#NEXUS [! 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Moraea_australis 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Moraea_gigandra 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Moraea_graminicola 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Moraea_graniticola 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Moraea_herrei 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Moraea_inclinata 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Moraea_inconspicua 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Moraea_incurva 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Moraea_kamiesensis 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Moraea_kamiesmontana 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Moraea_maximiliani 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Moraea_polyanthos 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Moraea_pyrophila ????????????????????????????????????????????????????????GGGGCAATCCTGAGCCAAATCTTTATTTTGAGAAAACAAACAA------GGGTTTTAAAAACTAGAATAAAAAAGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACGAATGGAGTTGACTACGTTACGTTGGTAGTGAGAATCCTT-CTATCGAAATT-AAA-------------GAAAGGATGATCCTATATATCTAATACGTAGTACGTAT-------ACATACTAACATATCAAA----CGATTAATTACGACCTGAA---------TCT-ATTATATATTT-----ATTATATATGCAAAA-TTCAGAGCTATTGTGGATCTATTCCAATCGAAGTTGAAGGAAGAATCGATCGGTGATCAAATCATT---------CATTCCAGAGTTTGATAGATCTTTTGAAAAACGAATTAATCGGAAGAGAATAAAGAGAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGACAGCAATGAAATTTATAGTAAAAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTC-TATCCCCAATAAAAAGTCTATTTT--ACTTCCTAACTCTTTATAGT------CTTTTTTCATCTTCATCCATCAATGGTTCAAACAAAATTCAATATCTTTCTCATTAATTCTACTCGTTCAC------AAAAGGATACGAACAGAAAGCTTTTGATCTTATCTCAATCTGGTTTGGATAGATATGATACCTGTACAAATGAACATGTATGGGCAAGTAATTCCCATTATTGAATCATTCACAATCCATAT------CCTTATGTTTACAAATAAA----------CTTTTTGAATGAAGATCTAAAACTAAGAAATT------ACAGGGACTATGCCAAATTTGTTAATACTTTT------------------GTAGTCTCTTT--------AATTTACATAGATACA--------AGTACTCCACTAGGATGGTGCGCGGT------AAAAGGTCGGGATAGC??? 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Moraea_schimperi 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Moraea_schlechteri 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Moraea_serpentina 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Moraea_vegeta 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Moraea_verecunda 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Moraea_vigilans 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Moraea_villosa 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Ferraria_crispa 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Ferraria_uncinata 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Moraea_albicuspa 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Moraea_albiflora 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Moraea_alpina 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Moraea_alticola 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Moraea_australis 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Moraea_autumnalis 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Moraea_barkerae 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Moraea_barnardiella 