#NEXUS BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=99; TAXLABELS Faurea_galpinii Faurea_macnaughtonii Faurea_rochetiana Faurea_rubriflora Faurea_saligna Leucadendron_gandogeri Protea_acaulos Protea_acuminata Protea_amplexicaulis Protea_angolensis Protea_angustata Protea_aristata Protea_aspera Protea_aurea Protea_burchellii Protea_caespitosa Protea_caffra Protea_canaliculata Protea_compacta Protea_comptonii Protea_convexa Protea_cordata Protea_coronata Protea_cryophila Protea_curvata Protea_cynaroides Protea_decurrens Protea_denticulata Protea_dracomontana Protea_effusa Protea_enervis Protea_ericifolia Protea_eximia Protea_foliosa Protea_gaguedi Protea_glabra Protea_grandiceps Protea_heckmanniana Protea_holosericea Protea_humiflora Protea_inopina Protea_intonsa Protea_lacticolor Protea_laetans Protea_laevis Protea_lanceolata Protea_laurifolia Protea_lepidocarpodendron Protea_longifolia Protea_lorea Protea_lorifolia Protea_magnifica Protea_montana Protea_mucronifolia Protea_mundii Protea_mundiieast Protea_namaquana Protea_nana Protea_neriifolia Protea_nitida Protea_nubigena Protea_obtusifolia Protea_odorata Protea_parvula Protea_pendula Protea_piscina Protea_pityphylla Protea_pruinosa Protea_pudens Protea_punctata Protea_recondita Protea_repens Protea_restionifolia Protea_revoluta Protea_roupelliae Protea_rubropilosa Protea_rupicola Protea_scabra Protea_scabriusucula Protea_scolopendrifolia Protea_scolymocephala Protea_scorzonerifolia Protea_simplex Protea_speciosa Protea_stokoei Protea_subulifolia Protea_subvestita Protea_sulphurea Protea_susannae Protea_tenax Protea_venusta Protea_vogtsiae Protea_welwitschii Protea_wentzeliana Protea_witzenbergiana Protea_woeskaensis Serruria_barbigera Serruria_scoparia Serruria_villosa ; 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Faurea_saligna 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Protea_angolensis 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Protea_cordata 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Protea_cynaroides 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Protea_decurrens 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Protea_humiflora 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Protea_inopina 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Protea_laetans 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Protea_lorifolia 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Protea_neriifolia 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Protea_obtusifolia 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Protea_odorata 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Protea_scorzonerifolia 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Protea_simplex 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Protea_subulifolia 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Protea_tenax 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Serruria_villosa