#NEXUS [written Thu Apr 07 16:21:35 EDT 2011 by Mesquite version 2.6 (build 486) at KatzLab-jgrant.local/131.229.113.228] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=492; TAXLABELS Acanthamoeba_castellanii Acanthocystis_nichollsi Acanthometra_sp Acetabularia_acetabulum Acrasis_rosea Acrosphaera_sp Adelina_dimidiata Alexandrium_tamarense Allantion_sp Allas_diplophysa Allogromia_sp Allomyces_macrogynus Amastigomonas_sp_50062 Amastigomonas_bermudensis_AY050178 Amastigomonas_debruynei_AY050180 Amastigomonas_mutabilis_AY050182 Amastigomonas_sp._Millport_AY050181 Amastigomonas_sp_AY268039 Ammonia_beccarii Amoeba_leningradensis Amoeba_proteus Amoebidium_parasiticum Amoebophrya_sp Amphiacon_denticulatus Amphibelone_anomala Amphibiothecum_penneri Amphisorus_hemprichii Amastigomonas_sp_AY050179 Ancyromonas_sigmoides_AF174363 Ancyromonas_sigmoides_AY827843 Ancyromonas_sp Andalucia_godoyi Andalucia_incarcerata Aphrocallistes_vastus Aplysia_californica Apodachlya_brachynema 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Carpediemonas_membranifera Cercomonas_agilis Cercomonas_sp Challengeron_diodon Chaos_carolinense Chaos_nobile Chaunacanthid_217 Chilodonella_uncinata Chilomonas_paramecium Chlamydaster_sterni Chlamydomyxa_labyrinthuloides Chlorarachnion_CCMP621 Chlorella_vulgaris Chlorokybus_atmophyticus Choanocystis_rotundata Cholamonas_cyrtodiopsidis Chromera_velia Chroomonas_mesostigmatica Chrysocapsa_paludosa Chrysochromulinda_polylepis Ciliophrys_infusionum Ciona_intestinalis Clathrulina_elegans Closterium_ehrenbergii Clydonella_sp Coelodendrum_ramosissimum Coleochaete_scutata Collozoum_inerme Colpodella_sp Colpodidium_caudatum Comandonia_operculata Conchellium_capsula Corallochytrium_limacisporum Corallomyxa_sp Corcontochrysis_noctivaga Corythion_dubium Corythionella_sp Costaria_costata Cribrothalammina_alba Cryothecomonas_longipes Crypthecodinium_cohnii Cryptobia_helicis Cryptoglena_pigra Cyanidioschyzon_merolae Cyanophora_paradoxa_gene Cyanoptyche_gloeocystis Cycas_taitungensis Cyphoderia_ampulla Deltotrichonympha_operculata Dermamoeba_algensis Dermocystidium_percae Diaphanoeca_grandis Dictyostelium_discoideum Didymium_dubium Didymium_iridis Didymium_nigripes_anotated Didymocyrtis_tetrathalamus Dimorpha_sp Dinenympha_exilis Dinophyceae_sp Dinophysis_acuminata Diphylleia_rotans Diplomonad_ATCC50330 Diplonema_papillatum Distigma_gracile Drosophila_melanogaster Dysnectes_brevis Entamoeba_histolytica Ebria_tripartita Eccrinidus_flexilis Echinamoeba_exundans Eggerelloides_scabrum Eimeria_tenella Elliptochloris_sp Emiliania_huxleyi Endolimax_nana Enteromonas_hominis Entodinium_caudatum Eucyrtidium_hexastichum Euglena_gracilis Euglena_longa Euglypha_rotunda Euplotes_octocarinatus Eutreptia_viridis Filamoeba_nolandi Fucus_distichus Giardia_lamblia Glaucocystis_nostochinearum Gallus_gallus Geleia_fossata Geminella_minor Gephyramoeba_sp Ginkgo_biloba Glaeseria_mira Glaucosphaera_vacuolata Globobulimina_turgida Gloeodinium_viscum Glomus_intraradices Goniomonas_truncata 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Lecythium_sp Leishmania_major Lepidoderma_carestianum Lepocinclis_spirogyroides Leptomyxa_reticulata Leucocryptos_marina Leukarachnion_sp Lingulamoeba_leei Lithomelissa_sp Lotharella_globosa Loxodes_striatus Lunularia_cruciata Lycopodium_tristachyum Malawimonas_jakobiformis Mallomonas_rasilis Massisteria_marina Mastigamoeba_simplex Mastigamomeba_sp Mastigella_commutans Maullinia_ectocarpii Mayorella_sp Mesostigma_viride Metopion_fluens Metopus_palaeformis Metromonas_simplex Micromonas_pusilla Micronuclearia_podoventralis Minchinia_chitonis Ministeria_vibrans Mnemiopsis_leidyi Monoblepharis_macrandra Monocercomonas_sp Monocercomonoides_sp Monocystis_agilis Monopylocystis_visvesvarai Monosiga_brevicollis Multicilia_marina Naegleria_gruberi Nannochloropsis_maritima Nemalionopsis_shawii Nematostella_vectensis Neocercomonas_jutlandica Neoparamoeba_perurans Nitzschia_thermalis Noctiluca_scintillans Nolandella_sp Nuclearia_simplex Nucleariidae_environmental Nyctotherus_ovalis 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Alexandrium_tamarense 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Amoeba_leningradensis 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Amoeba_proteus 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Amoebidium_parasiticum 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Amphibelone_anomala 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Amphisorus_hemprichii 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Ancyromonas_sp 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Aplysia_californica 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Apodachlya_brachynema 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Arabidopsis_thaliana 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Arachnula_sp CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACTGCGAAACTGCGGATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTACTTGGTTGGATAACTGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGAAGGAGTGTCATTATTAGTTACAAACCAAATCAAGTTTCTGCCCTATCAACTTTGGATGGTAGTGTATTGGACTACCATGGTTATAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGGTTCCGGAGAGGGAGCCTTAAAAACGGCTACCACTTCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGATACGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAATACAGGTCTGTAATTGGAATGAGTACAATGTAAACATCTTAACGAGGAACAACTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAGTAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTCGAATCGATACTTTGAAAAAATTAGGGTGTTTAAAGCAGAATAGATTAGCATGGGATAATATGATAATAGGAACGGTCGGGGTTATTCATATTTACTTGTCAGAGGTGAAATTCTTAGATTTTGTAAAGATGAACCTGTGCGAAAGCATCTAACAAGGACGCTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACTATAAACGATGTGGGCCAAGGATCGGAGTCCGGCACTTTGTGAGTAATCAGAGCTTTTGCACTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACTAGGTCAGGACATAGCAAGGATTGACAGATTGAAGTTCTTTCATAATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACCTCAACTTTAAAGGGACTAATGGGTGGAAG--TGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTAGGCTGCACGCGCGCTACACTGACAGGACCAAATAGTGTTGGGTAATCCGTGACAGGGATCGATTATTGTAATTATTAGTCGTGAACGAGGAATTCCTAGTAAACGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Araucaria_heterophylla 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Arcella_hemisphaerica 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Arcyria_denudata 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Assulina_seminulum 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Aulosphaera_trigonopa 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Aureococcus_anophagefferens 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Balamuthia_mandrillaris 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Batrachochytrium_sp 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Blastocrithidia_culicis 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Blepharisma_japonicum CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACGGCGAGACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAGTTTATTTGCTTGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATG-TGCGTAGTATTTATTAGATAAAACCCAATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTTTCGATGGTAGTGTATTGGACTACCATGGCGATGACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTAACTCGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAACGCGGGGCTGCGATTGGAATGAGTTAAGTGTAAAAGCCTTTTCGAGGACCCACTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAGTAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAGCTCTACCTTGAGCAAATGAGAGTGTTCCAGGCAGAATCGTCCAGCATGGAATAATATGATAATAGGGATAGTTGGGGGCATTTGTATTTAATTGTCAGAGGTGAAATTCTATGATTTATTAAAGACAAACTTATGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAAGGGATCAAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGAGATTGGAGTTCAGCATCTTCCGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGACTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATGGGAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACTACTCCAAGGAAGTTTAAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCAGGCAGTAAGCCCCCGGTAACCCGTGATGGGGATTGACTCTTGGAATTATTGGTCATCAACGAGGAATTCCTAGTAAACGCAAGTCATCAACTTGCATTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTATCACTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAA------- Bodo_saltans 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Bodomorpha_minima 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Bolidomonas_pacifica 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Bonamia_ostreae 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Boothiomyces_macroporosum 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Borelis_schlumbergeri 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Branchiostoma_floridae CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCACGTGCAAGTTTA-TCAGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTTGATTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTGGCGTGCATTTATCAGACCAAGACCAATTCGAATGTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGTTCTGTGCCTACCATGGTGGCAACGGGTGACGGGGAATCAGGGTTCGGTTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCCGACTCGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACGGGACCGTAATTGGAATGGGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCTATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGAATAGG-GTGCATGGAATAATATGACAAGAGGGACGGACGGGGGCATTCGTATTGCGGCGGGAGAGGTGAAATTCTTGGATCGCCGCAAGACGAACCACTGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTGTGGGCGCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTCACAACCATAAACGATGCCAACCAGCGATCCGCCATGGGCAGCTCCCGGGAAACCTGAGTTTTCGGGTTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGGAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCCGGCCCGGACACAGTAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGCTAATCCCGATAACGAACGAGACTCTGGCATTAGAGGGACAAGCCG-ACGAGATG--GAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCGGGGCCGCACGCGCGCTACAATGAAGGCATCAGCGAGTTGCGGGTAACCCGTGCTAGGGATCGGGGATTGCAATTATCTCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAGATGCGTGTCATCAGCGCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTTGACCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGT--------- Breviata_anathema 