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Moraea_barnardii 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Moraea_bituminosa 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Moraea_brevituba 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Moraea_brittenniae 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Moraea_bubalina 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Moraea_bulbillifera 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Moraea_cookii 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Moraea_deltoidea 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Moraea_demissa 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Moraea_deserticola 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Moraea_elegans 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Moraea_elliotii 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Moraea_exiliflora 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Moraea_fenestralis 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Moraea_fergusoniae 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Moraea_flaccida 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Moraea_garipensis 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Moraea_gawleri 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Moraea_gigandra 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Moraea_gracilenta 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Moraea_graminicola 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Moraea_graniticola 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Moraea_herrei 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Moraea_huttonii 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Moraea_insolens 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Moraea_kamiesensis 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Moraea_kamiesmontana 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Moraea_macrocarpa 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Moraea_macronyx 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Moraea_margaretae 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Moraea_marlothii 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Moraea_maximiliani 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Moraea_miniata 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Moraea_modesta 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Moraea_pallida 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Moraea_pyrophila 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Moraea_radians 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Moraea_ramosissima 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Moraea_reflexa 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Moraea_rigidifolia 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Moraea_rivulicola 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Moraea_simplex 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Moraea_sisyrinchium 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Moraea_spathulata 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Moraea_speciosa 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Moraea_stagnalis 