#NEXUS [written Thu Jan 20 16:31:57 EST 2011 by Mesquite version 2.73 (build 544) at dhcp128036177160.central.yale.edu/128.36.177.160] BEGIN TAXA; TITLE taxa; DIMENSIONS NTAX=52; TAXLABELS Atocion_rupestre_13547_02676 Eudianthe_laeta_1341_Z83155 Lychnis_chalcedonica_2487_Z83164 Lychnis_coronaria_2488_Z83165 Lychnis_floscuculi_2406_Z83163 Petrocoptis_pyrenaica_12875_02284 Petrocoptis_pyrenaica_2486_Z83167 Silene_ammophila_12639_03163 Silene_aprica_7570_Z83181 Silene_conica_E_02095 Silene_coniflora_D_04295 Silene_coniflora_M_04297 Silene_coniflora_S_04275 Silene_coniflora_Z_04310 Silene_conoidea_12655_02094 Silene_davidii_13374_2599 Silene_diclinis_DIC_7_03234 Silene_dioica_D1842_4_3233 Silene_elisabethae_2470_Z83184 Silene_fedtschenkoana_12132_02092 Silene_fruticosa_Z83188 Silene_heuffelii_H4_6_4207 Silene_latifolia_L121_9_3224 Silene_latifolia_L170_10_3237 Silene_latifolia_L200_2_3230 Silene_latifolia_L81_9_3223 Silene_littorea_2395_Z83185 Silene_lydia_L_04351 Silene_lydia_S_04296 Silene_lydia_Z_04313 Silene_macrodonta_BOx3699_03162 Silene_marizii_M4_1_04289 Silene_multinervia_R_04353 Silene_multinervia_S_03657 Silene_nigrescens_13357_4439 Silene_nigrescens_KGB217_AJ629915 Silene_noctiflora_O_Z83176 Silene_noctiflora_P_3658 Silene_pendula_12654_02093 Silene_pseudoatocion_7821_EU314656 Silene_pygmaea_13772_FN821311 Silene_quadriloba_12438_03165 Silene_samia_7822_Z83168 Silene_stellata_6374_DQ908847 Silene_subconica_1033_4298 Silene_turkestanica_12484_03168 Silene_uniflora_2403_Z83173 Silene_viscosa_7705_02156 Silene_vulgaris_6459_02091 Silene_zawadzkii_Z83177_00092 Silene_akinifievii_6897_03211 Silene_multinervia_DQ908830_01209 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE rps16_dna; DIMENSIONS NCHAR=966; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Atocion_rupestre_13547_02676 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTCTAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTCTCCGTGTGCCTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATTAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCCTTTT------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAA------GAT-AAAGGCTTCCGTAACAAGGAAAAACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTAAAATCGATTTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTGCTCAATAAATGATAAATGCT---------------------AAAGGATTTTTTT-CTTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAATAAATGATTTTTTT-----------GAGGAAAG----------AAA-GGGCTTAATTTAAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGA------CTTTTTAATTGGTCATTTTAATTTATACATATATTAT----TAATTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Eudianthe_laeta_1341_Z83155 ???????????TCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTTTAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTCCTTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATAGAATATGATGGAGCTTGAGTAG-----AAAGTATTAAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAAAAAAGAAATTTTTTAATCCCCTAGGGCATTTTGATAAACCCTTTT------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATGCATCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTACAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAATAA------GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTAAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATTAATTCAAATCAATTTTAAATGAGATAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTGCTCAA?AAATGATAAATACT---------------------AAAGGATTTTTT--CTTTT------GGGATCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGGGAAG----------AAA-GGGCTTAATTTGAATTTATTTGAGGATTAAGGATTTTATAGATATAGACTTTTTT-TTTGTCATTCTAATTTATACATATATTTT??????ATTTTAATCATTTTTTTCTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTC? Lychnis_chalcedonica_2487_Z83164 ???????????????????????????A-TATCCATCA---------TTCTATAAAAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTCTCTCTTTCACTCGAACCC-AGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGCGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAASTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGATAG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AAAAAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTC---------AAAAAACAAGATCAAGAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGAAACAATTGATTGGTATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTGCTCAA?AAATGATAAATGCT---------------------AAAGGATTTTTTT-AGTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATA?AAA----TGATTTTTTT-----------GAGGAAAG----------AAA-GGGCTAAATTTGAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTCTAGA------CTTTTTGATTGGTCATTCAAATTTAAA-------------TTTTTTTTAATCATTTTTTTCTCGAGCCGTACGAGGATAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGT???????????????????????? Lychnis_coronaria_2488_Z83165 GAAGGACATGGTCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAAAAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTT?T?T?TTTCA?TCGAACCC-AGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGGTGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGCGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTST--CAATCAAAAGAATAASTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAKAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAACCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------AAATTAATTTTATTTATATATATTGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAAAAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTTAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTC---------AAAAAACAA------GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGAAACAATTTATTGGTATCAATTCAAATCGATGTTAAATTAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAA?AAATGATAAATGCT---------------------AAAGGATTTTTTT-AGTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGGAAAG----------AAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTCTAGG------CTTTTTGATTGGTCAGTCGAATTTATACATACATTTT------ATTTTAATCATTTTTTTCTCGAGCCGTACGAGGATAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGG????????????????????????? Lychnis_floscuculi_2406_Z83163 GAAGGACATGGTCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAAAAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTCTCTSTTTCACTCGAACCC-?GTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGCGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAACCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTTATTTATATATATTGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTATTTGATAGAAAAAAATAA-----SAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCTAATGATTS---------AAAAAAAAA------GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGAAACAATTGATTGGTATCAATTCAAATAGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTGCTCAA?AAATGATAAATGCT---------------------AAAGTCTTTTTTT-AGTTT------GGGTTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGGAAAG----------AAA-GGGCTTAATTT-AAGT-ATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA---------TTTGAT-GGTCATTCGAATTTATACATACATTTT------ATTTTAATCATTTTTTTCTCGAGCCGTATGAGGATAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTACATCTATCC????????????? Petrocoptis_pyrenaica_12875_02284 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTCTAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATATTTTTCTCTGTTYCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGTTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGAGGTCTAGGGTTAGCGT--CAATAAAAAAAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAAAAG------AAAGGATCAAAAAAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAAACCTTTT------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAA------GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGTAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATTTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTGCTCAATAAATGAGAAATGCT---------------------AAAGGATTTTTTT----TT---------ATCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGGAAAG----------AAA-GGGCTGAATTCTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGGTCATTTTAATTTATACATACATTTT-----------AATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAAGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Petrocoptis_pyrenaica_2486_Z83167 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTCTAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATATTTTTVTVTGTTCCACTCGAACCC-?GTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGTTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGAGGTCTAGGGTTAGCGT--CAATAAAAAAAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAAAAG------AAAGGATCAAAAAAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAAACCTTTT------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTSTAAACCCAAT?ATTC---------AAAAAACAA------GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATTTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTGCTCAA?AAATGAGAAATGCT---------------------AAAGKWTTTTTTT----TT---------CTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA-----GATTTTTTT-----------GAGGAAAG----------AAA-GGGCTGAATTCTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGGTCATTTTAATTTATACATACATTTT-----------AATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAAGAGWWWWCTTCCTATAHGTTTCCAAGGGGGG????????????????????????? Silene_ammophila_12639_03163 ???????????????????????????????????????????????????????TAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTTACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAATATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTTAT------TAATTAATTTGATTTATATATATCTTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----TAAAAGGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAAGAAATGCTAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTT----TTT-GGGGGGGGCTTCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGATAAGTAAAAAAA-GGGCTAAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGT------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATA???????????????????????????????????????? Silene_aprica_7570_Z83181 ??????????????GTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAAAAAAATAG------AAAGGATCAAAATAAAGCCAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCATGCGGAAATCCCTCGTTCATATTATTAGATTCTTTGATAGARATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTCCCATTTTTGAAAGGATTCAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAAAAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AGAGGGTATTTTAGACTAC-CAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTTT----------GAGTAAAG-----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTCTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT--------TTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCBGTCT Silene_conica_E_02095 ?????????????????????????????????????????????????????AATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTTACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAATATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTTAT------TAATTAATTTGATTTATATATATCTTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----TAAAAGGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAAGAAA-------TGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-TTTTT--GGGGGGGCTTCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGATAAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGT------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATATATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAG?????????????????????????????? Silene_coniflora_D_04295 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTTTTA-TATCCATCATTCTTTAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTTACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATCTATATCGTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----TAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGCGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTTCTTGAAACCTA-----CTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGATAAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGT------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_coniflora_M_04297 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTTTTA-TATCCATCATTCTTTAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTTACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATCTATATCGTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----TAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGCGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTTCTTGAAACCTA-----CTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGATAAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGT------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_coniflora_S_04275 ?????????????TGTTGTGGATTTTTA-TATCCATCATTCTTTAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTTACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATCTATATCGTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----TAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGCGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTTCTTGAAACCTA-----CTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGATAAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGT------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_coniflora_Z_04310 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTTTTA-TATCCATCATTCTTTAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTTACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATCTATATCGTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----TAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGCGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTTCTTGAAACCTA-----CTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGATAAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGT------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_conoidea_12655_02094 ????????????????????????????????????????????????TCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTTACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTATAAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGCCAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----TAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGCGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTTCTTGAAACCTA-----CTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGATAAGTAAAAAAAAGGGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTCTAGT------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT------TTTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTT?????????????????????????????????????????????? Silene_davidii_13374_2599 ??????????????????????????????????????????????????????????AGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCT-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAAAAAAATAG------AAAGGATCAAAATAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATTATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTCCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC-------AAAAAAAAAAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTTT----------GAGTAAAG-----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTCTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAA????????????????????????????????????????????????? Silene_diclinis_DIC_7_03234 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTACTGAGGAATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATACGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAGT-----AAAGGATCAAAATAAAGAAAATTTTGAATCCCCCAGGAGATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTCTGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGCAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAA-------TGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGG-CATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_dioica_D1842_4_3233 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTACTGAGGAATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATACGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAGT-----AAAGGATCAAAATAAAGAAAATTTTGAATCCCCCAGGAGATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTCTGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGCAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAA-------TGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGG-CATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_elisabethae_2470_Z83184 ??????????????GTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAMAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATATATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGRAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAA?AAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCYCCTTGAAACCTATCTAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAG-----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CCTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTKCCAAGGGGGGT?AAATCTATSCCAATGAGCCGTCT Silene_fedtschenkoana_12132_02092 ???????????????????????????????????????????????????????????GGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACT?GAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAAAAAAATAG------AAAGGATCAAAATAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTTATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATTATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTCCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAAAAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGCAAAGACTCTTTTAAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGAATTTTTTT-ATTTT------GGGCTACTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTTT----------GAGTAAAG-----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTCTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCT??????????????????????????????????????????? Silene_fruticosa_Z83188 ?AAGGACATGATCTGTTATGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTSTSTSTTTCACTCGAACCC-?GTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGASTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------AAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGRATMAAAATAAAVMAAATTTTTAATMMMCCGGRAWATTTTRATAAAMMTTW-T------TAATTMATTTGATTTATATATATMGWGMGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----?AAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAA------GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGKCGSAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGGTAAATGAGACAAAAC------AGAGCGTATTTTAGACTGSTCAA?AAATGATAAATGCT---------------------AAAGGATTTTTT---TTTT--------GCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATA-AAA----TGATTTTTTT-----------GAGGAAAG---------A?AA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTGATTGGTCATTCTAAATTTATGCAACATTTT--------TTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGT???????????????????????? Silene_heuffelii_H4_6_4207 