATTTTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGGAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCCGAAATATTGGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGGGTAAATATTACCTTC
		'Phytophthora colocasiae -China'              ATGAATTTTCAAAATATAAATAAATGGTCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCGGGTGTTGTTGGTACAACATTATCTCTTTTAATTCGTATGGAATTAGCACAACCTGGTAATCAAATTTTTATGGGTAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCAGCTTTAATTGGAGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATAGGTGCACCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTTGAATCTGGTGCTGGTACAGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCTAGTGTACAAGCTCACTCAGGTCCTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATCTCTTCATTATTAGGTGCAATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTCTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCTGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCGGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGGATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTACGGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATAGGGTTATTAGGTTCAATTGTTTGGGCGCATCATATGTTTACTGTAGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCCGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACTCCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATATTATTATTTGTTATGGGAGGTGTAACAGGTGTAGCTATGTCAAATTCAGGTTTAGATATTGCAATACATGATACTTACTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTTTTATCTATGGGTGCCGTTTTTGGTATTTTTACTGGTTTTTATTTTTGGATTGGTAAAATTTCAGGACGAAGATATCCTGAAATTTTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTTTTTATAGGAGTAAATGTAACTTTC
		'Phytophthora capsici -Florida'               ATGAATTTTCAAAATATAAATAAATGGTCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCGGGTGTTGTTGGTACAACATTATCTCTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATCTTTATGGGAAATCATCAATTATATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGTTTTGGTAACTGGTTTGTTCCTTTAATGATAGGTGCACCTGATATGGCTTTTCCACGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTAGAATCAGGTGCTGGTACAGGTTGGACTGTTTATCCACCATTATCTAGTGTACAAGCACATTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATCTCTTCATTATTAGGTGCAATTAATTTTATTTCAACCATTTATAATATGAGAGCTCCAGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCAGGTGGAGGTGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCTGGATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGATTATTAGGTTCAATTGTTTGGGCACACCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCTTATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACTCCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTCGTTATGGGTGGTGTAACTGGTGTAGCTATGTCAAACTCAGGTTTAGATATTGCAATACATGATACATATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTTTTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGTTTCTATTTTTGGATTGGTAAAATTTCAGGACGTAGATATCCTGAAATTTTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTTTTTATCGGAGTAAATGTAACTTTC
		'Phytophthora cactorum -New York'             ATGAATTTTCAAAATATAAATAAATGGGCAACAAGATGGCTTTTTTCAACAAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTAATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTTGGTACAACATTATCTCTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCGGGTAATCAAATTTTCATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACAGCACATGCTTTTATTATGGTGTTTTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGTTTTGGTAACTGGTTTGTTCCTTTAATGATTGGTGCTCCTGATATGGCATTTCCTCGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTTGAATCAGGTGCAGGTACAGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCTAGTGTACAAGCGCACTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACTATATATAATATGAGAGCTCCTGGATTAAGTTTCCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTATATTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGAGCCATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCATCTGGAGGGGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCAGAAGTTTATGTTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACAAGAGCTTATTTTTCAGCTGCTACTATGATTATTGCTGTACCTACAGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCATTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTCGTTATGGGTGGAGTAACTGGTGTAGTTATGTCAAATTCAGGTTTAGATATTGCAATACATGATACTTATTATATTGTTGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTATTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCTGAAGTTTTAGGTCAAATACATTTTTGGTTATTCTTTATTGGAGTAAATGTTACTTTC
		'Pythium aphanidermatum -Mexico'              ATGAATTTTCAAACAATATCAAATTGGTCAACTAGATGGCTTTTTTCAACAAATCACAAAGATATCGGTACTTTATATTTAATTTTTGGTGCTTTTTCAGGTGTAGTTGGTACAACTTTATCTGTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCTGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTAACAGCACATGCTTTCATAATGATTTTCTTCATGGTTATGCCTGTATTAATTGGTGGTTTTGGTAACTGGTTTATTCCTTTAATGATTGGTGCTCCAGATATGGCTTTTCCTAGAATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCTTCATTATTATTATTAGTATCATCAGCTATAGTAGAATCAGGTGCTGGTACAGGTTGGACTGTATATCCACCATTATCAAGTGTACAAGCACACTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTATCTGGTATTTCTTCATTATTAGGTGCTATTAATTTTTTATCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCTGGATTAAGTTTTCATAGATTACCGTTATTTGTATGGTCTGTTTTTATTACAGCTTTTTTATTATTGTTAACATTACCAGTATTAGCAGGTGCTATTACAATGTTATTAACAGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCTTCAGGTGGAGGTGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGACACCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCTGCTTTTGGTATTATTAGTCATGTTTCTGCTACATATTCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCTATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCAATTGTTTGGGCTCACCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTAGAGCATATTTCTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACAGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTATGTGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCAATGTTATTTACTTTAGGTTTCTTATTATTATTCGTAATAGGTGGGGTAACTGGAGTAATTATGTCTACATCAGGTATTGATATTGCTATTCATGATACATACTATATTGTAGCGCATTTCCATTATGTTTTATCTATGGGTGCTGTTTTCGGTATTTTTGCTGGATTTTATTATTGGATTGGTAAAATAACAGGACGTCAATATCCTGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGTGTAAATATTACATTT
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BEGIN CODONS;
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 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
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BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MAXSTEPS ; 
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