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Moraea_unguiculata 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Moraea_vallisbelli 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Moraea_variabilis 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Moraea_vegeta 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Moraea_ventricosa 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Moraea_verdickii 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Moraea_verecunda 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Moraea_versicolor 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Moraea_vespertina 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Moraea_vlokii 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[rps16] Belamcanda GGATTTTTCCATCCA-CCATTTTCTATAGGAATGAAGATGCTCTTGACTCGACATAGTTTGTTCTGTTCCTGCTAAGAACCTAATTTT---------------TATTGGGTTGGTAAATAAAA-ATAGTACATGATGGAGCTCGAGTAAAAAATCTTT--ATTCATT-------TATCGGGGGGAAAATCTAGGGTTAGTAACAATGAATAAGTGATACTAACTTTGTAAGTATATCCTCAATATCAATATATAAATTGAAAGGTTCAAATTCGAACAAGTTTGAATTCAAAAT--------AAAGT-----CAAATTTGTCGGAATTTGGAAAACTTTTTCGATGTAAAGTGTATTACAAAGGAATCAATCCTTCATATTTCTTTTCCATAGAAATAAATA-CAAAAAACAAA-GGTATGTTGCTGCCATTTTGAAAGAAGTAAGAATCACCGAAGTAATGTCTAAACCCAAGGATTTCACAAAGCAAAGAGACAGGATTCCGGAACAAGGAAACGCAATTTTCATCAATTGTCTCAATAATTTTA-------TTAGAATGAGGAAAAAAATAGATTCGAGATGATACAAACAAGAGGTTAGAGACGACTCAATAAATTTCTAAGGATTTCACTTCGAATTCTTTACGAATTATCCAACCTGAGTTATGAGTACACATGATATTTCTTTTTTTCTGTAAGTGTA-GTG-AAG------------------------AACAAAAAAATAACTAAAATCATAGTCTAATTCATGCTCTTATGTATCCATTTGCTAT--TATACACAGAAATTAGAATCATTTTTTCTCGAGCCGTATGAGGAGAAAACTCTCCTATACGTTTCTAGGGGGGGCATTATTTATTTATATCTATCC Bobartia 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Ferraria_crispa ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Moraea_barnardiella ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Moraea_deserticola ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TAAATAGAA-ATAGTACATGATGGAGCTCGAGTAAAAAGTCTTTTTATTCATT-------TATCGGGAGG-AAATCTAGGGTTAGTAACAATGAATAAGTTAGACCAACTTTGTAAGTATATCCTCAATAT------ATAAATCGAAAGATTCAAATTCGAACAAGTTTGAATTCAAAAT--------AAAGT-----AAAATTTGTCGGAATTTGGAAAACTTTTTCGATGTAAAGTGTATTACAAGGGAATCAATCGTTCGTATTTCTTTTCCATAGAAATAAATAACAACAAACAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTGAAAGGAGTAAGAATCACCGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTTTGCAAAGCAAAGAGATAGTATTCCGGAACAAGTAAACGCAATTTTCATCAATTGTCTCAATCATTTTA-------TTAGAATGAGGAAAAAAATGGATTCGAGACGATAAAAAAAAGAGGTTAGAGACGACTCAATAAATTTCTAAGGATTTCACTTCGAACTCTTTCCGAATTACCCAACTTGAGTTATGAGTACAAATGATATTTCTTTTTTTCTGTAAGTGTAA-TGTAAGGAAG--------------------AACAAAAAGATAACTAAAATCATAGTCTAATTCATGCTCTTATGGATCCATTTGCTAT--TATA-ACAGAAATTAGAATCATTTTTTCTCGAGCCGTATGAGGAGAAA-CCCTCCTA-ACGTTTCTAGGGGGGGCATATTATT????????????? 