NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:04:38] [Matrix accession#: M1808] BEGIN TAXA; TITLE M1808; DIMENSIONS NTAX=21; TAXLABELS Varecia_variegata_variegata Varecia_variegata_rubra Scalopus_aquaticus Saguinus_sp. Macaca_fuscata Lemur_catta Homo_sapiens Hapalemur_griseus Felis_silvestris Eulemur_macaco_macaco Eulemur_macaco_flavifrons Eulemur_fulvus_rufus Eulemur_fulvus_collaris Eulemur_fulvus_albifrons Erythrocebus Daubentonia_madagascariensis Colobus_guereza Cheirogaleus Cercopithecus Canis_lupus Callithrix_jacchus ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M1808; DIMENSIONS NCHAR=901; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ; MATRIX Varecia_variegata_variegata GACAAAGTAGCAGTGACTGCTTCCAGTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCAGCATTTA-TTTTTAACATCATTAATTCACACCTCAAAAAGAATGAAGTTCTGC---------AGAGCCTACTGAACCGGGGCTGGAACTCTAGGCACTCTCATTCATTGC-TTTGGTGCATTAGGTTTGCAATG-----CCTGGTACCTCAATTACCTCAAATAGATGATAGAAATAAAGATATGGTATTCATTAAGCTGTTAATATTGAATTTGCAGAAAAGCATCCCTTTATAAAATTTATTTGTGGGT-AAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTTTAGCTAATTAAAATGTATTTATTGATTCATCTTTGAAA-GGCTTGGGGA-ACAACATTCTAGGCAGACATCTAATTCTTAAATCCTCTGGAAGAATTAACTAATACTATAAAATAAGATAGAAAGTACT-----CTAATGTTATTTTACAACAGCTAGTAAGAGGGAATTGCTACAG-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAAC-A---TTTGGTCCTATGT-ANGAAACAT-ATATTTTTTCAGTAATTCCACTCACATGGAGAAGTT-AACAAAGCAA-TGTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCCTCAAAATTCATTATACACGTCCCC-AGTGGATA-CAGCATGACTGGAGGCAGAAATCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTATA--CTGAGTAGGGAAGCTCA-TAA-TGTCAACACTTATGTT-CCNNGTAATGGGATCAGTGTATACTCTCTGTTTTGCTCCAGATTTCTGACACCATAAAGACTAAATCCTTTCCCACT-GACCAAC-TTGTTAACTTCTCACTTGT Varecia_variegata_rubra GACAAAGTAGCAGTGACTGCTTCCAGTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCAGCATTTA-TTTTTAACATCATTAATTCACACCTCAAAAAGAATGAAGTTCTGC---------AGAGCCTACTGAACCGGGGCTGGAACTCTAGGCACTCTCATTCATTGC-TTTGGTGCATTAGGTTTGCAATG-----CCTGGTACCTCAATTACCTCAAATAGATGATAGAAATAAAGATATGGTATTCATTAAGCTGTTAATATTGAATTTGCAGAAAAGCATCCCTTTATAAAATTTATTTGTGGGT-AAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTTTAGCTAATTAAAATGTATTTATTGATTCATCTTTGAAA-GGCTTGGGGA-ACAACATTCTAGGCAGACATCTAATTCTTAAATCCTCTGGAAGAATTAACTAATACTATAAAATAAGATAGAAAGTACT-----CTAATGTTATTTTACAACAGCTAGTAAGAGGGAATTGCTACAG-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAACTA---TTTGGTCCTATGT-ATGAAACATGAT-T-TTTTCAGTAATTCCACTCACATGGAGAA-TTTAACAAAGCAAATGTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCCTCAAAATTCATTATACACGTCCCC-AGTGGATA-CAGCATGACTGGAGGCAGAAATCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTATA--CTGAGTAGGGAAGCTCA-TAA-TG-CAACACTTATGTT-CCCAGTAATGGGATCAGTGTATACTCTCTGTTTTGCTCCAGATTTCTGACACCATAAAGACTAAATCCTTTCCCACT-GACCAAC-TTGTTAACTTCTCACTTGT