NEXUS
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[Matrix accession#: M1714]

BEGIN TAXA;
	TITLE M1714;
	DIMENSIONS  NTAX=11;
	TAXLABELS
		Bursaphelenchus_xylophilus_188_Quebec_CAN	Bursaphelenchus_xylophilus_187_New_Brunswick_CAN	Bursaphelenchus_xylophilus_186_JP	Bursaphelenchus_xylophilus_185_CAN	Bursaphelenchus_mucronatus_168_Zusmarshausen_DE	Bursaphelenchus_mucronatus_167_Gruenberg_DE	Bursaphelenchus_mucronatus_166_DE	Bursaphelenchus_mucronatus_165_FIN	Bursaphelenchus_mucronatus_164_Hanestad_NOR	Bursaphelenchus_mucronatus_163_JP	Bursaphelenchus_fraudulentus
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M1714;
	DIMENSIONS NCHAR=627;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Bursaphelenchus_xylophilus_188_Quebec_CAN              GGTGGTTTTGGTAATTGAATAGTACCTTTGATATTAGGTGCTCCTGATATAAGGTTTCCGCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGGTTATTACCTACTTCTTTATTATTACTTTTAGATGCTTGCTTTGTTGATACTGGTGCAGGAACTAGATGAACTGTTTATCCTCCATTAAGAACTTTAGGGCATCCTGGTGGAAGAGTAGACTTAGCTATTTTTAGTTTACATTGTGCAGGGGCAAGATCAATTTTAGGAGGAATTAATTTTATATGTACAACTAAAAATTTACGTAGAAGTTCAATTTCTTTAGAGCATATAAGATTATTTGTATGAACTATCTTTGTTACAGTTTTTTTGTTAGTTCTTTCTTTACCTGTATGGGCAGGAGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAACATTAATACTTCTTTTTTTGACCCAAAAATAGGAGGGAACCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTGATTTTACCTGCATTCGGGATTGTAAGTCAAAGAACTTTATATTTAACTGGTAAAAAAGAAGTTTTTGGTTCTTTAGGAATAGTTTATGCTATTTTAAGAATTGGTTTAATTGGTTGT
		Bursaphelenchus_xylophilus_187_New_Brunswick_CAN       GGTGGTTTTGGTAATTGAATAGTACCTTTGATATTAGGTGCTCCTGATATAAGGTTTCCGCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGGTTATTACCTACTTCTTTATTATTACTTTTAGATGCTTGCTTTGTTGATACTGGTGCAGGAACTAGATGAACTGTTTATCCTCCATTAAGAACTTTAGGGCATCCTGGTGGAAGAGTAGACTTAGCTATCTTTAGTTTACATTGTGCAGGGGCAAGATCAATTTTAGGAGGAATTAATTTTATATGTACAACTAAAAATTTACGTAGAAGTTCAATTTCTTTAGAGCATATAAGATTATTTGTATGAACTATCTTTGTTACAGTTTTTTTGTTAGTTCTTTCTTTACCTGTATTGGCAGGAGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAACATTAATACTTCTTTTTTTGACCCAAAAATAGGAGGGAACCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTGATTTTACCCGCATTCGGGATTGTAAGTCAAAGAACTTTATATTTAACTGGTAAAAAAGAAGTTTTTGGTTCTTTAGGAATAGTTTATGCTATTTTAAGAATTGGTTTAATTGGTTGT
		Bursaphelenchus_xylophilus_186_JP                      GGTGGTTTTGGTAATTGAATAGTACCTTTGATATTAGGTGCTCCTGATATAAGGTTTCCGCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGGTTATTACCTACTTCTTTATTATTACTTTTAGATGCTTGCTTTGTTGATACTGGTGCAGGAACTAGATGAACTGTTTATCCTCCATTAAGAACTTTAGGGCATCCTGGTGGAAGAGTAGACTTAGCTATCTTTAGTTTACATTGTGCAGGGGCAAGATCAATTTTAGGAGGAATTAATTTTATATGTACAACTAAAAATTTACGTAGAAGTTCAATTTCTTTAGAGCATATAAGATTATTTGTATGAACTATCTTTGTTACAGTTTTTTTGTTAGTTCTTTCTTTACCTGTATTGGCAGGAGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAACATTAATACTTCTTTTTTTGACCCAAAAATAGGAGGGAACCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTGATTTTACCTGCATTCGGGATTGTAAGTCAAAGAACTTTATATTTAACTGGTAAAAAAGAAGTTTTTGGTTCTTTAGGAATAGTTTATGCTATTTTAAGAATTGGTTTAATTGGTTGT
		Bursaphelenchus_xylophilus_185_CAN                     GGTGGTTTTGGTAATTGAATAGTACCTTTGATATTAGGTGCTCCTGATATAAGGTTTCCGCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGGTTATTACCTACTTCTTTATTATTACTTTTAGATGCTTGCTTTGTTGATACTGGTGCAGGAACTAGATGAACTGTTTATCCTCCATTAAGAACTTTAGGGCATCCTGGTGGAAGAGTAGACTTAGCTATTTTTAGTTTACATTGTGCAGGGGCAAGATCAATTTTAGGAGGAATTAATTTTATATGTACAACTAAAAATTTACGTAGAAGTTCAATTTCTTTAGAGCATATAAGATTATTTGTATGAACTATCTTTGTTACAGTTTTTTTGTTAGTTCTTTCTTTACCTGTATTGGCAGGAGCTATTACAATATTATTAACTGATCGTAACATTAATACTTCTTTTTTTGACCCTAAAATAGGAGGGAACCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTGATTTTACCTGCATTCGGGATTGTAAGTCAAAGAACTTTATATTTAACTGGTAAAAAAGAAGTTTTTGGTTCTTTAGGAATAGTTTATGCTATTTTAAGAATTGGTTTAATTGGTTGT
