#NEXUS [NEXUS FILE GENERATED BY WINCLADA (Copyright 2002 K.C. Nixon); THIS DOES NOT CONSTITUTE ENDORSEMENT OF THIS FORMAT, NOR GUARANTEE ACCURACY] BEGIN DATA; DIMENSIONS NTAX=43 NCHAR=3437; FORMAT MISSING=? 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Panicum_pyrularium ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATTTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGCCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTAGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAATTGGATTCCTAATAATGGTATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCCCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTTTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAGTTTAATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATGCTTATTCAAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTACTAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGAATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGCCAATAGGGATTTTGTTTTATCAACAATGAAGAGTGGGGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCCAAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGGACTCCC????????????????????????TTTGTGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTAAAATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn?AGAGAAATAAACGATTCAATGATCAAATAATAATACTAGTCTGTTATGGTTGGAGAGGAGGTAACAGGATCCACTCAAACATTAGAGTGGAAGTGTGTTGAATCAAGAGTAGATAGTAAGCGTCTTTATTATGGTCGTTTCATTTTGTCCCCGCTTAGAAAAGGTCAAGCAGATACTGTCGGTATTGCCTTGCGAAGAGCTTTACTTGGAGAAATAGAAGGAACATGTATCACACGCGCCAAATTTGGGAACGTGCCGCACGAATATTCTACAATAGTAGGTATTGAAGAATCCATACAAGAAATTTTACTAAATTTGAAAGAAATTGTATTGAGAAGTAATCTCTATGGAGTTAGAGACGCATCAATTTGTGTCAAAGGTCCTAGATACATAACCGCTCAAGATATAATCTTACCGCCTTCCGTAGAAATCGTTGATACGACACAACCTATAGCTAACTTGAGAGAGCCCATTGATTTCTATATTGAGTTACAGATCAAGAGAGATCGCGGATATCATACGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn? 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Panicum_arctum ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGCCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCG?????????????????????????GGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTAGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAATTGGATTCCTAATAATGGTATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCCCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTTTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAGTTTAATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTTTAGGTATAGGTTCTTATCAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCnAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTACTAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGAATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTTTTATCAACAATGAAGAGTGGGGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCCAAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGGACTCCC????????????????????????TTTGTGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTTTGAATTCCCTTGT??????AAAAGGGAATCCAAAAAAGAACTTTTTAAATGAAGTAAAAAAAAAAATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTCTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACGCATTTTTTCGATAAAGGTGTCATTGATGGAATTACCAATGGAGTA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Panicum_bartlettii ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTTTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTATAGGTTCTTCTCAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAGGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGTCAATAGAGATTTTGTTTTACCAACAATGAAGAGTGGGGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCCCAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGATAGGGTCCTTTAGTACTCCC????????????????????????TTTGTGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGGTAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCACTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTTTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCTAAATTCCCTTGTAAAAGTAAAAGGGAATCAAAAAAAAAACTTTTTGAATGAAGTAAAAAAAAAGATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; ENDBLOCK; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE=unord