Scalopus_aquaticus G-CGAAGTAGAAGTGGCTTCTTCCAGCTTTGCCAACCAGCCTTTGTTCCTAGGGCAAGGGGGCTCACCATCTCTTCTGAAACATCATTGATTCAAATTCCAAAAAGAATGAAGCTTTGC---------TCAGCTCACTGAACTGGGGCTTGGATTCTGGGTGCTTTCGCCTTTTGTTTTTGGTGTTTTGGGTTCACTATG-----CTCGGCACCTCAATTTCCTGAGATAGATGGTAGAAATAATGATATGCTATTTGTGAAGCTATTTATAGAGAATTTTCATAAATGTATACCTTTATAAAATTTATTT--------------------------------CCCTTTAGCTAATCAAAATGAATTTATCGACTATTCTTTGAAA-GGCTTAGAGG-GCACTATTTGATATCTTAAGTACTCTAGAAGAGTTTAATAAACACTATACAATGGATCTTGAAGTCATGCAACATCATTTTACAACAACATTATTTTACAACAACTAAGAAGGAATTGATTATTTGGGCAATAACTGACTAAAATGCTCTCAGG--AAAAT----GATTTGGTTCCAT-----GGAATGTTATATATTTTCAATAATTCCACTCAAACAGCAAGGCTTAATGAAGCCACTGGTCTCAGG-AGCCTATTCTCTCCTTTAAAATTCATTGTATATGTCCCC-AGTTGAGCTCAGTGTGTCTGGAGGCGAAAACCATTCTTGCTTTGGGAACACTCTTGTCTGTGTTATA--CTGCGTAGGGAAGCTCGTTGACTGTCAACAGTTCAGTT-GCAGGAAATGCGATTAGAATATACTTCCTGCCTTGTTCCAGATTTCTAGTATCATAATGAGTGGACCCTTTAT-------------------------------- Saguinus_sp. CCTGAAGTAGAAGTAGCTCCTTCCGGCTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACTCAGCATCTG-TTTTAAATATCATTGATT-GAACTTCAAAAAGAATGAAGCTCCGCTGAGCTTGCTGAGCTTACTGAGCTGGGACTTGAATTCTAGACATTCTGCCTCATAGC-TTCGGTGTACTGGGTTTGCAAAG-----TCTGGTACCTCAATTTCCTCAGATAGATGATAGAAATAAAGATGTGATATTAAGGAAGCTGTTAATACTGAATTTTCAGAAAAGCGTCCCTTTATCAAATGTATTTGGGGGG-CAAACCGCATGAGATTATATTCTGGCCCTATAGCTAGTCAAAATGTATTTATTGATTAATCTTTAAAA-GGCT-GGTGA-GCAATATTCTAGATATCTATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAATTAATACTATAAAATGGGTCAGGATGTAGA-----CTGATGTTATTTTATAACAACCGGTAAGAGGGAGCGACTATGG-CAACAACT----AAAATGATCTCAGG--GAAAACTC---TTTGGCCCTATGT-ATGATACATTACATCTTTTCAGTAATTCCACTCAAATGGAGAGGCTTAACAAAGCAACTATCCTCAGGGGGCCAATTTTCTCCCTTAAAATTCATTATACGCATCCCCTGGTTGATAGCGGCATGTCTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAATAATTATGTCTGTGTTATA--CTGCATAGGGAAGCTCAGTAATTGTCAACACTTTTGTT-CCTGATAATGGGATCAGTGTGTAATTCTTGCTTTGTTCCAGATTTCTAATACCATGAACCATAAATCCTTCCACTCT-GATCAATTTTGTTAACTTCTCATTTGT Macaca_fuscata AATGAGGTAGGAGTGACTCCTTCCAGCTTTGCCAAGCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCAGCATCTA-TTTTTAATATCATTTATTCAAACTTCAAAAAGAATGAAGTTCCAC---------TGAGCTTACTGAGCTGGGACTTGAACTCTGGGGATTCTGCCTCATTGC-TTTGGTGCATTGGGTTTGTAATG-----TCTGGTATCTCCACTTCCTCAGATCGATGATAGAGATAAAGATATGATATTAAGGAAGCTGTTAATCCTGAATTTTCAGAAAAGTATCCCTTTATAAAATGTATTTGGGGGG-CAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTATAGCTAATCAAAATGTGTTTACCGATTAATCTTTAAAA-GGCTTAGTGA-ACAATATTTTAGTCAGATATCTAATTCTTAAATACTCTAGAAGGATTAACTAAT-CTATAAAATGGGTCTGGATATAGT-----CTGACATAATTTTATAACAACCGGTAAGAGGGAGTGACTAGAG-CAACAACT----AAAATC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TACACACAT-CCT-GGTTGATAGCAGTGTGTCTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTATA--CTGAATAGGGAAGCTCATTAACTGTCAACACTT-TGTTATTCAATAATGGAATCAGTGTGTAATTC-TGTTT-GTTCCAGATTTCTAACACCATAAAGAATAAATCCTTTCACTCT-GATCAATGTTGTTAACTTCTCACTTGT