		Bursaphelenchus_mucronatus_168_Zusmarshausen_DE        GGTGGTTTTGGTAATTGAATAGTTCCTTTAATATTAGGTGCTCCAGATATAAGTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGTTTTTGATTATTACCTACTTCATTATTATTACTTTTAGATGCATGTTTTGTTGATACTGGTGCTGGAACTAGTTGAACAGTTTATCCTCCTTTAAGTACATTAGGTCATCCAGGTGGAAGTGTTGATTTAGCTATTTTTAGATTACATTGTGCAGGAGCAAGATCAATTTTAGGTGGAATTAATTTCATATGTACTACTAAAAATTTACGTAGTAGTTCTATTTCTTTAGAACATATAAGATTATTTGTATGAACTATTTTTGTTACAGTATTTTTATTAGTTTTGTCTTTACCTGTTTTAGCTGGAGCTATTACTATATTATTAACTGATCGAAATATTAATACTTCTTTTTTTGATCCTAGAATAGGTGGAAATCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCTGAAGTTTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGGATTGTAAGTCAAAGTACTTTGTATTTGACTGGTAAAAAAGAAGTTTTTGGTTCTTTAGGAATAGTCTATGCTATTTTAAGAATTGGTTTAATTGGTTGT
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		Bursaphelenchus_mucronatus_166_DE                      GGTGGTTTTGGTAATTGAATAGTTCCTTTAATATTAGGAGCTCCTGATATAAGATTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGGTTATTGCCTACTTCATTATTATTACTTTTGGATGCATGTTTTGTTGATACTGGAGCTGGGACTAGGTGAACTGTGTATCCTCCTTTAAGAACTTTAGGTCATCCAGGTGGTAGAGTAGATTTAGCTATTTTTAGATTACATTGTGCAGGAGCTAGATCAATTTTAGGTGGAATTAATTTTATATGTACTACTAAAAATTTACGTAGTAGATCTATTTCTTTAGAACATATAAGATTATTTGTATGAACTATCTTTGTTACAGTATTTTTATTAGTTCTTTCTTTACCTGTATTAGCTGGAGCTATTACTATATTATTAACTGATCGAAATATTAATACTTCTTTTTTTGATCCTAGAATAGGAGGAAACCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCTGAAGTATATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTGTAAGTCAAAGTACTTTATATTTAACTGGTAAAAAAGAGGTCTTTGGTTCTTTAGGAATAGTATACGCTATCTTAAGAATTGGTTTAATTGGTTGT
		Bursaphelenchus_mucronatus_165_FIN                     GGTGGTTTTGGTAATTGAATAGTTCCTTTAATATTAGGAGCTCCTGATATAAGATTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGGTTATTACCTACTTCATTATTATTACTTTTGGATGCATGTTTTGTTGATACTGGAGCTGGAACTAGGTGAACTGTGTATCCTCCTTTAAGAACTTTAGGTCATCCAGGTGGTAGAGTAGATTTAGCTATTTTTAGATTACATTGTGCAGGAGCTAGATCAATTTTAGGTGGAATTAATTTTATATGTACTACTAAAAATTTACGTAGTAGATCTATTTCTTTAGAACATATAAGATTATTTGTATGAACTATCTTTGTTACAGTATTTTTGTTAGTTCTTTCTTTACCTGTATTAGCTGGAGCTATTACTATATTATTAACTGATCGAAATATTAATACTTCTTTTTTTGATCCTAGAATAGGAGGAAACCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCTGAAGTGTATATTTTAATTTTACCAGCTTTTGGTATTGTAAGTCAAAGTACTTTATATTTAACTGGTAAAAAAGAGGTCTTTGGTTCTTTAGGAATAGTGTACGCTATCTTAAGAATTGGTTTAATTGGTTGT
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		Bursaphelenchus_fraudulentus                           GGTGGTTTTGGTAATTGAATATTACCTCTTATATTAGGTTCTCCTGATATAAGTTTTCCACGTTTAAATAATCTTAGATTTTGGTTATTACCAACTTCATTATTATTATTATTAGATTCATGTTTTGTAGATACTGGGGCTGGAACTAGTTGAACTGTATATCCTCCTTTAAGAACTTTAGGGCATCCTGGTGGAAGAGTAGATTTAGCTATTTTTAGATTACATTGTGCTGGTGCAAGATCAATTTTAGGAGGTATCAATTTTATATGTACTACTAAAAATCTTCGTAGAAGTTCTATTTCTTTAGAACATATAAGATTATTTGTTTGAACTATTTTTGTTACTGTATTTTTATTAGTTCTTTCTTTACCAGTATTAGCAGGTGCAATTACTATATTATTAACTGATCGAAATATTAATACTTCTTTTTTTGATCCTAGAATAGGAGGTAACCCTTTAATTTATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGTCATCCTGAAGTCTATATTTTGATTTTACCTGCTTTTGGTATTGTAAGTCAAAGTACTCTTTATTTAACTGGTAAAAAAGAGGTTTTTGGTTCTTTAGGTATAGTATATGCAATTTTAAGAATTGGTCTTATTGGTTGT
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 627 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;