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Moraea_gawleri GGATTTTTCCATCCA-CCATTTTCTATAGGAATGAAGATGCTCTTGACTCGACATAGTTTGTTCTGTTCCTGCTAAGAACTTAATTTG---------------TATTGAGTTGGTAAATAGAA-ATAGTACATGATGGAGCTCGAGTAAAAAGTCTTTTTATTCATT-------TATCGGG-GGAAAATCTAGGGTTAGTAACAATGAATAAGTTAGACCAACTTTGTAAGTATATCCTCAATAT------ATAAA-----AGGTTCAAATTCGAACAAGTTTGAATTCAAAAT--------AAAGT-----AAAATTTGTCGGAATTTTGAAAACTTTTTCGATGTAAAGTGTATTACAAGGGAATCAATCGTTCGTATTTCTTTTCCATAGAAATAAATAACAAAAAACAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTGAAAGGAGTAAGAATCACCGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTTCGCAAAAAAAAGAGACAGTATTCCGGAACAAGGAAACGCAATTTTCATCAATTGTCTCAATAATTTTA-------TTAGAATGAGGAAAAAA-TGGATTCGAGACAATAAAAAAAAGAGGTTAGAGACGACTCAATAAATTTTTAAGGATTTCACTTCGAACTCTTTCCTAATTACCCAACTTGAGTTATGAGTACAAATGATATTTCTTTTTTTCTGTAAGTGTAA-TGTAAGGAAG--------------------AACAAAAAAATAACTAAAATCATAGTCTAATTCATGCTCTTATGGATCCATTTACTAT-GTATATACAGAAATTAGAATCATTTTTTCTCGAGCCGTATGAGGAGAAA-CCCTCCTATACGTTTCTAGGGGGGGCATTATTTATTTATATCTATCC Moraea_gigandra ?????????????????????????????????????????????????????????TTTGTTCTGTTCCTGCTAAGAACTTAATTTG---------------TATTGAGTTGATAAATAGAA-ATAGTACATGATGGARCTCGAGTAAAAAGTCTTTTTATTCATT-------TATCGGGAGGAAAATCTARGGTTAGTAACAATGAATAAGTTAGACCAACTTTGTAAGTATATCCTCAATAT------ATAAATCGAAAGGTTCAAATTCGAACAAGTTTGAATTCAAAAT-CAAAATTAAAGT-----CAAATTTGTCGGAATTTTGAAAACTTTTTCGATGTAAAGTGTATTACAAGGGAATCAATCGTTCGTATTTCTTTTCCATAGAAATAAATAATAAAAAACAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTGAAAGGAGTAAGAATCACCGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTTCGCAAAGCAAAGAGATAGTATTCCGAAACAAGGAAACGCAATTTTCATCAATTGTCTCAATAATTTTA-------TTAGAATGAGGAAAAAAATGGATTCGAGACGATAAAAAAAAGAGGTTAGAGACGACTCAATAAATTTCTAAGGATTTCACTTCGAACTCTTTCCGAATTACCCAACTTGAGTTATGAGTACAAATGATATTTCTTTTTTTCTGTAAGTGTAA-TGTAAGGAAG--------------------AACAAAAAGATAACTAAAATCATAGTCTAATTCATGCTCTTATGGATCTATTTGCTAT--TATATACAGAAATTAGAATCATTTTT-CTCGAGCCGTATGAGGAGAAA-CCCTCCTATACGTTTCTAGGGGGGGCATTATTTATT??????????? Moraea_gracilenta ???????????????????????????????????????????????????????????????????????GCTAAGAACTTAATTTG---------------TATTGAGTTGATAAATAGAA-ATAGTACATGATGGAGCTCGAGTAAAAAGTCTTTTTATTCATT-------TATCGGGAGGAAAATCTAGGGTTAGTAACAATGAATAAGTTAGACCAACTTTGTAAGTATATCCTCAATAT------ATAAATCGAAAGGTTCAAATTTGAACAAGTTTGAATTCAAAAT--------AAAGT-----CAAATTTGTCGGAATTTGGAAAACTTTTTCGATGTAAAGTGTATTACAAGGGAATCAATCGTTTGTATTTCTTTTCCAGAGAAATAAATAACAAAAAACAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTGAAAGGAGTAAGAATCACCGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTTCGCAAAGCAAAGAGATAGTATTCCGGAACAAGGAAACGCAATTTTCATCAATTGTCTCAATCATTTTA-------TTAGAATGAGGAAAAAAATGGATTCGAGACGATAAAAAAAAGAGGTTAGAGACGACTCAATAAATTTCTAAGGATTTCATTTCGAACTCTTTCCGAATTACCCAACTTGAGTTATGAGTACAAATGATATTTCTTTTTTTCTGTAAGTGTAA-TGTAAGGAAG--------------------AACAAAAAGATAACTAAAATCATAGTCTAATTCATGCTCTTCGGGATCCATTTACTAT--TATATACAGAAATTAGAATCATTTTTTCTCGAGCCGTATGAGGAGAAA-CCCTCCTATACGTTTCTAGGGGGGGCATTATTTATTTATATCT???? Moraea_graminicola GGATTTTTCCATCCA-CCATTTTCTATAGGAATAAAGATGCTCTTGACTCGACATAGTTTGTTCTGTTCCTGCTAAGAACTTAATTTG---------------TATTGAGTTGATAAATAGAA-ATAGTACATGATGGAGCTCGAGTAAAAAGTCTTTTTATTCATT-------TATCGGGAGGAAAATCTAGGGTTAGTAACAATGAATAAGTTAGACCAACTTTGTAAGTATATCCTCAATAT------ATAAATCGAAAGGTTCAAATTCGAACAAGTTTGAATTCAAAAT-CAAAAT-AAAGT-----CAAATTTGTCGGAATTTTGAAAACTTTTTCGATGTAAAGTGTATTACAAGGGGATCAATCGTTCATATTTCTTTTCCATAGAAATAAATAACAAAAAACAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTGAAAGGAGTAAGAATCACCGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTTCACAAAGCAAAGAAATAGTATTCCGGAACAAGGAAACGCAATTTTCATCAATTGTCTCAATAATTTTA-------TTAGAATGAGGAAAAAAATGGATTCGAGACGATAAAAAAAAGAGGTTAGAGACGACTCAATAAATTTCTAAGGATTTCACTTCGAACTCTTTCCGAATTACCCAACTTGAGTTATGAGTACAAATGATATTTCTTTTTTTCTGTAAGTGTAA-TGTAAGGAAG--------------------AACAAAAAGATAACTAAAATCATAGTCTAATTCATGCTCTTATGGATCCATTTGCTAT--TATATACAGAAATTAGAATCATTTTTTCTCGAGCCGTATGAGGAGAAA-CCCTCCTATACGTTTC??????????????????????????????? 