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTACTGAGCAATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATACGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAGT-----AAAGGATCAAAATAAAGAAAATTTTGAATCCCCCAGGAGATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTCTGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGCAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAA-------TGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGG-CATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_latifolia_L121_9_3224 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTACTGAGGAATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATACGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAGT-----AAAGGATCAAAATAAAGAAAATTTTGAATCCCCCAGGAGATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTCTGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGCAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAA-------TGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGTTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGG-CATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_latifolia_L170_10_3237 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTACTGAGCAATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATACGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAGT-----AAAGGATCAAAATAAAGAAAATTTTGAATCCCCCAGGAGATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTCTGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGCAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAA-------TGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGG-CATTCTAATTTATACATACATTTT--------TTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_latifolia_L200_2_3230 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTT-TCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTACTGAGCAATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATACGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAGT-----AAAGGATCAAAATAAAGAAAATTTTGAATCCCCCAGGAGATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTCTGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGCAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAA-------TGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGG-CATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_latifolia_L81_9_3223 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTACTGAGCAATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATACGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAGT-----AAAGGATCAAAATAAAGAAAATTTTGAATCCCCCAGGAGATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTCTGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGCAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAA-------TGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTTTATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGG-CATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_littorea_2395_Z83185 ??????????ATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCT-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AA-----TTAGTTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTAT--CAATAAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAAAAAAATAG------AAAAGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTAATAAACCTTT-TCAATATCAATAAATTT--TTTTTATATATCGTGCGGAAATCCCCCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAAAT---GAT-AAAGGCTTCCGAAACAAGGAAAGACYCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGRTCAATTCAAATCGATKTWAAAKGGGACAAAAC------AAGGGGGATTTTAGACTWCCCAA?AAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT--TTTT--------GCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GATTAAAG-----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGA------CTTTTTT-TTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TCTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAGCTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCYKTCT Silene_lydia_L_04351 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTTTTC-TATCCATCATTCTTTAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAACTATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATACAAATAAATAA-----TAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGCGAAATACTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT---TTT-------GGCTTCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGAGAAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGC------CTTTTTGATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT--------TTTAATCATTTTTG-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_lydia_S_04296 ???????????????????????TTTTC-TATCC-TCATTCTTTAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAACTATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATACAAATAAATAA-----TAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGCGAAATACTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT---TTT-------GGCTTCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGAGAAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGC------CTTTTTGATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT--------TTTAATCATTTTTG-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTA?????????????????????????????????????????? Silene_lydia_Z_04313 ????????????????????????????????????CATTCTTTAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAACTATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATACAAATAAATAA-----TAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGCGAAATACTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT---TTT-------GGCTTCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGAGAAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGC------CTTTTTGATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT--------TTTAATCATTTTTG-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGG????????????????????????? Silene_macrodonta_BOx3699_03162 ???????????????????????????????????????????TAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTTACTCGAACCC-GGTTTGTTGGAGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAATATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAATCTTTAT------TAATTAATTTGATTTATATATATCTTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATATAAATAAATAA-----TAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTGGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGTAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATTGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGCGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-TTTGG-GGGGGGGGCTTCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGAGAAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGAATTTTATAGT------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGG????????????????????????? Silene_marizii_M4_1_04289 