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Bursaria_truncatella 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Candida_albicans 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Chondrus_crispus CTTGTCTCAAGGACTAAGCCATGCAAGTGTAAGTATGTACAACGAAACTGCGAATGGCTCGGTAAAACAGCTATAGTTTCTTCGATTGGATACCCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACAAGTGTCGTGGTATAAATTGAATACAAACCAGTTCAAATTTCTGACCTATCAACTTTGGATGGTAAGGTATTGTCTTACCATGGTTGTGACGAGTGACGGATCGTGGGTGCGAGACTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAGACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCGGATACGGGAGGTAGTGACAAGAAATAGCAATAGAGGGCTCTAATTGGAATGAGAACAAGGTAAACAGCTTATCGAGGAGCCAGCAGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCTGTAAGCGTATACCAAAGTTGTTGCAGTTAAAACGCTCGTAGTCGGAGGTTTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGAATACATTAGCATGGAATAATATGATAAGAGGGACGGTTGGGGGCATTTGTATTCCGGCGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTGGCGGAAGACAAACGGCTGCGAAAGCGTCTGCCAAGGACGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTAAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTTACTATAAACGATGAGGACTGGGGATCGGGGCCCGGCACCCTTCGGGAAACCAAAGTGTTTGCTTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCATCACCGGGTGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCGGACATAGTGAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGTTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATCTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAGCGAGACCTGGGCGCTAGACGGACTAGTCCACGGAAGCTCCAGGCAATAACAGGTCTGAGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGTGCTACACTGAGCGGGTCAACGGGTGCTTCCTAATCCGTGCTGGGGATCGAGGCTTGCAACTTTCCCTCTTGAACGAGGAACACCTTGTAAGCGTGGGTCATCATCCCGCGCTGAATACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTATCACTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Cryptosporidium_parvum 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Chlamydomonas_reinhardtii 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Cypria_reptans 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Caenorhabditis_elegans 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Cafeteria_roenbergensis 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Calcidiscus_leptoporus 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Calonympha_grassii 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Capitella_capitata 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Capsellina_sp 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Carpediemonas_membranifera 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Cercomonas_agilis 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Chaunacanthid_217 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Chilodonella_uncinata TTCCTCCTGGAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAATCTATTTGATTGGATAACCATTGGGAAACTATGGCTAATACATG-TCGGTTGTATTTATTAG-TTTTGACCATTTCGAGTTTCTGCCCTATCAG--ATCGTTGGTAGTGTATTGGACTACCATGTCTATCACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACAGCTACGGTAGGCAGCAGGTGCGTAAATTACCCAATCCAAATTCGGAAGGTAGTTACAGGAAATTTGTTGCGCGTGAAACCGAACACATTTAAGCATTGTGTGTTT-------------AATTGGAGGGCAAGTTTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAACTCCAAGAGTGTATCTTAATGTTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAATTTCTACTTTGAAGAAATTAGAGTGTTCATAGCAGCATAAATTAGCATGGAATAATATGATAACAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTACTCAGTGGCCAGAGGTGAAATTCTTAGACTCGCTGAAGACGCACTAATGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGGACGAAAGTTAGGGGATCAAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCCTAGCCATAAACTATACCGACTAACGATTGGTGATCAGGAGTTAATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTCAATTTGATTCAACACGGGGAAACTTACCAGGGCAAGACCTTAGAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTTGAGGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTCGTGGAGTGATCTGTTTGGTTAATTCCCTAAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACAAGCGCATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCAGTGATGCCCTTAGACGTCCTGGGCCGCACGTGTGCTACACTGATGCATTCAGCAAGTGCTGGGTAATCCGTGCTTGGGATTGATCTTTGCAATTATGGATCATGAACGAGGAATTCCTAGTAAGTGCAAGTCATCATCTTGTACTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTATCACTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Chilomonas_paramecium CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTTAGTGTA---TATGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCAAATACGTGATTGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGGTGGGTTGTGATTATTAGATTAAA-CCAATCCTTATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTTTTAACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAGACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACTCGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAGTAGAGGGCTTCTTTTGGAATGAGAACAATTTAAACCCCTTAACGAGGATCAATTAGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCTAATAGCATATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTCGGATTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGAATAGATTAGCATGGAATAATATGATAATAGGGACAGTTGGGGCCGTTCATATTTCGTTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTACGAACGATGAACTTGTGCGAAAGCATTCGGCAAGGATGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCAACTAGGGATCATTGATTGGCACCTTGTGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTCAGGATGGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTTAGAGGGACCAACGAATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGGATGCAACGAGCCCCGGGTAAACCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTCTTGATCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Chlamydaster_sterni 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Chlamydomyxa_labyrinthuloides -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTT-AAAAGCTCGTAGTTGGATTTCCACAGTGAGCAAAATAGAGTGTTCAAAGCAGGATACATTAGCATGGAATAATATGATAATAGGGATAGTTGGGGGTATTCGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGGAAGACGAACGAATGCGAAAGCATCTACCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGATGATTAGATACCATCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATTGGCTGTCAGCACCTTACGAGAAGTCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGTGAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACCCCCGCCTTAGAGGGACTAGCCGAAGGAAGTTGGGGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACACACGCAGCGAGTTCCGGGTAATCCGTGATAGGGATAGATTATTGCAATTCTTAATCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAACGCAAGTCATCAGCTTGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACTGCCCGTCGCACCTACCGATTTCATTATTTAGAGGAAGGTGAAGTCGTAACAAGGTT Chlorarachnion_CCMP621 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Chlorella_vulgaris CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATCGGATACCCGTAGTAAATCTAGAGCTAATACGTGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAGGCCGATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACTGGGCGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAACCCCTTAACGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGAATACATTAGCATGGAATAACATGATAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATCGGCGGCCGGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTGAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTTAGAGGGACTAGCCAAT-GAAGCATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCATTCAACGAGCCCCGGGTAATCCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTCTCCCACCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Chlorokybus_atmophyticus 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Choanocystis_rotundata CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCGTGTCTAAGAATAAATGGTGAATCTGCGAATGGCTCA-TAAATCAGTTATTGTTTATTTGATTGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGAAGGGGTGCATTTATTAGATTCAAACCAATTCAAATTTCTGCCCTATCAGCTTTCGATGGTAGGATCTTGGCCTACCATGGCTATAMCGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGGTTCCGGAGAGGGAGCTTGAGAAACGGCTACCACATCTWAGGATGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATGCTGGACGGCAATTGGAATGAGAGTAATTTAAATCAATTCTCGAGTAGCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCC-ATAGCGTATATTWWMGTTGWTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTCTGACCTTTACTTTGAGAAAAATAGAGTGTTCAAAGCAGAATACATTAGCATGGGATAATATGATAATAGGGACAGTTGGGGACATTCATATTCCATGGCTAGAGGTGAAATTCTTAGATTCATGGAAGATGAACTACTGCGAAAGCATTTGTCAAAGATGTTTTCATTGATCAAGAACGAAAGTTAGGGGAGCAAAGACGATCAGAWACCGTYGTAGTCTTAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATCGGTGWTCGGCACCTCGGGGGAAACCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCARGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCSTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCAGGTCCAGACATGGTAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCCATGAAAGGTGGCGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGA-TTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACCAGCAGAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCTGCACGCGCGCTACACTGACGAGCTCAACGAGTTCTGGGTAATCCGTGATGGGGATAGATGATTGTAATTATTCGTCTTGAACGAGGAAGTCCT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Cholamonas_cyrtodiopsidis 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Chromera_velia ----------AGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTATGTACAGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATCGCTTCTCTGATTGGATATCCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGAAGGGTTGTATTTATTAGATTAAAGCCATTGCAGGTTTCTGACCTATCAGCTTCCGACGGTACGGTATTGGCCTACCGTGGCAATGACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAATACAGGGCTGTAATTGGAATGAGTAGATCCCAAACCTCTTTGCGAGTAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAATTTCTACTTTGAGAAAATTAGAGTGTTTCAAGCAAAATACTGCAGCATGGAATAATATGATAATAGGGATAGTTGGGGGCATTCGTATTTAACTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTGTTAAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAGGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGAGATTGGCGTTCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCAGGTCCAGACATAGTGAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTACTTAATTGTGATAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACTAACGCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCTGCACGCGCGCTACACTGATGCAGTCAGCGAGTATCGGGTAATCCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAGTGCAAGTCATCAGCTTGTACTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTC----------- Chroomonas_mesostigmatica 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Chrysocapsa_paludosa 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Ciliophrys_infusionum 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Ciona_intestinalis 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Clathrulina_elegans 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Closterium_ehrenbergii 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Coelodendrum_ramosissimum 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Comandonia_operculata 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Conchellium_capsula 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Corallochytrium_limacisporum 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Corcontochrysis_noctivaga 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Corythion_dubium 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Corythionella_sp 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Cribrothalammina_alba 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Cryothecomonas_longipes 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Crypthecodinium_cohnii 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Cryptobia_helicis 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Cryptoglena_pigra 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Cyanidioschyzon_merolae 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Cyanophora_paradoxa_gene 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Cycas_taitungensis 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Cyphoderia_ampulla 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Deltotrichonympha_operculata 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Dictyostelium_discoideum 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Didymium_dubium 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Didymium_iridis 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Didymium_nigripes_anotated 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Didymocyrtis_tetrathalamus 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Dimorpha_sp 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Dinenympha_exilis 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Diphylleia_rotans 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Diplonema_papillatum 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Distigma_gracile 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Drosophila_melanogaster 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Dysnectes_brevis 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Entamoeba_histolytica 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Ebria_tripartita 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Eccrinidus_flexilis 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Echinamoeba_exundans 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Eggerelloides_scabrum 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Enteromonas_hominis 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Entodinium_caudatum CTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCATGTCTAAGTATACATAGTAAAACTGCGAATGGCTCATTACAACAGTTATTGTTTATTTGATTGGATAACTGTATAAAAACTAGAGCTAATACATG-AAGGTTGTATTTATTGAATT---CCGAATCCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTTTCGTTGGTAGTGTATTGGACTACCATGGCTCTCACGGGTAACAGGGAATTAGGGTTCGATTCTGGAGAACGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCTACGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATCCTGAATCGGGAGGTGGTGACAAGATATAACAACGAGAC--TTCGATTGTAGTGAGGGTTTTTTAAATAGAACCTATAG-TACGATTAGAGGGCAAGTCTGGCGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCTAATAGCGTATACTAAAGTTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTACTGTGAGAAAATTAGAGTGTTTCAAGCAGAATACATTAGCATGGAATAACACGATCATAGAGACAGTTGGGGGCATTAGTATTTAATTGTCAGAGGTGAATTTCTTGGATTTGTTAAAGACTAACGTATGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGGACGAAAGATAGGGGATCAAAGACAATCAGATACTGTCGTAGTCCTATCTATAAACTATGCCGACTAGGGATTGGAGTTCAGTACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGACTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACGTAGTAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACCTTAACCTTACAGGGACAAATACATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCAGTGATGCCCTTATATGTCCTGGGCTGCACGCGTGCTACACTGATGCATACAACAAGTG-TAGGCAATCCGTGATGGGGATAGATCTTTGCAATTATAGATCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAGTGCAAGTCATCATCTTGCATTGATTATGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATAATATCACCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Eucyrtidium_hexastichum ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGCATTTATTGAC---CAAGCCATTCAAGTTTCTGACCTATCA--GTTAGTCGGTAGTGTATTGGACTACTGAGGCATTGACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATCCTGACTCGGGAGGTAGTGACAAAAAATCACAATATTTCACAATAATTGTATTGAGAACAGGCTAAACATGTTACCGATAAACTATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATACTAACGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTACTTTGAGAAAATTAGAGTGTTCAAAACAGTATATCATAGCATGGAATAATATGATGATAGAGTCAGTCGGAGGCATTAGTATTTTATCGTTAGAGGTGAAATTCACAGATCGATAAAAGACTAACAACTGCGAAAGCATTTGTCTAGGATGTGCTCTTTGATCAAGAACGAAAGTTGGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTCAACTATAAACTATACCAGCTAGGGATTGGCGGTCAGAACCTTATGAGAAATCAAAGCATTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACAAGCCGTGGATCCTGTGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCGGACATAGTTAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCGCCACCTTAGAGGGACCACCGAAAGGAAGTTGGCGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCGCACGGGCTACAATGGCGGATACAACAAGCACTGGGGAATCCATGGTTGGGATCGGACATTGTAATTATTGTCCGTGAACGAGGAATGCCTAGTAGGTACAAGTCATTAGCTTGTGCCGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTCGCGCATCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Euglena_gracilis 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Euglena_longa 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Euglypha_rotunda 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Euplotes_octocarinatus 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Eutreptia_viridis 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Filamoeba_nolandi 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Fucus_distichus CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACGGTGAAACTGCGAATGGCTCATTATATCAGTCATAATTTATTTGAATGGCTACCCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGACGGGCTGCATTGATTAGACTAAACCAAATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTTTGGATGGTAGGGTATTGGCCTACCATGGCTTTAACGGGTAACGGGGAATTGGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAGACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATGCCGGGCGGCAATTGGAATGAGAGCAATTTAAATCCATCATCGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTGTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGATACATTAGCATGGAATAATATGATAACAGGAACGGTTGGGGGTATTCGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGGAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTACCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGATGATTAGATACCATCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATTGGCGGTCAGCACCTTCCGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCGGACATAGTGAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCCCCGCCTTAGAGGGACTAACCGAAGGAAGTTGGGGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCATGCAACGAGTTCCGGGTAACCCGTGATAGGGATAGATTTTTGTAAATATTAATCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAACGCGAGTCATCAGCTCGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCACCTACCGATTTCAACATTTAGAGGAAGGTGAAGTCGTAACAAGGTT Giardia_lamblia 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Glaucocystis_nostochinearum 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Geleia_fossata 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Glaucosphaera_vacuolata 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Gymnophrys_cometa 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Gyropaigne_lefevrei 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Hypochitrium_catenoides 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Halimeda_macrophysa ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCGGTAATTCAAGCTCCAATAGCGTATATGTAAATTGTTGCGGTTGAAAAGCTCGTAGTTGGACTTCTACTTTGAGGAAATCAGAGTGCTCAAAGCAAACTTCACTAGCATGGAATAACACGACGATAGAGACGGTCGGGGGCATTCGTATTGCGCAGTTAGAGGTGAAATTCTCCGATCTGCGCAAGACGCACTAATGCGAAAGCAGTTGCCAAGGACGTCCTCTTTGATCAAGAGCGAAAGTCGGGGGATCAAAGATGATTAGATACCGTCGTAGTCCCGACCATAAATGATGCCGACTGAGCTTCGGCGGTCGGCGCTCTTAGAGAAATTAAAGTCTTTGGGCTCCGGGGGTAGTATGGTCGCAAGTCTGTAACTTGAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACAAGGCGTGGATGTTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAGCTTACTAGGTTTGGACACCTTTGTGATGGACAGATTGAAGCTCTTACCCTACTGCGTGGATGGTGGTGCATGGTCGTTCTCAGCCCGTGGGTTGACCTGTCAGGTTTACTCCGGTAACGCGCGAGACCTCGGTCTTAGAGAGAGCAGAGTGAGGGAAGTCGAGGCAATAACAGATCTGTGATGCCCTTAGTTATCCTAGGTCGCACGCGCCATACAATGTGGCGCACAACGAGTACTGGGCAATCCGTGACTGGGCTAGACTTTTGTAATTTTTGGTCTTGAACGAGGAATGCCTAGTAATCGCAGGTCAGCATCCTGCGATGATTCGGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCATCCGTG-TTCGCACGTAAAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Haplosporidium_costale 