Lemur_catta GACACAATAGCAGTGACTCCTTCCAGTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCGGCATTTA-TTTTTAACATCATTAATTCAAACTACAAAAAGAATGAAGTTCTGC---------AGAGCTTACTGAACCGGGGCTTGGACTCTAGGCTCGGTCCTTCATTGC-TTTGGTGCACTGGGTTTGCAATG-----CCTGGTACCTCAATTACCTCAAATAGATGACAGAAATAAAGATATGGTATTAATCAAGCTGTTGATATTGAATTTTCAGAAAAGTATCCCTTTATAAAATTTATTTGGGGGT-AAAACTGCATAAGATTATATTCTGGCCCTTTAACTAATTAAAACGTATTTATTGATTCATTTTTGAAA-GGCTTGGGGA-AGAACATTCTAGGCAGACATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAATACTATAAAATAAGTCAGAAAGTACG-----CTAACGTTATTTTACAACAACTAGTAAGAGGGAATTACTACAG-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAACTA---TTTGGTCCTATGTTATGGAACATTACATCTTTTCAGTAATTCCACTCACATGGAGAAGTT-AACAAAGCAACTGTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCCTCAAAATTCATTATACACGTCCCC-GGTTGATAGCAGCATGACTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTGTA--CTGAGTAGGGAAGCTCATTAATTGTCAACACTTACGTT-CCCGGTAATGGGATCAGTGTGTACTCTCTGTTTTGCTCCATATTTCTGACACCATAAAGACTAAATCCTTTCTCACT-GACCAATGGTGTTAACTTCTCACTTGT Homo_sapiens AATGAAGTAGAAGTGACTCCTTCCAGCTTTGCCAACCAGCTTTTATTACTAGGGCAAGGGTACCCAGCATCTA-TTTTTAATATAATTAATTCAAACTTCAAAAAGAATGAAGTTCCAC---------TGAGCTTACTGAGCTGGGACTTGAACTCTGAGCATTCTACCTCATTGC-TTTGGTGCATTAGGTTTGTAATA-----TCTGGTACCTCTGTTTCCTCAGATAGATGATAGAAATAAAGATATGATATTAAGGAAGCTGTTAATACTGAATTTTCAGAAAAGTATCCCTCCATAAAATGTATTTGGGGGA-CAAACTGCAGGAGATTATATTCTGGCCCTATAGTTATTCAAAACGTATTTATTGATTAATCTTTAAAA-GGCTTAGTGA-ACAATATTCTAGTCAGATATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAATACTATAAAATGGGTCTGGATGTAGTT----CTGACATTATTTTATAACAACTGGTAAGAGGGAGTGACTATAG-CAACAACT----AAAATGATCTCAGG--AAAACCTG---TTTGGCCCTATGT-ATGGTACATTACATCTTTTCAGTAATTCCACTCAAATGGAGACTTTTAACAAAGCAACTGTTCTCAGGGGACCTATTTTCTCCCTTAAAATTCATTATACACATCCCT-GGTTGATAGCAGTGTGTCTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTACGTCTGTGTTATA--CTGAGTAGGGAAGCTCATTAATTGTCGACACTTACGTT-CCTGATAATGGGATCAGTGTGTAATTCTTGTTTCGCTCCAGATTTCTAATACCACAAAGAATAAATCCTTTCACTCT-GATCAATTTTGTTAACTTCTCACGTGT Hapalemur_griseus GACACAGTAGCAGTGACTCCTTCCAGTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCGGCATTTA-TTTTTAACATCATTAATTCAAACCACAAAAAGAATGATGTTCTGC---------AGAGCTTACTGAACCAGGGCTTCGACTCTAGGCACGGTCCTTCATTGC-TTTGGTGCACTGGGTTTGCAATG-----CCTGGTACCTCAATTACCTCAAATAGATGATAGAAATAAAGATATGGTATTTATCAAGCTGTTGACATTGAATTTTCAGAAAAGTATCCCTTTATAAAATTTATTTGGGGGT-AAAACTGCATAAGATTATATTCTGGCCCTTTAGCTAATTAAAATGTATTTATTGATTCATTTTTGAAA-GGCTTGGGGA-AGAACATTCTAGGCAGACATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAATACTATAAAATAAGTCAGAAAGTACT-----CTAATGTTATTTTACAACAACTAGTAAGAGGGACTTACTACAG-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAACTA---TTTGGTCCTAGGT-ATGGAACATTACCTCTTTTCAGTAATTCCACTCACATGGAGAAGTT-AACAAAGCAACTGTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCCTCAAAATTCATTATACACGTCCCC-GGTTGATAATAGCATGACTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTGTA--CTGAGTAGGGAAGCTCATTAATTGTCAACACTTATGTT-CCCGGTAATGGGATCAGTGTGTACTCTCTGTTTTGCTCCAGATTTCTGACACCATAAAGACTAAATCCTTTCTCACT-GACCAATGTTGTTAACTTCTCACTTGT Felis_silvestris GATGAAGTAGAAGGGCCCTCTCCCAGCTCTGCCAGTCAGCTTGTGTTACTAGGACAAGGGTACCCAGCATCGACTTTTAAATATCATCGATTCAAACTGCAAAATGAATGAAGTTCTGC---------AGAGCTCACTGACCTGGACCTTGGACCCTGGGTGCTCCCCACTATAGC-TTTGGTGCACTGGGTTTACGGTGCCTGGCTCCTTGCCTCAATTTCCTCGAATATATGGTAGGAATAACAATATGATATTCATGAAGCTACCAATATTGCGTTGTCAGATGTGCATCCTTTTATAAAGTTTATTT--------------------------------CCCTTCAGCTCATCAAAATGTATCTATTGATTAATCTCTGAAA-GGCTGGGTGG-ACAACATTCTAGTCGAATACTGAATGCTTAAGTCCTCTAGAGGAATTAACTAATACTATAAAATGCATCCTTAAGTAGTC------GACATTATTTTCCAACCAGTAAGAGGGAATTACTACAACAGCAGCTGACT----AAAACGTTCTCAGG-AAAAACAAGCTATTTGGTCCTGT-----GGCACATTGCATCTTTTTAGTAACTCCACTCAAATGGCAAGGCTTAACAAAGCAACTGTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCTTTAAAATTCATTATACATGTTCCA-GGTCGATGGCAGCATGTCCGGAGGCAGAAACCAGTCTTTCTTTGGGAACAATCATGTCTGTGTTATATACTGAGAAGGGGAGCTCATTAACTGTCAACACTTACAAT-GCTGGAAATGGACTTGGCATGGACTTCTTGCCTTGTTCCAGATTTCTAACACCATAAAGAACAGCTCCTTTCA-------------------------------- Eulemur_macaco_macaco GACAAAGTAGAAGTGACTCCTTCCAGTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCGGCATTTA-TTTTTA---TCATTAATTCAAACCTCAAAAAGAAGGCAGTTCTGC---------AGAGCTTACTGAACCGGGGCTTGGGCTCTAGGCACTCTCCTTCATTGC-TTTGGTGCACTGGGTTTGCAATG-----CCTGGTACCTCAATTACCTCAAATAGATGATACAAATAAAGATATGATATTAATTAAGCTGTTAATATTGAATTTTCAGAAAAGCATCCCTTTATAAAATTTATTTCAGGGT-AAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTTTAGCTAATGAAAATGTATTTATTGATTCATCTTTGAAA-GGCTTGGGGG-ACAACATTCTAGGCAGACATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAATACTATAAAATAAGTCAGGAAGTACT-----CTAATGTTATTTTACAACAACTAGTAAGAGGGAATTACTACAG-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAACTA---TTTGGTCCTATGT-ATGGAACATTACATCTTTTCAGTAATTCCACTCAAATGGAGAAGTT-AACAGAGCAACTCTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCCTCAAAATTCATTATCCACGTCCCC-GGTCAAA-------TGACTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTATA--CTGAGTAGGGAAGCTCATTAATTGTCAACACTTAGGTT-CCCGGTAATGGGATCAGTGTATACTCTCTGTTTTGCTCCAGATTTCTGACACCATAGAGACTAAATCCTTTCCCACT-GACCAATGTTGTTAACTTCTCACTTGT Eulemur_macaco_flavifrons