NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:04:16]
[Matrix accession#: M1759]

BEGIN TAXA;
	TITLE M1759;
	DIMENSIONS  NTAX=31;
	TAXLABELS
		Phytophthora_syringae	Phytophthora_sojae	Phytophthora_ramorum_PrSDC21.6_US	Phytophthora_ramorum_Pr102_US	Phytophthora_ramorum_Phyram1_Spain	Phytophthora_ramorum_BBA12.98_Germany	Phytophthora_quercina	Phytophthora_psychrophila	Phytophthora_pseudosyringae_P40_US	Phytophthora_pseudosyringae_IFBPSEU4_Germany	Phytophthora_pseudosyringae_IFBPSEU25_Italy	Phytophthora_pseudosyringae_IFBPSEU16_Germany	Phytophthora_palmivora	Phytophthora_nicotianae	Phytophthora_nemorosa	Phytophthora_megasperma	Phytophthora_lateralis_PL33	Phytophthora_lateralis_PL27	Phytophthora_infestans	Phytophthora_ilicis	Phytophthora_hibernalis_380	Phytophthora_hibernalis_379	Phytophthora_gonapodyides	Phytophthora_erythroseptica	Phytophthora_cryptogea	Phytophthora_cinnamomi_P6379_A1	Phytophthora_cinnamomi_P2444_A2	Phytophthora_capsici	Phytophthora_cambivora	Phytophthora_cactorum	Nephroselmis_olivacea
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M1759;
	DIMENSIONS NCHAR=388;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Phytophthora_syringae                               TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCAGCATTAATTCATGCAGCAACAATGGTAACCGCAGGTGTTTATTTAACAGCAAGATGTTCTCCGATGTTTGAATATTCAATGTTTTCATTGAAAGTAATTACAATAATAGGTGCTTCAACTGCTTTTTTTGCAAGTACCGTAGGTTTAGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCATATTCGACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCGAATTACCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCATATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCGGGTGCAGTAATTCATGCAATGGGTGATGAGCAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_sojae                                  TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCAACAATGGTAACAGCTGGTGTATATTTAACAGCACGCTGTTCACCTATGTTCGAATATTCTATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACTGTAATTGGTGCTTCAACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTAGGATTAGTTCAGAATGATTTTAAGAAAATTGTTGCATATTCAACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCAAATTACCCCTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCATATTTTAAGGCATTATTATTTTTATGTTCAGGTGCAGTAATTCACGCTATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGGGGTTTAAGAC
		Phytophthora_ramorum_PrSDC21.6_US                   TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCTACAATGGTAACTGCAGGTGTATATTTAACTGCACGTTGTTCTCCTATGTTTGAATATTCTATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACAGTTATAGGAGCTTCAACAGCTTTTTTTGCCAGTACTGTTGGTTTAGTTCAGAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCTTATTCAACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCTAATCATGCATATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCTGGTGCAGTAATTCACGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAGATGGGGGGTTTAAGAC
		Phytophthora_ramorum_Pr102_US                       TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCTACAATGGTAACTGCAGGTGTATATTTAACTGCACGTTGTTCTCCTATGTTTGAATATTCTATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACAGTTATAGGAGCTTCAACAGCTTTTTTTGCCAGTACTGTTGGTTTAGTTCAGAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCTTATTCAACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCTAATCATGCATATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCTGGTGCAGTAATTCACGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAGATGGGGGGTTTAAGAC
		Phytophthora_ramorum_Phyram1_Spain                  TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCTACAATGGTAACTGCAGGTGTATATTTAACTGCACGTTGTTCTCCTATGTTTGAATATTCTATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACAGTTATAGGAGCTTCAACAGCTTTTTTTGCCAGTACTGTTGGTTTAGTTCAGAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCTTATTCAACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCTAATCATGCATATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCTGGTGCAGTAATTCACGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAGATGGGGGGTTTAAGAC
		Phytophthora_ramorum_BBA12.98_Germany               TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCTACAATGGTAACTGCAGGTGTATATTTAACTGCACGTTGTTCTCCTATGTTTGAATATTCTATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACAGTTATAGGAGCTTCAACAGCTTTTTTTGCCAGTACTGTTGGTTTAGTTCAGAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCTTATTCAACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCTAATCATGCATATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCTGGTGCAGTAATTCACGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAGATGGGGGGTTTAAGAC
		Phytophthora_quercina                               ??????????????????????????????????????????????CAACAATggTaACTGCTGGTGTATATTTAACAGCAAGATGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAGTTATTACTGTTATAGGTGCTTCAACAGCTTTTTTTGCTAGTACTGTTGGATTAGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCTTATTCCACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCTAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCATATTTTAAAGCATTATTGTTTTTATGTTCAGGTGCAGTAATTCATGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_psychrophila                           ???????????????????????????????????AaTTCATGCAGCAACAATGGTAACAGCCGGTGTATATTTAACAACACGTTGTTCACCTATATTTGAATATTCTATATTTTCTTTAAAAGTTATTACTATAATTGGTGCATCAACTGCTTTTTTTGCGAGTACTGTTGGATTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATTGTTGCTTATTCTACATGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGTTTATCTAATTACCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGTGCTGTAATACATGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGGGGTTTAAGAC
		Phytophthora_pseudosyringae_P40_US                  TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCAGCATTAATTCATGCAGCAACAATGGTAACCGCTGGTGTATATTTAACAGCACGTTGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACAGTAATTGGTGCTTCAACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTAGGATTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATTGTGGCCTATTCTACATGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGCGGTTTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTCCATTTATCAAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGAGCAGTAATTCATGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_pseudosyringae_IFBPSEU4_Germany        ???????????????????????????????????aATTcATGCagCAaCAATGGTAaCCGCTGGTGTATATTTAACAGCACGTTGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACAGTAATAGGTGCTTCAACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTAGGATTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATTGTTGCTTATTCTACATGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGCGGTTTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGAGCAGTAATTCATGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_pseudosyringae_IFBPSEU25_Italy         ???????????????????????????????????AAttCAtGCAGCAaCAATGGTAACAGCTGGtGTATATTTAACAGCACGTTGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACAGTAATTGGTGCTTCTACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTAGGATTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATTGTTGCCTATTCTACATGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGCGGTTTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTCCATTTATCAAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGAGCAGTAATTCATGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_pseudosyringae_IFBPSEU16_Germany       TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCAGCATTAATTCATGCAGCAACAATGGTAACCGCTGGTGTATATTTAACAGCACGTTGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACAGTAATTGGTGCTTCAACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTAGGATTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATTGTGGCCTATTCTACATGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGCGGTTTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTCCATTTATCAAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGAGCAGTAATTCATGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_palmivora                              TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCTGCTTTAATTCATGCAGCAACAATGGTAACAGCTGGTGTATATTTAACTACCCGTTGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAGTTATTACTGTTATAGGTGCTTCAACAGCATTTTTTGCAAGTACTGTTGGATTAGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCCTATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCCTGTGGATTATCGAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGTGCAGTAATTCATGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGGGGTTTAAGAC
		Phytophthora_nicotianae                             TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCTGCTTTAATTCATGCAGCTACCATGGTAACTGCAGGTGTATACTTAACAGCAAGATGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAGTTATTACTGTTATAGGTGCTTCAACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTTGGATTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCTTATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCTAACCATGCCTATTTTAAAGCATTATTATTCTTATGTTCAGGTGCAGTAATTCATGCTATGGGTGATGAGCAAGATATTAGAAAAATGGGAGGTTTAAGAC