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Haplosporidium_louisiana 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Haplosporidium_nelsoni 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Hartmannella_cantabrigiensis 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Hartmannella_vermiformis 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Hatena_arenicola 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Heleopera_sphagni 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Hemiselmis_rufescens 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Heterosigma_akashiwo 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Histomonas_meleagridis 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Hyperamoeba_flagellata 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Joenia_sp 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Kathablepharis_remigera 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Kirchneriella_aperta 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Koliella_planctonica 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Kryptoperidinium_foliaceum 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Labyrinthula_sp_N12 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Larcopyle_butschlii -----------------------------------------TTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAGTTTATTTGATTGGATAACCGTAGTAATTCTAGGGCTAATACATGGCGGGCTGTATTTATTAGATAAACACCAATTCAAATTTCTGCCCTATCAGCTTTCGATGGTAGGATATGGGCCTACCATGGCTTTAACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAATAGACGAATCTAATTGGAATGAGTACAATTTAAACAACTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATACTAACGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTACTTTGAGAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGAATATATTAGCATGGAATAATATGATGATAGGGACAGTTGGGGGCGTCAGTATTCTGAAGCGAGAGGTGAAATTCTTGGACCTTCGGAAGACTAACAACTGCGAAAGCATTCGCCTAGGATGTTCTCTTTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTCAACTATAAACTATGCCAGCTAGGGATTGGTGATCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGCATTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGGAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGTGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCGGACATAGTAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCCCAGCCTTAGAGGGACTAACGAATGGAAGTTTGGGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACACGGGCTACACTGCGAGGTTCAACAAGCATTGGGCAATCCGTGATAGGGATAGACTATTGCAATTGTTAGTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAACGCGAGTCATCAACTCGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTGTTCATCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Lecythium_sp -------------TTAAGTCATGCATGTGTAAGTATATACTGTAAAACTGCGAACGGCTCATTATATCAGCAATAATTTATTTGATTGGATAACTGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGGAGGGATGTATTTATTAGATAAAAACCAATTCAAATTTCTGCCCTATCAGCTTTCGACGGTAGTGTACTGGACTACCGTGGCGTTAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAAAAAATAACAATACCTGGCGGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGATCATTGGAGGGCCAAGTCTGGTGCCAACAGCCGCGGAATTCCCAGCTCCAAGAGCATATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAAGTCGTAGTTGAATTTCTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTTAAAGCAAAATACATTAGCATGGAATAATATGATGATAGGGACAGTTGGGGGTGCTAGTATTGGCCGGCCAGAGGTGAAATTCTTGGATTCGGTCAAGACTAACTTATGCGAAAGCATTCACCAAGGATGTCTTCTTTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACTATGCCAACTAGGGATGGGTGATCCGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCGGACATAGTGAGGATTGACAGATTGAAGATCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCGACCTTAGAGGGACTAGCTAAAGGAAGTTCGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATCGGTTCATCGAGCTCTGGGTAATCCGTGCTGGGGATAGATCATTGTAATTATTGATCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAACGCGAGTCATCAACTCGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTT Leishmania_major 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Lepidoderma_carestianum 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Lepocinclis_spirogyroides 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Leptomyxa_reticulata 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Leucocryptos_marina 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Leukarachnion_sp 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Lingulamoeba_leei 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Lithomelissa_sp 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Lotharella_globosa 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Loxodes_striatus 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Lunularia_cruciata 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Lycopodium_tristachyum -------------------------------------TACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTCTTTGATCGGATACCGTAGTAATCTCTAGAGCTAATACGTGAAGGGACGTATTTATTAGACTAAGGCCAATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTGGTGACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCTTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACTGG-CGGTAATTGGAATGAGTACAATCTAAACCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATCTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGCTCAAAGCAGAATACATTAGCATGGAATAACATGATAATAGGGACGGTTGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATCGGCGGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGG-AACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTTAGAGGGACCAGCGGATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGAATTCAACGAGTCCTGGGTAATCCGTGATGGGGATAGATCATTGCAATTATTGATCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTATCATTTAGAGGAAGGAG---------------- Malawimonas_jakobiformis 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Mallomonas_rasilis 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Massisteria_marina 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Mastigamoeba_simplex 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Mastigella_commutans 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Maullinia_ectocarpii 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Mayorella_sp 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Mesostigma_viride 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Metopion_fluens 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Metopus_palaeformis 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Metromonas_simplex 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Micromonas_pusilla CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGCAATAGTTTCTTTGGTTGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGAAGGGACGTATTTATTAGATAAGACCGAATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGACGGTAGGATAGAGGCCTACCGTGGTGTTCACGGGTGACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATATCGGGGGATAATTGGAATGAGAACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCGGAATATTTCAGCATGGAATAACATGATAAGAGGAACAGTTGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGATGATTAGATACCATCCTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCGGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTTAGAGGGACTAGCCAATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACGAATGCAACGAGCTCTGGGTAATCCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Micronuclearia_podoventralis -----------------GCCATGCATGTCTAAGTATATACAGTAAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCATTTATTTGATGGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGAAGTGCTGCATTTATTAGATAAAAACCAATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGTCGGTAAGGTAGTGGCTTACCGAGGTTTCAACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAAGGAGCATGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAATACAGGGCTGTAATTGGAATGAGAACAATCCAAACCCCTTAACGAGTATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAACGCTCGTAGTTGAATCTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGTATACATTAGCATGGAATAATATGATAATAGGGATAGTTGGGGGCATTCGTATTTAACTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTGTTAAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGGAACGAAAGTCGGGGGATCGAAGATGATCAGATACCGTCGTAGTCTCGACCATAAACTATGCCGACCAGGGATCGGAGTCCGGCACCTTTGGAGAAATCAGAGTGTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTGATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTTAGAGGGACTAGTGAATGGAAGTTTGAGGCGATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGAAGTCAACGGGTGTTGGGTAATCCGTGATGGGGATTGACTATTGTAATTATTAGTCATGAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGTGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTAACATGCAGAGGAAGGAG---------------- Minchinia_chitonis 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Ministeria_vibrans 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Mnemiopsis_leidyi 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Monoblepharis_macrandra 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Monocercomonas_sp 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Monocercomonoides_sp 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Monocystis_agilis 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Monopylocystis_visvesvarai 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Multicilia_marina 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Naegleria_gruberi