#NEXUS [written Fri May 13 15:53:08 CEST 2011 by Mesquite version 2.74 (build 550) at orobanche/131.130.131.201] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=29; TAXLABELS Melampodium_americanum_acc._1 Melampodium_americanum_acc._2 Melampodium_diffusum_acc._1 Melampodium_diffusum_acc._2 Melampodium_pilosum_acc._1 Melampodium_pilosum_acc._2 Melampodium_longipes_acc._2 Melampodium_linearilobum_acc._1 Melampodium_linearilobum_acc._2 Melampodium_nayaritense_acc._3 Melampodium_nayaritense_acc._2 Melampodium_nayaritense_acc._4 Melampodium_sericeum Melampodium_strigosum_acc._1 Melampodium_strigosum_acc._2 Melampodium_pringlei_acc._2 Melampodium_longicorne_acc._1 Melampodium_longicorne_acc._2 Melampodium_glabribracteatum Melampodium_mayfieldii_acc._1 Melampodium_mayfieldii_acc._2 Melampodium_cupulatum_acc._1 Melampodium_cupulatum_acc._2 Melampodium_appendiculatum Melampodium_tenellum_acc._1 Melampodium_tenellum_acc._2 Melampodium_rosei_acc._2 Melampodium_rosei_acc._3 Melampodium_sinuatum ; END; 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Melampodium_cupulatum_acc._1 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Melampodium_sinuatum AAAACGAACATAAATACTTCAATTTAAATGGAAAAAGAGAGGATAGAGAATCTATTGATAAGTTTATCTGTATCCGAGGTATCTATTCAGTTTGTACCTTGTTTTGACTGTATCGCACTATGTATCATTTATAACCCCCAAAATCCTCTACCTTTCATTTCAATAGAATTTCAAATGGATAAATTCCAAAGCTATTTAGGGCTAGAGAGATCTCACTACTTCTTATATCCACTTATCTTTCAGGAGTATATTTATGTACTTGCTCATGATCATGGTTTAAATGGATCGATTTTGTTGGAAAATGCAGGTTATGACAATAAATCCAGTCTACTAATTGTGAAACGTTTAATCATTCGAATGTCTCAACAGAATCATTTGATTCTTTCTGTTAATGATTCTAAACAGACTCCTTTTTTGGGGCACAACAATAATTTTTATTCGCAAGTAATGTCAGAGGTTTCTTCAACCATTATGGAAATTCCATTGTCTCTGCGATTAATATCTTCCCTAGAAAGGAAAGGTTTAGTTAAATCCGAGAATTTACGATCAATTCATTCAATATTTTCTTTTTTAGAGGACAACTTTTCACATTTAAATTATGTATTAGATATACTAATACCTTACCCAGCTCATCTGGAAATCTTGGTTCAGGCTCTTCGCTATTGGATAAAAGATGCTTCCTCTTTGCATTTATTAAGATTCTTTCTTCATGAGTGTCATAATTGGGATAGTCTTATTACTTCAAATTCAAAGAAAGCTAGTTCTTCTTTTTCAAAAAGAAATCACAGACTATTCTTCTTCCTATATACTTCTTATGTATGTGAATATGAATCTGGCTTCCTCTTTCTCCGTAACCAATCTTCTCACTTACGATCAACATATTCTGGAGCCCTTATTGAACGAATCTATTTCTATGGAAAAATAGAGCATCTTGCAGAAGTCTTTGCCAGGGCTTTTCAAGCGAATTTATGCTTATTCAAAGATTCTTTCATGCATTATGTTCGGTATCAAGGAAAATCAATTCTTGCTTCAAAAGGAACGTTTCTTTTGATGAATAAATGGAAATATTACTTTGTCAATTTCTGGAAATATTATTTTTACCTGTGGTCTCAACCAGGAAGGATTTATATAAACCAATTATCTAATCATTCCCTTGACTTTCTGGGTTATCGTTCAAGTGTGCGACTAAAGCCTTCAATGGTACGCGGTCAAATGCTAGAAAATACATTTTTAATCGATAATGCTATTAAGAAGTTTGATAGTATTGTTCCAATTATGCCTCTGGTTGGATCATTGGCTAAATTGAAATTTTGTAACGCATTGGGGCATCCTATTGGTAAGGCGATTTGGGCCGATTTATCAGATTCTGATATTATTGAGCGCTTTGGCCGTATATACAGAAATCTTTCTCATTATCATAGTGGATCTTCAAAAAAAAAAAGTTTGTATCGAGTAAAATATATACTTAGACTTTCTTGTGCTAGAACTTTAGCTCGTAAGCATAAAAGTACTGTACGTGCTTTTTTGAAAAGATTCGGTTCGCAATTATTGGAAGAGTTCTTTACGGAAGAAGAACAAGTTTTTTCCTTGACCTTTCCAAGAGTTTCTTCTATTTCTATTTCGCGAAGGTTATCTAGAAGGCGTATTTGGTATTTGGATATTGTTTGTATCAATGATTTGGCCAATCATGAATGATTCGTTATGAAATGTTGT-------AATTTGATCACTAAATCTTCTAATACTAC--------------------------------------TAAATAATTCAATAATGAAAAGCAAAAAAAAAAAATGAAAAGCAAAAAAAAAAAAAATGATTGATTTCTATTCTGAAATAATGATTGATTTCTATTCTGAAATGTTGATGTAGTATATAGTAAGGATTCAATCAATTTAGTATTCAACCTTTTCTT---------GTCTAAAAaTGGATAAGACTTTGGTCTGATTGTATA-------GGAGTTTTTGAACTAAAAAAAAGGAGCAATAGCTTCCCTCTTGTTTTATTAAGATTAAGAGGGCGTTATTGCTCCTTTTTTTT-ATTTTGATTTAGTACT------CGTCCATAGTTTCTTTAAAAATAACAAGGACTTTTTTTAGTTTGGTTCGATTTGTGTGTTTTT-CTTTGTATTCATTTAGATTATAGGTTTCTATATCATATACTTTTCCCAATCTTTTATGAAGTTTTATTTCCAATTCAATTTCAATCGAAAATAGGTAAAAATTTCAATTTTGCTTATTTATTACTTTTCTTTCTTATT-----------------------TAAGAAAGAAAAGTAATATGCTTTTTTATgTTAATGGAAAAA-------------------------TATAGTAAAGTAATCAAGTAAC---ATAGTATAGGGGC ; END; BEGIN TREES; Title 'Trees from "Melampodium_cp.nex"'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Melampodium_americanum_acc._1, 2 Melampodium_americanum_acc._2, 3 Melampodium_diffusum_acc._1, 4 Melampodium_diffusum_acc._2, 5 Melampodium_pilosum_acc._1, 6 Melampodium_pilosum_acc._2, 7 Melampodium_longipes_acc._2, 8 Melampodium_linearilobum_acc._1, 9 Melampodium_linearilobum_acc._2, 10 Melampodium_nayaritense_acc._3, 11 Melampodium_nayaritense_acc._2, 12 Melampodium_nayaritense_acc._4, 13 Melampodium_sericeum, 14 Melampodium_strigosum_acc._1, 15 Melampodium_strigosum_acc._2, 16 Melampodium_pringlei_acc._2, 17 Melampodium_longicorne_acc._1, 18 Melampodium_longicorne_acc._2, 19 Melampodium_glabribracteatum, 20 Melampodium_mayfieldii_acc._1, 21 Melampodium_mayfieldii_acc._2, 22 Melampodium_cupulatum_acc._1, 23 Melampodium_cupulatum_acc._2, 24 Melampodium_appendiculatum, 25 Melampodium_tenellum_acc._1, 26 Melampodium_tenellum_acc._2, 27 Melampodium_rosei_acc._2, 28 Melampodium_rosei_acc._3, 29 Melampodium_sinuatum; TREE cp_data_BI = ((29:0.005666,((27:0.002522,(25:0.001615,26:0.001614)0.97:0.001846)1.00:0.004423,(22:8.07E-4,23:6.18E-4,(24:8.0E-4,28:0.001305)0.76:0.001522)0.98:0.00225)0.61:0.001034)1.00:0.0104385,(19:0.006084,(((8:5.31E-4,9:0.001059)0.62:9.04E-4,(10:0.001036,11:8.27E-4,12:5.26E-4)0.54:0.001029)1.00:0.008382,(((15:0.001037,16:5.23E-4)1.00:0.00201,(13:0.001975,(14:0.001728,(17:5.41E-4,18:5.32E-4)1.00:0.003239)1.00:0.002292)0.51:9.42E-4)1.00:0.002867,(((3:5.19E-4,4:5.15E-4)1.00:0.0036,(20:5.37E-4,21:5.16E-4)0.97:0.003934)0.81:0.001669,((5:0.002096,6:0.001322)0.95:0.001316,(1:5.19E-4,(2:0.001558,7:5.17E-4)1.00:0.001551):0.002099)1.00:0.003994)1.00:0.001199)0.71:0.003651)0.87:0.002051)0.78:0.0104385); TREE cp_data_MP = ((29,((27,(25,26)),(23,28,(22,24)))),(19,((8,9,10,11,12),(((3,4),(20,21)),((5,6),(1,(2,7))),(13,(15,16),(14,(17,18)))))))[% ] [% ] [% setBetweenBits = selected ]; END;