#NEXUS
[written Wed Nov 17 22:42:06 EST 2010 by Mesquite  version 2.73 (build 544) at ComPhy.local/10.0.1.7]

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	TITLE  '12 non-coding cpDNA regions';
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	MATRIX
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	Hedera_canariensis              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	Hedera_iberica                  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	Hedera_maderensis               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	Hedera_maroccana_SpanishCanary  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	Hedera_nepalensis_Sinensis      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	Hedera_nepalensis               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	Hedera_rhombea_Pierot           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	Fatsia_japonica                 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	Brassaia_actinophylla           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	Polyscias_fruitocosa            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	Trevesia_sundaica               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;



END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
	TYPESET * UNTITLED   =  unord:  1 -  9972;

END;

BEGIN TREES;
	Title '12 non-coding cpDNA regions';
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Hedera_algeriensis,
		2 Hedera_azorica_Pico,
		3 Hedera_azorica_SaoMiguel,
		4 Hedera_helix_MDinvasive,
		5 Hedera_helix_CAinvasive,
		6 Hedera_algeriensis_CAinvasive,
		7 Hedera_canariensis,
		8 Hedera_colchica,
		9 Hedera_cypria,
		10 Hedera_helix_EmeraldGem,
		11 Hedera_helix_Baltica,
		12 Hedera_helix_rhizomatifera,
		13 Hedera_helix_caucasigena,
		14 Hedera_helix_NCinvasive,
		15 Hedera_hibernica_WAinvasive1,
		16 Hedera_hibernica_hibernica,
		17 Hedera_hibernica_WAinvasive2,
		18 Hedera_iberica,
		19 Hedera_maderensis,
		20 Hedera_maroccana_SpanishCanary,
		21 Hedera_maroccana,
		22 Hedera_nepalensis_Sinensis,
		23 Hedera_nepalensis,
		24 Hedera_pastuchovii_1,
		25 Hedera_pastuchovii_2,
		26 Hedera_rhombea,
		27 Hedera_rhombea_Pierot,
		28 Fatsia_japonica,
		29 Brassaia_actinophylla,
		30 Polyscias_fruitocosa,
		31 Schefflera_sp,
		32 Trevesia_sundaica;
	TREE PAUP_1 = (((((((((1:0.0,6:0.0):1.0,((2:1.0,3:0.0):0.0,19:0.0):4.0):0.0,(((4:0.0,14:0.0):2.0,13:1.0):3.0,9:4.0):1.0):0.0,((((((5:0.0,10:0.0):1.0,11:0.0):0.0,15:0.0):0.0,16:0.0):0.0,17:0.0):2.0,(8:2.0,(22:0.0,((((23:2.0,24:2.0):0.0,27:0.0):0.0,26:0.0):0.0,25:0.0):0.0):0.0):2.0):2.0):3.0,((7:5.0,(12:0.0,18:0.0):3.0):2.0,(20:0.0,21:1.0):3.0):4.0):25.0,28:25.0):1.0,32:30.0):6.0,(29:16.0,31:30.0):33.0):0.0,30:77.0);

END;


BEGIN CODONS;
	CODESET * UNTITLED   =  universal:  1 -  9972;


END;

BEGIN MESQUITECHARMODELS;
	ProbModelSet * UNTITLED   =  'Jukes-Cantor':  1 -  9972;
END;

Begin MESQUITE;
		MESQUITESCRIPTVERSION 2;
		TITLE AUTO;
		tell ProjectCoordinator;
		timeSaved 1290051726745;
		getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa;
		tell It;
			setID 0 7001880019572646337;
		endTell;
		getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters;
		tell It;
			setID 0 3000101256723843014;
			mqVersion 273;
			checksumv 0 2 1080022174 null  getNumChars 9972 numChars 9972 getNumTaxa 32 numTaxa 32   short true   bits 15   states 15   sumSquaresStatesOnly 7732857.0 sumSquares 7732857.0   NumFiles 1 NumMatrices 1;
			mqVersion;
		endTell;
		getWindow;
		tell It;
			suppress;
			setResourcesState true false 285;
			setPopoutState 400;
			setExplanationSize 0;
			setAnnotationSize 0;
			setFontIncAnnot 0;
			setFontIncExp 0;
			setSize 700 464;
			setLocation 8 22;
			setFont SanSerif;
			setFontSize 10;
			getToolPalette;
			tell It;
			endTell;
			setActive;
			desuppress;
		endTell;
		endTell;
end;