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTACTGAGGAATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATACGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAGT-----AAAGGATCAAAATAAAGAAAATTTTGAATCCCCCAGGAGATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTCTGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGCAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAA-------TGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGG-CATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_multinervia_R_04353 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCGCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAGAAAAGAAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTT------ACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------AAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAA-AAAAAG-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTCAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTAT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAGAAA-GGGCTGAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGATAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_multinervia_S_03657 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCGCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAGAAAAGAAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTT------ACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------AAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAA-AAAAAG-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTCAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTAT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAGAAA-GGGCTGAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGATAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_nigrescens_13357_4439 ????????????????????????????????????????????????????????????????CTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGAAAAAAAAATAG------AAAGGATCAAAATAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATTATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTCCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC--------AAAAAAAAAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAGTTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATAAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTTT----------GAGTAAAG-----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTCTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAA????????????????????????????????????????????????? Silene_nigrescens_KGB217_AJ629915 ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGAAAAAAAAATAG------AAAGGATCAAAATAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATTATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTCCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAAAAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAGTTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATAAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTTT----------GAGTAAAG-----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGG------CTCTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAG???????????????????????????????????????????????????????? Silene_noctiflora_O_Z83176 ???????????TCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTT-TCTGTTTAACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGAGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTAT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAACTTTGAATCCCCCAGGATATTTTGATCAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCA------AAA?KATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGCT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAACCAAAACAAAGGGTATTTTAGACTACTCAA?AAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATTCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGA----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGA------------------------TAATTTATACATACATTTT--------GTTAATCATTTTTT-ATCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGGTTCCAAGGGGGGTTCAATCTATCCCAATGAGCCGTC? Silene_noctiflora_P_3658 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTT-TCTGTTTAACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGAGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTAT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAACTTTGAATCCCCCAGGATATTTTGATCAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGCT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAACCAAAACAAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATTCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGA----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGA------------------------TAATTTATACATACATTTT--------GTTAATCATTTTTT-ATCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGGTTCCAAGGGGGGTTCAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_pendula_12654_02093 ????????????????????????????????????????????????TCTATAATAAAGGGTGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCAAACCC-GGTTTTGGGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGATATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCGTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAGGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ATTAAAGGATTTTTTG-ATTTT------AGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTAATTCTTTTTTTGAGTAAAGA---GTAAAGAAA-GGGTTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGA---------------TTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT--------TTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTT???????????????????????????????????? Silene_pseudoatocion_7821_EU314656 GAAGGACATGATCTTTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTCTCTGTTTCACTCGAACCT-AGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAGGGATAAAAA-----AAATTTTTTAATCCCCCGGGACAATTTGATAAACCTTTGT------TAATTAATTTGCTTTATATATATCATACGGAAATCCCTCGCTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAACATAACAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAAGGATTC---------AAAAAATAA------GATTAAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTAAATTGTCGCAACAATTGATTCGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTGCTCAATAAA-------TGCT---------------------AAAGGATTTTTT---TTTTGGGGGGGGGCTCCTTGAAACCGATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGGAAAG-----AAAAGAAA-AGG?TTCATTTTAATTCATTTGAGGGTTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTGATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCCTTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGATAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_pygmaea_13772_FN821311 ???GGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTCTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGAGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGTGTTAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATAAAGCCAATTTTGAACCCCTCGGAACATTTTGATAAACTTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAATAA------GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGTAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGGTTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAACT-----AAAGGGTATTTTAGACTGCTCAATAAATGAGAAATGCT---------------------AAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGGAAAG-----AAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTGATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTTATTTTAATTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTT???????????????????????????????????? Silene_quadriloba_12438_03165 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATT---ATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCCCGGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAAAAAAATAGAAAGAGAAAGGATCAAAATAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATTATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTCCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAAAAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTT--ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTTT----------GAGTAAAG-----TAAAGAAA-GAGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGA------CTCTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_samia_7822_Z83168 ??????????????GTTRTGGVTTCTTA-TATCCATCATTCTATAVTTTCTATAATAAAGGVTGCTCTTAACTCGACATVTTTTTTTCTSTTTCACTTGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTAT--CAATAAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAT------AAAGGVTCAAAATAAAGCAAATTTTGAVTCCCCCAGGACATTTTGATAAACSTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGBGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTCGATTCTTTGATAGAAA-AAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCMBTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAGGGCTGCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATTGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAA?AAA---------------------------------AAGGATTTTTTT-------GGGGGGGGCTCCTTGAAACCTATCTAACTTGAGTTATGAGTATACAAA-------TTTT--------------GAGTAAAG----------AAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGGGGATTTTATAGA------CTTTTTTTTTGGTCATTCTAATTTATACATGCATTTT-------TTTTAATCATTTTTG-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAA?TTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTACATCTATCCCAATGAGCC???? Silene_stellata_6374_DQ908847 ??????????????????????????TA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAAAAAAATAG------AAAGGATCAAAATAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCTTGCGGAAATCCCTCGTTCATATTATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTGTGTTGCTCCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAAAAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGATAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTTT----------GAGTAAAG-----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTCTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACTTTTCCAAGGGGGGTTAATTCTATCCCAATG???????? Silene_subconica_1033_4298 ?????????????TGTTGTGGATTTTTA-TATCCATCATTCTTTAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTTACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAATATTGAGCTATTTATCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGTTCCAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTTAT------TAATTAATTTGATTTATATATATCTTGCGGAAATCCCTC---------ATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----TAAAAGGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAAGAAA-------TGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT--TTTTGGGGGGGGGCTTCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT------------GAGTAAAGATAAGTAAAAAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGT------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGG????????????????????????? Silene_turkestanica_12484_03168 GAAGGACATGATCTGTGGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTT-TCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGAGA-----------------GAGGAGTCTAGGGTTAGTAT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAACTTTGAATCCCCCAGGATATTTTGATCAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGCT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAACCAAAACAAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATTCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGA----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTGAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGA------------------------TAATTTATACATACATTTT--------GTTAATCATTTTTT-ATCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGGTTCCAAGGGGGGTTCAATCTATCCCAATGAGCCGTCT Silene_uniflora_2403_Z83173 ???????????TCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTT?TCTGT?TCACT?AAACCC-GGTTTTCGGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGAAGCTATTTCTCAAGGGAGAGGGGTCTAGGGTTAGTST--CAATAAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTTAATCCCCCAGGATATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATBGTGCGGAAATSCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAGGGTATGTTGCTGCCATTTTTTAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTAAGACTACTCAA?AAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTGTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTT??TTATTTTTTTGAGTAAAGA--AGTAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGAATTGAGGATTTTATAGA------TTTTTTT----GTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCC???? Silene_viscosa_7705_02156 ???????????????????????????????????????TCTATAATT---ATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCCCGGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAAAAAAATAGAAAGAGAAAGGATCAAAATAAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------TAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATTATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTCCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAAAAAGAT---GATTAAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTT--ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTTT----------GAGTAAAG-----TAAAGAAA-GAGCTTAATTTTAATTCATTT-------GAGGATTTTATAGA------CTCTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGT???????????????????????? Silene_vulgaris_6459_02091 ???????????????????????????????????????TCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCAAACCC-GGTTTTCGGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGAAGCTATTTCTCAAGGGAGAGGAGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTTAATCCCCCAGGATATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATTGTGCAGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAGGGTATGTTGCTGCCATTTTTTAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTAAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTGTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTAATTATTTTTTTGAGTAAAGA--AGTAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGAATTGAGGATTTTATAGA------TTTTTTT----GTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAACTTCCTAKACGTT?CCAAGGGGGG????????????????????????? Silene_zawadzkii_Z83177_00092 ??????????????GTTGTGGATTCTTA-TATCCATCA---------TTCTATAATAAAGGATGCTCTTAACTCGACATCTTTTT-TCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGCTGGAGCTCGAGTAA-----AAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATCAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAAAAAAATAT------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAWTAAATAM-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTCAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAAWTGTCGCAATAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAA?AAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGA----TAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGAGAAAMCTTCCTATACGTTTCCAAGGGGGGTTAAATCTATCCCAATGAGCCGTC? Silene_akinifievii_6897_03211 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAG-----AAAGTATTGAGTTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTTGGAACAACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------CAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAATAAATAA-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTAAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTTT-ATTTT------AGGCTCCTTGAAACCTATACAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAG-----AAAAGAAA-GGGCTTAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT???????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_multinervia_DQ908830_01209 GAAGGACATGATCTGTTGTGGATTCTTA-TATCCATCATTCTATAATTTCTATAATAAAGGATGCGCTTAACTCGACATCTTTTTTTCTGTTTCACTCGAACCC-GGTTTGTTGGGGTGTAATGGAATATGATGGAGCTCGAGTAGAAAAGAAAGTATTGAGCTATTTCTCAAGGGA-----------------GAGGGGTCTAGGGTTAGTGT--CAATAAAAAGAATAAGTT------ACTTCGTAAGTTATCTTTGACAGAAAAATAG------AAAGGATCAAAATCAAGCAAATTTTGAATCCCCCAGGACATTTTGATAAACCTTT-T------AAATTAATTTGATTTATATATATCGTGCGGAAATCCCTCGTTCATATGATTAGATTCTTTGATAGAAA-AAAAAG-----CAAAAAGGTATGTTGCTGCCATTTTTGAAAGGATTCAAAATCAACGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTC---------AAAAAACAAGAT---GAT-AAAGGCTTCCGGAACAAGGAAAGACTCTTTTTAATTGTCGCAACAATTGATTGGGATCAATTCAAATCGATGTTAAATGAGACAAAAC------AAAGGGTATTTTAGACTACTCAATAAATGAGAAATGCTAA----------------ACTAAAGGATTTTTAT-ATTTT------GGGCTCCTTGAAACCTATCCAACTTGAGTTATGAGTATACAAA----TGATTTTTTT-----------GAGTAAAGATGAGTAAAGAAA-GGGCTGAATTTTAATTCATTTGAGGATTGAGGATTTTATAGA------CTTTTTTATTGGTCATTCTAATTTATACATACATTTT-------TTTTAATCATTTTTT-CTCGAGCCGTACGAGGATAAAATTTCCTATACGTTTCCAAGGGGG?????????????????????????? ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE rps16_indels; DIMENSIONS NCHAR=82; FORMAT DATATYPE = STANDARD GAP = - MISSING = ? SYMBOLS = " 0 1"; MATRIX Atocion_rupestre_13547_02676 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Eudianthe_laeta_1341_Z83155 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Lychnis_chalcedonica_2487_Z83164 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Lychnis_coronaria_2488_Z83165 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Lychnis_floscuculi_2406_Z83163 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Petrocoptis_pyrenaica_12875_02284 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Petrocoptis_pyrenaica_2486_Z83167 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_ammophila_12639_03163 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_aprica_7570_Z83181 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_conica_E_02095 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_coniflora_D_04295 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_coniflora_M_04297 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_coniflora_S_04275 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_coniflora_Z_04310 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_conoidea_12655_02094 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_davidii_13374_2599 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_diclinis_DIC_7_03234 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_dioica_D1842_4_3233 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_elisabethae_2470_Z83184 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_fedtschenkoana_12132_02092 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_fruticosa_Z83188 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_heuffelii_H4_6_4207 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_latifolia_L121_9_3224 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_latifolia_L170_10_3237 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_latifolia_L200_2_3230 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_latifolia_L81_9_3223 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_littorea_2395_Z83185 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_lydia_L_04351 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_lydia_S_04296 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_lydia_Z_04313 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_macrodonta_BOx3699_03162 