CTTGTCTCAAAGCCTAAGCCATGCAAATGTAAGATCA-------AGTCTGTGGAAGGCTCATTATAACAGTTATACTCCTAGCCACAGGATACCACCGTTAACTGCAGCGATA-TACTTG-----------------------------GAGGAGTTTCTTACCTATCAGCT--CGTTGTTTGTTTAAAGGACAAACCAGGCTTTGACGGGT-ACGGGGAATCAGTGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATCGCTACCACATCTAAGGACGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCTCAATAGAGGAGGTAGTGACAAGCTATAGTGACTCCACACGACGATTTCCATGATTTGGGTGTAGATAACCCTTAGAGTAGCCATTGGAGGAAAAGTCTGGTGCCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCCAAGAGCGTATATTAATACTGCTGTAGTTAAAACGCCCGTAGTATACCTAACACTGTAAATAAATCGTTGTGCTTAAAGCGGAGAGGTTTAGCATGGGACTGC----TAATGGAGCCAGGTGAGGCCCCGGGTACCATGAGGCTAGAGGTGAAATTCTGAGACCCTCATGTGACCAACTAAGGCGAAAGCTGTCGGCCACCACAAGCTCGTCTATCAGGGACAAAAGTTGGGGGATCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCCCAACTATAAACGATACCAACCGAGTATTTGGGCTCAGAACTCAA-GGGAAACCA-AGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATAGTCGCAAGACCGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGAGTGGAGTCTGCGGCTTAATTCGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCAGGACACAAGTTTGATTGACAGGTTAAAGCCCTTTCTTGATTGTGTGGTGGGTAGTGCATGGCCGTTTCCAGTTCGTGGAGTGATCTGTCTTGTTAATTCAGATAACGAACGAGACCTAAGCCTTAAAGGGACCAGGATGAGGAAGATTTAGGCCATAACAGGTCTGTGATGCTCTTAGATGTCCTGGGCTGCACGCGTACTACAATAACGGTACCAGCGAGC--ATGGAAACTTATGACAGGGATCGAGGATTGGAAC--ATCCTCGTGAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGTGGTTCATCATACCACATTGATTACGTCCCTGCCTTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATGTCTTCGTCTGTAGGAAGGAAAAGTCGTAACAAGGTC Nannochloropsis_maritima 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Nemalionopsis_shawii 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Neocercomonas_jutlandica 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Nitzschia_thermalis 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Nyctotherus_ovalis 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Ochromonas_danica 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Octomitus_intestinalis 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Oltmannsiellopsis_geminata 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Ophriocystis_elektroscirrha 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Oreochromis_esculentus 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Oryza_sativa 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Oscarella_carmela 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Ovaminna_opaca 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Oxymonas_sp 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Palavascia_patagonica 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Paradinium_poucheti 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Paraflabellula_hoguae 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Paramecium_caudatum 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Paramonas_globosa 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Paravahlkampfia_ustiana 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Pavlova_lutheri 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Pelagomonas_calceolata 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Pelomyxa_palustris CTCATGCCAAAGATTAAGCCATGCACGTGCAAGCATATGTTTTTAAGCTGCTCATGGCTCCCTAAATCAGTCTTGATTTTTTTATTAAGATAACCATAAAGACT----GGCTAATACATGGAAAGGTGTCATTTTCATTTTTAA----AATTGAGAAACTGCTCCATC-TTTTCGGTCAGCATTGTATTGTACTAAGATGAGAAACACGGGTAACGGAAGATCAGGGTTTGACGCCGGAGAGGGAGCTCGAAAGATGGCTCCCACTCCCAAGGGGGGCAGCAGGCGCGCAAATTGTCCAATCCTAACACGGGAGACAGTGACCACAAATAACATTTCTCCTGAGTTGGTGGAATGAGAAAATTTCAAACAGTTTATTGAGCAACCATTGGAGGGAAAGTMTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGTGTAAGCTAAAGTTGTTGTGATTGAAAAGCTCGTAGTTGTAAGCATGCCTTGAAAAAATTAAAGTGTTCAAAGCAGTATATATTAGCATGGTACAAATGCAAAATGGAGG---TTGAGGACGCTCTGATTTACTTGAGAGAGGTGAAATTCTGTGACTTGTGAAAGAAGAACCGAGGCTAAAGCAGGTAATGTGTACGCTTTCATCAATCAAGAACGAAAGCTA-GGGATCAAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTATCTATAAACGATACAAGCCAAACCCTGGTGTTCAGGATTTTTAGAGAAATCGGAGCGTTTGTGTTTCAGGGGGAGTATGGCCGCAAGACTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCA-CACCAGAGGTGGAGCGTGCGGCTCAATTTGACTCAACACGGGAAAACTCACCAGGTCCAGACACTAGGATGACTGACAGWCTGAAGCTCTTTCACGATTTTTTGGGTKGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTCGTGGAGTGATTTGTCTAGTTAATTCTGTTAACGAGCGAGATCTCATCCTCAACATGATCAATGGATGGAAGAGTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTCGATGTCTTGGGCTGCACGCGCGCGACAATGACATAGACAAAGAGTGTTTGGAAATCCATGCTGGGGATAAAGCCTTGTAACTATTGCTTTTTAACGTGGAATCTCTTGTAGCTGTTTGTCATTAGCCAGCATTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTTTTATCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Pentatrichomonoides_scroa 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Percolomonas_cosmopolitus CTCGTCTCGAAGACTAAGCCATGCACGTGTCAGTGCAGACAGTGGAACTGCGGATGGCTCCTTATAACAGTGAGTACCGGCCTGCTCGGATAACCTAGCCAACTGCTAGGCTAATACGTGGAGACGTAGCGCAAGGCACATAATCGGC-GACAGCTTTCTGACCCATTAGCT--GGTTGTGAAGGTAGCGGCTTCACAAGGCAGCCATGGGTA-CGGGGAATCAGCGTTCGATTCCGGAGAGAAAGCCTGAGACACGGCTATCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATGCAGACTTGCGAGGTAGTGAACAGCCATAGTGACCTCCCATGGCCTCGGCCATG--AGACGTCTAAA----CACGTGAAGGCCTAGTAGAGGACCAGTCTGGTGCCAGCACCCGCGGTAACTCCAGCTCTGCTAGCCTATGATAATACTGTTGTCTTT-AAACGTTCGTAGCCCGCCTAGAATCGCTAGTAAATGGAAATGCTTAAAGTAG----TAATAGCATGGCGTGAG----CAATGGGGAGGTTC--AAGCAGGAGTACTGGCTGGATAGGGGTGAAATCCAGTGACCCAGCCATGACTAGCTGAGGCGAAGGCGCCTTGCTAGAGCCCGCCTCTCGGCGATGGACGAGAGTGAAGGGCGCGAAGATGATTAGATACCGTTGTAGTCTCCACCGTAAACTATGCCAGCTCGGCCGCCACCGCTGG---CCTA-GGGAACTAA-AGCTCTTCGGCTAGAGGGGTAGTACTGTTGCAAGGCAGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAAGCACCACCAGGCGTGGAGTCTGCGGCTTAATTCGACTCAACACGGGGAACCTTACCAGGACAGCACACTGAATGGATTGTCGGCTTGCCGAGCCTACCTGATACTGTGGATAGTGGTGCATGGCCATTCTTAGTTCGTGAAGTGATTTGTCTCCTTGATTGAGGTAACGAGCGAGACCCTGAAGTCACCGGCGC---CTACGGGCGAGACAGGACAATAATAGGTCTGTKATGCCCTTAGATGCCCTGGGATGCACGCGTACTACACTGACGATCACAGCGAGT--GGGGGAAGCCACGGTAAGGATTGCTGCCTGCAA--GGGCAGCATGAATGAGGAATGCCTTGTAAGCGCGCTTCAGCATAGCGCACTGAATACGTCCCTGCTTTTTGTACACACCGCCCGTCGCATCAAGGAACTGCCTTGGTCTTACCATGATGAAGTCGTAACAAGGTA Peridinium_willei 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Perkinsus_marinus 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Pessonella_sp CTTGTCTCAAAGATTAAACCATGCAAGTCTAAGTTTAAACACGAAGACAGCGAATATCTCCTTAAATCAGCAATCGTTTACTTGATCGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACGTA------TGTATTTATTAG---AAAACCAATTCAAATTTCTGCCCTATCAGCTTTCGTTGGTAGTGTAGTGGACTACCAAGGCTTTTACGGGT-ACGGGGAATTAGAGTTTGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACTTCCAAGGAAGGCAGCAGGTGCGAAAATTACCCAATTCCATCTCGAGAGGTAGTGACAAAAAATAACAATACTGGACTGTAATTGCAATGAGTACAATTTAAACCAATTAACAAGGATCCAATAGAGGGCAAGCCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCTGTGAGTGTATATTAGATTTGTTGTAGTTAAAAAGCTCGTAGTCGGAGATGTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAAATATTTTAGCATGGGATAATATGATAACAGGGACAGTTGGGGGTATTAGTATTGCGTTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTAACGCAGGACTAACTTTTGCGAAGGCATTTACCAAGGATGTTTTCATTGATCAAGAACGATAGTTTGGGGATCGAAGATGATTAGACACCGTTGTAGTCCAAACTGTAAACTATGCCGGCCCTGGATGTGCAGTGCGCACAGTAAGAGAAATTAAAGCGTTTGGGTTCTAGGGGGAGTATGGTCGCAAGACTGGAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGCCACCACAAGTTGTGGAACGTGCGGCTTAATTTGAGTCAACACGGGAAAACTTTCCAGGGCAAGACGGAATGAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTTTTCGGTTAGTGGTGCATGGCCGCTCTTAGTTGGTGCTTTGAAGTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAGCGAGACCTCAACTTTAGAAGGACAAACAAAAGGAAGTTTGAGGAAATAGCAGGTCTGTAATSSCCTTAGATGTTCTGGAATGCACGCGCGTTACTATTGAAAAAGAAAAAAGT-CTGGGTAATCATCAATTGGGATAGATGATTGCAATTCTTCATCTTGAACGAGGAATATCTAGTAAACGCGACTCATCAAGTCGCGTTGACTACGTCACTGGCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTTCTACCGATTTTTATCATTAGAGGAAGAAGAAGTCGTAACAAGGTT Petalomonas_cantuscygni 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Phaeocystis_pouchetii 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Phaeodactylum_tricornutum CTCGTCTCAAAGATTAAGCC-TGCATGTCTAAGTATATACTTTGAAACTGCGAATGGCTCATTATATCAGTTATAGTTTATTTGATTGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATG--GGGTAGTATTTATTAGATTAAACCAAATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTTTGGATGGTAGGGTATTGGCCTACCATGGCTTTAACGGGTAACGGGAAATCAGGGTTTGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAGACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATGCCGGGCGGCTTTTGGAATGAGAACAATTTAAACCCCTTATCGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAATGTTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTGTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGAATATATTAGCATGGAATAATATGATAATAGGGACAGTTGGGGGTATTCGTATTCCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTCTGGAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTACCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGATGATTAGATACCATCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACAAGGGATTGGCGGTCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCTTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTGAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCCCTGCCTTAGAGGGACTAGACGCAGGAAGATAGGGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCATTCAACGAGTCCTGGGCAATCCGTGATAGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAACGCAGATCATCAATCTGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCACCTACCGATTTTATCATCTAGAGGAAGGTGAAGACGTAACAAGGTT Phaeomonas_parva 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Phagomyxa_odontellae 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Phalansterium_solitarium 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Phanerochaete_chrysosporium 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Phreatamoeba_balamuthi 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Physarum_polycephalum 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Physcomitrella_patens 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Phytophthora_palmivora 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Picophagus_flagellatus 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Pinguiochrysis_pyriformis CTCGTCTCACAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTATATCAGTTATAGTTTCTTTGATTGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGACGGGATGTATTTATTAGATGAAACCAAATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTTTGGATGGTAGTGTATTGGACTACCATGGCGTTAACGGGTAACGGAGAATTGG?GTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAGACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATCCTGACATGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATGTCGGACGTCATCTGGAATGAGAACAATTTATATCCCTTATCGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGAATACATTAGCATGGAATAATATGATAATAGGGATAGTTGGGGGTATTCGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTAGATTTATGGAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTACCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGATGATTAGATACCATCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTCGGGATTGGGGGTCAGCACCGTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGCGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTGAGGATTGACAGATYGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCCCCGCCTTAGAGGGACTAACAGAAGGAAGTTGGGGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATACGTTCAACGAGCCCTAGGTAATCCGTGATAGGGATAGATCATTGCAATTATTGATCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAACGCGAGTCATCAGCTCGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCACCTACCGATTTCATCGTTTAGAGGAAGGTGAAGTCGTAACAAGGTT 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Plasmodiophora_brassicae 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Platyamoeba_placida 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Platyamoeba_plurinucleolus 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Platyamoeba_stenopodia 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Polyplacocystis_symmetrica 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Polysphondylium_violaceum 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Porphyra_capensi 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Proleptomonas_faecicola 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Prorocentrum_minimum 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Prorodon_viridis 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Protacanthamoeba_bohemica 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Protophysarum_phloiogenum 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Prymnesium_parvum 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Psalteriomonas_lanterna 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Pseudocubus_obeliscus 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Pseudodidymium_cryptomastigoph 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Pterocanium_trilobum 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Raineriophrys_erinaceoides 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Raphidiophrys_contractilis 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Rhabdammina_cornuta 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Rhytidocystis_polygordiae CTTGTCACAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTTCAAAT--TGAGACTGTGGATAGCTCATTAAAACAGCTATTGTTTCTTTGACTGGATAACTTTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGGGGTGATGTGTTTATTAGATGGCAACCAATTCGAGTTTCTGACCTATCAGCTTCCGACGGTAAGGTATTGGCTTACCGTGGCAGTGACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTTGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATTCTGACATGAGAGGTAGTGACAAGAAATAACAATACAGC--TGTAATTGGAATGAGCGTAAGGTAAAGCTTTGCGCAAGTACCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGCTGTCTTGTTACTTTGAGTAAACTAGAGTGTTCCTAGCAAAATACTGCAGCATGGAATAATATGATGATAGGAACAGCTGGGGGCATTCGTATTCAACAGTCAGAGGTGAAATTCTTAGATTTGTTGAAGACGAACTAATGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAGTCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACTATGCCAACTAGAGATTGGAGTTCAGAACCTTATGGGAAACCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGGAAGGATTGACAGACTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTCTACTTTAGCAGAACTAATACGAGGAAGTTGGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATACAGGCAACGAGT-CTAAGGACTCCGTGATGGGAACAAACGATTGCAATTTTTTCGTTCGAACGAGGAATTCCTAGTAAGCATGAGTCATCAGCTTGTGCTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTTCCTACCGAT------------------------------------ Ripidomyxa_sp 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Saccamoeba_limax 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Saccharomyces_cerevisiae 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Saccinobaculus_ambloaxostylus 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Sainouron_mikroteron CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCCAAGTATATACAGCGAAACTGCGTACAGCTCATTACATCAGTTATAATTCCTTTGAATGGATACCTATGGTAACTCCAGAGCTAATACATG-AGAGATGTATTTATTAGTTCCAGCCTAATTCAAATTTCTGCCCTATCAGCTTTGGATGGTAGTGTAGTGGACTACCATGGCATTTACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGGTTCCGGAGAGGCAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCTTGACACAGGAGGTAGTGACAAGAAATGCTGATGCCAGACGGTAATCGGAATGAGAGGCAGTTAAATCTAGTACTCGAAAGCAACTGGAGGGCAAGTCTGGTGTCTGCAG-TACGGTAATTCCAGCTCCAGTAGCGTATATTAAAATTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTTTACTTTGAGAAAATTAAAGTGTTCCAAGCAGAATACTACAGCATGGAATAAAATGACGATATTGGACGATGGGGGTGCTTGTATTCCTGGAGCAGAGGTGAAATTCTTGGACCCCAGGAAGACAAACAACAGCGAAAGCATTCACCAAATAGTCCCAAATTAATCAAGAACGAAAGTTGAGGGATCGAAGACAATCAGATACTGTCGTAGTCTCAACCATAAACGTTTGTATTTTGGGGTGAGTGACTCGAACCATGTGGAAAACCAAAAT-----ACGTCCGGGGGGAATATTATCGCAAGATAGAAACTTAAAGGCATTGACGGAAGGA-AACACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAAATTGACTCAACACGAGAAATCTCACCAGGCCCGGACATATTGAGGATTGACAGCCTTGAGCGCTTTCTTGATTATTGTGGAAGTGGTGCATGGCCGCTCTTGGCTGGTGGTGTGGATTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAGCGAGACGTTGGTTTTAGCCCGACTAAGCAATGGAAGTTCAACGCAATAGCAGGTCCGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGTTTGTACTAGCGTGTCCTGGGAAATCCGTGCTAGGGATTGTCGATTGCAATTATTCGTCATAAACGAGGAATTCCTTGTAAGCGCACGTCATCAGCGTGCATTGACTACGTCCCTTTCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTGCTACCGATTTGAGGATCTAGAGGAAGCAAAAGTCGTAACAAGGTT Salpingoeca_amphoridium 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Sappinia_diploidea 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Sarcocystis_neurona CTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAGTTTATTTGATTGGATAACCGTGGTAATTCTATGGCTAATACATGAAGGGTAGTGTTTATTAGATAAGAACCAATTCAAGTTTCTGACCTATCAGCTTTCGACGGTACTGTATTGGACTACCGTGGCAGTGACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGACTCGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAACACTGGAAAGTGATTGGAATGATGGGAATCCAAACCCCTTTCAGAGTAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATATCTACTTTGAGAAAATTAGAGTGTTTCAAGCAGAATACTGCAGCATGGAATAACATGATAATAGGGACAGTTGGGGGCATTCGTATTTAACTGTCAGAGGTGAAATTCTTAGATTTGTTAAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAAGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGCTCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGAGATAGGAATCCTGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAG-CTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATGGGAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACTAACGCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCTGCACGCGCGCTACACTGATGCATCCAACGAGTTCTAGGTAATCCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAGGCGCAAGTCAGCAGCTTGCGCCGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTTTAACACTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Sawyeria_marylandensis CTTATTTCGAAGATTAAGCCATGTAAATGTAAGTGC-CATTCTAAAACTGTGCAAGGCTCAATAAACGATTTATAA----------AGGATAACGCAGTCAAAAGCATCGATAATACTTG----------------------------AAATAAATTTATCATCTATCATTTTAAAGTGTTAATTTA-----CACTCATGACAACCACAGATA-CGGATAATCAGTGTTTGATTCCGGAGAAAGAGCCTTAAAAATGGCTACTAGTACCAAGGTTTGCAACAGGCGCGAAAATTATCCAATGCGAATAAGCGAGATAGTGAAAAGAAATAAGCATCCATATTATCAGTTACAATG--GACAAATTAGATATTTGTTAGAGAAACAATTAGAGGTCAAGTCAGGTGCCAGCATCCGCGGTAATACCTGCTCTAATAGTCTATAATAAAATTGTTGTGGTTAAAACGCTCGTAGTCAATTCAAACCTGTGACTAAATTAACGCGATTAAAGCAGAGCACATTTATTTTGAATAGA----TAATAGGACCAGTTCAAGTTCTCAGTACTTGCTAATCAGGGGTGAAATCCGTATAGTTAGCAAAGACTACCAAAGGCGAAAGCAGAGAACCAGAACTGGTCTATTGATCAGGAGCTAGAGTTAAGGGAACAAAGATGATTAGATACCGTCGTAGTCTTAACTATAAACTATACTAATTAGAGCTTGTACATCATAACCC---GAGAAATCA-AATTTTTGAGTTCCAGGGGAAGTATATTCGCAAGAATGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAATTCACCACCAGGAGTGGAGTTTGCGGCTTAATTCGACTCAACGCGTGAAAACTTACCAAATCCAAATTATGTAAAGATTGACAGGTTAAGACT-TTTCTTGATTCATAAAAGAGTGGTGCATGGTCGTTCTCAGTTCGTGGATTAATCTGTCTACTTAATTGTGTTAACGAGCGAGACCTTAATTTTAGTAAAAC------AAACAGAGTTAAGGCTATAACAGATCTGTTATGCCCTCAGATGTTTTGGGCAGCACGCGTACTACATTGATAGTTTCAGTAAGT--ATAGTAAACCAAATCAGGAATTAAGGATTGTAA--ATTCCTTATGAACAAGGAATTCCTAGTAATAGTAAATCATCATTTTCCAATGATTACGTCCCTGAATTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCAATTTTTGTATTTGTAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTT Schistosoma_mansoni 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Schizocladia_ischiensis CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACAGTGAAACTGCGAATGGCTCATTATATCAGTCATAATTTATTTGAATGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATG---GGTGGCACATATTAGACTAAACCAAATTCAAGTTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGGTATTGGCCTACCATGGCTCTAACGGGTAACGGAGAATTAGGGTTTGATTCCCGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATCCTGACACGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATGCCGGGCGGCAATTGGAATGAGAACAATTTAAACCCCTTATCGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATACTAATGTTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGAAATCTACTGTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGATACATTAGCATGGAATAATATGATAACAGGAACGGTTGGGGGTGTTCGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGGAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTACCAAGGATGTTTTCATTAATCARGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGATGATTAGATACCATCGTAGTCTTAACCATAARCTATGCCGACTAGGGATTGGCGGTCAGCACCTTCCGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGARATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTGAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCCCCGCCTTAGAGGGACTAACCGAGGGAAGTTGGGGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTCGATGTCCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCATGCAACGAGTCCCGGGTAACCCGTGATAGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTGAACGAGGAATGCCTAGTAAACGCGAGTCATCAGCTCGCATTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCACCTACCGATTTCATCATTTAGAGGAAGGTGAAGTCGTAACAAGGTT 