		Phytophthora_nemorosa                               TATGCTATGGAAGGTCCTACACCTGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCAACTATGGTAACTGCAGGTGTATACTTAACAACACGTTGTTCACCTATATTTGAATATTCTATATTTTCTTTAAAAGTTATTACTATAATTGGTGCATCAACGGCTTTTTTTGCGAGTACTGTAGGATTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATTGTTGCTTATTCTACATGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGTTTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGTGCTGTAATACATGCAATGGGTGATGAACAGGATATTAGAAAAATGGGGGGTTTAAGAC
		Phytophthora_megasperma                             TATGCTATGGAAGGTCCTACACCCGTGTCTGCATTAATTCATGCAGCTACTATGGTAACAGCGGGTGTATATTTAACAGCACGTTGTTCTCCAATGTTTGAATATTCGATGTTTTCTTTAAAAGTTATTACCGTAATTGGAGCTTCAACAGCTTTTTTTGCTAGTACTGTGGGTTTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATCGTAGCTTATTCAACATGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCATATTTTAAAGCATTATTATTTTTATGTTCTGGTGCAGTAATTCATGCTATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGGGGTTTAAGAC
		Phytophthora_lateralis_PL33                         TATGCTATGGAAGGTCCTACACCGGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCTACAATGGTAACTGCGGGTGTATATTTAACAACACGTTGCTCACCTATGTTCGAATATTCGATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACCATTATTGGAGCTTCAACTGCTTTTTTTGCAAGTACTGTAGGTTTAGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCATATTCAACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGACTTTCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCTAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTCTTATGTTCTGGAGCTGTAATCCATGCAATGGGTGATGAGCAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_lateralis_PL27                         TATGCTATGGAAGGTCCTACACCGGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCTACAATGGTAACTGCGGGTGTATATTTAACAACACGTTGCTCACCTATGTTCGAATATTCGATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACCATTATTGGAGCTTCAACTGCTTTTTTTGCAAGTACTGTAGGTTTAGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCATATTCAACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGACTTTCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCTAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTCTTATGTTCTGGAGCTGTAATCCATGCAATGGGTGATGAGCAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_infestans                              GATGCTATGGAAGGTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAATACATGCAGCAACAATGGTAACAGCTGGTGTATATTTAACAGCACGTTGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAATAATTACAATTATAGGTGCTTCTACTGCTTTTTTTGCAAGTACTGTCGGATTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATAGTCGCTTATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCAAATTACCCTTTAGCAATTTTCCATTTATCAAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTTCTATGTTCTGGTGCAGTAATTCATGCAATGGGTGATGAGCAAGATATTAGAAAAATGGGGGGTTTAAGAC
		Phytophthora_ilicis                                 TATGCTATGGAAGGTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAATTCATGCAGCAACCATGGTAACCGCAGGTGTATACTTAACAACACGTTGTTCACCTATATTTGAATATTCTATATTTTCTTTAAAAGTTATTACTATAATTGGTGCATCAACTGCTTTTTTTGCAAGTACTGTGGGATTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATTGTTGCTTATTCTACATGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGTTTATCAAATTATCCCTTAGCTATTTTCCATTTATCAAATCATGCTTATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGTGCAGTAATACATGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_hibernalis_380                         TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCAGCCTTAATTCATGCAGCAACCATGGTAACTGCTGGTGTTTACTTAACAGCACGTTGTTCACCTATGTTTGAATATTCTATGTTTTCTTTAAAAATTATTACAGTAATTGGTGCTTCAACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTTGGATTAGTTCAAAATGATTTCAAAAAAATCGTTGCCTATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCTAATTACCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCTAATCATGCATATTTTAAAGCTTTATTATTCCTATGTTCAGGTGCTGTAATTCATGCAATGGGTGATGAGCAAGATATTAGAAAGATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_hibernalis_379                         TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCAGCCTTAATTCATGCAGCAACCATGGTAACTGCTGGTGTTTACTTAACAGCACGTTGTTCACCTATGTTTGAATATTCTATGTTTTCTTTAAAAATTATTACAGTAATTGGTGCTTCAACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTTGGATTAGTTCAAAATGATTTCAAAAAAATCGTTGCCTATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCTAATTACCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCTAATCATGCATATTTTAAAGCTTTATTATTCCTATGTTCAGGTGCTGTAATTCATGCAATGGGTGATGAGCAAGATATTAGAAAGATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_gonapodyides                           TATGCTATGGAAGGTCCTACACCGGTATCCGCATTAATTCATGCCGCAACTATGGTAACCGCGGGTGTATATTTAACAGCACGTTGTTCCCCAATGTTTGAATATTCAATGTTTTCATTAAAAGTTATTACAGTAATTGGAGCTTCAACAGCTTTTTTCGCCAGTACTGTAGGTTTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATTGTAGCTTATTCAACATGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCGAATTATCCTTTAGCTATTTTCCATTTATCTAATCATGCCTATTTTAAAGCATTATTATTTTTATGTTCAGGTGCTGTAATTCATGCTATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_erythroseptica                         