#NEXUS [written Mon Nov 15 21:42:15 EST 2010 by Mesquite version 2.73 (build 544) at ComPhy.local/10.0.1.7] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=31; TAXLABELS Lepechinia_salviaefolia Lepechinia_radula Lepechinia_lamiifolia Lepechinia_mexicana_Pueblo Lepechinia_mexicana_Hidalgo Lepechinia_calycina Chaunostoma_mecistandrum Neoeplingia_leucophylloides Lepechinia_hastata Lepechinia_glomerata Lepechinia_caulescens Lepechinia_chamaedryoides Melissa_officinalis Dorystaechas_hastata Rosmarinus_officinalis Perovskia_atriplicifolia Salvia_officinalis Salvia_roemeriana Salvia_henryi Salvia_greatae Salvia_polystachya Salvia_mellifera Salvia_axillaris Salvia_patens Meriandra_bengalensis Zhumeria_majdae Salvia_aristata Salvia_przewalskii Salvia_sclarea Horminum_pyrenaicum Hedeoma_piperitum ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE nrDNA; DIMENSIONS NCHAR=1156; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Lepechinia_salviaefolia 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Salvia_officinalis 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Salvia_roemeriana 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Salvia_henryi 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Salvia_greatae 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Salvia_polystachya 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Salvia_mellifera 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Salvia_axillaris 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Salvia_patens 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Salvia_przewalskii 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Salvia_sclarea AAACCTGCAA-AGCAGACCGCGAACACGTGTTTAACACCGACCGAC-GGCG-CA--CGGCTCGGGGG--CGA--CCCCG-CTCCGTGCCGC-CGTCGA-----CCCCGCCCGCGCGTTCCC-TC---GGGT-C-GCGCGGCGCGGGCTAACGAACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTAAACGAA-GCGTCCGCCC-CC---CGCGCCCCGTTCGCGGAGT----GCGC-GGGGG-CGTCGGACGTCTATC-----AAATGTCATAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCGCGTCGCCCCCCACCACA----------------TGCGGGGGCGGATACTGGCCTCCCGTGCGCCCC-GGCGCGCGGCTGGCCCAAATGCGATCCCTCGGCGACTCGTGTCACGACAAGTGGTGGTTGAAAT-CTCAATCTCTTGCGCCGTCGTGCCGCTGCGTCGTCC-GTGAGGGCATCCATCAAC----AACCCAACGGCC-GGT------GCGCCTCGCGGCGCCCGA-------CCTTCGACCGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATTGTTTGGGCATGTTGGATCCCTGCTCCGGGCAGCGACAACGTTTCCTCCGCGCCTCTTCAGT---TGTTGGCTAGAG--CACGTGCTCGTCCGATTTTCGGTTTTCCTGTGCTGAATACCTATCACGAAGGCAT--TCTGTCGGCTAAAAATGTCCATTTCCCGCCTTGCGCTGCGTGCT-CCTCGTGAGCA-AGCGGTGCGGGGTGGGCCATATC-GTGCACGTCGTGTATCGCAC-CGCGTTCGACCC-TCCG--GGGCGTTCGGGTTGACGACCCACGACGTGATGCTCGATATCTCGGATACGGAACATCACGTGGG---TACGAGG--CCAT-CG-GCCTCCGAGCACCACAAAAAA--GCGTTCTACGCTTCGTGCGAACGACCGTCGTTCCCGGCCTTGCGCCGCGCTCTCGTAGCTCGGTTCA-AGTCGGGCCGAC-GT-CGG Horminum_pyrenaicum