GACAAAGTAGAAGTGACTCCTTCCAGTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCGGCATTTA-TTTTTA---TCATTAATTCAAACCTCAAAAAGAAGGCAGTTCTGC---------AGAGCTTACTGAACCGGGGCTTGGGCTCTAGGCACTCTCCTTCATTGC-TTTGGTGCACTGGGTTTGCAATG-----CCTGGTACCTCAATTACCTCAAATAGATGATACAAATAAAGATATCATATTAATTAAGCTGTTAATATTGAATTTTCAGAAAAGCATCCCTTTATAAAATTTATTTCAGGGT-AAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTTTAGCTAATGAAAATGTATTTATTGATTCATCTTTGAAA-GGCTTGGGGG-ACAACATTCTAGGCAGACATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAATACTATAAAATAAGTCAGGAAGTACT-----CTAATGTTATTTTACAACAACTAGTAAGAGGGAATTACTACAG-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAACTA---TTTGGTCCTATGT-ATGGAACATTACATCTTTTCAGTAATTCCACTCAAATGGAGAAGTT-AACAGAGCAACTCTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCCTCAAAATTCATTATCCACGTCCCC-GGTCAAA-------TGACTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAAT-ATGTCTGTGTTATA--CTGA-TAGGGAAGCTCATTAATTG-CAACACTTATGTT-CCCGGNNATGGGATCAGAGGATACTCTCTG--------------------------------------------------------------------------- Eulemur_fulvus_rufus GACAAAGTAGAAGTGACTCCTTCCAGTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCGGCCTTTA-TTTTTA---TCATTAATTCAAACCTCAAAAAGAAGGCAGTTCTGC---------AGAGCTTACTGAACCGGGGCTTGGGCTCTAGGCACTCTCCTTCATTGC-TTTGGTGCACTGGGTTTGCAATG-----CCTGGTACCTCAATTACCTCAAATAGATGATACAAATAAAGATATGAT-TTAATTAAGCTGTTAATATTGAATTTTCAGAAAAGCATCCCTTTATAAAATTTATTTCAGGGT-AAAACTG-ATGAGATTATATTCTGGCCCTTTAGCTAATGAAAATGTATTTATTGATTCATCTTTGAAA-GGCTTGGGGA-ACAACATTCTAGGCAGACATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAATACTATAAAATAAGTCAGAAAGTACT-----CTAATGTTATTTTACAACAACTAGTAAGAGGGAATTACTA-AG-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAACTA---TTTGGTCCTATGT-ATGGAACATTACATCTTTTCAGTAATTCCACTCAAATGGAGAAGTT-AACAGAGCAACTGTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCCTCAAAATTCATTATCCACGTCCCC-GGTCAAA-------TGACTGGAGGCAGGAACC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Eulemur_fulvus_collaris GACAAAGTAGACGTGACTCCTTCCAGTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCGGCATTTA-TTTTTA---TCATTAATTCAAACCTCAAAAAGAAGGCAGTTCTGC---------AGAGCTTACTGAACCGGGGCTTGGGCTCTAGGCACTCTCCTTCATTGC-TTTGGTGCACTGGGTTTGCAATG-----CCTGGTACCTCAATTACCTCAAATAGATGATACAAATAAAGATATGATATTAATTAAGCTGTTAATATTGAATTTTCAGAAAAGCATCCCTTTATAAAATTTATTTCAGGGT-AAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTTTAGCTAATGAAAATGTATTTATTGATTCATCTTTGAAA-GGCTTGGGGG-ACAACATTCTAGGCAGACATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAATACTATAAAATAAGTCAGAAAGTACT-----CTAATGTTATTTTACAACAACTAGTAAGAGGGAATTACTATAG-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAACTA---TTTGGTCCTATGT-ATGGAACATTACATCTTTTCAGTAATTCCACTCAAATGGAGAAGTT-AACAGAGCAACTGTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCCTCAAAATTCATTATCCACGTCCCC-GGTCAAA-------TGACTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTATA--CTGAGTAGGGAAGCTCATTAATTGTCAACACTTAGGTT-CCCGGTAATGGGATCAGTGTATACTCTCTGTTTTGCTCCAGATTTCTGACACCATAGAGACTAAATCCTTTCCCACT-GACCAATGTTGTTAACTTCTCACTTGT