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CTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGAAGGGATGTATTTATTAGATAAAAACCAATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTTTTAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAATGCAGGGCTGTAATTGGAATGAGTACAATGTAAATACCTTAACGA?GAACAATTGGAGGGCAA?TCTGGTGCCA?CAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACTTTTACCTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGAATACATTAGCATGGAATAATATGATAATAGGGATAGTCGGGGGCATTCGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCCTCGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAA?TTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACAAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGATTGAAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTA?TTGGTGGAGTGATTTGTCTGCTTAATTGCGATAACGAACGAGACCTTAACCTTAGAGGGACAAGCCAATGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGACGGAGCCAACGAGTTCTGGGTAATCCGTGCTGGGGATAGAGCATTGCAATTATTGCTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGAATACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTTGGTCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTT Seculamonas_ecuadoriensis 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Siphonosphaera_cyathina 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Soginia_anisocystis 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Sorosphaera_veronicae 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Sphaerastrum_fockii 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Sphaeroforma_arctica 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Sphaerozoum_punctatum 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Spironucleus_barkhanus 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Spironucleus_vortens 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Spongaster_tetras 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Staurojoenina_assimilis 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Stemonitis_flavogenita 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Symbiodinium_sp 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Symphytocarpus_impexus 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Taeniella_carcini 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Teleaulax_acuta 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Telonema_antarcticum 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Telonema_subtilis 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Teranympha_mirabilis 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Tetrahymena_thermophila 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Tetramitus_thermacidophilus ----------------AGCCATGCATGTGTAAGATCG-------AATCTGTGAAAGGCTCATTAAACAAGTTATGAATTTAGCCACTGGATAACACTGTTAACTGCAGCGATAATGCCTA----------------------------GTATG--TTTCTAATCTATCAGCTT-CGTAGTTTTGGTAAAGGCAAAACATGGCTATCACGGATA-CGGGGGATTAGTGTCCAACTCCGGAGAGAGAGCCTGAGAGACGGCTATCACATCTAAGGACGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATCCTAATTAGGGAGGTAGTGACAAGACATAGCGACTTTACACTGTGGTTGAAATGGATGGAGATTAAACCTCTCCATGAGTAGCAATTAGAGGACAAGTCTGGTGCCAGCACCCGCGGTAATTCCAGCTCTAAAAGTGTATATTAATACTGTTGTAGTTAAAACGCCCGTAGTATACCTAACACCGTAAACAAATCAGAGTGCTCCAGGCAGTGTAGTTTAGCATGGAATTGT----TAATGAG-ACAGTAGAGGATCCAAGTACTATGGCGCGAGAGGTGAAATTCAGTGACCGCCATATGACTATCTAATGCGAAGGCAGTTGACCAGAACGTGTCTGTCAATCAGGGACGAAAGTTAAGGGATCGAAGATGATTAGATACCGTCGTAGTCTTAACCGTAAACGATACCAACACGAGATTGGTAGTCAGAATCCAA-GGGAAACCGAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGAGTGGAGTATGCGGCTTAATTCGACTCAACGCGGGGAAACTCACCAAGTTAGGATGTGAATATGATTGACAGATTAAGGTTCTTTCTTGATTTTACAGAAGGTGGTGCATGGTCGTTCTTAGTTCGTGGAGTGATTCGTCTTGTTAATTCAGTTAACGAGCGAGACCTTAACTTTAGAGGTAG---GGTGAGGAAGTTTAAGGCAATAACAGATCTGTGATGCCCTTAGATATCTTGGGCTGCACGCGTACTACAATATTAATAGCAACAAGT--GTGGTAATCTGTGACAGGGATCGAGGTTTGTAAATCCTCG---TGAACGAGGAATTCCTAGTAAGCATGATTCATCATGTCGTATTGACTACGTCCCTGCCTTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCGTACCAACTTCTCTATTTGTAGGAACGAGAAGTCGTAACAAGGTC 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Tetraselmis_kochiensis 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Thalassicolla_pellucida 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Thalassiosira_pseudonana 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Theileria_parva 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Trichia_persimilis 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Trichonympha_agilis 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Trimastix_pyriformis 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Trimitus_sp 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Trinema_lineare 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Trochammina_hadai 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Trypanosoma_brucei 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Urosporidium_crescens 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Ustilago_maydis 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Vahlkampfia_avara 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Vannella_aberdonica 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Vannella_miroides 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Volvox_carteri 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Voromonas_pontica 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Wallaceina_brevicula 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Welwitschia_mirabilis 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Wobblia_lunata 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Zygnema_cylindricum 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; END; BEGIN TREES; Title 'Trees from "Sub_SSU_penmaskdel.nex"'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Acanthamoeba_castellanii, 2 Acanthocystis_nichollsi, 3 Acanthometra_sp, 4 Acetabularia_acetabulum, 5 Acrasis_rosea, 6 Acrosphaera_sp, 7 Adelina_dimidiata, 8 Alexandrium_tamarense, 9 Allantion_sp, 10 Allas_diplophysa, 11 Allogromia_sp, 12 Allomyces_macrogynus, 13 Amastigomonas_sp_50062, 14 Amastigomonas_bermudensis_AY050178, 15 Amastigomonas_debruynei_AY050180, 16 Amastigomonas_mutabilis_AY050182, 17 Amastigomonas_sp._Millport_AY050181, 18 Amastigomonas_sp_AY268039, 19 Ammonia_beccarii, 20 Amoeba_leningradensis, 21 Amoeba_proteus, 22 Amoebidium_parasiticum, 23 Amoebophrya_sp, 24 Amphiacon_denticulatus, 25 Amphibelone_anomala, 26 Amphibiothecum_penneri, 27 Amphisorus_hemprichii, 28 Amastigomonas_sp_AY050179, 29 Ancyromonas_sigmoides_AF174363, 30 Ancyromonas_sigmoides_AY827843, 31 Ancyromonas_sp, 32 Andalucia_godoyi, 33 Andalucia_incarcerata, 34 Aphrocallistes_vastus, 35 Aplysia_californica, 36 Apodachlya_brachynema, 37 Apusomonadidae_sp._limnaEU349232, 38 Apusomonadidae_sp._mylnikovi_EU349231, 39 Apusomonas_proboscidea_L37037, 40 Arabidopsis_thaliana, 41 Arachnula_sp, 42 Araucaria_heterophylla, 43 Arcella_hemisphaerica, 44 Arcyria_denudata, 45 Arthracanthid_206, 46 Artostrobus_sp, 47 Assulina_seminulum, 48 Astasia_curvata, 49 Astrammina_rara, 50 Aulacantha_scolymantha, 51 Aulosphaera_trigonopa, 52 Aureococcus_anophagefferens, 53 Aurigamonas_solis, 54 Balamuthia_mandrillaris, 55 Bangiopsis_sp, 56 Bangiopsis_subsimplex, 57 Batrachochytrium_sp, 58 Bigelowiella_natans, 59 Blastocrithidia_culicis, 60 Blastocystis_hominis, 61 Blastocystis_sp_H11, 62 Blastodinium_navicula, 63 Blepharisma_japonicum, 64 Bodo_saltans, 65 Bodomorpha_minima, 66 Bolidomonas_pacifica, 67 Bonamia_ostreae, 68 Boothiomyces_macroporosum, 69 Borelis_schlumbergeri, 70 Branchiostoma_floridae, 71 Breviata_anathema, 72 Bursaria_truncatella, 73 Candida_albicans, 74 Chondrus_crispus, 75 Cryptosporidium_parvum, 76 Chlamydomonas_reinhardtii, 77 Cypria_reptans, 78 Caenorhabditis_elegans, 79 Cafeteria_roenbergensis, 80 Calcidiscus_leptoporus, 81 Calonympha_grassii, 82 Capitella_capitata, 83 Capsaspora_owczarzaki, 84 Capsellina_sp, 85 Carpediemonas_membranifera, 86 Cercomonas_agilis, 87 Cercomonas_sp, 88 Challengeron_diodon, 89 Chaos_carolinense, 90 Chaos_nobile, 91 Chaunacanthid_217, 92 Chilodonella_uncinata, 93 Chilomonas_paramecium, 94 Chlamydaster_sterni, 95 Chlamydomyxa_labyrinthuloides, 96 Chlorarachnion_CCMP621, 97 Chlorella_vulgaris, 98 Chlorokybus_atmophyticus, 99 Choanocystis_rotundata, 100 Cholamonas_cyrtodiopsidis, 101 Chromera_velia, 102 Chroomonas_mesostigmatica, 103 Chrysocapsa_paludosa, 104 Chrysochromulinda_polylepis, 105 Ciliophrys_infusionum, 106 Ciona_intestinalis, 107 Clathrulina_elegans, 108 Closterium_ehrenbergii, 109 Clydonella_sp, 110 Coelodendrum_ramosissimum, 111 Coleochaete_scutata, 112 Collozoum_inerme, 113 Colpodella_sp, 114 Colpodidium_caudatum, 115 Comandonia_operculata, 116 Conchellium_capsula, 117 Corallochytrium_limacisporum, 118 Corallomyxa_sp, 119 Corcontochrysis_noctivaga, 120 Corythion_dubium, 121 Corythionella_sp, 122 Costaria_costata, 123 Cribrothalammina_alba, 124 Cryothecomonas_longipes, 125 Crypthecodinium_cohnii, 126 Cryptobia_helicis, 127 Cryptoglena_pigra, 128 Cyanidioschyzon_merolae, 129 Cyanophora_paradoxa_gene, 