#NEXUS [written Mon May 03 11:10:51 EDT 2010 by Mesquite version 2.7 (build 510) at dhcp128036183007.central.yale.edu/128.36.183.7] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=71; TAXLABELS Parazoanthus_aff_juanfernandezii_.FRA. Parazoanthus_aff_juanfernandezii_.CA. Parazoanthus_juanfernandezii Parazoanthus_axinellae Parazoanthus_anguicomus Parazoanthus_capensis Parazoanthus_aff_swiftii_.Sal. Parazoanthus_aff_swiftii_.GAL. Parazoanthus_aff_swiftii_.Nur. Parazoanthus_swiftii Parazoanthus_aff_parasiticus_.NIP. Parazoanthus_aff_parasiticus_.NCs. Parazoanthus_aff_parasiticus_.MAD. Parazoanthus_parasiticus Parazoanthus_aff_parasiticus_.NCd. Parazoanthus_aff_parasiticus_.SUL. Parazoanthus_aff_catenularis_.SEN. Parazoanthus_puertoricense Parazoanthus_catenularis Epizoanthus_cutressi Parazoanthus_sp_.SUL5. Parazoanthid_sp_.EBISCO. Parazoanthid_sp_.CORSARO. Parazoanthid_sp_.NC3. Parazoanthus_sp_.G1. Parazoanthid_sp_.M2. Parazoanthid_sp_.Cape_Verde. Parazoanthid_sp_.Principe. 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Parazoanthus_capensis 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Parazoanthus_aff_swiftii_.Sal. 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Parazoanthus_aff_swiftii_.GAL. 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Parazoanthus_aff_swiftii_.Nur. 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Parazoanthus_swiftii 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Parazoanthus_aff_parasiticus_.NIP. 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Parazoanthus_aff_parasiticus_.NCs. 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Parazoanthus_aff_parasiticus_.MAD. 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Epizoanthus_cutressi CGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGGCCTTCTGATTGGCGCCGCCGCCCCGGCAACGG------AGCAGCGGA---TGTCGAAAAGTTGGTCAAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTA-ACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTACCGTTGTCATACAT????????????????????????????????????????????????????????????ACCAACAACCTTGCGC-GTTGTTAGTC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TACA--CTGTGAACCTTACCAA????????????????????CCTT?????????????????????????????????????????????????????????????TAAGGGGTAGC???????????????????????????????????TTGT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTTTAAATGGAAG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TAGTGTCTCGAGTGAGTGAGTGTGTGCCTGGAGTTTGACGTCGCTTCAAGCACTACCCATTCAT?????????????????TACTCGCT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCTCCGGCCCC????????????????????GTTT--GTTTTTT????????????????CCATTCTC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????TACAC??????????????????????????????????????????????????????????????????GTTTT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GACTGAAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTG-AGGAAAAGGAAAACG?????GGAGACAACTTTTAACGGTGGATCTCTTGGCTCGTGCATCGATGAAGAACGCAGCCAGGTGCGATAAGTAGTGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCAAATGGCGCTCTTGGGTTCTCCCAGGAGCATGTCTGTCTGAGTGTCGGTTTCCAA--CCAT--CGCGCGCCGC-CGT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGCTC-GCTTCGTGTAGCGAAGAAGCTTGGGTGTAC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TAGGTGGGTC????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Parazoanthus_sp_.SUL5. 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Parazoanthid_sp_.EBISCO. 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Parazoanthid_sp_.CORSARO. 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Parazoanthid_sp_.NC3. 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Parazoanthus_sp_.G1. 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Parazoanthid_sp_.M2. 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Parazoanthid_sp_.Cape_Verde. 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Parazoanthid_sp_.Principe. ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGAACCTGCGGAAGGATCATTACCGTTGC-ATACAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CAACAACAAAAAAAAAATCCCTCTGCGAGGAGGGAAGA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TACA--CTGTGAACCTTAACAA?????????????????????????CCA?????????????????????????????????????????????????????????TTAGGGGTAGA??????????????????????????????????????????????????TGCGCCGGCTTGCAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTTTAAATGGAAG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAGGGCGACGT---TCGCAG???????????????????????????????????GACTTCTCCGGCTCGC-TG????????????????????????????????????????????????????????CCGAAGAGTCGCAGTGGTTCTCGAGCCACTACTTGCTGCTCTGGGTTGGCCAGACGCGGTC?????????????????????????CTGCGCCGCGTGGACGG-C????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTTCCTGCCCC????????????????????GTTT--GTGTTTTT?????????????????????????CTC??????????????????????????????????????????????????????????????????????TACAC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACGTTATCGTCTC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GACTGAAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTTTT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCG-AGGAAAGAAAAAAC??????GAAGACAACTTTTAACGGTGGATCTCTTGGCTCGTGCATCGATGAAGAACGCAGCCAGGTGCGATAAGTAGTGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCAAATGGCGCTCTTGGGTTCTCCCAGGAGCATGTCTGTCTGAGTGTCGGTATCCAA-CTCAT--CGCGCGCCAC-CGT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCGGTGGGTC????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Corallizoanthus_tsukaharai 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Mesozoanthus_fossii_.1. 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Mesozoanthus_fossii_.3. 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Epizoanthus_cf_arenaceus 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Epizoanthus_cf_ramosus 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Epizoanthus_incrustatus CGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGGCCTTCTGATTGGCGCCGCCGCCCCGGAGACGG------AGCAGCGGA---TGTCGAAAAGTTGGTCAAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTA-ACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCCTTACCG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATCATACAAGACCCAA-----TGTGGTTT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGCA--CTGTGAACCTTACCAA????????????????????CTT??????????????????????????????????????????????????????????????TTAGGGGTAGG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTTCTGT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTTTAAATGGTGT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGGTTTGAATTTGGCCAGCC-------TCATTTTT--TCYC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????WCACCGGCCCC????????????????????GCTT--GTGTTTT????????????????????????????????????????????????????????AC???CCTTTTTTAA????????????????????????????TACWC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTTCTC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GACTGAAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTGGCGAGATTGATT------TCTC??????????????????????????GCTCCW-AAAACTGAAAA??????GAAGACAACWTTTAACGGTGGATCTCTTGGCTCGTGCATCGATGAAGAACGCAGCCAGGTGCGATAAGTAGTGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCAAATGGCGCTCTTGGGTTCTCCCAGGAGCATGTCTGTCTGAGTGTCGGTTTACAAA-CTAT--CGTGCGACGC-TTG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTAATC?????????????????????????????????????????????????????CGAGCGTGTC????