CTTTCAAAT-TCAGAGAAACCCTGGAAGTAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTATTTTCAGAAAACAAAGAAGGGTTCCGCAAGCAAGAAAACGGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAGGCTGTTCTAACGAATGGAGTTGACTGTGTTGGTAGAGGAA-----TCGAACCCTTCTATCGAAACAAAGATGAAGAATAAATCTATATACGTATGTATACGCCCTGAAATAGAATATCAAACGATTAATGACGAGTCACGTCTGTATTGTATTTTTTATATGAAAAATTGAAAAATTCTTTGGAATTGATTCCAAAGAATCGAATATTCAGTGATCAAATGATTCATGCCACAGTTTGA-----TAGATCTTTTGAAGAACTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATA-----CCGACAACAATGAAATTT--ATAGTAAGAGGAAAA-TCC-GTCGACTTT-ATAAATCGTGACAATAAAATAAAAAA-GGG-GCCC-GTTTT----ATTCCCTAACTCTTTTTTTTT-------CGTCAGCGATTCAAATTTAG-------------------------TTATGTTTCTCATTCACTCTA-------------TTCTTT-TACAAA-TTCCAAATGGA-----TCCGCGCAGAAATCTTTC---TCTCT-TACC--ACAA--GTCTTGTGATATGTGATATAT-----------------------ATATGTACAAATGAACATCTATAAGCAAGGAATTCCCATTTGAATCT-GAAT------CATTTATCATCCATATAATT-------ACTCTTAATCTT-------AATGAAACTTACAAAGTCTT----------------------------------------CTTTTT-----GAAGATCCAAGAATTTCCAGGGCCTGGGTAAGACTT-GTAATGTTTTTTTAGTCCTTTAATTGACATAGACCCAAGA-------------------GTATATCCACCATTTTCTAAAGGAATAAAAATGCTCTTGGCTCGACATAGTTTGTTCTGTTCCACGAGAACCCGGACTTTGTTGGGTTGTAAAT------AGTACATGATGGAGCTCGAGCAAAAAGTATTGATTCATTTCTCAAGGGCAAGGATCTAAGGTTAGTGTCAATCAATAAATTGGAAAAACTTCGTAAGCATATCTTCGATATAGAAATTGAAAGGGTCTAATTTGAACAAGTTTCAACAAATCCAAAA-GGAAAATTTGTTGGAATTGGTAAAGTAAAAA------CTTTTCGACC---AAAAATGTATCTCGCGCGAATCAATCGTTCCTATGA-----TTCTTCGATAGAAAGAAATCACAAAA--GGTATGTTGCTGCCATTTTGAAATGATTAAGGATCGCCGAAGTAA----TGTCTAAACCCAATGATTCAAAGCAACGATAAAAGATCCATGAACAAGGAAACACCA----TTTT-CAATGGTCTCAACAATTGAATTGGATCAAAATGAGGAATCAAAA-------TAGATTCGAAACGAGACAAAGAAAGGGGTTTAGAGACGGCTCAATAAATGAAATGCCTAAGGATTTTCCTTTCAGCTCTTT-----GAGAATTATCCAACTTGAGTTATGAGTACGAATGATTTTTCCTTTTTTTTTCTTTTTCGCGAAGGAAAAAGAAAAAAA---AACGACTCAAATCATA---------GTCGAATTGATTTGATGATTTTATAGATCTATTTGACACTAAAATACATAATAAATTGAATCATTCTTTCTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACC-TCCTATACGGTTCTAGGGG???????????????????????????????CATGGATTAGGCGTTAATGAAACCTTTCACAGGAATCTTTCACAAAAATCTCAACTAATA------TTATCAACTAATCACTTCGTTATTAGA-CCCTGTCATGGTATTTGAATCTCCAAATACATTATTATTGTATACTCTTTCATATATATGGCGCAACCCAATCCTTGTTTTTCAAGCTTCTAATCCTTACTTT-TTTTGAATCTAAATATC-------TAAATAATAATAAATTCACTCTTGA----------------------CAGTAATATATGTTGTAT-------ATGTAAATTTTTACAAATTCTATATGTGAAAA----TATGCGGAATTCGCCCATGAAAAGGTATAAGATATAA-GAATAGGCGGAAATCAATATGCTTATGCT-GAAATAAGAAACAAGGGCCAATGAGATAGAAATAAGGAATCATAAAT-----AGAGTTCAGATTCGAATTCCATAGATAATATGGATGGGATTTTCTATAATGATA-------------------GAGAAATGAAA-GACTTCTTGATACTACTTTAATCTTATTTTA-CCTGCTTGATATTTTTAAAAAGGGTTGGTTGAATTGAATTAGAAAATTCAC??????????????????????????CGCGAGAAGTCCACTGAACCTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGATACCTGCCCAGCAGAGAGACCCGCG-AACACGTTGCATCTTTGATGGTCGGTCGG----CCCCCGTGGCCTCCGACC-TAACACAAACAATCGGCGCGGTTGGCGCCAAGGAACTCACAATGGAAATGGGTGTGGCACAGCCGCGACTTGTGCGTGGCGTGTGCTATCCTCAGAATCCGAATCTTATTAACGACTCTCGGCAACGGATATCTCGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAGTCTTTGAACGCAAGTTGCGCCCTAGGCCATCGGGCCGAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCACGCATCGCGTCGCCCTCCCTCAAACCCCATCG-----CGGTGTTTGGGTGCGGAGCGGAGATTGGCCCCCCATTCCCCCCCGTTGGGTTGTGGTCGGCCTAAAAGGAATGTCCCCTTGTGTGATGAGCACCACGACGAGAGGTGGTTGATG-------CCA-CTCTGCTA-GACGTC-ACGTGCTCTATCTCTGTGGGA-------CTCTATGGAACCCTTCGATCATACGACTGCGACCCCAGGTCAGGCGGGGCTACCCGCTGAGTTTAAGCAT-AT-CAATAAGCGGAGGAAAAGAAA-----------------------------------CTTACGAGGATTCCCCTA-TAACGGCGAGCGAA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN TREES; Title Protea_BEAST_TB; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Faurea_galpinii, 2 Faurea_macnaughtonii, 3 Faurea_rochetiana, 4 Faurea_rubriflora, 5 Faurea_saligna, 6 Leucadendron_gandogeri, 7 Protea_acaulos, 8 Protea_acuminata, 9 Protea_amplexicaulis, 10 Protea_angolensis, 11 Protea_angustata, 12 Protea_aristata, 13 Protea_aspera, 14 Protea_aurea, 15 Protea_burchellii, 16 Protea_caespitosa, 17 Protea_caffra, 18 Protea_canaliculata, 19 Protea_compacta, 20 Protea_comptonii, 21 Protea_convexa, 22 Protea_cordata, 23 Protea_coronata, 24 Protea_cryophila, 25 Protea_curvata, 26 Protea_cynaroides, 27 Protea_decurrens, 28 Protea_denticulata, 29 Protea_dracomontana, 30 Protea_effusa, 31 Protea_enervis, 32 Protea_ericifolia, 33 Protea_eximia, 34 Protea_foliosa, 35 Protea_gaguedi, 36 Protea_glabra, 37 Protea_grandiceps, 38 Protea_heckmanniana, 39 Protea_holosericea, 40 Protea_humiflora, 41 Protea_inopina, 42 Protea_intonsa, 43 Protea_lacticolor, 44 Protea_laetans, 45 Protea_laevis, 46 Protea_lanceolata, 47 Protea_laurifolia, 48 Protea_lepidocarpodendron, 49 Protea_longifolia, 50 Protea_lorea, 51 Protea_lorifolia, 52 Protea_magnifica, 53 Protea_montana, 54 Protea_mucronifolia, 55 Protea_mundii, 56 Protea_mundiieast, 57 Protea_namaquana, 58 Protea_nana, 59 Protea_neriifolia, 60 Protea_nitida, 61 Protea_nubigena, 62 Protea_obtusifolia, 63 Protea_odorata, 64 Protea_parvula, 65 Protea_pendula, 66 Protea_piscina, 67 Protea_pityphylla, 68 Protea_pruinosa, 69 Protea_pudens, 70 Protea_punctata, 71 Protea_recondita, 72 Protea_repens, 73 Protea_restionifolia, 74 Protea_revoluta, 75 Protea_roupelliae, 76 Protea_rubropilosa, 77 Protea_rupicola, 78 Protea_scabra, 79 Protea_scabriusucula, 80 Protea_scolopendrifolia, 81 Protea_scolymocephala, 82 Protea_scorzonerifolia, 83 Protea_simplex, 84 Protea_speciosa, 85 Protea_stokoei, 86 Protea_subulifolia, 87 Protea_subvestita, 88 Protea_sulphurea, 89 Protea_susannae, 90 Protea_tenax, 91 Protea_venusta, 92 Protea_vogtsiae, 93 Protea_welwitschii, 94 Protea_wentzeliana, 95 Protea_witzenbergiana, 96 Protea_woeskaensis, 97 Serruria_barbigera, 98 Serruria_scoparia, 99 Serruria_villosa; TREE TREE1 = (((((3:2.31487078037558,5:2.31487078037558):2.159953308833204,4:4.4748240892087825):0.8551383926923606,1:5.329962481901144):4.427118393434822,2:9.757080875335962):17.996545317543564,(((((37:10.103235193202455,(((((92:5.387231379524063,(90:2.8927677827331353,96:2.8927677827331397):2.494463596790923):0.779972974257463,53:6.167204353781524):0.2980951017935247,42:6.465299455575054):1.5925750794632378,(((((70:1.3477689335087295,43:1.3477689335087297):1.2643326356389124,55:2.6121015691476432):1.5572402017432307,(56:2.9667990266608397,87:2.9667990266608384):1.2025427442300365):0.5779584559134623,91:4.747300226804335):1.1443050418622374,(14:4.028137379391047,75:4.028137379391046):1.863467889275526):2.166269266371714):0.5186778872939115,34:8.576552422332204):1.5266827708702504):2.8496127383736756,(((((13:2.421185