NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:03:53] [Matrix accession#: M1712] BEGIN TAXA; TITLE M1712; DIMENSIONS NTAX=5; TAXLABELS Bursaphelenchus_sexdentati_180_IT Bursaphelenchus_sexdentati_179_GR Bursaphelenchus_sexdentati_178_DE Bursaphelenchus_sexdentati_177_GR Bursaphelenchus_poligraphi ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M1712; DIMENSIONS NCHAR=627; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ; MATRIX Bursaphelenchus_sexdentati_180_IT GGTGGTTTTGGTAATTGACTATTACCTTTAATACTTGGTTCTCCTGATATAAGGTTTCCACGTTTAAATAATTTAAGTTTTTGACTTTTACCAACTTCTTTAATATTATTTATTGATGCATGTTTTGTTGATATAGGAAGAGGTACTAGGTGAACAGTTTATCCTCCTTTAAGAACTTTAGGTCATCCTGGTAGGAGTGTTGATCTAGCAATTTTTAGTTTGCATTGTGCAGGAGTAAGTTCTATTTTAGGAGGAATTAATTTTATGTGTACTACAAAAAATTTACGTAGAAGTTCAATTTCTTTAGAACATATAAGTTTATTTGTTTGAACTATTTTTGTTACTGTTTTTCTTTTGGTTTTGTCATTACCAGTATTAGCTGGGGCTATTACTATATTATTAACTGATCGTAATATTAATACTTCTTTTTTTGATCCTAGAATAGGAGGTAATCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCCGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTGTAAGGCAAAGAACTTTGTATTTAACTGGAAAAAAAGAAGTTTTTGGTACTTTGGGTATGGTATATGCAATTTTGAGAATTGGTTTAATTGGTTGT Bursaphelenchus_sexdentati_179_GR GGTGGTTTTGGTAATTGACTTTTACCTTTAATACTTGGATCTCCTGATATAAGATTTCCACGATTAAATAATTTAAGATTTTGATTACTTCCAACTTCTTTAATATTATTGATTGATGCATGTTTTGTTGATATAGGTAGGGGTACAAGATGAACAGTTTATCCTCCTTTAAGGACTTTAGGTCATCCTGGAAGAAGAGTTGATTTAGCAATTTTTAGTTTACATTGTGCTGGGGTTAGTTCTATTCTAGGAGGTATTAATTTTATATGTACTACAAAAAATTTACGTAGAAGTTCTATTTCTTTAGAACATATAAGTTTATTTGTTTGAACTATTTTTGTTACTGTTTTTCTTTTAGTTTTGTCATTGCCGGTATTAGCAGGAGCTATTACTATGTTGTTAACTGATCGTAATATTAATACTTCTTTTTTTGACCCTAGAATAGGAGGGAACCCATTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCTGAGGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTGTAAGGCAAAGTACTTTATATTTAACTGGTAAAAAAGAAGTTTTTGGTACATTAGGTATAGTATATGCAATTTTAAGAATTGGTTTAATTGGTTGT Bursaphelenchus_sexdentati_178_DE GGTGGTTTTGGTAATTGATTATTACCATTGATATTAGGTTCACCAGATATAAGTTTTCCACGTTTAAATAATTTAAGATTTTGACTTTTACCAACTTCTTTATTTTTACTTATTGATGCATGTTTTGTTGATATAGGGGCTGGTACAAGATGAACAGTTTATCCTCCATTAAGAACTTTGGGGCACCCAGGGAGTAGAGTAGATTTAGCAATTTTTAGTTTACATTGTGCTGGTGTAAGTTCAATTTTAGGTGGTATTAATTTTATATGTACTACAAAAAATTTACGTAGGAGTTCTATTTCTTTAGAACACATAAGTTTATTTGTATGAACAATTTTTGTTACTGTTTTTCTTTTAGTTTTATCATTACCAGTTTTAGCCGGGGCTATTACTATACTTTTAACAGATCGTAATATTAATACTTCTTTTTTTGATCCTAGAATAGGGGGTAATCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGACACCCAGAAGTATATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTGTAAGTCAAAGTACTTTATATTTAACTGGTAAAAAAGAAGTTTTTGGTACTTTAGGTATGGTATATGCAATTTTAAGTATTGGTTTAATTGGTTGT Bursaphelenchus_sexdentati_177_GR GGTGGTTTTGGTAATTGATTATTACCATTGATATTAGGTTCACCAGATATAAGTTTTCCACGTTTAAATAATTTAAGATTTTGACTTTTACCAACTTCTTTATTTTTACTTATTGATGCGTGTTTTGTTGATATAGGGGCTGGTACAAGATGAACAGTTTATCCTCCATTAAGTACTTTGGGGCACCCAGGGAGTAGAGTAGATTTAGCAATTTTTAGTTTACATTGTGCTGGTGTAAGTTCAATTTTAGGTGGTATTAATTTTATATGTACTACAAAAAATTTACGTAGGAGTTCTATTTCTTTAGAACACATAAGTTTATTTGTATGAACAATTTTTGTTACTGTTTTTCTTTTAGTTTTATCATTACCAGTTTTAGCCGGAGCTATTACTATACTTTTAACAGATCGTAATATTAATACTTCTTTTTTTGATCCTAGAATAGGGGGTAACCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGACACCCAGAAGTATACATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTGTAAGTCAAAGTACTTTATATTTAACTGGTAAAAAAGAAGTTTTTGGAACTTTAGGTATGGTGTACGCAATTTTAAGTATTGGTTTAATTGGTTGT Bursaphelenchus_poligraphi GGTGGTTTTGGTAATTGGTTATTACCTTTAATATTAGGTTCACCAGATATAAGATTTCCACGTCTAAATAATTTAAGATTCTGATTATTACCTACTTCAATGATTTTATTAATTGATGCTTGTTTTGTTGATATAGGAAGTGGTACAAGATGAACTATTTATCCTCCTTTAAGAACTTTAGGTCATCCTGGGAGAAGGGTAGATTTAGCAATTTTTAGTTTGCATTGTGCTGGGGTAAGTTTTATTTTAGGGGGTATTAATTTTATATGTACTACAAAAAATTTACGTAGAAGTTCTATTTCTTTAGAGCATATAAGTTTATTTGTATGAACAATTTTTGTTACAGTATTTTTGCTAGTATTATCTTTACCTGTTTTAGCTGGGGCTATTACTATATTATTGACAGATCGTAATATTAATACATCTTTTTTTGATCCTAGAATAGGTGGGAATCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCACCCAGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTGTCAGGCAAAGAACTTTATTTTTAACCGGGAAAAAAGAGGTATTTGGGACTTTGGGGATGGTGTACGCAATTTTAAGTATTGGTTTAATTGGTTGT ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions = N: 1 - 627 ; CODESET * UNTITLED = Universal: all ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; END;