Eulemur_fulvus_albifrons GACAAAGTACAAGTGACTCCTTCCAGTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCAGCATTTA-TTTTTA---TCATTAATTCAAACCTCAAAAAGAAGGCAGTTCTGC---------AGAGCTTACTGAACCGGGGCTTGGGCTCTAGGCACTCTCCTTCATTGC-TTTGGTGCACTGGGTTTGCAATG-----CCTGGTACCTCAATTACCTCAAATAGATGATACAAATAAAGATATGATATTAATTAAGCTGTTAATATTGAATTTTCAGAAAAGCATCCCTTTATAAAATTTATTTCAGGGT-AAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTTTAGCTAATGAAAATGTATTTATTGATTCATCTTTGAAA-GGCTTGGGGG-ACAACATTCTAGGCAGACATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAATACTATAAAATAAGTCAGAAAGTACT-----CTAATGTTATTTTACAACAACTAGTAAGAGGGAATTACTATAG-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAACTA---TTTGGTCCTATGT-ATGGAACATTACATCTTTTCAGTAATTCCACTCAAATGGAGAAGTT-AACAGAGCAACTGTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCCTCAAAATTCATTATCCACGTCCCC-GGTCAAA-------TGACTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTATA--CTGAGTAGGGAAGCTCATTAATTGTCAACACTTAGGTT-CCCGGTAATGGGATCAGTGTATACTCTCTGTTTTGCTCCAGATTTCTGACACCATAGAGACTAAATCCTTTCCCACT-GACCAATGTTGTTAACTTCTCACTTGT Erythrocebus AATGAAGTAGGAGTGACTCCTTCCAGCTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTGCCCAGCATCTA-TTTTTAATATCATTAATTCAAACTTCAAAAAGAATGAAGTTCCAC---------TGAGCTTACTGAGCTGGGACTTGAACTCTGGGGATTCTACCTCATTGC-TTTGGTGCTTTGGGTTTGTAATG-----TCTGGTATCTCCACTTCCTCAGATCGATGATAGAGATAAAGATATGATATTAAGGAAGCTGTTAATCCTGAATTTTCAGAAAAGTATCCCTTTATAAAATGTATTTGGGGGG-CAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTATAGCTAATCAAAATGTGTTTATTGATTAATCTTTAAAA-GGCTTAATGA-ACAATATTTTACTCAGATATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAAT-CTATAAAATGGGTCTGGATGTAGT-----CTGACATAATTTTATAACAACCGGTAAGAGGGAGTGACTAGAG-CAACAACT----AAAATGATCTCAGG--AAAAACTG--TTTTGGTCCTATGT-ATAGTACATTACATCTTTTCAGTAATTCCATTCAAATGGAGAAGTTTAACAAGGCAACTGTTCTCAGGGGGCCTATTCTCTCCCTTAAAATTCATTATACACATCCCT-GGTTGATAGCAGCGTGTCTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTATG--CTGAGTAGGGAAGCTCATTAACTGTCAACACTTATGTT-CCTGATAATGGAATCAATGTGTAATTCTTGTTTTGTTCCAGATTTCTAACACCATAAAGAATAAATCCTTTCACTCT-GATCAATGTTGTTAACTTCTCACTTGT Daubentonia_madagascariensis