TATGCTATGGAAGGTCCTACACCGGTTTCAGCATTAATTCACGCAGCAACCATGGTAACTGCTGGTGTTTATTTAACTGCGCGTTGTTCGCCCATGTTTGAATATTCTATGTTTTCATTAAAAGTTATAACTGTAATAGGTGCTTCAACAGCCTTTTTTGCAAGTACTGTTGGATTAGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATTGTAGCATATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTCTTTGCTTGTGGATTATCTAATTATCCTTTAGCTATTTTCCATTTATCTAATCATGCGTATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGTGCTGTAATTCATGCTATGGGTGATGAACAGGATATTAGAAAGATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_cryptogea                              TATGCTATGGAAGGTCCTACACCGGTTTCAGCATTAATTCATGCAGCAACCATGGTAACTGCTGGTGTTTATTTAACTGCGCGTTGTTCGCCTATGTTTGAATATTCTATGTTTTCATTAAAAGTTATAACTGTAATAGGTGCTTCAACAGCCTTTTTTGCGAGTACTGTTGGATTAGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATAGTAGCATATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTCTTTGCTTGTGGATTATCTAATTATCCTTTAGCTATTTTCCATTTATCTAATCATGCGTATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGGGCTGTAATTCATGCTATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAGATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_cinnamomi_P6379_A1                     TATGCTATGGAAGGTCCTACACCTGTATCTGCATTAATTCATGCTGCAACAATGGTAACAGCTGGTGTATATTTAACTGCACGCTGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAGTAATAACTGTAATTGGTGCATCTACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTGGGATTGGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCATATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGGTTATCAAATTATCCTCTTGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCGTATTTTAAGGCTTTATTATTCTTATGTTCAGGAGCGGTAATACATGCTATGGGTGATGAACAAGATATTCGTAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_cinnamomi_P2444_A2                     TATGCTATGGAAGGTCCTACACCTGTATCTGCATTAATTCATGCTGCAACAATGGTAACAGCTGGTGTATATTTAACTGCACGCTGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAGTAATAACTGTAATTGGTGCATCTACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTGGGATTGGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCATATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGGTTATCAAATTATCCTCTTGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCGTATTTTAAGGCTTTATTATTCTTATGTTCAGGAGCGGTAATACATGCTATGGGTGATGAACAAGATATTCGTAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_capsici                                TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCTACTATGGTAACTGCGGGTGTTTATTTAACAGCAAGATGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCCTTAAAAGTTATTACTGTTATAGGTGCTTCAACAGCTTTTTTTGCAAGTACTGTAGGTTTAGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCATATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGTTTATCAAATTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCTTATTTTAAAGCATTATTATTTTTATGTTCAGGTGCAGTAATCCATGCAATGGGAGACGAACAAGACATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_cambivora                              TATGCTATGGAAGGTCCTACACCAGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCAACAATGGTAACAGCAGGTGTATATTTAACTGCACGTTGTTCACCAATGTTTGAATATTCTATGTTTTCTTTAAAAGTAATTACTATAATTGGGGCATCAACCGCTTTTTTTGCAAGTACTGTTGGATTAGTTCAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCTTATTCAACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCAAACTATCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCATATTTTAAAGCTTTATTATTTTTATGTTCAGGTGCTGTAATTCATGCTATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGTGGTTTAAGAC
		Phytophthora_cactorum                               TATGCTATGGAAGGTCCTACACCTGTTTCTGCATTAATTCATGCAGCTACAATGGTAACAGCAGGTGTATATTTAACGGCTCGTTGTTCACCTATGTTTGAATATTCAATGTTTTCTTTAAAAATTATTACAATTATAGGTGCTTCTACCGCTTTTTTTGCTAGTACTGTTGGTTTAGTACAAAATGATTTTAAAAAAATAGTTGCTTATTCTACTTGTAGTCAATTAGGTTATATGTTTTTTGCTTGTGGATTATCAAATTACCCTTTAGCTATTTTTCATTTATCAAATCATGCCTATTTTAAAGCTTTATTATTCTTATGTTCTGGAGCAGTAATTCATGCAATGGGTGATGAACAAGATATTAGAAAAATGGGGGGTTTAAGAC
		Nephroselmis_olivacea                               GATGCCATGGAAGGTCCAACTCCTGTTTCTGCATTAATTCACGCTGCTACAATGGTAACAGCTGGAGTTTTTTTAGTTGCTAGATGTAGTCCTATTTTTGAGTATGCGCCTAATGCTTTAATGATTGTTACTTTTGGTGGTGCTATGACTGCGTTTTTTGCAGCAACTACAGGTTTAGTACAAAATGACATGAAACGAGTTATTGCTTATTCAACCTGTAGTCAACTAGGTTATATGATTTTTGCTTGTGGGATTTCTAATTATTCTGTAGGTATTTTTCATTTAATGAACCATGCTTTTTTTAAAGCTTTATTATTCCTAAGTGCTGGTTCTGTAATTCATGCAATGCAGGATGAACAAGATATGCGGAAAATGGGAGGACTTGTAC
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 388 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;