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Moraea_ramosissima GGATTTTTCCATCCA-CCATTTTCTATAGGAATGAAGATGCTCTTGACTCGACATAGTTTGTTCTGTTCCTGCTAAGAACTTAATTTG---------------TATTGAGTTGGTAAATAGAA-ATAGTACGTGATGGAGCTCGAGTAAAAAGTCTTTTTATTCATT-------TATCGGGAGGAAAATCTAGGGTTAGTAACAATGAATAAGTTAGACCAACTTTGTAAGTATATCCTCGATAT------ATAAATCGAAAGGTTCAAATTCGAACAAGTTTTAATTCAAAAT--------AAAGT-----AAAATTTGTCGGACTTTGGAAAACTTTTTCGATGTAAAGTGTATTACAAGGGAATCAATCGTTCGTATTTCTTTTCCATAGAAATAAATACCAAAAAACAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTGAAAGGAGTAAGAATCACCGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTTCGCAAAGAAAAGAGATAGTATTCCGGAACAAGGAAATGCAATTTTCATCAATTGTCTCAATAATTTGA-------TTAGAATGAGTAAAAAAATGGATTCGAGACGATAAAAAAAAGAGGTTAGAGACGACTCAATAAATTTCTAAGGATTTCACTTCGAACTCTTTCCGAATTACCCAACTTGAGTTATGAGTACAAATGATATTTCTTTTTTTCTGTAAGTGTAA-TGTAAGGAAG--------------------AACAAAAAAATAACTAAAATCATAGTCTAATTCATGCTCTTATGTATCCATTTGCTAT--TATATACAGCAATTAGAATCATTTATTCTCGAGCCGTATGAGGAGAAA-CCCTCCTATACGTTTCTAGGGGGGGCATTATTTATTTATATCTATCC Moraea_reflexa ???????????????????????????????????????????TTGACTCGACATAGTTTGTTCTGTTCCTGCTAAGAACTTAATTTG---------------TATTTAGTTGATAAATAGAA-ATAGTACATGATGGAGCTCGAGTAAAAAGTCTTTTTATTCATT-------TATCGGGAGGAAAATCTAGGGTTAGTAACAATGAATAAGTTAGACCAACTTTGTAAGTATATCCTCAATAT------ATAAATCGAAAGGTTCAAATTTGAACAAGTTTGAATTCAAAAT-CAAAATTCAAGT-----AAAATTTGTCGGCATTTTGAAAACTTTTTCGATGTAAAGTGTATTACAAGGGAATCAATCGTTCGTATTTCTTTTCCATAGAAAT----AACAAAAAACAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTGAAAGGAATAAGAATCACCGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTTCGCAAAGCAAAGAGATAGTATTCCGGAACAAGGAAACGCAATTTTCATCAATTGTCTCAATAATTTTA-------TTAGAATGAGGAAAAAAAGGGATTCGAGACGATAAAAAAAAGAGGTTAGAGACGACTCAATAAATTTCTAAGGATTTCACTTCGAACTCTTTCCGAATTACCCAACTTGAGTTATGAGTACAAATGATATTTCTTTTTTTCTGTAAGTGTAA-T-----------------------------AACAAAAAGATAACTAAAATCATAGTCTAATTCATGCTCTTATGGATCCATTTGCTAT--TATATACAGAAATTAGAATCATTTTTTCTCGAGCCGTATGAGGAGAAA-CCCTCCTATACGTTTCTAGGGGGGGCATTATTTATTTATATCTATCC Moraea_regalis GGATTTTTTCATCCA-CCATTTTCTATAGGAATAAAGATGCTCTTGACTCGACATAGTTTGTTCTGTTCCTGCTAAGAACTTAATTTG---------------TATTGAGTTGATAAATAGAA-ATAGTACATGATGAAGCTCGAGTAAAAAGTCTTTTTATTCATT-------TATCGGGAGGAAAATCTAGGGTTAGTAACAATGAATAAGTTAGACCAACTTTGTAAGTATATCCTT-----------ATAAATCGAAAGGTTCAAATTCGAACAAGTTTGAATTCAAAAT-CAAAAT-AAAGT-----CAAATTTGTCGGAATTTTGAAAACTTTTTCGATGTAAAGTGTATTACAAGGGAATCAATCGTTCGTATTT-TTTTCCATAGAAATAAATAACAAAAAACAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTGAAAGGAGTAAGAATCACCGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTTCGCAAAGCAAAGAGATAGTATTCCGGAACAAGGAAACGCAATTTTCATCAATTGTCTCAATAATTTTA-------TTAGAATG-GGAAAAAAATGGATTCGAGACGATAAAAAAAAGAGGTTAGAGACGACTCAATAAATTTCTAAGGATTTCACTTCGAACTCTTTCCGAATTACCCAACTTGAGTTATGAGTACAAATGATATTTCTTTTTTTCTGTAAGTGTAA-TGTAAG------------------------AACAAAAAGATAACTAAAATCATAGTCTAATTCATGCTCTTATGGATCCATTTGCTAT--TATATACAGAAATTAGAATCATTTTT-CTCGAGCCGTATGAGGAGAAA-CCCTCCTATACGTTTCTAGGGGGGGCA???????????????????? 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