AAACCTGCAAGAGCAGACCGCGAACACGTGTTTAACGCA-----AC-GGGGACA--CGGCGCGGGGACGCGAGTCCTCC-GTT-GTGTCAC-CGAAT------CCCCGCCGGCGCGCACCC-TC---GGGT-C-GTGTCGTGCGGGCTAACGAACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACTGAACGAAAGCGTCCGCCCCCA---CGCACCCCGTTCGCGGGGA----TTGC-GTGGG-GACCGGTCGTCTATC--A--AAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCGCGTCGCCCCATCGCGCATGAACTTGCC-GGCGAGGGGGGGGCGGATATTGGCCCCCCGTGCGCCTC-GGCGTGCGGTCGGCCGAAATTCGATCCCTCGGCGACTCGTGTCACGACAAGTGGTGGTTGAACGTCTCAATCTC--GCATCGTCGTGCTCCCGCGTCGTCC-GAACGGGCATCCTCGAAC----GACCCAACGGTG-TCG------GCGCTTCACGGCGCCCCA-------C-------------------------------GTTTCGGTGTGTCGGATCCCTGCTC-GGGCAGCGACGGCATTTCCCGCACGTCTCTTCATT---TGTTGGCGCGAG--CGTGAGCTCGGCCGATGTT-GGTTTTCCTGTGCTGAATACCTATCGCGAAGGCAT--TAAGTCGGCTAGAATCGTCTCTTTCCCGTCTTGCGCTGC-TGCT-CCTTGCGGGCA-AGCGGTGCGGGATGGGCCGAATG-GCTCACGTTGTGTGTTACATTCCCGTTCTCCTA-TAAAA-GGAGGATCGGGTTGATGACCCACGACCGATAGCTTGGTCTCTCGGGTGCGGAACATCGTGTGGG---TACGGGG--ACAT-CG-GTCCTTGATTACCACAAACAA--GCGTTCTACGCTTCGTGCGAACGACGGCCGGTTC-GGTCTTTGGCCTYGCCCTCGTGGCTTGGTTCGGAGTCGGTCCGAC-GT-CGA Hedeoma_piperitum AAACCTGCAA-AGCAGACCGCGAACACGTAACTAACACC-----GC-GG-G-CA--CGGCGCGGGGG--CAA--CCCCCTGCC-GTGTC-C-CGTC-------TCCTGCCGACGTGCTCCC-TC---GGGT-C-ACGCCGTGCGGGCTAACGAACCCCGGCGCGGAATGCGCCAAGGAAAACCGAACGAA-GCGTCCGCCC-CC---GGCATCCCGTTCGCGGAGC----GTGC-CGCGG-GATCGGGCGTCTATC-----AAATGTCAAAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCGAAGCCATTAGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCGCGTCGCCCCCCCGCGCG---CATCGCCGGGCG-GTCGGGGGCGGACACTGGCCTCCCGTGCGCCTC-GGCGTGCGGCTGGCCCAAATGAGATCCCCGGGCGACTGGCGTCACGGCAAGTGGTGGTTGAACATCTCAATCTCTCTCGTGGTCGTGCCGCCGTGTCGTCCCGTATGGGAATCGAA-AAT----GACCCAACGGTGCACG------GCGCG-AACAGCGTCTCA-------CCTTCGACCGCGACCCCAGGTCAGGCGGGATTGTATT-GCGTGATGGATCCCTGCTC-GGGCAGCGACATCATCTCATCCACGACTCTTCATT---TGTTGGTGCCAG--CATGTGCTCGGCCGGTGTT-GGTTTTCCTGTGCTAGATACCCGTATYGT-GGCATCGAATGTTGGTTACA-TTGTCCCTCAGCCCCCTCGTGCTGC-TGCT-CCTTGCGGGCA-AGCGGCGCGGGTTGGCCCATATG-GCGCACGCCGTGTGTCCCAT-CCCGTTGACCCCGTAAGAAGGGCGTCCGGGCTGACGATCCACGGCTTGATGCTCGGTCCCTTGGGTACGGAACGTCGTGTGGGGTATACGGGG--CCGT-CG-GCCTCGGAGCACCCCCAAYAA--GCGTTCTACGCTTCGTGCGAACGACCGTTGGCCC-AGTCTCTGGC-TGGCCCTCGTGGCTTGGCTCAGGACCGTGCCGGC-GT-CGG ; END; BEGIN TREES; Title ML_nrDNA; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Lepechinia_salviaefolia, 2 Lepechinia_radula, 3 Lepechinia_lamiifolia, 4 Lepechinia_mexicana_Pueblo, 5 Lepechinia_mexicana_Hidalgo, 6 Lepechinia_calycina, 7 Chaunostoma_mecistandrum, 8 Neoeplingia_leucophylloides, 9 Lepechinia_hastata, 10 Lepechinia_glomerata, 11 Lepechinia_caulescens, 12 Lepechinia_chamaedryoides, 13 Melissa_officinalis, 14 Dorystaechas_hastata, 15 Rosmarinus_officinalis, 16 Perovskia_atriplicifolia, 17 Salvia_officinalis, 18 Salvia_roemeriana, 19 Salvia_henryi, 20 Salvia_greatae, 21 Salvia_polystachya, 22 Salvia_mellifera, 23 Salvia_axillaris, 24 Salvia_patens, 25 Meriandra_bengalensis, 26 Zhumeria_majdae, 27 Salvia_aristata, 28 Salvia_przewalskii, 29 Salvia_sclarea, 30 Horminum_pyrenaicum, 31 Hedeoma_piperitum; TREE PAUP_1 = (((((((7:0.026835,(8:0.022076,(4:0.012316,5:0.001123):0.00688):0.002901):0.009185,6:0.066347):0.006893,((1:0.01361,2:0.014304):0.003894,3:0.017981):0.009778):0.004908,(12:0.024929,(10:0.011819,(11:0.01704,9:0.01282):0.002994):0.030017):0.009202):0.018968,13:0.041795):0.016366,((28:0.071724,((26:0.026386,27:0.07143):0.033494,(((((23:0.09952,21:0.069319):0.017933,24:0.056181):0.01789,20:0.041856):0.003219,22:0.091297):0.013412,(14:0.028508,25:0.021464):0.003818):0.013074):0.011421):0.0125,((29:0.070163,(17:0.043004,(19:0.010102,18:0.012901):0.041139):0.01013):0.0149,(16:0.028269,15:0.084097):0.004183):0.005156):0.012023):0.024479,(30:0.096216,31:0.108674):0.0); END;