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Epizoanthus_illoricatus 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Palythoa_cf_grandis 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Zoanthus_pulchellus 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Zoanthus_vietnamensis 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Palythoa_tuberculosa 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Palythoa_aff_caesia 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Palythoa_aff_mutuki CGTCCCTGCCCTTT-TACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGTTTTAGTGAGGCCTTCCGATTGGCGCCGCCGCTTCGTTTTCTCGT----GGCAGCGGATTTTGTCGAGAAGTTGGTCAAACTTGAGCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTA-ACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTAACG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TACTATGCAATATGTTTTGTCGGGAACC???????????ATCGAGGTGTTCGATCGACCGTCTTTGGCC----GGACGACGCC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGGT--GCGAGAAC-TTA??????????????????????????????????????????????????????????????????????GTAGGGCTTC?????????TTTGGGGTAGA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CACCCTCGGGTGT????????????????????????????????????????????CTTTAAATGTCGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGCACGTCTCG-CGCAAAGGTTTCCTTTCTAGTACCTCGACCGATCGAATCGTATCCCGTTCGCACGGGGTAAGGAAGTCGTTGGGTCGTACGCGGAACGAAAGGAATTT-ACCGAGAGAGAGACTGC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CACCCGGCCCC????????????????????GTTTTTTTTT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCGTCAAC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTGCTTGC??????????????????????????????????????????????????????????????????????GACTGTAC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGT--ATG?????????????GAGAAAGGAAAAACG?????????AGAGACAACTTTTAACGGTGGATCTCTTGGCTCGTGCATCGATGAAGAACGCAGCCAGCTGCGATAAGTAGTGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCAAATGGCGCTCTCGGGTTCTCCCGGGAGCACGTCCGTCTGAGTGTCGGCATACA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TATCAT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Palythoa_aff_sakurajimensis 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Sphenopus_marsupialis 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ATCGCGCTACG????????????????????????????????????????????????AGCGCGGCGTTGAGGTG-TCGTGG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCCCTTTGAGAGGTAGGCC?????????????????????????????????????????????????????GCGTCCCTTGAAGA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAAGGAAACGATC--CGGCGGCGAGGTTCGCGCGTAGAT?????????????????????????????????????CACCGGAGGCCAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGACTGTTTTAGTTTCCCCCGGAATCTGCCGCCCTCGCGCGTCGCTTC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCGCTCTCGTGACCGCATTCGA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCCTCGACCTC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Palythoa_heliodiscus 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Edwardsiid_sp_.BAR. CGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGGCCTCCTGATTGGCGCCGCGGCCCCGGCAACGG------AGCAGCGGAT--TGTCGAAAAGTTGGTCAAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTA-ACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTACCG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATCGAA-----TCCAAGCGTGCAATTTCCGCGGAAATTCGTAC????????????TGCA--CCGTGAAC-TGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACCGAACCGTTGGGGGTCGC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTCAGATAGCGTTAAATGGCGA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCGAGTGGTTCTTCTTCCCCTCTTCGCACCGGCGGCGGCGAACATTAGAGACGATCCGTGCGCGCTCGCGGCGGTTCCGATATTTTGTCTTCGTCGGCGGAGTGTTGCGGCGGTGGAGGTTCTGCGGCGTCTCGCAGCCCC?????????????????????TGCATTTTT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTAAC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTGATAAAAACACCTGTCAAACT?????????????????????GAACTTGT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTC--GAACAATGCGCTTCGACGAGAGAGAAAAACG?????????AGAGATAACTTTTAACGGTGGATCTCTTGGCTCGTGCATCGATGAAGAACGCAGCCAGGTGCGATAACTAGTGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCAAATGGCGCTCTTGGGTTTTCCCAGGAGCATGTCTGTCTGAGTGTCGGTTTCCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Edwardsiid_sp_.CUR. CGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGGCCTCCTGATTGGCGCCGCGGCCCCGGCAACGG------AGCAGCGGAC--TGTCGAAAAGTTGGTCAAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTA-ACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTACCG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGCAAATTTGTCCAAGC?????????????????????????AAGAGTTCTTGCTACT--CCGTGAACC-GT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCGAACCGTTGGGGGTCGC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTGTCAGAGCGTTAAATAGCGG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCGAGC-GTTC????????GCCTTCGCACCTGCGG??????????????????????????????????????????????????????????????????GTGTAGAGGCGGCG?????????CGGCGTCTCGCAGCCCC?????????????????????TGCACTTGT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTTCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTTCTACAAACGTAACGAATCGACTGAAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGT--GC????????????????????AAAAAAGCGAG???????AGAAACAACTTTTAACGGTGGATCTCTTGGCTCGTGCATCGATGAAGAACGCAGCCAGGTGCGATAACTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCAAATGGCGCTCTTGGGTTTTCCCAGGAGCATGTCTGTCTGAGTGTCGGTTTCCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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; OPTIONS MSTAXA = UNCERTAIN; END; BEGIN TREES; Title Nuclear_71_taxa_TB; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Parazoanthus_aff_juanfernandezii_.FRA., 2 Parazoanthus_aff_juanfernandezii_.CA., 3 Parazoanthus_juanfernandezii, 4 Parazoanthus_axinellae, 5 Parazoanthus_anguicomus, 6 Parazoanthus_capensis, 7 Parazoanthus_aff_swiftii_.Sal., 8 Parazoanthus_aff_swiftii_.GAL., 9 Parazoanthus_aff_swiftii_.Nur., 10 Parazoanthus_swiftii, 11 Parazoanthus_aff_parasiticus_.NIP., 12 Parazoanthus_aff_parasiticus_.NCs., 13 Parazoanthus_aff_parasiticus_.MAD., 14 Parazoanthus_parasiticus, 15 Parazoanthus_aff_parasiticus_.NCd., 16 Parazoanthus_aff_parasiticus_.SUL., 17 Parazoanthus_aff_catenularis_.SEN., 18 Parazoanthus_puertoricense, 19 Parazoanthus_catenularis, 20 Epizoanthus_cutressi, 21 Parazoanthus_sp_.SUL5., 22 Parazoanthid_sp_.EBISCO., 23 Parazoanthid_sp_.CORSARO., 24 Parazoanthid_sp_.NC3., 25 Parazoanthus_sp_.G1., 26 Parazoanthid_sp_.M2., 27 Parazoanthid_sp_.Cape_Verde., 28 Parazoanthid_sp_.Principe., 29 Corallizoanthus_tsukaharai, 30 Epizoanthus_aff_tsukaharai_.NZ., 31 Epizoanthus_aff_tsukaharai_.CA., 32 Parazoanthus_lucificum, 33 Gerardia_savaglia, 34 Parazoanthus_gracilis, 35 Parazoanthus_aff_tunicans_.SUL., 36 Parazoanthus_cf_gracilis_.NC2., 37 Parazoanthus_cf_gracilis_.NC1., 38 Isozoanthus_antumbrosus, 39 Parazoanthus_tunicans, 40 Parazoanthid_sp_.yellow_polyp., 41 Epizoanthus_patagonichus, 42 Epizoanthus_californicus, 43 Epizoanthus_minutus, 44 Mesozoanthus_fossii_.1., 45 Mesozoanthus_fossii_.3., 46 Epizoanthus_aff_arenaceus_.HI., 47 Epizoanthus_cf_arenaceus, 48 Epizoanthus_cf_ramosus, 49 Epizoanthus_incrustatus, 50 Epizoanthus_illoricatus, 51 Epizoanthus_aff_illoricatus, 52 Isozoanthus_giganteus, 53 Isozoanthus_cf_giganteus, 54 Epizoanthus_cf_balanorum, 55 Epizoanthus_scotinus, 56 Epizoanthus_paguricola, 57 Palythoa_cf_grandis, 58 Zoanthus_pulchellus, 59 Zoanthus_vietnamensis, 60 Zoanthus_kuroshio, 61 Zoanthus_gigantus, 62 Palythoa_tuberculosa, 63 Palythoa_sp_.289., 64 Palythoa_mutuki, 65 Palythoa_aff_caesia, 66 Palythoa_aff_mutuki, 67 Palythoa_aff_sakurajimensis, 68 Sphenopus_marsupialis, 69 Palythoa_heliodiscus, 70 Edwardsiid_sp_.BAR., 71 Edwardsiid_sp_.CUR.; TREE Nuclear_only = ((((53,52),((46,((54,(48,47)),(49,(55,56)))),(50,51))),(((((38,(37,(34,36))),(39,35)),(40,(41,(42,43)))),(((68,(67,((66,64),((63,62),65)))),((61,((59,60),58)),69)),57)),((44,45),((((27,28),(25,26)),(22,(23,24))),((29,(31,((33,32),30))),(((19,(18,21)),20),((((14,(13,(16,15))),17),(11,12)),(((6,(10,(9,(8,7)))),(5,4)),((2,3),1))))))))),(70,71)); END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED = unord: 1 - 7971; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED = universal: 1 - 7971; END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED = 'Jukes-Cantor': 1 - 7971; END;