410034588,28:2.4211854100345827):6.210727996025802,(((((9:3.901615011178147,40:3.901615011178147):1.5033374860717386,(22:3.8921864052423456,(32:2.8064899350611414,(86:1.61977332061498,27:1.61977332061498):1.1867166144461603):1.085696470181205):1.5127660920075336):1.0608627607753833,23:6.4658152580252635):0.2003186643669954,16:6.666133922392259):1.0549152279297846,((((84:2.0838705216807187,85:2.0838705216807187):4.0859216363365025,((19:4.407008819152776,(59:3.6435615265849117,(69:2.048164447470619,49:2.0481644474706195):1.5953970791142935):0.763447292567863):0.9191119087350126,(89:2.3594982725097338,62:2.359498272509733):2.966622455378053):0.8436714301294312):0.32463536679228344,((73:3.497161008232623,66:3.497161008232623):0.00849604064911702,82:3.5056570488817393):2.9887704759277605):0.5543935961038242,78:7.048821120913327):0.6722280294087168):0.910864255738346):0.0954308058946495,77:8.727282600165747):0.8960354891616742,((((48:0.9822838930966623,47:0.9822838930966623):0.8167880241002813,15:1.7990719171969416):1.6130217331897843,((39:1.1829321204978853,52:1.182932120497887):1.1284133583619675,51:2.3113454788598564):1.1007481715268717):3.721574768603747,33:7.133668418990472):2.489649670336946):1.5816802843384963,12:11.204998373665916):1.7478495579102127):1.0275620502385312,72:13.98040998181467):2.0599525425908407,((((31:5.379119855274431,(94:3.9146287434691724,((17:0.7798006970320042,61:0.7798006970320043):1.5826465504946845,29:2.362447247526688):1.552181495942487):1.4644911118052595):1.5874856314202725,(((25:2.6558964899931867,(64:1.8937399463764388,(44:1.195808238641672,83:1.195808238641672):0.6979317077347658):0.7621565436167486):1.3947124503750672,(38:2.6771374261552463,(76:2.252206288015611,20:2.25220628801561):0.424931138139637):1.3734715142130085):1.384269070603514,(35:3.119961016292791,(93:1.8860141885079849,10:1.886014188507985):1.2339468277848074):2.3149169946789776):1.5317274757229349):1.5063725895443083,88:8.472978076239013):4.213344179518181,(((((41:5.914595179727016,((60:3.3028207451023053,36:3.3028207451023084):1.5426994535025385,46:4.845520198604848):1.069074981122168):2.587708822816186,(11:7.310825636582126,((58:6.082412247424955,81:6.082412247424956):0.1383031275373428,((21:2.657620316099989,7:2.657620316099987):1.801393056426408,(45:3.121997932868428,74:3.121997932868427):1.3370154396579679):1.7616957473612107):1.0901165166945113):1.1914783659610837):0.7608303726385337,57:9.263134375181732):0.9364150436089655,(54:3.7792000546512994,63:3.7792000546512994):6.420349364139404):0.7736693181008807,(8:5.190292554555687,(((95:2.2997381846970675,67:2.29973818469707):0.9401755842676707,(30:1.7324328626473806,71:1.7324328626473806):1.5074809063173562):1.274981409469894,(18:2.919089601746301,65:2.919089601746301):1.5958055766883357):0.6753973761210537):5.78292618233589):1.7131035188656103):3.3540402686483013):2.304932960927893,(26:12.133431878725254,(50:10.609299147241703,((80:3.1447884782061193,79:3.1447884782061197):1.8903871332406612,(24:2.7729092780216242,68:2.7729092780216242):2.262266333425157):5.5741235357949135):1.5241327314835633):6.211863606608132):9.408330707546106); END;