130 Cyanoptyche_gloeocystis, 131 Cycas_taitungensis, 132 Cyphoderia_ampulla, 133 Deltotrichonympha_operculata, 134 Dermamoeba_algensis, 135 Dermocystidium_percae, 136 Diaphanoeca_grandis, 137 Dictyostelium_discoideum, 138 Didymium_dubium, 139 Didymium_iridis, 140 Didymium_nigripes_anotated, 141 Didymocyrtis_tetrathalamus, 142 Dimorpha_sp, 143 Dinenympha_exilis, 144 Dinophyceae_sp, 145 Dinophysis_acuminata, 146 Diphylleia_rotans, 147 Diplomonad_ATCC50330, 148 Diplonema_papillatum, 149 Distigma_gracile, 150 Drosophila_melanogaster, 151 Dysnectes_brevis, 152 Entamoeba_histolytica, 153 Ebria_tripartita, 154 Eccrinidus_flexilis, 155 Echinamoeba_exundans, 156 Eggerelloides_scabrum, 157 Eimeria_tenella, 158 Elliptochloris_sp, 159 Emiliania_huxleyi, 160 Endolimax_nana, 161 Enteromonas_hominis, 162 Entodinium_caudatum, 163 Eucyrtidium_hexastichum, 164 Euglena_gracilis, 165 Euglena_longa, 166 Euglypha_rotunda, 167 Euplotes_octocarinatus, 168 Eutreptia_viridis, 169 Filamoeba_nolandi, 170 Fucus_distichus, 171 Giardia_lamblia, 172 Glaucocystis_nostochinearum, 173 Gallus_gallus, 174 Geleia_fossata, 175 Geminella_minor, 176 Gephyramoeba_sp, 177 Ginkgo_biloba, 178 Glaeseria_mira, 179 Glaucosphaera_vacuolata, 180 Globobulimina_turgida, 181 Gloeodinium_viscum, 182 Glomus_intraradices, 183 Goniomonas_truncata, 184 Gregarina_niphandrodes, 185 Gromia_oviformis, 186 Gromia_oviformis2, 187 Guillardia_theta, 188 Gymnochlora_stellata, 189 Gymnophrys_cometa, 190 Gyropaigne_lefevrei, 191 Hypochitrium_catenoides, 192 Halimeda_macrophysa, 193 Haplosporidium_costale, 194 Haplosporidium_louisiana, 195 Haplosporidium_nelsoni, 196 Hartmannella_cantabrigiensis, 197 Hartmannella_vermiformis, 198 Hatena_arenicola, 199 Hedriocystis_reticulata, 200 Heleopera_sphagni, 201 Hemidinium_nasutum, 202 Hemiselmis_rufescens, 203 Herpetomonas_roitmani, 204 Heteramoeba_clara, 205 Heterocapsa_rotundata, 206 Heterococcus_pleurococcoides, 207 Heteromita_sp, 208 Heteromita_globosa, 209 Heterophrys_marina, 210 Heterosigma_akashiwo, 211 Hexaconus_serratus, 212 Hexamita_inflata, 213 Histomonas_meleagridis, 214 Holomastigotoides_mirabile, 215 Homo_sapiens, 216 Hoplonympha_sp, 217 Hyperamoeba_dachnaya, 218 Hyperamoeba_flagellata, 219 Hyperamoeba_sp._EF45771, 220 Ichthyodinium_chabelardi, 221 Isochrysis_galbana, 222 Jakoba_libera, 223 Joenia_sp, 224 Karena_brevis, 225 Kathablepharis_remigera, 226 Kirchneriella_aperta, 227 Koliella_planctonica, 228 Korotnevella_stella, 229 Koruga_bonita, 230 Kryptoperidinium_foliaceum, 231 Labyrinthula_sp_N12, 232 Larcopyle_butschlii, 233 Lecythium_sp, 234 Leishmania_major, 235 Lepidoderma_carestianum, 236 Lepocinclis_spirogyroides, 237 Leptomyxa_reticulata, 238 Leucocryptos_marina, 239 Leukarachnion_sp, 240 Lingulamoeba_leei, 241 Lithomelissa_sp, 242 Lotharella_globosa, 243 Loxodes_striatus, 244 Lunularia_cruciata, 245 Lycopodium_tristachyum, 246 Malawimonas_jakobiformis, 247 Mallomonas_rasilis, 248 Massisteria_marina, 249 Mastigamoeba_simplex, 250 Mastigamomeba_sp, 251 Mastigella_commutans, 252 Maullinia_ectocarpii, 253 Mayorella_sp, 254 Mesostigma_viride, 255 Metopion_fluens, 256 Metopus_palaeformis, 257 Metromonas_simplex, 258 Micromonas_pusilla, 259 Micronuclearia_podoventralis, 260 Minchinia_chitonis, 261 Ministeria_vibrans, 262 Mnemiopsis_leidyi, 263 Monoblepharis_macrandra, 264 Monocercomonas_sp, 265 Monocercomonoides_sp, 266 Monocystis_agilis, 267 Monopylocystis_visvesvarai, 268 Monosiga_brevicollis, 269 Multicilia_marina, 270 Naegleria_gruberi, 271 Nannochloropsis_maritima, 272 Nemalionopsis_shawii, 273 Nematostella_vectensis, 274 Neocercomonas_jutlandica, 275 Neoparamoeba_perurans, 276 Nitzschia_thermalis, 277 Noctiluca_scintillans, 278 Nolandella_sp, 279 Nuclearia_simplex, 280 Nucleariidae_environmental, 281 Nyctotherus_ovalis, 282 Ochromonas_danica, 283 Octomitus_intestinalis, 284 Oltmannsiellopsis_geminata, 285 Ophriocystis_elektroscirrha, 286 Oreochromis_esculentus, 287 Oryza_sativa, 288 Oscarella_carmela, 289 Ovaminna_opaca, 290 Oxymonas_sp, 291 Oxyrrhis_marina, 292 Palavascia_patagonica, 293 Paradinium_poucheti, 294 Paradinium_sp, 295 Paraflabellula_hoguae, 296 Paraflabellula_JG, 297 Paraflabellula_reniformis, 298 Paramecium_caudatum, 299 Paramonas_globosa, 300 Paravahlkampfia_ustiana, 301 Pavlova_lutheri, 302 Pelagomonas_calceolata, 303 Pelomyxa_palustris, 304 Pentatrichomonoides_scroa, 305 Percolomonas_cosmopolitus, 306 Peridinium_willei, 307 Perkinsus_marinus, 308 Pessonella_sp, 309 Petalomonas_cantuscygni, 310 Phaeocystis_pouchetii, 311 Phaeodactylum_tricornutum, 312 Phaeomonas_parva, 313 Phaeothamnion_confervicola, 314 Phagomyxa_odontellae, 315 Phalansterium_solitarium, 316 Phanerochaete_chrysosporium, 317 Phreatamoeba_balamuthi, 318 Physarum_polycephalum, 319 Physcomitrella_patens, 320 Phytophthora_infestans, 321 Phytophthora_palmivora, 322 Picophagus_flagellatus, 323 Pinguiochrysis_pyriformis, 324 Ancyromonas_micra_strain_ATCC_50267, 325 Plasmodiophora_brassicae, 326 Plasmodium_berghei, 327 Platyamoeba_placida, 328 Platyamoeba_plurinucleolus, 329 Platyamoeba_stenopodia, 330 Pleurochrysis_carterae, 331 Pleurostomum_flabellatum, 332 Polymyxa_betae, 333 Polyplacocystis_symmetrica, 334 Polysphondylium_violaceum, 335 Porphyra_capensi, 336 Proleptomonas_faecicola, 337 Prorocentrum_minimum, 338 Prorodon_viridis, 339 Protacanthamoeba_bohemica, 340 Protaspis_grandis, 341 Proterospongia_choanojuncta, 342 Protocystis_xiphodon, 343 Protophysarum_phloiogenum, 344 Prymnesium_parvum, 345 Psalteriomonas_lanterna, 346 Pseudocubus_obeliscus, 347 Pseudodidymium_cryptomastigoph, 348 Pseudodifflugia_cf_gracilis, 349 Pseudoparamoeba_pagei, 350 Pseudotrypanosoma_giganteum, 351 Pterocanium_trilobum, 352 Pterocladiella_nana, 353 Pterocorys_zancleus, 354 Pterocystis_foliacea, 355 Pyrocystis_noctiluca, 356 Pyrsonympha_grandis, 357 Raineriophrys_erinaceoides, 358 Raphidiophrys_contractilis, 359 Raphidonema_nivale, 360 Reclinomonas_americana, 361 Reticulamoeba_sp, 362 Reticulomyxa_filosa, 363 Rhabdammina_cornuta, 364 Rhizamoeba_saxonica, 365 Rhizamoeba_sp, 366 Rhizopus_microsporus, 367 Rhodosorus_marinus, 368 Rhynchobodo_ATCC50359, 369 Rhynchopus_sp, 370 Rhytidocystis_polygordiae, 371 Ripidomyxa_sp, 372 Saccamoeba_limax, 373 Saccharomyces_cerevisiae, 374 Saccinobaculus_ambloaxostylus, 375 Sainouron_mikroteron, 376 Salpingoeca_amphoridium, 377 Sappinia_diploidea, 378 Sarcocystis_neurona, 379 Sawyeria_marylandensis, 380 Schistosoma_mansoni, 381 Schizocladia_ischiensis, 382 Schizosaccharomyces_pombe, 383 Seculamonas_ecuadoriensis, 384 Siphonosphaera_cyathina, 385 Soginia_anisocystis, 386 Sorosphaera_veronicae, 387 Sphaerastrum_fockii, 388 Sphaeroforma_arctica, 389 Sphaerozoum_punctatum, 390 Spironucleus_barkhanus, 391 Spironucleus_vortens, 392 Spirotrichonymphella_sp, 393 Spizellomyces_punctatus, 394 Spongaster_tetras, 395 Spongomonas_minima, 396 Spongospora_subterranea, 397 Spumella_elongata, 398 Staurojoenina_assimilis, 399 Stemonitis_flavogenita, 400 Stephanoeca_diplocostata, 401 Stephanonympha_nelumbium, 402 Stephanopogon_minuta, 403 Stephanopogon_SSU, 404 Sticholonche_sp, 405 Storeatula_major, 406 Streblomastix_strix, 407 Strongylocentrotus_purpuratus, 408 Stygamoeba_regulata, 409 Stylodictya_sp, 410 Stylonema_alsidii, 411 Stylonychia_lemnae, 412 Styptosphaera_sp, 413 Subulatomonas, 414 Sycon_calcaravis, 415 Symbiodinium_sp, 416 Symphyacanthid_211, 417 Symphytocarpus_impexus, 418 Taeniella_carcini, 419 Teleaulax_acuta, 420 Telonema_antarcticum, 421 Telonema_subtilis, 422 Teranympha_mirabilis, 423 Tetrahymena_thermophila, 424 Tetramitus_thermacidophilus, 425 Tetrapyle_octacantha, 426 Tetraselmis_kochiensis, 427 Thalassicolla_pellucida, 428 Thalassiosira_pseudonana, 429 Thalassomyces_fagei, 430 Thaumatomastix_sp, 431 Thaumatomonas_seravini, 432 Thecamoeba_similis, 433 Thecamoebidae_sp, 434 Theileria_parva, 435 Theratromyxa_weberi, 436 Thoracosphaera_heimii, 437 Thraustochytrium_striatum, 438 Toxoplasma_gondii, 439 Trepomonas_agilis, 440 Trichia_persimilis, 441 Trichomonas_vaginalis, 442 Trichonympha_agilis, 443 Trimastix_marina, 444 Trimastix_pyriformis, 445 Trimitus_sp, 446 Trinema_lineare, 447 Trochammina_hadai, 448 Trypanosoma_brucei, 449 Urosporidium_crescens, 450 Ustilago_maydis, 451 Vahlkampfia_avara, 452 Vahlkampfia_damariscottae, 453 Vampyrellidae_sp, 454 Vannella_aberdonica, 455 Vannella_miroides, 456 Vexillifera_armata, 457 Vexillifera_minutissima, 458 Volvox_carteri, 459 Voromonas_pontica, 460 Wallaceina_brevicula, 461 Welwitschia_mirabilis, 462 Wobblia_lunata, 463 Xenophyophorea_sp, 464 Zygnema_cylindricum, 465 Eukaryota_sp._BOLA187_AF372745, 466 Eukaryota_sp._BOLA366_AF372746, 467 Eukaryota_sp._D1P01C8_EF100391, 468 Eukaryota_sp._D1P02H06_EF100226, 469 Eukaryota_sp._D3P05C09_EF100280, 470 Eukaryota_sp._D4P07D12_EF100407, 471 Eukaryota_sp._WIM30_AM114802, 472 Eukaryota_sp._SA2_2C8_EF527166, 473 Eukaryota_sp._SA2_2G5_EF527173, 474 Eukaryota_sp._Ma29_3E_43_HM103514, 475 Eukaryota_sp._Ma29_3E_30_HM103503, 476 Eukaryota_sp._Ma29_3E_18_HM103491, 477 Eukaryota_sp._Ma29_1E_22_HM103458, 478 Eukaryota_sp._Ma29_1E_30_HM103465, 479 Eukaryota_sp._RM1SGM32_AB505489, 480 Eukaryota_sp._RM1_SGM28_AB505485, 481 Eukaryota_sp._RM2_SGM71_AB505579, 482 Eukaryota_sp._NAMAKO2_AB252741, 483 Eukaryota_sp._RM1SGM33_AB505490, 484 Eukaryota_sp._RM1SGM31_AB505488, 485 Eukaryota_sp._RM1SGM37_AB505494, 486 Eukaryota_sp._RM1SGM30_AB505487, 487 Eukaryota_sp._CYSGM24_AB275107, 488 Eukaryota_sp._NAMAKO2_AB252742, 489 Eukaryota_sp._RM1SGM45_AB505553, 490 Eukaryota_sp._RM1SGM69_AB505577, 491 Eukaryota_sp._RM1SGM39_AB505547, 492 Eukaryota_sp._RM1SGM29_AB505486; TREE TREE1 = 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