NEXUS
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[Matrix accession#: M1819]

BEGIN TAXA;
	TITLE M1819;
	DIMENSIONS  NTAX=15;
	TAXLABELS
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	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M1819;
	DIMENSIONS NCHAR=812;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Puccinia_allii_HSZ0344          TAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCTGTAGGTGAACCTGCAGAAGGATCATTATTAAAAGACTTAGAGTGCACTTTATTGTGGCTCGACCCCTTTTTT-NAAATCTTACCCAAACTAACTAAGACTTTTTTGCATGATTTGAAAGAATCATTGTGACTAAGTAGACGTAAC-TTCTTAATTGAATGTT-GCATTACCCCCCC-TCTTCTTCTTTTTTTTATTATTATTATTAACACAAGTTTAAATGAATGTAAAAA-NNAACCTTTAAATTATATATAACTTTTAACAATGGATCTCTAGGCTCTCACATCGATGAAGAACACAGTGAAATGTGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCATCTTGCGCCTTTTGGTATTCCAAAAGGCACACCTGTTTGAGTGTCATGAAACCCTCTCATTAAACCATTTTGTTCTTGAACAAGATGGCTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTCATTAGCTCACTTTAAATATATCAGTTACTTTT-NCAAATGAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTTATATAAAAGGGACTTCTAAAAAAAAAAAA-NCCCAATTAATT-NNNNNNTTAAGACCTCAAATCAGGTGGGACTACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAACGGCGAGTGAAGAGGGAAAAGCCCAAATTTGTAATCTGGCTCTTTCAGAGTCCGAGTTG
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	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 812 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS gapmode = newstate ; 
 END;