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Phytophthora_gregata_VHS21992_HQ12859 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AATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTATTGTTGGTACAACTTTATCACTTTTAATTCGTATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTATTGTTACTGCACACGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATTGGGGCACCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCACCAGCTTTATTATTATTAGTATCATCAGCTATTGTTGAATCTGGTGCTGGTACAGGTTGGACAGTTTATCCACCATTAGCAAGTGCACAAGCACACTCAGGACCTTCAGTTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCATCTTTATTAGGTTCTATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACGGCTTTTCTTTTATTATTAACATTACCCGTATTAGCAGGTGCTATTACAATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCATCTGGTGGGGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTGCTGCTGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCAATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTGTATTGTATGGGCACACCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTCGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACAGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGCGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTAATTGGTGGTGTAACTGGTGTAGCAATGTCTAATTCTGGTTTAGATATTGCAATTCATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCAGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAAATACCCTGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCttTaTTGGTG 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Phytophthora_gibbosa_VHS22007_HQ12848 AATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTATTGTTGGTACAACTTTATCACTTTTAATTCGTATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTATTGTTACTGCACACGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATTGGGGCACCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCACCAGCTTTATTATTATTAGTATCATCAGCTATTGTTGAATCTGGTGCTGGTACAGGTTGGACAGTTTATCCACCATTAGCAAGTGCACAAGCACACTCAGGACCTTCAGTTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCATCTTTATTAGGTTCTATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACGGCTTTTCTTTTATTATTAACATTACCCGTATTAGCAGGTGCTATTACAATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCATCTGGTGGGGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTGCTGCTGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCAATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTGTATTGTATGGGCACACCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTCGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACAGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGCGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTAATTGGTGGTGTAACTGGTGTAGCAATGTCTAATTCTGGTTTAGATATTGCAATTCATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCAGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAAATACCCTGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGTG Phytophthora_gibbosa_VHS22008_HQ12849 AATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTATTGTTGGTACAACTTTATCACTTTTAATTCGTATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTATTGTTACTGCACACGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATTGGGGCACCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCACCAGCTTTATTATTATTAGTATCATCAGCTATTGTTGAATCTGGTGCTGGTACAGGTTGGACAGTTTATCCACCATTAGCAAGTGCACAAGCACACTCAGGACCTTCAGTTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCATCTTTATTAGGTTCTATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTATTAATTACGGCTTTTCTTTTATTATTAACATTACCCGTATTAGCAGGTGCTATTACAATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCATCTGGTGGGGGAGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTGCTGCTGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCAATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTGTATTGTATGGGCACACCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTCGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACAGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGCGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTAATTGGTGGTGTAACTGGTGTAGCAATGTCTAATTCTGGTTTAGATATTGCAATTCATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTCCATTATGTATTATCTATGGGTGCAGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAAATACCCTGAAGTATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGTG Phytophthora_asparagi_VHS17175_HQ12844 AATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTATTGTTGGTACAACTTTATCACTTTTAATCCGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAACTATATAACGTTGTTGTTACTGCACACGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCCTTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTCCCTTTAATGATTGGCGCTCCAGATATGGCTTTTCCACGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCACCGGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTTGAATCAGGTGCCGGTACAGGTTGGACTGTTTATCCACCATTATCTAGTGTACAAGCTCACTCGGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCATCATTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGCGAGCTCCAGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCAGTATTAATTACGGCTTTTCTTTTATTATTAACCTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACGGATAGAAATTTAAACACTTCTTTTTATGATCCATCTGGTGGGGGAGATCCCGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTCTTCGGTCATCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCAATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCGATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTCGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCCTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTCGTTATGGGTGGCGTAACAGGTGTAGTTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCCTTACACGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACAGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCTGAAGTTTTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGTG 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AATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTATTGTTGGTACAACTTTATCACTTTTAATCCGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAACTATATAACGTTGTTGTTACTGCACACGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCCTTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTCCCTTTAATGATTGGCGCTCCAGATATGGCTTTTCCACGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCACCGGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTTGAATCAGGTGCCGGTACAGGTTGGACTGTTTATCCACCATTATCTAGTGTACAAGCTCACTCGGGACCTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCATCATTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGCGAGCTCCAGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCAGTATTAATTACGGCTTTTCTTTTATTATTAACCTTACCTGTATTAGCTGGTGCAATTACTATGTTATTAACGGATAGAAATTTAAACACTTCTTTTTATGATCCATCTGGTGGGGGAGATCCCGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTCTTCGGTCATCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCAGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCAATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCGATTGTATGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACTCGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCCTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTCGTTATGGGTGGCGTAACAGGTGTAGTTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCCTTACACGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACAGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCAGGTCGTAGATATCCTGAAGTTTTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGTG Phytophthora_nicotianae_AY129169 AATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTAGGTACAACACTATCTCTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCTGGTAATCAAATTTTTATGGGTAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACAGCACATGCTTTTATTATGGTATTTTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGGTTTGGTAACTGGTTTGTACCTTTAATGATAGGTGCTCCTGATATGGCATTTCCTCGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTAGAATCTGGTGCTGGTACTGGTTGGACTGTTTATCCCCCATTATCTAGTGTACAAGCACATTCAGGTCCTTCTGTAGATTTAGCGATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTCGTATGGTCTATATTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGAGCAATTACTATGTTATTAACAGATAGAAATTTAAATACTTCTTTTTATGATCCATCTGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAAGTTTATGTATTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATTAGTCAAGTTTCTGCTGCTTTTGCTAAAAAAAATGTATTCGGTTATTTAGGAATGGTTTATGCAATGTTATCTATTGGTTTATTAGGTTCAATTGTATGGGCACATCATATGTTTACAGTTGGTTTAGATGTAGATACAAGAGCTTATTTTTCTGCAGCTACTATGATTATTGCGGTACCAACAGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCAACCTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACACCATTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTATGGGTGGAGTAACTGGTGTAGCTATGTCTAATTCAGGTTTAGATATTGCATTACATGATACTTATTATATTGTAGGACACTTCCATTATGTTTTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCAGAAGTTTTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTCTTTATTGGAG Phytophthora_infestans_AY129165 AATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTTGGTACAACATTTTCTCTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTTACCGCACATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATCGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTATTCCTTTAATGATAGGTGCTCCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCTTCTTTATTATTATTAGTTTCTTCAGCTATCGTTGAATCTGGGGCTGGTACTGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCTAGTGTTCAAGCACATTCAGGACCTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCTTCTTTATTAGGTGCTATTAATTTTATTTCAACAATTTATAATATGAGAGCTCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTATGGTCTATATTAATTACTGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTACTAGCTGGGGCAATTACTATGTTACTAACTGATAGAAATTTAAACACTTCATTTTATGATCCATCAGGTGGAGGTGATCCAGTATTATATCAACATCTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCAGAGGTTTATGTTTTAATTTTACCAGCATTTGGTATTATCAGTCAAGTTTCTGCATCTTTTGCAAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGTATGGTTTATGCTATGTTATCTATAGGTTTACTAGGTTCAATTGTATGGGCGCACCACATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTAGATACACGCGCTTACTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCGGTACCAACGGGTATTAAAATATTTAGTTGGTTAGCAACTTTATGGGGAGGTTCTCTAAAATTTGAAACACCTTTATTATTTGTTTTAGGTTTTATTTTATTATTTGTTATGGGCGGAGTAACTGGTGTAGCTATGTCGAATTCGGGTTTAGATATTGCATTACATGATACCTATTATATTGTGGGGCATTTTCATTATGTATTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTTTATTTTTGGATTGGAAAAATTTCTGGTCGTAGATATCCTGAAATTTTAGGACAAATTCATTTTTGGTTATTTTTTATTGGGG Phytophthora_multivora_DDS1450_FJ237504 AATTTTTAGTGCTTTTGCTGGTGTTGTTGGTACAACATTATCTTTATTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCTGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTTGTTGTAACTGCACATGCTTTTATTATGGTTTTCTTTTTAGTTATGCCTGCTTTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATAGGTGCACCTGATATGGCTTTCCCACGTATGAATAATATAAGTTTTTGGTTATTACCTCCAGCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTATTGTAGAATCTGGTGCTGGTACAGGTTGGACAGTTTATCCACCATTATCTAGTGTACAAGCACATTCTGGACCATCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAACAGGTATTTCTTCATTATTAGGTGCAATTAATTTTATTTCTACTATTTATAATATGCGAGCTCCAGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTGTTTTAATTACAGCATTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCGGGTGCAATTACTATGTTATTAACTGATAGAAATTTAAATACATCTTTTTATGATCCTTCAGGAGGAGGTGATCCTGTATTATATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCTGGATTTGGTATAATTAGTCAAGTTTCTGCCCGCTTTGCTAAAAAAAATGTATTTGGTTATTTAGGAATGGTATATGCAATGTTATCTATAGGTTTATTAGGTTCAATCGTTTGGGCACATCATATGTTTACTGTTGGTTTAGATGTTGATACTAGAGCTTATTTTTCAGCAGCTACTATGATTATTGCAGTACCTACTGGTATTAAAATTTTTAGTTGGTTAGCTACTTTATGGGGTGGTTCTTTAAAATTTGAAACTCCTTTATTATTTACTTTAGGATTTATTTTATTATTTGTTATGGGAGGTGTAACTGGTGTAGTTATGTCAAATTCTGGTTTAGATATTGCAATACATGATACTTATTATATTGTAGGACATTTTCATTATGTTTTATCTATGGGTGCTGTTTTTGGTATATTTACTGGATTCTATTTTTGGATTGGTAAAATTTCAGGACGTAGATATCCAGAAATATTAGGTCAAATTCATTTTTGGTTATTTTTTATTGGAG ; END; BEGIN TREES; Title 'cox-clade 