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_marizii_M4_1_04289 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_multinervia_R_04353 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_multinervia_S_03657 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_nigrescens_13357_4439 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_nigrescens_KGB217_AJ629915 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_noctiflora_O_Z83176 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_noctiflora_P_3658 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_pendula_12654_02093 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_pseudoatocion_7821_EU314656 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_pygmaea_13772_FN821311 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_quadriloba_12438_03165 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_samia_7822_Z83168 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_stellata_6374_DQ908847 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_subconica_1033_4298 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_turkestanica_12484_03168 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_uniflora_2403_Z83173 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_viscosa_7705_02156 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_vulgaris_6459_02091 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_zawadzkii_Z83177_00092 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_akinifievii_6897_03211 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Silene_multinervia_DQ908830_01209 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN TREES; Title rps16_TB; LINK Taxa = taxa; TRANSLATE 1 Atocion_rupestre_13547_02676, 2 Eudianthe_laeta_1341_Z83155, 3 Lychnis_chalcedonica_2487_Z83164, 4 Lychnis_coronaria_2488_Z83165, 5 Lychnis_floscuculi_2406_Z83163, 6 Petrocoptis_pyrenaica_12875_02284, 7 Petrocoptis_pyrenaica_2486_Z83167, 8 Silene_ammophila_12639_03163, 9 Silene_aprica_7570_Z83181, 10 Silene_conica_E_02095, 11 Silene_coniflora_D_04295, 12 Silene_coniflora_M_04297, 13 Silene_coniflora_S_04275, 14 Silene_coniflora_Z_04310, 15 Silene_conoidea_12655_02094, 16 Silene_davidii_13374_2599, 17 Silene_diclinis_DIC_7_03234, 18 Silene_dioica_D1842_4_3233, 19 Silene_elisabethae_2470_Z83184, 20 Silene_fedtschenkoana_12132_02092, 21 Silene_fruticosa_Z83188, 22 Silene_heuffelii_H4_6_4207, 23 Silene_latifolia_L121_9_3224, 24 Silene_latifolia_L170_10_3237, 25 Silene_latifolia_L200_2_3230, 26 Silene_latifolia_L81_9_3223, 27 Silene_littorea_2395_Z83185, 28 Silene_lydia_L_04351, 29 Silene_lydia_S_04296, 30 Silene_lydia_Z_04313, 31 Silene_macrodonta_BOx3699_03162, 32 Silene_marizii_M4_1_04289, 33 Silene_multinervia_R_04353, 34 Silene_multinervia_S_03657, 35 Silene_nigrescens_13357_4439, 36 Silene_nigrescens_KGB217_AJ629915, 37 Silene_noctiflora_O_Z83176, 38 Silene_noctiflora_P_3658, 39 Silene_pendula_12654_02093, 40 Silene_pseudoatocion_7821_EU314656, 41 Silene_pygmaea_13772_FN821311, 42 Silene_quadriloba_12438_03165, 43 Silene_samia_7822_Z83168, 44 Silene_stellata_6374_DQ908847, 45 Silene_subconica_1033_4298, 46 Silene_turkestanica_12484_03168, 47 Silene_uniflora_2403_Z83173, 48 Silene_viscosa_7705_02156, 49 Silene_vulgaris_6459_02091, 50 Silene_zawadzkii_Z83177_00092, 51 Silene_akinifievii_6897_03211, 52 Silene_multinervia_DQ908830_01209; TREE rps16_MB_con_50_majrule = (1:0.020457,2:0.042534,((3:0.016292,4:0.012872,5:0.017689):0.025566,((51:0.00585,((((17:0.001143,18:0.001176,23:0.002271,32:0.001161):0.002284,22:0.001138,26:0.002285,24:0.002217,25:0.003429):0.01496,43:0.026397):0.003777,(39:0.014307,(47:0.001117,49:0.003822):0.012468):0.012359,((((8:0.004696,(10:0.003966,45:0.003003):0.002887):0.004375,31:0.014013):0.007096,((14:0.001168,11:0.001181,13:0.001188,12:0.001148):0.00354,15:0.008196):0.003886):0.002893,(30:0.001244,29:0.002154,28:0.001161):0.01691):0.020267,(52:0.002275,34:0.001131,33:0.001144):0.013918):0.004208,19:0.005839,27:0.033673):0.003016,(9:0.008279,16:0.004103,20:0.007654,(35:0.002698,36:0.002676):0.00557,(42:0.001315,48:0.002417):0.009337,44:0.00695):0.010931,(((38:0.001198,37:0.00245):0.002401,46:0.003634):0.023047,50:0.008775):0.003582):0.011518,((21:0.027303,40:0.040837):0.003716,41:0.017088):0.004732):0.00907,(7:0.002591,6:0.003718):0.02395); TREE rps16_BS_PAUP_1 = (1,2,(((3,4)56,5)100,(51,(9,16,20,(35,36)84,(42,48)100,44)97,((17,18,23,32)62,22,26,24,25)100,19,27,((38,37)62,46)100,(39,(47,49)100)99,43,50,((((8,(10,45)70)72,31)90,((14,11,13,12)83,15)79)68,(30,29,28)100)100,(52,34,33)100)95,(21,40)54,41)74,(7,6)100)0; END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED (CHARACTERS = rps16_dna) = unord: 1 - 966; TYPESET * UNTITLED (CHARACTERS = rps16_indels) = unord: 1 - 82; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED (CHARACTERS = rps16_dna) = universal: 1 - 966; END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED (CHARACTERS = rps16_dna) = 'Jukes-Cantor': 1 - 966; ProbModelSet * UNTITLED (CHARACTERS = rps16_indels) = 'Mk1 (est.)': 1 - 82; END; Begin MESQUITE; MESQUITESCRIPTVERSION 2; TITLE AUTO; tell ProjectCoordinator; timeSaved 1295559117530; getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa; tell It; setID 0 2101349889398725170; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters; tell It; setID 0 4857606528315383208; mqVersion 273; checksumv 0 2 1750376757 null getNumChars 966 numChars 966 getNumTaxa 52 numTaxa 52 short true bits 2305843009213693967 states 15 sumSquaresStatesOnly 1056662.0 sumSquares -2.6286610305036108E20 NumFiles 1 NumMatrices 2 errorReportedDuringRun; mqVersion; setID 1 8448653977805027065; mqVersion 273; checksumv 1 2 2376038482 null getNumChars 82 numChars 82 getNumTaxa 52 numTaxa 52 short true bits 0 states 0 sumSquaresStatesOnly 0.0 sumSquares 0.0 NumFiles 1 NumMatrices 2 errorReportedDuringRun; mqVersion; endTell; getWindow; tell It; suppress; setResourcesState true false 329; setPopoutState 400; setExplanationSize 0; setAnnotationSize 0; setFontIncAnnot 0; setFontIncExp 0; setSize 700 464; setLocation 8 22; setFont SanSerif; setFontSize 10; getToolPalette; tell It; endTell; setActive; desuppress; endTell; endTell; end;