GACAAAGTAGAAGTGACTCCTTGC-GTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCA-CATCTAGTTTTAA-CATCATTGATTCAAACCTCAAAAAGAATGAAG--------------------------AACTGGGACTTGGACTCTGGGCACGCTCCTTCATTGC-TTTGGTGCATTGGGTTTGCAATG-----CCTAGCACCTCAATTTCCTCAGATAGATGGCAGGAATAAAGATATGCTATTAATGAAGCTGTTAATATTGCATTTTCAGAAAAGCATCCTTTTATAAAATTTATTTGGGGGT-AAAGCTGCATGAGATTATATCCTGGCCCTTTAGCTAATTCAAATGTATTTACTGAGTAATCTTTGAAA-GGCTTGGTGATGTCTAATTCTAGTCAGATATATAATTCTTAAATCTT-TAGAAGAATTAACTAATACTGTAAAATAAGTCAGAAAGTAGT-----CTAATGTTATTTTACAACAACTAGTAAGAGGGAATTACTACAC-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAACTA---TTTGGTCCTAT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Colobus_guereza AATGAAGTAGGAGTGACTCCTTCCAGCTTTGCCAACCAGCTTTTGTCACTAGGGCAAGGGTACCCAGCATCTA-TTTTTAATATCATTAATTCAAACTTCAAAAAGAATGAAGTTCCAC---------TGAGCTTACTGAGCTGGGACTTGAACTCTGGGGATTCTGCCTCATTGC-TTTGGTGCACTGGGTCTGTAATG-----TCTGATATCTCCGCTTCCTCAGATCGATGATAGAGATAAAGATGTGATATTAAGGAAGCTGTTAATCCTGAATTTTCAGAAAA-TATCCCTTTATAAAATGTATTTGGGGGG-CAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTATAGCTAATCAAAATGTATTTACTGATTAATCTTTAAAA-GGCTTAGTGA-ACAATATTTTAGTCAGATATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAAT-CTATACAATGGGTCTGGATGTAGT-----CTGACATAATTTTATAACAACCCGTAAGAGGGGGTGACTAGAG-CAACAACT----AAAATGATCTCAGG--AAACACTG--TTTTGGTCCTGTGT-ATGGTGCATTACCTCTTTTCAGTAATTCCATTCAAATGGAGAAGTTTAACAAGGCAACTGTTCTCAGGGGGCCTATTCTCTCCCTTAAAATTCATTATACACATCCCT-GGTTGATAGCAGCGTGTCTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTCTA--CTGAGTAGGGAAGCTCATTAACTGTCAACACT-ATGTT-CCTGATAATGGAATCAGCGTGTAATTCTTGTTTTGTTCCAGATTTCTAACACCATAAAGAATAAATCCTTTCACTCT-GATCAATTTTGTTAACTTCTCACTTGT Cheirogaleus GACAAAGTAGAAGTGACTCCTTCCAGTTTTGCCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTACCCAGCATTTA-TTTTTAACATCATTAATTCAAA-------AAGAATGAAGTTCTGC---------AGAGCTTACTGAACCGGGGCTTGGACTCTAGGCACTCTCCTTCATTGC-TTTGGTGCATTAGGTTTGCAATG-----CCTGGCACCTCAATTCCCTCAAATAGATGATAGAAATAAAGATATGATATTCATCAAGCTGTTAATACTGAATTTGCAGAAAAGCATCCCTTTATAAAATTTATTTGAGGGT-AAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTTTAGCTAATTAAAATGTATTTATTGATTAATCTGTGAAA-GGCTTGGGGA-ACAACATTCTAGGCAGACATCTAATTCTGAAATCCTCTAGAGGAATTAACTAATACTATAAAATAAGTCAGAAAGTAGT-----CTACTGTTATTTTCCAACAACTAGTAAGAAGGAATTACTACAG-CAACAACTGACTAAAATGATCTCAGG--AAAAACTA---TTTGGTCCTATGTTATGGAACATTACATCTTTTCAGTAATTCCACTCACATGGAGAAGTT-AACAAAGCAACTGTTCTCAGAGGGCCTATTTTCTCCCTCAAAATTCATTATACACGTCCCC-GGTTGATAGCAGCATGACTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTGTA--CTGAGTAGGGAAGCTCATTAATTGTCAACACTTACGTT-CCCGGTAATGGGATCAGTGTGTACTCTCTGTTTTGCTCCATATTTCTGACACCATAAAGACTAAATCCTTTCTCACT-GACCAATGTTGTTAACTTCTCACTTGT Cercopithecus