6'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Phytophthora_personii_VHS14081_HQ12877, 2 Phytophthora_inundata_VHS19081_HQ12861, 3 Phytophthora_inundata_VHS16836_HQ12860, 4 Phytophthora_sp_DH02_HQ12883, 5 Phytophthora_sp_DH03_HQ12884, 6 Phytophthora_sp_CLJO100_HQ12881, 7 Phytophthora_sp_HSA2530_HQ12887, 8 Phytophthora_sp_HSA2313_HQ12885, 9 Phytophthora_sp_TCH009_HQ12889, 10 Phytophthora_sp_HSA2529_HQ12886, 11 Phytophthora_sp_DDS2909_HQ12882, 12 Phytophthora_megasperma_PHTCYTOX_L04457_1, 13 Phytophthora_megasperma_VHS17183_HQ12868, 14 Phytophthora_megasperma_DDS3432_HQ12867, 15 Phytophthora_taxon_PgChlymaydo_VHS3753_HQ12878, 16 Phytophthora_taxon_PgChlymaydo_VHS6595_HQ12879, 17 Phytophthora_taxon_salixsoil_HSA1959_HQ12880, 18 Phytophthora_gonapodyides_SPLA72_HQ12850, 19 Phytophthora_gonapodyides_292_78237_AY129175, 20 Phytophthora_thermophila_LUNENBURG_HQ12869, 21 Phytophthora_thermophila_VHS3655_HQ12870, 22 Phytophthora_thermophila_VHS7474_HQ12871, 23 Phytophthora_thermophila_VHS16164_HQ12875, 24 Phytophthora_thermophila_VHS13530_HQ12872, 25 Phytophthora_thermophila_VHS13567_HQ12873, 26 Phytophthora_thermophila_VHS13761_HQ12874, 27 Phytophthora_litoralis_DH135_HQ12862, 28 Phytophthora_litoralis_DH138_HQ12863, 29 Phytophthora_litoralis_VHS17085_HQ12864, 30 Phytophthora_litoralis_VHS19173_HQ12865, 31 Phytophthora_litoralis_VHS20763_HQ12866, 32 Phytophthora_taxon_palustris_SPLA166_HQ12876, 33 Phytophthora_taxon_raspberry_RAS1_HQ12888, 34 Phytophthora_gregata_DCE68_HQ12851, 35 Phytophthora_gregata_MJS235_HQ12853, 36 Phytophthora_gregata_MJS238_HQ12854, 37 Phytophthora_gregata_SPLA107_HQ12855, 38 Phytophthora_gregata_HSA2356_HQ12852, 39 Phytophthora_gregata_VHS9854_HQ12856, 40 Phytophthora_gregata_VHS21961_HQ12857, 41 Phytophthora_gregata_VHS21962_HQ12858, 42 Phytophthora_gregata_VHS21992_HQ12859, 43 Phytophthora_gibbosa_VHS21998_HQ12846, 44 Phytophthora_gibbosa_VHS21999_HQ12847, 45 Phytophthora_gibbosa_VHS22007_HQ12848, 46 Phytophthora_gibbosa_VHS22008_HQ12849, 47 Phytophthora_asparagi_VHS17175_HQ12844, 48 Phytophthora_asparagi_VHS17644_HQ12845, 49 Phytophthora_nicotianae_AY129169, 50 Phytophthora_infestans_AY129165, 51 Phytophthora_multivora_DDS1450_FJ237504; TREE COX1 = (1,(((2,3),(4,5)),(((((((6,9),(7,8)),(10,11)),(15,16)),((12,(13,14)),(18,19))),(((20,((21,(22,23)),24,25,26)),((27,28,29,30),31)),(32,(((33,(((35,36),42),(37,38))),((34,41),39,40)),(43,44,45,46))))),((17,((49,50),51)),(47,48))))); TREE COX1_BS = (((1:100.0,((2:100.0,3:100.0):97.454842,(4:100.0,5:100.0):94.216995):99.966667):79.105774,(((6:100.0,9:100.0):54.566116,(7:100.0,8:100.0):81.992035):51.002258,(10:100.0,11:100.0):99.719139):98.573334,((12:100.0,(13:100.0,14:100.0):66.512909):100.0,(18:100.0,19:100.0):100.0):82.077751,(15:100.0,16:100.0):100.0,17:100.0,((20:100.0,((21:100.0,(22:100.0,23:100.0):67.082947):95.102997,24:100.0,25:100.0,26:100.0):61.725494):100.0,((27:100.0,28:100.0,29:100.0,30:100.0):87.639641,31:100.0):100.0):77.616219,(32:100.0,(((33:100.0,(((35:100.0,36:100.0):59.518826,42:100.0):99.962166,(37:100.0,38:100.0):96.834053):55.295841):68.699158,((34:100.0,41:100.0):63.773666,39:100.0,40:100.0):90.829369):92.602386,(43:100.0,44:100.0,45:100.0,46:100.0):100.0):81.179077):93.658173,(47:100.0,48:100.0):100.0):94.481316,((49:100.0,50:100.0):99.572685,51:100.0):0.0); TREE COX1_BAYES = (1,(((2,3),(4,5)),(((6,(7,8),9,(10,11)),(((((12,(13,14)),(18,19)),((20,((21,(22,23)),24,25,26)),((27,28,29,30),31))),(32,(((33,((35,36,42),(37,38))),(34,41),39,40),(43,44,45,46)))),(15,16))),(17,((47,48),((49,50),51)))))); END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED = universal: 1 - 1205; END; BEGIN SETS; CHARSET excluded = 1190 - 1205; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS gapmode = newstate; TYPESET * UNTITLED = unord: 1 - 1205; EXSET * UNTITLED = 1190 - 1205; EXSET excluded = 1190 - 1205; END;