PolyTcount=MINSTEPS ; ENDBLOCK; BEGIN TREES; TRANSLATE 1 Zea_mays, 2 Anthaenantiopsis_rojasiana, 3 Paspalum_foliiforme, 4 Paspalum_bertonii, 5 Acroceras_zizanoides, 6 Echinochloa_cruspavonis, 7 Echinochloa_chacoensis, 8 Oplismenus_burmanii, 9 Panicum_sellowii_, 10 Sacciolepis_vilvoides_, 11 Sacciolepis_angustissima, 12 Sacciolepis_myuros, 13 Panicum_trichanthum, 14 Panicum_trichoides, 15 Panicum_brevifolium, 16 Panicum_hirtum, 17 Panicum_heterostachyum, 18 Panicum_margaritiferum, 19 Panicum_gracilicaule, 20 Panicum_tenellum, 21 Panicum_dinklagei, 22 Panicum_parvifolium, 23 Panicum_wettsteinii, 24 Panicum_cyanescens, 25 Panicum_schwackeanum, 26 Panicum_pseudisachne, 27 Panicum_subulatum, 28 Panicum_auricomum, 29 Panicum_granuliferum, 30 Panicum_rivale, 31 Panicum_polycomum, 32 Panicum_machrisianum_, 33 Panicum_caaguazuense, 34 Panicum_nervosum, 35 Panicum_micranthum, 36 Panicum_pyrularium, 37 Panicum_natalense, 38 Panicum_brazzavillense, 39 Panicum_millegrana, 40 Sacciolepis_indica_, 41 Panicum_verrucosum, 42 Panicum_arctum, 43 Panicum_bartlettii ; [NOTE: THE COMMAS IN THE NEXUS TREE FORMAT ARE UNNECESSARY AND CONFUSING] TREE t1 =(1,((((43,((14,(17,(15,16))),(9,39))),(13,(41,(((21,(((((33,(24,(23,(27,31)))),(32,(26,28))),(34,(30,(29,(35,(36,42)))))),(22,25)),(20,38))),(37,(18,19))),(11,(10,(12,40))))))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t2 =(1,((((43,((14,(17,(15,16))),(9,39))),(13,(41,(((21,((34,((((33,(24,(23,(27,31)))),(32,(26,28))),(30,(29,(35,(36,42))))),(22,25))),(20,38))),(37,(18,19))),(11,(10,(12,40))))))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t3 =(1,((((13,((41,((21,(((((33,(24,(23,(27,31)))),(32,(26,28))),(34,(30,(29,(35,(36,42)))))),(22,25)),(20,38))),(37,(18,19)))),(11,(10,(12,40))))),(43,((14,(17,(15,16))),(9,39)))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t4 =(1,(((((14,(43,(17,(15,16)))),(9,39)),(13,(41,(((21,(((((33,(24,(23,(27,31)))),(32,(26,28))),(34,(30,(29,(35,(36,42)))))),(22,25)),(20,38))),(37,(18,19))),(11,(10,(12,40))))))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t5 =(1,(((((14,(43,(17,(15,16)))),(9,39)),(13,(41,(((21,((34,((24,(((23,(33,(27,31))),(32,(26,28))),(30,(29,(35,(36,42)))))),(22,25))),(20,38))),(37,(18,19))),(11,(10,(12,40))))))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t6 =(1,((((((14,43),(17,(15,16))),(9,39)),(13,(41,(((21,(((24,(23,((33,(31,(27,(32,(26,28))))),(22,25)))),(34,(36,(30,(29,(35,42)))))),(20,38))),(37,(18,19))),(11,(10,(12,40))))))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t7 =(1,((((43,((14,(17,(15,16))),(9,39))),(13,(41,(((21,(((24,(23,((33,(31,(27,(32,(26,28))))),(22,25)))),(34,(36,(30,(29,(35,42)))))),(20,38))),(37,(18,19))),(11,(10,(12,40))))))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t8 =(1,((((13,((41,((21,(((24,(23,((33,(31,(27,(32,(26,28))))),(22,25)))),(34,(36,(30,(29,(35,42)))))),(20,38))),(37,(18,19)))),(11,(10,(12,40))))),(43,((14,(17,(15,16))),(9,39)))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t9 =(1,((((13,((41,((21,((34,(27,(24,(((31,(33,(23,(28,(26,32))))),(30,(29,(35,(36,42))))),(22,25))))),(20,38))),(37,(18,19)))),(11,(10,(12,40))))),(43,((14,(17,(15,16))),(9,39)))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t10 =(1,(((((43,(14,(17,(15,16)))),(9,39)),(13,(41,(((21,((34,(31,(24,((23,((33,(27,(22,25))),(30,(29,(35,(36,42)))))),(28,(26,32)))))),(20,38))),(37,(18,19))),(11,(10,(12,40))))))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t11 =(1,(((((43,(14,(17,(15,16)))),(9,39)),(13,(41,(((21,((31,(24,((23,((33,(27,(22,25))),(34,(30,(29,(35,(36,42))))))),(28,(26,32))))),(20,38))),(37,(18,19))),(11,(10,(12,40))))))),(5,(8,(6,7)))),(2,(3,4)))); TREE t12 =(1,((2,(3,4)),((5,(8,(6,7))),((14,43,(17,(15,16)),(9,39)),(13,(41,((21,((23,24,27,31,33,34,(26,28,32),(29,30,35,36,42),(22,25)),(20,38))),(37,(18,19))),(11,(10,(12,40))))))))); ENDBLOCK;