AATGAAGTAGGAGTGACTCCTTCCAGCTTTACCAACCAGCTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTGCCCAGCATCTA-TTTTTAATATCATTAATTCAAACTTCAA-AAGAATGAAGTTCCAC---------TGAGCTTACTGAGCTGGGACTTGAACTCTGGGGATTCTACCTCATTGC-TTTGGTGCTTTGGGTTTGTAATG-----TCTGGTATCTCCACTTCCTCAGATCGATGATAGAGATAAAGATATGATATTAAGGAAGCTGTTAATCCTGAATTTTCAGAAAAGTATCCCTTTATAAAATGTATTTGGGGGG-CAAACTGCATGAGATTATATTCTGGCCCTATAGCTAATCAAAATGTGTTTATTGATTAATCTTTAAAA-GGCTTAATGA-ACAATATTTTAGTCAGATATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAACTAAT-CTATAAAATGGGTCTGGATGTAGT-----CTGACATAATTTTATAACAACC-GTAAGAGGGAGTGACTAGAG-CAACAACT----AAAATGATCTCAGG--AAAAACTG--TTTTGGTCCTATGT-ATAGTACATTACATCTTTTCAGTAATTCCATTCAAATGGAGAAGTTTAACAAGGCAACTGTTCTCAGGGGGCCTATTCTCTCCCTTAAAATTCATTATACACATCCCT-GGTTGATAGCAGCGTGTCTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCTTTGGAAACAATTATGTCTGTGTTATG--CTGAGTAGGGAAGCTCATTAACTGTCAACACTTATGTT-CCTGATAATGGAATCAATGTGTAATTCTTGTTTTGTTCCAGATTTCTAACACCATAAAGAATAAATCCTTTCACTCT-GATCAATGTTGTTAACTTCTCACCTGT Canis_lupus GTTGAAGTGGAAGTGACTTCTTTTGGCTCTGCCAGCTGGCTTTTGTTGCTAGGACAAGGGTACCCAGCATCAACTCTTAAATCTCATTGATGCAAACCTCAGACTGAATCAAGTTCTGC---------AGAGCTCACTGAACTGAGGCTTGGACCCTGGGTGCTCCCTGCTCTTGC-TTTGGTGCCCTGGCTTTACAGTGCCTGGCTCCTCCACTCCATTCCCTCAGAGAGATGGTAGAACTAAAGGTGTGATATTCATGAAGCCACCGATATTATGTTTTCAGAAATGCATCCTTTCATAAAGCTTGTTT--------------------------------CTTTTCAGCTAATCTAAAGGTATTGATTGATTGATTTTTGCAA-GGCTTGGCAG-ACACTGTTCTAATCAAATACCTAATTCTTAAGTCCTCTAAAAGAATTAACTCATACTATAAAATGGCCCATGAAACAGCC-----TGACATTATTTTGCAGCCAGTGGA-GGGAATTACTACAGCAACAGCCGACT----ACAATGCTCTCGGGGAAAAACTAACTATTTGGTCCTAT-----GGCACATTATACCTTTTCAGTAATTCCACTCAAATAGTGAGGCTTAACAAAGCAACTCTTCTCAAAGGGCCTACTTTCTCCCTTAAAATTCATTATACACGTCCCT-GGTCAATTGTAGCGTGTCTGGAGACAGAAATCAGCTTTGCTGTGGAAGCAATCATGTCTG-GTCACA--CTGAGAAGGGGAGCTCATTAACTATCAACACTTGCATT-GCTGGAAATGGAATTGGCATGTACTTTTTACCTTGTTCCAGATTTCTAGCACCATAAAGAACAGATCCTTTTAGGGGCACCTGGATAGCTCAGTTGGTTAAGCAT Callithrix_jacchus CCTGAAGTAGAAGTGG-TCCTTCTGGCTTTGCCAACCAACTTTTGTTACTAGGGCAAGGGTATTCAGCATCTG-TTTTAAATATCATTGATTAGAACTTCAAAAAGAATGAAGCTCCGCTGAGCTTGCTGAGCTTACTGAGCTGGGACTTGAATTCTGGACATTCTGCCTCATAGC-TTTGGTGCATTGGGTTTGCAAAG-----TCTGGTACCTCAATTTCCTCAGATAGATGATAGAAATAAAGATGTGATATTAAGGAAGATGTTAATACTGAATTTTCAGAAAAGCATCCCTTTATCAAATGTATTTGGGGGG-CAAACCGCATGAGATTATATTCTGGCCCTATAGCTAGTCAAAATGTATTTATTGATTAATCTTTAAAAAGGCT-GGTGA-GTAATATTCTAGATATCTATCTAATTCTTAAATCCTCTAGAAGAATTAATTAATACTATAAAATGGGTCAGGATGTAGA-----CTGACATTATTTTATAACAACCGGTAAGAGGGAGCGACTATGG-CAACAACT----AAAATGATCTCAGG--GAAAACTC---TTTGGCCCTATGT-ATGGTACATTACATCTTTTCAGTGATTGCACTCAAATGGAGAGGCTTAACAAAGCAACTATCCTCAGGGGGCCAATTTTCTCCCTTAAAATTCATTATACACATCCCT-GGTTGATAGCAGCATGTCTGGAGGCAGAAACCATTCTTGCCTTGGAAATAATTATGTCTGTGTTATA--CTGCATAGGGAAGCTCAGTAATTGTCAACACTTATGTT-CCTGATAATGGGATCAGTGTGTAATTCTTGCTTTGTTCCAGATTTCTAATACCATAAACCATAAATCCTTTCACTCT-GATCAATGTTGTTAACTTCTCATTTGT ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions = N: 1 - 901 ; CODESET * UNTITLED = Universal: all ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; END;