NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:03:31] [Matrix accession#: M1652] BEGIN TAXA; TITLE M1652; DIMENSIONS NTAX=41; TAXLABELS Otthia_spiraeae_IMI63581 'Fusicoccum vitifusiforme STE-U 5252' 'Fusicoccum vitifusiforme STE-U 5050' 'Fusicoccum viticlavatum STE-U 5044' 'Fusicoccum viticlavatum STE-U 5041' 'Diplodia porosum STE-U 5132' 'Diplodia porosum STE-U 5046' Diplodia_sarmentorum 'Diplodia sp. STE-U 5148' 'Diplodia sp. STE-U 5048' 'Cercospora penzigii STE-U 4001' 'Cercospora beticola STE-U 5073' Botryosphaeria_stevensii Botryosphaeria_ribis_CMW7773_AY236936_and_AY236877 Botryosphaeria_ribis_CMW7772_AY236935_and_AY236877 'Botryosphaeria rhodina STE-U 5051' 'Botryosphaeria rhodina STE-U 4419' 'Botryosphaeria parva STE-U 5253' 'Botryosphaeria parva STE-U 5142' 'Botryosphaeria parva STE-U 5049' 'Botryosphaeria parva STE-U 4589' 'Botryosphaeria parva STE-U 4584' 'Botryosphaeria parva STE-U 4540' 'Botryosphaeria parva STE-U 4530' 'Botryosphaeria parva STE-U 4439' 'Botryosphaeria parva STE-U 4438' 'Botryosphaeria parva STE-U 4437' 'Botryosphaeria parva STE-U 4424' 'Botryosphaeria parva STE-U 4420' 'Botryosphaeria parva STE-U 4417' Botryosphaeria_parva_CMW9079_AY236941_and_AY236888 Botryosphaeria_parva_CMW9078_AY236940_and_AY236885 'Botryosphaeria obtusa STE-U 5034' 'Botryosphaeria obtusa STE-U 4542' 'Botryosphaeria lutea STE-U 4593' 'Botryosphaeria lutea STE-U 4592' 'Botryosphaeria dothidea STE-U 5045' 'Botryosphaeria dothidea STE-U 4595' 'Botryosphaeria australis STE-U 4598' 'Botryosphaeria australis STE-U 4425' 'Botryosphaeria australis STE-U 4415' ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M1652; DIMENSIONS NCHAR=950; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ; MATRIX Otthia_spiraeae_IMI63581 AGGATCATTACCGAGTTGATTC-GAGCTCCGG-CTCGACTCTCCCACCCTTTGTGTACCTACCTCTGTTGCTTTGGCGGGCC---CG----CGGT----CGGC-----CTCG-TGCC------GTCC-AGCAC---CCGCCAGAGGA-CTACAAAACTCCAGTCAGTGAACGTCTCAGTCTGAAAAACAAGTTAAT-AAACTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTATTGGGCTCCGTCCTC---AGGGACGCGCCTCAAAGACCTCGGCGGTGGC-GTCTTGCC-TCAAGCGTAGTAGAAAACAC--CTCGCTTTGGAGCGCACGGCG-TCGCCCGCCGGACGAA-CCTT-TGAATT-TTTCTCAA-GGTTGACCTCGGAT-----NNNN----------------CATCGAGAAG-TTCGAGAAGG----TAAGAAAC-----TTTTCCGCTCCTTC------AC--ACC----------------CACCT------------------------GACATTTGCCTTGT-----CGCTCTGGTGAGGGGCATTTTCGATGGTGGGGT-TGGCCCGCGCGCTAAACCTCGTTTGCGCTTCGGCAAAATCTCCACATTTGATTTTTCCTTT--GCGCCCGG-TGTC--ACCCCGA----TGCCCCCGATGC-GCGCGTCCCTCACCAAAAA-CT-TTGA-------------GCCACTCA---GCGATCAGCT-GCTAATG--CC-TG-CT-GCAGGAAG-CCGCCGAGCTCGGTAAGGGTTCCTTCAAGTA- 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Botryosphaeria_ribis_CMW7772_AY236935_and_AY236877 AGGATCATTACCGAGTTGATTC-GAGCTCCGG-CTCGACTCTCCCACCCAATGTGTACCTACCTCTGTTGCTTTGGCGGGCCGC-GGTCCTCCGC--ACCGGCG-CCC-TT--CGGGGGGGCTGGCC-AGCGC---CCGCCAGAGGACCA-TAAAACTCCAGTCAGTGAACTTCGCAGTCTGAAAAACAAGTTAAT-AAACTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTATTGGGCTCCGTCCTC--CACGGACGCGCCTTAAAGACCTCGGCGGTGGC-GTCTTGCC-TCAAGCGTAGTAGAAAACAC--CTCGCTTTGGAGCGCACGGCG-TCGCCCGCCGGACGAA-CCTT-TGAATTATTTCTCAA-GGTTGACCTCGGAT-----NNNN----------------------GAAG-TTCGAGAAGG----TAAGAAAG-----TTTTTCCTTCCGCTGCACGCGCTGGGTGCTGGGTGCTGGGTGCTGGGTGCTGGGT----TCCCGC----AC-TCAATTTGCCTTAT-----CGCTTCGGTGAGGGGCA-TTTTGGTGGTGGGGT-TGGCCCGCGCGCTAAGCCTCGTTCGGGCT-CGGCAAAATGTCCGCATCTGGTTTTTTT-----GCGACCGG-CGTG--CGACCGAAG--CGC------------A--CCCCTC--------------GCC-AGA-----CACGCCACGCATGTGCGACCAGAC-GCTAAC----GGCC-ATCCCAGGAAG-CCGCCGAGCTCGGTAAGGGT-CC--------- 'Botryosphaeria rhodina STE-U 5051' 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Botryosphaeria_parva_CMW9078_AY236940_and_AY236885 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